EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-24059 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr20:30291430-30295160 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6060821chr2030294034hg19
rs80054178chr2030294682hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
TFAP4MA0691.1chr20:30293234-30293244AACAGCTGAT+6.02
ZNF143MA0088.2chr20:30294777-30294793TTCCCACAATGCCATG+7.06
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30292383-30293830Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30293974-30296822Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30293288-30294321Aorta
SE_02627chr20:30291813-30293615Astrocytes
SE_03156chr20:30292475-30293118Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30293152-30295232Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30293076-30297376Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30292005-30297574Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30294062-30295511CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30292092-30297225CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30292973-30294930CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_20764chr20:30292149-30295366CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30294469-30295251CD8_primiary
SE_23622chr20:30291926-30293145Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30293276-30294340Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30294588-30295088Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30291945-30297378DND41
SE_25933chr20:30291811-30295349Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30291662-30293146Esophagus
SE_26879chr20:30293157-30294278Esophagus
SE_27731chr20:30291257-30297421Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30291565-30297515Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30292078-30302768Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30291980-30293111Gastric
SE_31430chr20:30293220-30295196Gastric
SE_33407chr20:30292055-30302718H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30291507-30295446HeLa
SE_35852chr20:30291735-30295247HMEC
SE_36989chr20:30291921-30294611HSMMtube
SE_38141chr20:30291885-30293880HUVEC
SE_39443chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_39853chr20:30292057-30293062K562
SE_39853chr20:30293169-30295459K562
SE_40644chr20:30291815-30295345Left_Ventricle
SE_42121chr20:30291801-30295313Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_45708chr20:30291884-30293174Osteoblasts
SE_47264chr20:30291858-30294978Panc1
SE_47861chr20:30291945-30292571Pancreas
SE_47861chr20:30293292-30293942Pancreas
SE_48182chr20:30293240-30294390Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30294514-30295218Psoas_Muscle
SE_50155chr20:30291979-30293164Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30293172-30295195Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30293396-30302434Skeletal_Muscle
SE_52373chr20:30291702-30295310Small_Intestine
SE_53471chr20:30292078-30292710Spleen
SE_53471chr20:30294485-30295159Spleen
SE_55108chr20:30292167-30292585Thymus
SE_55108chr20:30293280-30294299Thymus
SE_55108chr20:30294451-30295219Thymus
SE_55770chr20:30292264-30294885u87
SE_56767chr20:30292026-30292562VACO_400
SE_56767chr20:30292607-30295221VACO_400
SE_57375chr20:30291974-30292464VACO_503
SE_57375chr20:30292729-30294334VACO_503
SE_57919chr20:30292049-30292581VACO_9m
SE_57919chr20:30292673-30293103VACO_9m
SE_57919chr20:30293234-30294355VACO_9m
SE_57919chr20:30294417-30294881VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_64478chr20:30291827-30294478NHEK
SE_65412chr20:30291566-30292774Pancreatic_islets
SE_65412chr20:30293264-30294304Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30294186-30295416Jurkat
SE_66898chr20:30292055-30302718H2171
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30292264-30294885u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr203029218730293046
chr203029349330294957
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031702chr203029062130297397
Enhancer Sequence
AATACAGTCA TGCACCACCA CACCCGGCTA ATTTTTTTAT TTTCAGTAGA GATGGGGTTT 60
CACTGTGTTG GCCAGGCTGG TCTGGAACTC CTGATCTCAG GTGATTCGCC TGTCTTGGCC 120
TCCCAAAGTG CTGGGATTAT AGGCATGAGC CACTGAGCCC AGCCCTGAAC TTGTTTTTTT 180
TTTTTTTTTG AGACGAGTAT TGCTCTGTCA CCCAGGCTGG AGTGCAGTGG TGCGATCTTG 240
GCTCATTGCA ACCTCTGCCT CCCAGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCAAGTA 300
GCCGGGACTA TAGGCCCACG CCACCACACC TGGCTAATTT TTGTAATTTT AGTAGAGACG 360
GGGTTTCGCC ATATTGGTCA GGCTGGTATC GAACTCCTGA CCTTAGTTGA TCCACTCGGC 420
TTGGCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGGC ATGAGCCACT GCACCCGGCC CTAAACCTTT 480
TTTTTTTTTT TTTTGAGACG GAGTCTCTCC CTGTCACCTA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCG 540
ATCTCAGCTC ACTGCAACCT ATGCCTCCCA GGTTCAAGCG ATTCTTCTGC CTCAGCCTCC 600
TGAGTAGCTG GGATTACAGG CGTGCACCAC ACCCGGCTAA TTTTTGTATT TTTAGCAGAG 660
ACGGGGTTTC CACCACCTTA GCCAGGCTGG TCTTGAACTC CCGACCTGAT GATCCACCCA 720
CCTCGGCCTC CCAAAGTGCT GAGATTACAG GCATGAGCCA CCGCGCCCAG CCTGAACTTG 780
GTTTTTAAAA GACCACTTTG GCTGGAGTAT TGGGCAAGAG TGATTTTCTA AGGTCCCTTC 840
CCAGCTTTTT CCCTGTCATT CTAGGCTGCC ATGAACTGGT TGCCTGAGCC ATAAAGACAC 900
AGTTTCTGGA TTAGAGTGAC TGAAGAGCTT AGAGTGGTTC CTTGCCCTTG GCCGGAGTAG 960
GGAATCTGTG TCACCTTGTT CTGCAGGAGA TGGAGGAAGT GACTCCCTCA GGGAGGGGTG 1020
GGAATCCCAT CTTGGAAAAC ATCCTCAAAC CACCTGTATT GTTTCTGCCT CCTGTGTGGA 1080
AGTTTCTGCC AATGACACAG TGCTCTCTGG AATGCACCCC CCCAACGCAC ACACCCAATC 1140
TTCCGTTTAC ACAGGCATAG CTGTACTTTG CATTCCTCCT AGGATTTAGT TCAAAGCTAG 1200
CCTACAGGAA CTGGTCGATA AAGAGTTACT GATTGATTAC TAAAGAAAGA GAATATTCTC 1260
AGCCATTAAG CAAATATTAA TGAGTTTTAT GAGTATTATG TTGGTCTCTG GGGGTGCAAG 1320
GTGATTAAAT GGGTTTCTAG TCTTCACTGA GCTCAGAATT CAGTGGATAG ACCAAAAACT 1380
ACAGACAACT ACAATGCTGG ATACAATAGT TATAACAGCA ACATTTACTA GGGCCTTCCT 1440
TATCCAGGTA GGACAAGTTG GCTTTGGAGC CAGACTACCT GGGTTCAAAT CATGGTTTTA 1500
CCACTTACTC GCTGTGCATC TTTGAACAAC TTTCTTAACT TCTCTATAGG AATAATAAGA 1560
GAACCTACCT GAGTGGTACT ATTTTGAGAA TTCAATGAAC TATCTCATAT AAAACACTTA 1620
AGTGCAAGTG CTCATTGTTA AATATTACTA AAATTACCTT AATACCTGCA CCATATGATC 1680
TTACATACAT TCTTACAAAA GGCTCTTAAA TCCTTACAAA AACCCTATGA AGTATTATTA 1740
TTATCCCCAT TTTTCAGATA GGGGGACTGA GGCTCAGAAA TGGAAAGGAA TGCACCCAAA 1800
ATCTAACAGC TGATATGTAA TAGAGACCAG ATTCAAACTC AACTCTGTCT GATTCCAGAG 1860
CCCATACTTC CAATTAACAA AATGATCCCC TTTTCATAAA GAGCCCCAGC ACAGTGCCTA 1920
ACACACAGCA GAGACTTTAT AAAGGGAGCT ATGGTTATTA TGTCATTGTC CCTGGAGTTT 1980
CCAGCTGTAG ATGCTGTAGA ACCCAGAGGA GGGGGCCTCT CTTTCACCCT AAAGGGATCT 2040
GAGAAGGGTT TAAAGGTGCT GGGTGCCAAC TACAGGCTTT GCTTGGGAGT CCCAAAGGTT 2100
TCCCTCACTG GGGCTTGGGA TACTAATATG GAACCTACAC TAGCACCACT AAATCAGACC 2160
CAGAAAGTTC CCCCAGGTGT CCAAACACCT GCATGAACAA GCAGGCAGTT TCCTCTAGGT 2220
TGACTTCTTG TCTGGCCCTA CACATCTCTC AGTTTCATCA CTCAGCCACC AGCCCTGGGT 2280
CTCATGTATG CACCTGCTGC TTGACCCAGT CCCAGGAGAC ACTGAGCCTT AGAATTGGGC 2340
TCCTTCTCTG GACCTTGCCC CAAAGGCTAT TTCTGAGTGA CTCCCTGGGA CTTCCCTGAC 2400
ATGGTAACCC CTAGGGCTCC AACTGAACAT GGGTGCTGTG AGCAAGGGGA AATTCTTCTG 2460
AGTAGCAGAT GGAGAGTGGG TAGAACAAGA GGCAGTTGTT CTGGATCAGA GATAAGCATG 2520
GGGTGAGAAC CATAGTACAC TGGATTTTAT GTTTAAGCAG CACTGATCCT CGATAGTTCA 2580
GAACTCCCGC ACTGAAGTCC AGCGTAGGCA GGTAAGGACA ACCTGGAGCC AGGCATTAAT 2640
ACTCACTTCT ACTTCCCATC TGAGTCATAT TCAGAGTCTG GCCTTGCCTG GTACTTTGAC 2700
TGCAGAAGGC AACCCATGGC TAAATCAAGG CACCTCAAGC CTCATAGAGA AAAGGGAAAG 2760
ACTCAGCATT TGCTGAGCTT TTACTCTGCA CTAGGCAATG TGTAAGTGCA CTTTACATGT 2820
ACCATTAATT ATTAGGAATG TTTGTTAATC CAGTCACTAA ACACTCAGCC ACCAAGTACT 2880
AGGCCCAGCA GTAGCTGTTA AGAGTGAATA AGACATAGTT TTTATCCTCA GTAAGCTCAG 2940
AGCACCTCGT TTAGTCTTTC TCCCAACAAC CCTCTGAAAT GAGTATTACT TCCACTTTAT 3000
AGATCTTCAG GTTTACAGAG GGAAGTAACT TGTCCAAATT CATGAAGCCA GTTAAGTGAT 3060
AAGATATTGC TTCTACTCAA AAAATGCTTG TTGACTGAAT GAATGAATGA ATGACACAGC 3120
TATGGCTGTG ACTTTAGTCA AGGAGTAGCA ACAAGACCAA ATATTTATAG TTCTCAAAGT 3180
GCTTTTTCAT CTATCATCTC TTTGGGCCTC CCTGCTAGCC CATGAGGGAG GCAAGGCGGG 3240
TGTTATCTTT CTTCAACATA TGAGGCAACA GGCAGAGCTT GGGCAAGAGG CTTGAGGCCA 3300
CAGAGCAAAC AAGGAGTGAG TGGGGCCATC CTGGAAAAAC TCCAGAGTTC CCACAATGCC 3360
ATGTTTAATC ATTCAAACCC ATGTCAAGCA CCTACTGTGT GCCAGGCATG CTCCTACCCA 3420
CTTTAAATAC TTAACTCATT AAGTCTTCCA CTCAGTCAAC AAACAAGGAG GACCCTGGGA 3480
AGATAAAACA AAATATGCCC CATTGCCAAA CGCCTAGTCA ACAACACTGG CCAAACCTCT 3540
ACTGTGTACA AGGTATGACT TGGGCCTTGT AGAGGAGGTA GGGGACAAGG TTGTGAGCCA 3600
AGGCCCCAAG CTTCAGGTAC CTTAAAATCT CTAAACTCTT GGTCCAAAGA TATCCACATA 3660
TTCTGTCAGC CTGAAAGTTC ACTCCTGGAG AGTAGATCCA ATAGCAATGA CAACAATTTG 3720
TTTACCAGTG 3730