EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-00839 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr1:28572440-28577130 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:28575155-28575174TGGCCTGCAGGGGGCGTTG+6.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:28576301-28576319TGAAAAAAGGAAGGAAGG+6.84
Gfi1bMA0483.1chr1:28575846-28575857AAATCACAGCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:28572493-28572504AATTTAATTAA+6.32
Nfe2l2MA0150.2chr1:28575358-28575373CATAATGACTCTGCA+6.15
PHOX2AMA0713.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
RREB1MA0073.1chr1:28576981-28577001CCACCCCCCACCCCCCACCT+6.8
RUNX1MA0002.2chr1:28573301-28573312AAACCACAGAG-6.14
SNAI2MA0745.2chr1:28572942-28572952AACAGGTGCA+6.02
SOX10MA0442.2chr1:28575393-28575404TTCTTTGTTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr1:28574936-28574946AAAACAATGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15081chr1:28571965-28577001CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21005chr1:28572183-28576988CD8_Memory_7pool
SE_29182chr1:28569155-28576849Fetal_Intestine_Large
SE_40167chr1:28572835-28576978K562
SE_64750chr1:28572499-28577008NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr12857601228576248
chr12857656028576686
chr12857420028576885
chr12857355328576556
Enhancer Sequence
AAAAAGCCTT AAATTTATTT GTTCATAGTC TTCAACTCAC GAATTTTTCT AGGAATTTAA 60
TTAATCAGGA ATATAATTAT TTAAGAGTTT TATCTCATCT TGAAATATGT GAAAAATTGG 120
GAAGAAAACC CTAAATGTTC TCAATAAGGA TTAATAAATT ATAGCATACA TGAATAGTCT 180
GCAACCATTA ACAATTATAT TTAAGGAATA TTTAATATTA CAAAAATTAT GAAATGTGCT 240
AAGTGGAAAA AGCAGGCTAT ATAGCTATAC ATTATTAATA CGGTATATAA ACTTATATGC 300
TATAAAAATA ACCAACATGT TGGTTTCTCT TTGTAGTGCA ATTGGGATTT GAGGGAGTTC 360
TCCCTTCTCT GTTTAAAAGG ATCTCTTTAA AAAACAACAA ATGTAATACA ACTTAGCACA 420
TAGATAGATA TTAAATAAGT GTATTATATA AAGAATCTTA AAACTTCTCC CTTCTCCGTC 480
CACCCCAGAG CTAACCAATG GTAACAGGTG CAAACTACAC ATCTTTCCAG ATCTTTGTTT 540
CCTCTGTGTA ACTATGTATA CAACTATGAG ACTGTTCTAT ATGTATCATT GCGCAACCTC 600
GGTTTTTGCT TCGTTCTGTT TTAACCTAAC AGGAAATCCT GCATACCTTT CCATTTCAGA 660
GCACTTGGAG CTACCTTCTG TTTCTTTGCT GTAGAAGCCG TTGTGTGAAC AAATCCGTTT 720
ATTTCTCTCA TCAGTCTCCT TTGATAGACA TTTGGGTCAC GTCCGGTTTT ACGCTTTTAC 780
AATACATCAG TGAACAGCAG TAATACGAGC TCAAGACAGA AGGCCTGAAA AACATTGAAA 840
AACACAGAGA CGGAAAAAAA AAAACCACAG AGGGGGAAAT ATAATTTCGG GTTATTTCAG 900
TTTCACCTTT ACACTTTGTT ATATTCCACA TTTTTTGCAA TAAATATAAA TTTGGAAGTA 960
AAAGCATAAA ACGAAAATCA AACGATTGAT TGATTGATTG ATTGACTGAG ACGGAGTATC 1020
ACTCTCGTCG TCCAGGCTGG AGTGTAGTGG CGCGTTCTCG GCTCACTGCA ACCTCCGTCT 1080
CCCGGATTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC CTCCCGAGTA GCTGGGATTA CAGGCGCCCG 1140
CCACCACGCC CGGCAAATTT CCAAACGTAT ATTTAAAAGA AGAAAAGGAA AAGAGGGGAA 1200
AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAT TAGAAGCAGA TGGGGCAGTT CAGCCTCTTC 1260
TCGCGGAGCG GGGCTAGACG GAGTCAGGGG CGGACCGCCA CAGCCTGCAC CAATCAGGAC 1320
CCGGTTGATA GGCAGAGCCT GGCGACTTCG AAGACTCGCC CCCAGTCAAA GAGCCCCGGG 1380
GATTCGTTTC CGTACGCAGC CTGGAAACCA GCCTGGGCCT ATCCTGCGCG CCGCTGCGGG 1440
CTACTATTGG CTGCCAAGAA ACCCCGCCCA TCTTCCTGCT CATTGGCCGG TGCGGTTTAC 1500
GTAAGAGGAG CCTGTTGCTG AGCGAAAAGT CTGTTCTGCA ATTTTCGCTA AGGAGTTGTT 1560
AACGCTGAAA CCGCACTGGG CGTCCTGGGG TCAAAAAAAC AATACTAGCC ACAGTTTATT 1620
AAACTGCAAC TAAATGCCAG GCTATGTGCG CCAAACTTTT AATATTAATG GTTGTAGGCA 1680
CCTTTCTTGA ACACCCACCA CTATCAGCCA GTCACTGAGC CAGATCCTTC AAAATAACAG 1740
TAAAAATATA GATAATCTAC AGTTTATTGA GCACTTCATC TGCATCAAGC CTTGTTAAGG 1800
GGTTTCCATG CATAAGCTCT CATTCTCACA ATAGAACGGT GGAGGTAAAC TATTGCCCCA 1860
TTTAACATTT AACATGCAGT CCTGTAGACC CAGCTACTCG GAAGGCTGAG GTGAGAGGAC 1920
CCAGGAGCTC CAAACTTAAG TGAGCTATGA TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA 1980
GAACGAGACC TGTCTCAGAA AAACAAAAAC GTAATAAAAG AAAAACAAAA ACAAAAAAAC 2040
AGGAAACGGG TTCAGAGAAG TGAAGTGTTT TGCTGAGGTT CACAAAGAAA GGGTTGGAAC 2100
TGGAACCTTC AACTCCGATA TCCTGATTCC AAGTGTGGCC TTTTTAGGGA GGGGGTCGGG 2160
GTACAGAATT CCGCTGGGGA TAGGGAAAGG TAGGACAGGA TGGTGGGAGG CCAGAGGCGT 2220
TGCTCCAGGG ACAAGCCTCA GGGTGGTTCT CTGAGAATAG GATGTATAGA GCCTCTAGGA 2280
GTGGAGGGTT GGGGAAGGAA GGGAGACCAG AGGAAAGGGA GAAGTTGTTC TTTCTGAAAA 2340
TGTGAGGCTT CTCTCCTGGG GCAGCCTATT AAGGTGTAGG TAGCCCTGGA CCTCGAGATT 2400
CTAGTCTCCA CTCTGTGGCC AACTTCCTAG GGAACCTTGG GCAAATTCCT CTCTCTCGAC 2460
CTGAGGCTTC CTGCCTTGTA AGAGAGGTAG TAAGCCAAAA CAATGGAAAG TGCATTCGGG 2520
CTGTGAAGTA TTTTAGGACT CTGGTCCTTG CTGGCAGCAG GGGGAATCTT CAGCAACCAC 2580
AGACCTTTAC TTAGCTGTTG CCTGGCCTCT TTTCAAGACC TTCAGGCGGT GACATGGACC 2640
CTAACAATCC TATAAACTCA AAACGGTTTG GGCCAGCCCT TTCCTACTCC ATTCTGACTT 2700
AGCTATAGCA GGATCTGGCC TGCAGGGGGC GTTGAGGAAC CACTCAGCCG ACAAAACTAA 2760
ACTAAATCAA CCAAGCAATT TGCCCAAAAG CACCCAGTGC GTTAGTTTTT GCATTTAAGA 2820
AGGGTAAACG TTTCCAAACC TGAAGATTTC TGTCCTCAGT ATGCAATCGA GAAGACGAAT 2880
TATATACACT GCCAGTTCTT TATGGCACCA GTTCTCTCCA TAATGACTCT GCAAGTTTAG 2940
AGCTAATTTC TATTTCTTTG TTTTACAGAT AGGGAAACAG ATTCAAAGAG CTGGAAAAAA 3000
AAAATTCAGT TTGGGTTACT TGGCTAAAAG CTGGCACCCG AATTGCCTGA CTCCTGGGAA 3060
GTGCTCTTAG GAGATAGTTG GCTTTGTTTC TGGGAGTCTG TGGTTGTACT GCCTGCTAAT 3120
GCACAACTCC AAAGGACAAT TTTGGTTGTG TAGCTTGACA GCTCGGCACC TGTCAGCTCT 3180
GTGCAGGAAG GACCTCCCTC CCCACCTAGC ACAATGCCTG CTTCATGAGT AATTGAATTA 3240
ATGTGTGACT AAGCCTTGAA GGATGGGTCT TCTTTGGCTT TATCAAACCA ATTGGAGTGG 3300
AACTTCTTTC CTGAAAGTTC CCCCTGGGCA GGAATTGTAT CTGAGATTAG TGGGTGGGGA 3360
GGGGGGAAAC AATAAGAAGA GCTCAGAAAA TGACATCTGG GGTGATAAAT CACAGCCCCC 3420
CGAATGGTCC CATTACAAGG TCATTATAGT AAAGTGATCT CAGAATTTGA GACTAGAAAA 3480
CTAATTCAGG AAGAATGAAT ACAGAACAGA TGACAATCAT ATTAGGGTCA TAATCTGAAA 3540
TGGATCTAAG GCTGAAGACA TCTCAAAAAC ATTTCAAATC CAGTCTAGGT AGGTGTATCT 3600
TTGGGACTGG AAGGTGATTG AGGAATATAA ATAGCTGGCC AATCAGTGGC CTCAACATAG 3660
CTGATGCAAG AGTTGAGAGT GTGGCAACAG AAGAAGGAGA TCTTTACCCA ACCAAAAATA 3720
CAAGGCAGTG GGGAGGGGAG GAATGTGCCC AGCCAGTGGC ACCCTGCCAT GCCCTGCTAG 3780
GCTGCTAGCT TCACCACTGG ATTTCCCAGA GCCAGGCACA GTGCCTGGTA CACACAAGAT 3840
GGTAAATAAA TATTTATTGA ATGAAAAAAG GAAGGAAGGA ACTGGAGCCC TGACCAGCAG 3900
ATAGTTGCTG AGTAGAGCAG TTCAATAATT CGTCCTTTCA CTTGCTCAGA TTCCAGCTGC 3960
CTTAGCCACC TTCAGATGAT AAATTTGCCT TTCAGTAAAG GCTCTCCTAC AAAGAGGAAT 4020
GCCCTGGCCT CTCAATTACA GGTCGCTTGA CAGTTATGTT TCTCACTTCC AATTAATATA 4080
TCTGCTTTAA GCATCAGTTC CTTTTGCCAG CCGGCTTCTT ACATATTCAT GTGTTTGTCT 4140
CATCAATGGA GTGGTGGAGT TTCTGCATAG GAGTCATTCC TGCCTGGGTT GGAATCCTTA 4200
CTCAGCATAT TACTAACCTA TCTGACCTTG GTCCAGACGT GTTACCTCTT GAGTCTCAGT 4260
TTTCTCATCA GTCAAATGGA GACACAATAG CCTGTTTCAC AACGTTGTGG TGAGAGTTAC 4320
CTGAGACAGT GATGTATCCT GAATTCTTGC TGGAGCTCAG TAACTCTTAA TGTCTGTGCT 4380
TCTTCCTGGC TTTTCTTTTT TGGAGACCAG GTCACAAAAG ATAATATCAA GGCTGGGCGT 4440
GGTGGCTCAC ACCTGTAATC CCAGCACTTT GGGAGGCCGA GATGGGCAGA TTGCTTGAGC 4500
TCAGGAGTTC AATAACAGCC TGGGCAACGT GGTGAACCGC CCCACCCCCC ACCCCCCACC 4560
TCGTCTCTAC AAAAAATACA AAAATTAGCC AGGTGTGGTG GTGTGCACCT ATAGTCCCAG 4620
CTGCTTGGGA GGCTGAGGTG GGAGAATCAC CTGAGCCTGG GAGGTTGAGG CTGCAGTAAA 4680
CAGTGATTGT 4690