EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-00811 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr1:27847730-27851290 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs59180873chr127848634hg19
rs74606343chr127850075hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:27849870-27849881TTTTATGGCTC-6.14
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:27847997-27848015CCCAGCTTCCTTCCTGCC-6.1
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:27850828-27850846GGAAGGACTGCAGGAATG+6.29
ZNF263MA0528.1chr1:27850365-27850386AGAGGAAGGAGGAGAGAAGAG+6.34
Number of super-enhancer constituents: 46             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00861chr1:27845422-27848562Adrenal_Gland
SE_01588chr1:27847229-27850959Aorta
SE_02913chr1:27849064-27850177Bladder
SE_03261chr1:27846755-27848207Brain_Angular_Gyrus
SE_03261chr1:27848220-27851115Brain_Angular_Gyrus
SE_03939chr1:27845236-27851100Brain_Anterior_Caudate
SE_05196chr1:27845131-27856743Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05814chr1:27844227-27851238Brain_Hippocampus_Middle
SE_06945chr1:27845183-27851030Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07770chr1:27844238-27856992Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08936chr1:27848269-27848780Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_14757chr1:27847180-27856512CD4_Memory_Primary_7pool
SE_23188chr1:27847642-27849034Colon_Crypt_1
SE_24033chr1:27847701-27848561Colon_Crypt_2
SE_24711chr1:27847113-27848532Colon_Crypt_3
SE_25901chr1:27849050-27850678Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26518chr1:27843507-27857767Esophagus
SE_27625chr1:27843691-27857024Fetal_Intestine
SE_28547chr1:27843416-27856986Fetal_Intestine_Large
SE_29557chr1:27845136-27850991Fetal_Muscle
SE_31031chr1:27846218-27856799Fetal_Thymus
SE_31394chr1:27847672-27850831Gastric
SE_33477chr1:27843634-27857256H2171
SE_35950chr1:27847434-27851336HMEC
SE_36974chr1:27845141-27851091HSMMtube
SE_39896chr1:27849246-27851350K562
SE_40593chr1:27844098-27856916Left_Ventricle
SE_42106chr1:27844182-27851151Lung
SE_48058chr1:27847224-27850904Psoas_Muscle
SE_48567chr1:27844222-27851412Right_Atrium
SE_49444chr1:27847670-27848476Right_Ventricle
SE_49444chr1:27848868-27849874Right_Ventricle
SE_50130chr1:27844122-27851113Sigmoid_Colon
SE_51091chr1:27848905-27857215Skeletal_Muscle
SE_51984chr1:27847470-27849848Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52467chr1:27843721-27848576Small_Intestine
SE_52467chr1:27848710-27850530Small_Intestine
SE_54527chr1:27845490-27857100Stomach_Smooth_Muscle
SE_55184chr1:27847634-27851100Thymus
SE_62007chr1:27846487-27856737Toledo
SE_62718chr1:27801410-27856116Tonsil
SE_63223chr1:27848362-27856425GLC16
SE_63746chr1:27846637-27850471HSMM
SE_65253chr1:27843908-27851025Pancreatic_islets
SE_66890chr1:27843634-27857256H2171
SE_68682chr1:27848751-27850192H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr12784920027851044
chr12784784327847948
chr12784818027848400
chr12784840027848542
chr12784872527849287
Enhancer Sequence
AGAGGGGAAG GGACTAGCCC GAGGCCACAG AGCACTGAAT TGGATGCAAG GATTTGGACC 60
TGGAGGAGTG TCCAGTCCAT ACTATCCACT TGCTGAAGGG GCAAATAGAG CCAGAGAAGG 120
GGAGCAAGTT CCCCAAGGTC ACTCCGTGAG TCTGGGGCCA GTGTGGGCCC AGAGCCAGGC 180
TGTGCACGAG GTCCCCTGCC CAGCTGCCTC GCTTGCTCAT CCAGCCCCCT TGGTTTTGTC 240
TCCCCCAGTG AGTGGGCGCA GAACGGGCCC AGCTTCCTTC CTGCCGCCCT GCCTGCCGTC 300
TGCCACGTTG GCATCCACCC TCAGCCTTCT CGCCCCTGCT GCTGCTGCTG CTGATGCGGC 360
ATCAGCCGAG ACCAACCCGC CGAGAGTTTG CCCAGAGCAG TCAGGGCTGC CGGAGCCGGG 420
GCTGGGCTGG CTGGCTGACT CTGCCAGACA GGAGGGAGCG AGCCAGCCGG TGGAGGGAGG 480
GAACAAGGGC TGAGCCAGCC CCCAGCCTTC CCAGCCCTTC CCCACCCTCG CCGGCCAAGG 540
GAAGGAGGCA GGAAGCTGGG GTTGGGGGCC AGGGGACTGC AGTGTCTGAG AATGAGGTTC 600
CGATAGCTGG GTCTGTCTGT GGGAGCATGC ACACATATGT GTGTGCATGG AAGAGCACGT 660
TGGGGTGGTT TGTGAGTCTG TGTTTGCCTC AATGTGCACA GGTGATGATG CTATGTGTGT 720
GGGTTTGTGC CGACATCGGG GGCCACTGTG TGTTTGTGTA AGCACAAGGG AAAGCTGTAT 780
GCCCTGAGTT TGAACGCAGG CCTGTGTACA GAGACGTGCG AGATCTAGCA GTGTGTGCAC 840
ATGGTAGCAG ATGGGCACCA CGTCAGTGCC AATAAATCTT TGTATGCACA AAAGAGTCGG 900
TACATGTGCC TGAGTTTGTG TATGTCACAT CTGGGTGTGT TGGGAGCCCC TGTGATTTTA 960
TGGTGTACAA GAGGATAACA GCATAACTGT GGGTTTGAGC TTGTCTGTGT ATGTGCAAGG 1020
GACAGTGTGT GTGCAGAAGG GAACTCTGCA GGTGGCTGGG ATTTTGTGCA TGTCTTGTGC 1080
CCAGGAAGGC ACAGTACTGG TGGTGTGGGC TAGTCCAAAT GTCCAGAGGA TGGGTATGGG 1140
CGCCTCTGTG CCCAACAGAC TTTGTCTGTG TGGTTGTTGA GAGTGACTCA GGGGAACACT 1200
GTGTGACTGT ATATGCTTGG CTGTGTGTAC AGGGAACAGG CAGCACAGGC ATTGTGTTTC 1260
TGTGGTTGCA TTTACACAGG GCGGTGGCGG CGGCGGTGGT GGTGATGGTG ACGGTGCTGT 1320
GCTACAGGTT TGCACTTGTT TCTCTATGTG GCAAGGCCCT GCGTGTGACT GCGTTTGTGC 1380
GTGTCTGTGA GCACGGTGCG CTGGAAACTG CGTGCTTGGG TCTGTGGCAG GCTGAATGGA 1440
GGAGGGCGGA GGGAGTCCAT GGCTATGTTT GTACTTGTCT GTGAGCCCGG GGTCAGATGC 1500
GCTCCATGTG CTACCTCCTG TGTGCACAGG TGGCCGCTGT GTCCAACCGT GTCTTTGTGT 1560
GTTTCGGGTT GCCTGAATGT GCACAGGCGG AGGACATGGA GGGGGGGATT TGAGTGCGTG 1620
CCTGTGCAGG CCCCTTTAAC GTGGCAAGTC TAAGAAATGT CGGCCTTCTT GGCAGCGAAT 1680
CTGGGCTTGG TTCCACTGGG GGCGTCTGCA GAGAGGGGCT CTTAGAAGGG ACGTGCTTGA 1740
GCGAGAGAGA CAGGAAGGGA AGGGGGGGCC AGCCCCAGCT CGGGGTTTCC AGGAGGGAAA 1800
GCCAGACATT GGAACTTGTC AACGCTACCT CCTTCCCTGC CCCCACCTTC CACTGCTGCC 1860
TCCCCTCCTG GCGCCTGAAG GCTGCTGGCA GACGGACAGA CAGACAGACA GTGCACACAT 1920
AGACTGGCTC ATAGGCACAG AGCCCAAACC TGAGCCCCTA AATGCACAAG CCTGGACACT 1980
GAGGTCCAGA GAGGGCAAAG GAAGTAGCTG AGTCTCGGAG GAGCACATGT GTTTATGCAT 2040
GTTGGGGGCA GGGGGTGCTG TTGGCCTCTG GTGCTTCAAC CCAGACTGGA GCCCAGGCCT 2100
AGGGCGGGGA AGAGGCTGTG GAGAGCCTCT GGGGAGGGGC TTTTATGGCT CTAACCAGGC 2160
CCTCAAGGCC CCCAGCTCCT CTCCCTGTTT ATACAACTGC TGCAGTGTCT TTGAGAGTCC 2220
TGTTGCCTCA AAAAAACACC TACCGCAACT CCCTGTTTGT ACAGAGGCAG AAAAGACCCA 2280
GAGAGGAGCA GCAGCTGATC CAGGGTCACA CAGCAGAACC AGGACTGGAA TCCAGGGCTC 2340
CTTCTCCTAG CTGTGCATGT TGGCCCATGG GCCACTTAGT CTTATCTTTC CCTTGGTCCA 2400
TTTATCTTTT CTTCCTCCCA GGTCTTCGGG ATATGACAAC GACCTCTTTT TTGTGTTGCT 2460
TTTGTTGCCC AAGTGATATG TCTGTCTGCC TGTTAGTCCA TCTGTTTGTC ACAGGGCTTC 2520
AATACCCTCT GGCAGAATAC GGAAGAGAAG AGGGCTTGGT TTTTGGCCAA GGGCTATTGG 2580
AGAGATAGGG GTGGGATGGG GAGACAGAGA AACAGAACGA AAGGAATTTG AGACGAGAGG 2640
AAGGAGGAGA GAAGAGCAAG GGGAGGGCAC TGGCGGCAGA GCTGAGAAGC CCAGGCTGCC 2700
CTTTACCTCC ACCTCCAGCC TGGGCACAGG GGCGAGCTCT GAGCTCAGAG ACTCTGAGTC 2760
CTGCCTCTTG GGGCCTTGGG GAGAGGACCC CAGGGCTCCT GTAGGGTCTG GGCCCAACCC 2820
CCAAACCCTG GGGGCAGCTG GGTTGGAGTC CTGGGGTCAG TATTCGGGGT GCAGGTGTGG 2880
GGTGCAGTGA CCGAACTGCC CTCATGGGAA AAGGAGGGAG GGGATTGCAG GTACCTAGGG 2940
GGCATGAACC TGGGCATGCG TTGACTTAGT GTGTGTGGTC TCTTTGCAGC AGGGTTGTTG 3000
AGAGTGTGCG TGAGGTTGCG AGTACGCTAG GACTCTGTGT GGACACCTAT GAACATACAT 3060
GACCCAGTGG CAGACAAGCT GGGATTTCAG TGGGGAGGGG AAGGACTGCA GGAATGTGTG 3120
TCTATGACCG GCAGGGAGTG GTTGTCTATG TGTGGAAGGA TTTGTGTGAA CCTGCCTTAC 3180
ATGTTCTTGG GGAGGCTGTA TCCTGTGTAT GTAGGCAGGT GAACTGTATA GCTCTGTACA 3240
ATTGTGTGTG GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTCTGGAT GAATATGTAC 3300
CATGTGTTTG AATTGCTTAA GTATTTACAT GTTAAATGTG TAACTGCATA TAAGTGTGGA 3360
TGTGTATACA TGTTTGTAAT TGTCTTGAGG TATATGTGTG GAGTTACCTG TATGAGTCTT 3420
GCCTGTAGGT TGTGTGTGCA GTTGTGTGTA TTTGTGGAGC AGTGAATATT AGGAAGCTGT 3480
TCACATGTGC GGTTGTGTAT TTTGGGGGAT TAGGTTATAT GTGTCGTTCT TTTTGGATGG 3540
AGTTTCACTC TTGTCACCCA 3560