EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS053-00429 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Foreskin_keratinocyte 
Coordinate
chr1:16513980-16517200 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6656611chr116515805hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:16514416-16514435TGCCGCCCTCTGGTGGCTG-8.01
FOSL1MA0477.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.62
JUNDMA0491.1chr1:16514795-16514806GGTGACTCATG+6.02
KLF4MA0039.3chr1:16515443-16515454CCACACCCTGC+6.62
POU2F2MA0507.1chr1:16517059-16517072TTATGCAAATCAA-6.03
Pou2f3MA0627.1chr1:16517057-16517073CTTTATGCAAATCAAC+6.21
TP63MA0525.2chr1:16514924-16514942AGCATGTTGGCACATGCC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 21             
IDCoordinateTissue/cell
SE_23091chr1:16514094-16514451Colon_Crypt_1
SE_23091chr1:16515057-16516232Colon_Crypt_1
SE_23751chr1:16514119-16514463Colon_Crypt_2
SE_23751chr1:16515130-16516087Colon_Crypt_2
SE_24743chr1:16514042-16514476Colon_Crypt_3
SE_24743chr1:16515648-16516115Colon_Crypt_3
SE_24743chr1:16516242-16516615Colon_Crypt_3
SE_26540chr1:16513910-16517815Esophagus
SE_28102chr1:16515172-16516184Fetal_Intestine
SE_29455chr1:16515096-16516063Fetal_Intestine_Large
SE_31527chr1:16515204-16516074Gastric
SE_34268chr1:16514127-16516193HCT-116
SE_34628chr1:16513819-16517068HeLa
SE_36144chr1:16514154-16516161HMEC
SE_47150chr1:16512880-16515228Panc1
SE_50427chr1:16514084-16516281Sigmoid_Colon
SE_52536chr1:16514970-16516287Small_Intestine
SE_56795chr1:16513668-16515000VACO_400
SE_64726chr1:16514111-16515805NHEK
SE_65472chr1:16514077-16514502Pancreatic_islets
SE_65472chr1:16516042-16517079Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr11651535416516020
chr11651402316516800
chr11651634816517102
chr11651414216514842
chr11651710616517195
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH01I016189chr11651624316516615
GH01I016187chr11651384116516098
Enhancer Sequence
AAGTATAAAA AAAATTACAC CAATATAAAG AATGGATACA TTATGTGAGT TACTGTGCCA 60
TGTGATAATG AAGTTCAAAT TGTAAATACA ACCACTAACT ATTTCTGTGA TTCATATTTT 120
TATATAAGAA AAATAAAAAG AAGAAGAAGA ACTTGACATG AAGGACTGGG ACATCATAGG 180
ACCAAGGGGG TGGTCTCTGG AGCCTCTGAG CATGTTTCAG ACTTAGGAAC CCTCACAGCT 240
GAGGCCAGGA CTGGCCATGT GCTCCTGTCT CCAGGGCTCT ATGCCCTCCC TTCCCTCTAC 300
CCAGCCCACT GCCCCTGCCC CTACTCCCTA CCCCTGCCCC ACAGACACAG CCAAGCCTCA 360
GGAGGACTCA ACCCACAGGA ATGTGGGCAA TGAGCAGGCT GCGCTCGGAG GACCCCGCTA 420
TCCCAGCCCT GGGCTCTGCC GCCCTCTGGT GGCTGGGCTG GGAAGGATGC TGCTCCCATT 480
ACTGCCGTTG TAGAACCGCA ATTGCCCTAA AAAAATAAAA TGCTGTTGCT GCTACTCATG 540
ATGATGACGA TGATGGCGAT GACGATGATG ATGATATTCA TTGCTTTATG GTTTGCCAAG 600
TACCTTCTCC GTCAATCATA GGCTGCACCA AACAGAGTGC AGGGTTCTGG ACTGAAATCA 660
GATGGGAATG TAAGTCCCTA GTCAAGTTCC AACTGATTAT GTGACCTTGG GCAAGTCATG 720
TCACTTCCTT GAGCCTCAGA CTCCTCATCT GTGGAACGGG GTGACAAAAA TAGGGTTGTT 780
ATAAGGATTA AAAGACCTAA CACCTGGCCG GGCGTGGTGA CTCATGCCTG TAACACCAGC 840
ACTTTGGGAG GCCGAGGTAG GAGGACTGCT TGAGCTCAGG AGTTTGAGAC CAGCCCGGGC 900
AAATGGTGAA ACCCCACCTC CACTAAAAAT ACAAAAAATA GCCAAGCATG TTGGCACATG 960
CCTGTAATTC CAGCTACTCA GGAGGCCGAG ACTTGAGAAT CGCTTGAACC CAGGAGGTGG 1020
AGATTGCAGT GAGCCTAGAT CACACCACTG CACTCCAGCC TGGGCGACAG AATGAGACTC 1080
TGTCAAAAAC AAAACAAACA ACAACAACAA CAACAAACCA TCTATTGAAC TAAATTGGCC 1140
TCCAAAATAT ACCCTTCTGG AATTTAGGTG GCTATTAAAA GACCTAACAC CTGGCACTTG 1200
GGTTGGAGAG AATAACATGG CTGTCGTTAT ATACTAATCC TTGGCCAGTC TGTCCTGGGA 1260
GATCAACTCC CCTTTGCATA GGGCTTTTTC GAAGTCCTTT TCCAAGGCAT CACCTTCTTG 1320
TAGCTGCATT ATCATGCCCG TTTACCAGAT GAGGAAACTG AGGCTCAGAG AGGGGAAGCA 1380
GCTTGCCTAG AGCATCGTGG CTTATAAGTT AAAGCAAGAC TCAAGCCAGG TCCACCTGCC 1440
TCCAAACCCG GTGCTGGACT TTCCCACACC CTGCTTTGGA AACTCTAAGG AACCTTCCAA 1500
TCCCCCAAAT CCTATTGCCT CATTTAAGTA AAGCAGGCCT GGTTTCTGCC TCCTTCAGTG 1560
CCCCTCTTCT CCTCCCACAC CCTTCCAGCA GCCGAAACGC TAGACCCAAT AGCTTACCCC 1620
TTCCTCCTTC CTGACCAGCT CCCAACCCTC AGGGCAGCTC ATGAGCCAAG AGCTTGAGAG 1680
TGGCTTCCAA AGGTCATCCT CTCCACCCCG CTGTGCCCCA CCCAAGCAGA TGACTGTTCA 1740
TCCTGTTCTT CACGCTGCTC AGGGGAAGAA ATTCCCCAGC TTCACTCCCT CCACTCGCCC 1800
AGGTGTCTGA GACAGTTCCC ACAGTTGGCA AACTCTGCCT TAAGTCCCAC CAGAGTCCCT 1860
CCTGCTACAA CGTCAGCCCA TTTATTTTAG TTCTTTCTCC CAGTAGCATC AGAAATACAA 1920
TCTGGGGGGA GACAAACGCC GGGAGAGTGG GATCCTGGGA AGGGGAAGGC ACACTTGGGG 1980
ACAGGAAGTG AGAGCAAACC CAGGTTCAAA TCCCGGTCAG GGTGACAAGA GTGGCCAAGC 2040
GAGGCCAGGC GCAGTGGTTC ACACCTGTAA TCTTAGCACT CTGGGAGGCT GAGGGGGGCA 2100
GATCACTTGA GGTCAGAAGT TCGAGACCAG CCTGACCAAC ATGGTGAAAC TCCGTGTCTA 2160
CTAAAAATAT AAAACTTAGC TGGGCGCTGT GGTGGGCGCC TGTAATCCCA GCTACTCAGG 2220
AGGCTGAGGC AGGAGAATCG CTTGAACCCA GGAGGCAGAG GTTGCAGTGA CCCAGAATGG 2280
TGCCACTGCA CTCTAGTCTG GGCGACAGAG TGAGACTTCA TCTAAAAAAA AAAAAAAAAA 2340
GAGCGGCCCA GTGGGTCTCC TGGTGTCCAG GGCAGTCTCA GCCCAGATGG GGCAGCCCCG 2400
CCCACAGCCC GAGGGCATCC AGACCCTCCA CCCCACCATA CTGGCACCAA GTAGCTCAAA 2460
TGAGGGAAGA GAGCTGGGGT GGGACTTGGA AGCAGAGCGG GTCTGAGGGG CAATTATGAG 2520
CTCGGGCTCA GGGTTCATGC AGAGCCGGGC TCAGACCCAG CAACAAATAT TCACTGAGCT 2580
GCTCCTGGGT TCCAGGCATG GCAGTTGGCA ATGAGGCCAC AGCACTGGGA AGACAGCCAG 2640
AGGCCCTTTC TTCATGGATT TCACGGTCCA GTGGGGGAGA CAACAGAAAA CAGGTCACCA 2700
CATGGATCAA CAAGGAATCC CAGAGTGGCC ACTCGGCTCT GCACTGTCCC CCTCCTGTCA 2760
CCTCCATTTC AGCTCTCAGG ATGCAGCTTC AGTGGCACCA CCTCCAGGAA GCCCACCCTG 2820
ACTGCCAGTG AGGACAGGCT GCTCCCTTAT TTGTGCCCCC ACAGCCCCAC AGTTTGCACT 2880
GTGTAAGCTT TCAGCTGAAA TTTAACTCCC ATGCAGAAAA GCACACAGAT CTTAGGCGCC 2940
CAGCCTGATG GACTGGTCCC AAAGTGCACA GCCCTGTGGA AGCAACATCA GCAGTCCCTC 3000
CCTAAGCAGT CACTACTTCA GCTGCAGGCG CTCCCCACCC TGACCTCGAT CCATCAATTA 3060
GTCTGCCTGG TTTTGTACTT TATGCAAATC AACTAATTTG TTTTGTTGTT GTTTTTTTTT 3120
TTTTTTGGCG TCTGGCTTCT CTCACGTTCA GTCTAGATTC GCCTATGCAG ACACAGACAG 3180
TACTTGTAGT TGTAGACAGT TTAGTCTCGT GACTGTGTAG 3220