EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS052-00749 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fibroblast_foreskin 
Coordinate
chr1:28572950-28576930 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CTCFMA0139.1chr1:28575155-28575174TGGCCTGCAGGGGGCGTTG+6.36
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:28576301-28576319TGAAAAAAGGAAGGAAGG+6.84
Gfi1bMA0483.1chr1:28575846-28575857AAATCACAGCC+6.02
Nfe2l2MA0150.2chr1:28575358-28575373CATAATGACTCTGCA+6.15
PHOX2AMA0713.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr1:28575669-28575680TAATTGAATTA-6.14
RUNX1MA0002.2chr1:28573301-28573312AAACCACAGAG-6.14
SOX10MA0442.2chr1:28575393-28575404TTCTTTGTTTT-6.62
Sox6MA0515.1chr1:28574936-28574946AAAACAATGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15081chr1:28571965-28577001CD4_Memory_Primary_7pool
SE_21005chr1:28572183-28576988CD8_Memory_7pool
SE_29182chr1:28569155-28576849Fetal_Intestine_Large
SE_40167chr1:28572835-28576978K562
SE_64750chr1:28572499-28577008NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr12857601228576248
chr12857656028576686
chr12857420028576885
chr12857355328576556
Enhancer Sequence
CAAACTACAC ATCTTTCCAG ATCTTTGTTT CCTCTGTGTA ACTATGTATA CAACTATGAG 60
ACTGTTCTAT ATGTATCATT GCGCAACCTC GGTTTTTGCT TCGTTCTGTT TTAACCTAAC 120
AGGAAATCCT GCATACCTTT CCATTTCAGA GCACTTGGAG CTACCTTCTG TTTCTTTGCT 180
GTAGAAGCCG TTGTGTGAAC AAATCCGTTT ATTTCTCTCA TCAGTCTCCT TTGATAGACA 240
TTTGGGTCAC GTCCGGTTTT ACGCTTTTAC AATACATCAG TGAACAGCAG TAATACGAGC 300
TCAAGACAGA AGGCCTGAAA AACATTGAAA AACACAGAGA CGGAAAAAAA AAAACCACAG 360
AGGGGGAAAT ATAATTTCGG GTTATTTCAG TTTCACCTTT ACACTTTGTT ATATTCCACA 420
TTTTTTGCAA TAAATATAAA TTTGGAAGTA AAAGCATAAA ACGAAAATCA AACGATTGAT 480
TGATTGATTG ATTGACTGAG ACGGAGTATC ACTCTCGTCG TCCAGGCTGG AGTGTAGTGG 540
CGCGTTCTCG GCTCACTGCA ACCTCCGTCT CCCGGATTCA AGCGATTCTC CTGCCTCAGC 600
CTCCCGAGTA GCTGGGATTA CAGGCGCCCG CCACCACGCC CGGCAAATTT CCAAACGTAT 660
ATTTAAAAGA AGAAAAGGAA AAGAGGGGAA AAAAAGAAAG AAAGAAAGAA AGAAAGAAAT 720
TAGAAGCAGA TGGGGCAGTT CAGCCTCTTC TCGCGGAGCG GGGCTAGACG GAGTCAGGGG 780
CGGACCGCCA CAGCCTGCAC CAATCAGGAC CCGGTTGATA GGCAGAGCCT GGCGACTTCG 840
AAGACTCGCC CCCAGTCAAA GAGCCCCGGG GATTCGTTTC CGTACGCAGC CTGGAAACCA 900
GCCTGGGCCT ATCCTGCGCG CCGCTGCGGG CTACTATTGG CTGCCAAGAA ACCCCGCCCA 960
TCTTCCTGCT CATTGGCCGG TGCGGTTTAC GTAAGAGGAG CCTGTTGCTG AGCGAAAAGT 1020
CTGTTCTGCA ATTTTCGCTA AGGAGTTGTT AACGCTGAAA CCGCACTGGG CGTCCTGGGG 1080
TCAAAAAAAC AATACTAGCC ACAGTTTATT AAACTGCAAC TAAATGCCAG GCTATGTGCG 1140
CCAAACTTTT AATATTAATG GTTGTAGGCA CCTTTCTTGA ACACCCACCA CTATCAGCCA 1200
GTCACTGAGC CAGATCCTTC AAAATAACAG TAAAAATATA GATAATCTAC AGTTTATTGA 1260
GCACTTCATC TGCATCAAGC CTTGTTAAGG GGTTTCCATG CATAAGCTCT CATTCTCACA 1320
ATAGAACGGT GGAGGTAAAC TATTGCCCCA TTTAACATTT AACATGCAGT CCTGTAGACC 1380
CAGCTACTCG GAAGGCTGAG GTGAGAGGAC CCAGGAGCTC CAAACTTAAG TGAGCTATGA 1440
TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTGGGCAACA GAACGAGACC TGTCTCAGAA AAACAAAAAC 1500
GTAATAAAAG AAAAACAAAA ACAAAAAAAC AGGAAACGGG TTCAGAGAAG TGAAGTGTTT 1560
TGCTGAGGTT CACAAAGAAA GGGTTGGAAC TGGAACCTTC AACTCCGATA TCCTGATTCC 1620
AAGTGTGGCC TTTTTAGGGA GGGGGTCGGG GTACAGAATT CCGCTGGGGA TAGGGAAAGG 1680
TAGGACAGGA TGGTGGGAGG CCAGAGGCGT TGCTCCAGGG ACAAGCCTCA GGGTGGTTCT 1740
CTGAGAATAG GATGTATAGA GCCTCTAGGA GTGGAGGGTT GGGGAAGGAA GGGAGACCAG 1800
AGGAAAGGGA GAAGTTGTTC TTTCTGAAAA TGTGAGGCTT CTCTCCTGGG GCAGCCTATT 1860
AAGGTGTAGG TAGCCCTGGA CCTCGAGATT CTAGTCTCCA CTCTGTGGCC AACTTCCTAG 1920
GGAACCTTGG GCAAATTCCT CTCTCTCGAC CTGAGGCTTC CTGCCTTGTA AGAGAGGTAG 1980
TAAGCCAAAA CAATGGAAAG TGCATTCGGG CTGTGAAGTA TTTTAGGACT CTGGTCCTTG 2040
CTGGCAGCAG GGGGAATCTT CAGCAACCAC AGACCTTTAC TTAGCTGTTG CCTGGCCTCT 2100
TTTCAAGACC TTCAGGCGGT GACATGGACC CTAACAATCC TATAAACTCA AAACGGTTTG 2160
GGCCAGCCCT TTCCTACTCC ATTCTGACTT AGCTATAGCA GGATCTGGCC TGCAGGGGGC 2220
GTTGAGGAAC CACTCAGCCG ACAAAACTAA ACTAAATCAA CCAAGCAATT TGCCCAAAAG 2280
CACCCAGTGC GTTAGTTTTT GCATTTAAGA AGGGTAAACG TTTCCAAACC TGAAGATTTC 2340
TGTCCTCAGT ATGCAATCGA GAAGACGAAT TATATACACT GCCAGTTCTT TATGGCACCA 2400
GTTCTCTCCA TAATGACTCT GCAAGTTTAG AGCTAATTTC TATTTCTTTG TTTTACAGAT 2460
AGGGAAACAG ATTCAAAGAG CTGGAAAAAA AAAATTCAGT TTGGGTTACT TGGCTAAAAG 2520
CTGGCACCCG AATTGCCTGA CTCCTGGGAA GTGCTCTTAG GAGATAGTTG GCTTTGTTTC 2580
TGGGAGTCTG TGGTTGTACT GCCTGCTAAT GCACAACTCC AAAGGACAAT TTTGGTTGTG 2640
TAGCTTGACA GCTCGGCACC TGTCAGCTCT GTGCAGGAAG GACCTCCCTC CCCACCTAGC 2700
ACAATGCCTG CTTCATGAGT AATTGAATTA ATGTGTGACT AAGCCTTGAA GGATGGGTCT 2760
TCTTTGGCTT TATCAAACCA ATTGGAGTGG AACTTCTTTC CTGAAAGTTC CCCCTGGGCA 2820
GGAATTGTAT CTGAGATTAG TGGGTGGGGA GGGGGGAAAC AATAAGAAGA GCTCAGAAAA 2880
TGACATCTGG GGTGATAAAT CACAGCCCCC CGAATGGTCC CATTACAAGG TCATTATAGT 2940
AAAGTGATCT CAGAATTTGA GACTAGAAAA CTAATTCAGG AAGAATGAAT ACAGAACAGA 3000
TGACAATCAT ATTAGGGTCA TAATCTGAAA TGGATCTAAG GCTGAAGACA TCTCAAAAAC 3060
ATTTCAAATC CAGTCTAGGT AGGTGTATCT TTGGGACTGG AAGGTGATTG AGGAATATAA 3120
ATAGCTGGCC AATCAGTGGC CTCAACATAG CTGATGCAAG AGTTGAGAGT GTGGCAACAG 3180
AAGAAGGAGA TCTTTACCCA ACCAAAAATA CAAGGCAGTG GGGAGGGGAG GAATGTGCCC 3240
AGCCAGTGGC ACCCTGCCAT GCCCTGCTAG GCTGCTAGCT TCACCACTGG ATTTCCCAGA 3300
GCCAGGCACA GTGCCTGGTA CACACAAGAT GGTAAATAAA TATTTATTGA ATGAAAAAAG 3360
GAAGGAAGGA ACTGGAGCCC TGACCAGCAG ATAGTTGCTG AGTAGAGCAG TTCAATAATT 3420
CGTCCTTTCA CTTGCTCAGA TTCCAGCTGC CTTAGCCACC TTCAGATGAT AAATTTGCCT 3480
TTCAGTAAAG GCTCTCCTAC AAAGAGGAAT GCCCTGGCCT CTCAATTACA GGTCGCTTGA 3540
CAGTTATGTT TCTCACTTCC AATTAATATA TCTGCTTTAA GCATCAGTTC CTTTTGCCAG 3600
CCGGCTTCTT ACATATTCAT GTGTTTGTCT CATCAATGGA GTGGTGGAGT TTCTGCATAG 3660
GAGTCATTCC TGCCTGGGTT GGAATCCTTA CTCAGCATAT TACTAACCTA TCTGACCTTG 3720
GTCCAGACGT GTTACCTCTT GAGTCTCAGT TTTCTCATCA GTCAAATGGA GACACAATAG 3780
CCTGTTTCAC AACGTTGTGG TGAGAGTTAC CTGAGACAGT GATGTATCCT GAATTCTTGC 3840
TGGAGCTCAG TAACTCTTAA TGTCTGTGCT TCTTCCTGGC TTTTCTTTTT TGGAGACCAG 3900
GTCACAAAAG ATAATATCAA GGCTGGGCGT GGTGGCTCAC ACCTGTAATC CCAGCACTTT 3960
GGGAGGCCGA GATGGGCAGA 3980