EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS052-00340 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fibroblast_foreskin 
Coordinate
chr1:16291760-16294040 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:16293019-16293037CTTTGCTTCCTTCCTTTG-6.33
Lhx3MA0135.1chr1:16293413-16293426TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293417-16293430TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293410-16293423AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293414-16293427AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293418-16293431AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:16293409-16293422AAATTAATTAATT+6.92
POU6F1MA0628.1chr1:16293411-16293421ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:16293415-16293425ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:16293419-16293429ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:16293411-16293421ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:16293415-16293425ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr1:16293419-16293429ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01987chr1:16292569-16293307Aorta
SE_02709chr1:16291780-16293317Astrocytes
SE_03452chr1:16291596-16293383Brain_Angular_Gyrus
SE_04408chr1:16289595-16293617Brain_Anterior_Caudate
SE_05249chr1:16287827-16297050Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06124chr1:16286945-16296922Brain_Hippocampus_Middle
SE_07342chr1:16287975-16297074Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08131chr1:16288406-16296945Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_18522chr1:16289418-16295180CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19255chr1:16289594-16294260CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_27189chr1:16292277-16293531Esophagus
SE_38820chr1:16291637-16293540HUVEC
SE_45001chr1:16292008-16293377NHLF
SE_45986chr1:16291429-16293624Osteoblasts
SE_55849chr1:16288535-16295464u87
SE_61132chr1:16274043-16303645HBL1
SE_67570chr1:16288535-16295464u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr11629178416292062
chr11629189116292149
chr11629237116293174
chr11629249316293407
chr11629256516293101
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I015961chr11628819916293984
Enhancer Sequence
ACAAAATGTC TACAAACCAC CCAATAGAAA AATGAGCAAG ACAATCTGTT GTTTCCGAGA 60
AGATGAAATC TGAATGATCA GTAAGCAACG AAAAGATGCC CAACTCAGAA CCAGGAAAAT 120
GCAAATCAAA ACCACATGAG ATGTCATTGT ACGCCCACCA GATTAGTAAA AATGTTGAAG 180
TCTGAAAATA CCATTGTTGA GAGGATATGA GGCAAACGGA ATTGTTGAAG GGTAAACTGG 240
GGAAACAGTT TTGGCAACAA CTTGGCATTA TTTGTTAAGT TGAAGACGCA CATACCCTGT 300
GACTCCACTC CCAGCTGCAG TCCCTGGAGA GGCTGTGCAT ACATGTCCCG GGAATGTGAA 360
CAGTGGCACT GTTTGTCTCA GCAAAATACT GGAAACAACC CAAATGTCCA CCAGTAATAG 420
AAAGGATAAA TAAATTCTCA TACAATGGAA CATTATTCAT CTGTGAAAAT GAAATACCAC 480
TCTATGCAAC GTGGATTAAT GTCAAGGCAC TGAAGAAAAC AATATGATTA TATTAAGTTC 540
AAAAACCTGC AGAATTAAAC GGTACATTGT TTAGCAATAC AAACACATGG TAAAACTATA 600
AAGAAAAGCA AGAGTGATAA AAGCAAAACT CAGGGATGAC TTGGGCCGGG TGAGATCAGG 660
GAGGGGACAC AGGGGACTCC AAAGGTAACA GTAAGTTCTT TTTGGAAACT GGGTAATGGG 720
TACATGGAAG ATGTTTCTTG TATCCTTATT CTTTACACTG AACACATTCT TTTGTATGGA 780
GTCAACATTT AACAAAAACG ATTTACAAAA TTAAACAAGT TCTTTCTTAC TTTAAATCAT 840
TTGCCAAGCA TTAATTTGGG CTGCTGACTG AGTCACAGTA ACGGGGGAAA ATCCCTGAGG 900
GGCCCACATG GCCCCGAGAC TACAGAAATG AGAAGTGCTT TGCTCTCTGA GCTCTGGTGA 960
TACAGCTTCC CATGGGGCAG GCTGGCGAAA TTCGAGTGGA GCCTGCCACT CGGGACAGGA 1020
AAGTGACTGC TTAGGTTAAT AAGTTCCAGT ATAGGAAGTG GTGCGGCTGG GGTGGGGAGA 1080
ACAGATTCTA CTGCCAGACC TTTCAAGACC AGAAGCTGAG TAGATTTTTG ATGTTACAAT 1140
GAACCCACTA AGCCTGCTTT CTGGCCCGCT CTCCACTCGC AGCGGGAATT CCCACCTCTG 1200
AGCCTCTGTC CACACTGCTG TTTAGATATG AGTGAACAAC TCTCAGTTCT AACCATGCCC 1260
TTTGCTTCCT TCCTTTGAAG CCCAGCCCTA CGAACCATCT CTCTTCAATT CATAACAAGC 1320
ACGTTTGAAT CCAAGAGCCT AAGCCCCAGT TTTCTACACG TATCTGTGCT GACTGCATTA 1380
CTGAGGTCAA CCTTAATCAC CCTGGGACTG TCAAACTATT GATGTCCATA AGGATTCTCT 1440
GTGCTGGCAT TCCACACACA CGCAGCAAGG TTCAATGAGC CACAGTACTT ACTCTCTGAC 1500
CTCTATTATT TCAACCATTT AAAAATTGTG GCCACGGGAG GCTGAGGTGG GAGGATCGCT 1560
TGAGCCCTGG AGGTCGAGGC TGCAGTGAGC TATAATCCCA GCACTGCACT CCAACCTGGG 1620
CGAAAGAGCG AGACCCTGTC TCAAAAATTA AATTAATTAA TTAATTAATT AAAAAACAAA 1680
AAAAAAAGCC GTGGCCAGCA AAAGAAGTAG ATTATGATCT CCAGGACAAT ATGTTTTGTA 1740
CATAAAATGT ATTTGGAGTT TTTTGTTTTC ATTAAAGTTG AGGTCCCTCC CTACTGTGAT 1800
GTCAAACCCA ACAATGGGTC ACCCCACAGG ACACCACCCC TGCTCGCACC TGTAATCCCA 1860
GTCCTTTGGG ATGGCGCAGG TAGGTGGATC ACTTGAGCCC AGGAGTTCAA GACCAGCCTG 1920
GGCAACGTGG CGAAACCCTA TCTCCACAAA AAACAGAAAA ATTAGCTAGG TGTGGTGGTG 1980
TGTGCTAGTA GTCCCAGCTA CTTGGGGGGC TGAGTCAGGA AGATCGCTTG AGCCAGGGAG 2040
GTCGAGGCTG CAGTGAGCTA TGACAGCTCC ACTGCTCTCT AGCCTTGGCC ACAGAGCAAG 2100
GCCCTAATTA AAAAAAAAAA GTGTTATATG AGGCTGGGTT TGGTGGTTCA AGCCTATAAT 2160
ACCAGCACTT TGGAAGGCTG AGATAGATGG ATTGCTTGCG CCCAGGAGTT TGGGACCAGC 2220
CTGGGCAACA CGGCGAGATT CTGTCTCTAC CAAAAAAAAA AAAAGTTTCC TGGGAGGAGA 2280