EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-24369 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr6:159514220-159516420 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs2451279chr6159515077hg19
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr6:159514271-159514284TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr6:159514275-159514288TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr6:159514268-159514281AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:159514272-159514285AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr6:159514267-159514280AAATTAATTAATT+6.92
Lhx3MA0135.1chr6:159514276-159514289AATTAATTAATTT-6.92
MEF2CMA0497.1chr6:159514924-159514939TGCTATTTTTATCTC-6.5
MYCNMA0104.4chr6:159515339-159515351AGCCACGTGGCC+6.37
MYCNMA0104.4chr6:159515339-159515351AGCCACGTGGCC-6.37
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr6:159514497-159514512TGAACTCCTGACCTC-6.22
POU6F1MA0628.1chr6:159514269-159514279ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:159514273-159514283ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:159514277-159514287ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr6:159514269-159514279ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:159514273-159514283ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr6:159514277-159514287ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_09549chr6:159513035-159515645CD14
SE_10173chr6:159514479-159517397CD19_Primary
SE_10987chr6:159513188-159522109CD20
SE_20562chr6:159514752-159517112CD56
SE_31171chr6:159514458-159516319Fetal_Thymus
SE_58493chr6:159513038-159556459Ly1
SE_60016chr6:159500763-159541903Ly4
SE_60871chr6:159514584-159530140DHL6
SE_61983chr6:159459565-159539725Toledo
SE_62256chr6:159453721-159556647Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr6159514738159514976
chr6159515330159516164
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH06I159093chr6159514580159517404
Enhancer Sequence
AATCATGATT CCTTCCCTTT GTCCATGAAG GCTGGCAGAT TTTTTAAAAA TTAATTAATT 60
AATTAATTTT TTTTTTGAGA CGGAGTCTCG CTCTGTCACC CAGGTTGGAG TGCTATGGCT 120
GGATCTCAGC TCGCTGAACC TCCACCTCCT GGGTTCAAGC CATTCTCCGG CCTCAGCCTC 180
CCGAGTAGCT GGGATTACAG GCGCCCGCCA CACACGCCTG GCTAATTTTT GTATTTTTAG 240
TAGAGATGGG GTTTCACCAT GTTGGCCAGG TTGGTCTTGA ACTCCTGACC TCAGGTGATC 300
TGCCCGCCTC TACCTCCCAA AGTGCTGGGA TTACAGGCGT GAGCCACCGC GCCCAGTCGA 360
GGCTGGTGGA TTTTAAACCT TTCTGCTACA TTATAAACTC TCTGAGAGCT TGGACTCTGA 420
CTCCAGAGTA TGGCAAAACG GCTTGAGTGG AGCAGACCCT CTGTGTGCCG GGAGCCATTA 480
GCTAATAAGT GATTGAGATT CATTTCAGGC TGGTGGAGGA GACTGAGATC TCTTCTCTGG 540
TCTTCTCTTT TTGTGAGTGG GTGGGGCCTC AACCCTTCTT GGAAAGCACA TCAGAAAGCG 600
ACTCTACTTC ATAGGAAACA CTGCACACAC GTGCCAGCCG GTTCTAAACT CTGATCTTGT 660
AGTTATTCTT TCAATCCCCA CCCCAATCCA TCCTGTGAGG AAGATGCTAT TTTTATCTCT 720
ACAGACGAGA AGACAGAGAC ACATAGAGCT TAGTCACAGT TGGTAAATGG CGGAGAGGAG 780
ATTCAACCCC CGCCTGGGTT CCAGAGTCTG CGCTTTGATC CAGTTTCCCG GGGCCATGTC 840
CCCCAGCATG GAGAAGAGCT GGCTCAGGAG GAGGGGGCAC AGCCTCCCAG GTGGTCGGAG 900
CAGCGCGGGC GGAGGCGCAG AGGCAAGAAG GAGCTGGTCT CTTTGAGGGC GAAGGCGGTT 960
CATAGGGTGT GTGCACATCT AATCCCTCTC CTTCGAGAGT GCCGCCACCC TCATTCTTAG 1020
GGAAGGGGCG GGGAAGGGTT CCTGGGATCG TCATCCTACC TAAGCACCCC AGTGAGTGTT 1080
CAGTTCCCTG CCGCAGCTAG TGCCCTGTGC CCAGTGGGAA GCCACGTGGC CAGGCCTAGC 1140
GAGATCTCCG GGCGCGGTGG CCCGTGTGTG CCTCTAGCCA GGCCGCCGTG GCCAGGGCTT 1200
GGTGGTGTGT TTGACGCTAA CCTTCCATGT CAACTCTGTG CGTTTCCCCA ACACCCCGCA 1260
CTGACCCTGT CCTCCTGGCT GCTGGTGACC CCTGACTCCC TGCCTCCTGA CTGCTGGTGA 1320
GCATGCTGAG TCTGTTTAGA GGGGCGACTC GGGGAGTTCC TGAATGCAAA GTGAGGGGTG 1380
GTTCAGGCCA CACACCTGTG AGTGCCCTGG GTACCAGCCC GCGGCCCAGA GCCTGGCTCA 1440
GGAGCTCAGC TGGGGCGCTC GCGGAGACTG TGACAAGTGT GCGTTCTGAG CCGTGGCAGG 1500
ATTTCCCCAG CTGCTGTTTG TGCCTCCCCG GGGCTTTCTC AGGTCTCTGA AAACAACATA 1560
TCCCGGGCTG GGATACGGGG GGAGGATGCC AGATGGGTTT TGAATTCTTT GAAATCTCCA 1620
AGCACCTAAA AAAATAATCA CGGTGGGTAG GTGTGGGAAG CTCTTTAAAA TGTGGCACAT 1680
TTCCCCCAAA GCTTAAAATA GAGCTTTTCA AGGGAAATTA AATGGAAGTA TAAAAATATG 1740
TAAATGCTCT TCCTTCCTAC AAAACAGAAA TAATGTTACA GGCATCACCC CGGGGCCCCA 1800
GGCCCCTCCG TAGTCAGCAC CAGCAGTGCC AAATATGGCC CATGGCTCTG GGTTTCCTCC 1860
CTATATTGAC TCTGACCAGG GACATCAACA CTTCCCCCAG GGGACCCCAC TATTTCTCTG 1920
ATATGTTCTA TTTGCCTAAT GTCTGTGTTT ATCCCTCGTT TTTTTGTTTT TGTTTTTAAA 1980
CTAGTGTGGG ATTTTTAGAA GGTTGTCACA TGTTCCTTGG GCCTGTAGGT TTCTTTGTGA 2040
AAAATATACC ACGTCCTGGG AGTTGTGGCT CCAGTCCAGA GGCTGCTCTA ATGCACACAT 2100
TGAGGAGGTG TTCATTGCAG AGCTTCCCAA AGAGAAAAAT GGTGCAGGTC ATGTTAACTC 2160
AGTTATCGAC TTTCTCAATT TCTGATTTCA ACTTTATTGC 2200