EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-20885 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr4:40214950-40217710 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr4:40216201-40216212AAGAGGATTAG+6.62
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:40217114-40217132CCCTCCTTCCTTTCCTTC-6.26
HNF4GMA0484.1chr4:40217599-40217614TGGACTCTGACCTTT-6.07
Hnf4aMA0114.3chr4:40217597-40217613GGTGGACTCTGACCTT-6.13
IRF1MA0050.2chr4:40214968-40214989CTCTCGTTTCTCTTTTTTTTT+6.27
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:40217332-40217347GAGGTCAAGAGTTCA+7.64
Nr2f6MA0677.1chr4:40217606-40217620TGACCTTTGACTTC-6.67
RARAMA0729.1chr4:40217332-40217350GAGGTCAAGAGTTCAAGA+6.45
RxraMA0512.2chr4:40217606-40217620TGACCTTTGACTTC-6.37
ZNF263MA0528.1chr4:40217115-40217136CCTCCTTCCTTTCCTTCCTTC-6.68
ZNF263MA0528.1chr4:40217118-40217139CCTTCCTTTCCTTCCTTCTCT-6.69
ZNF263MA0528.1chr4:40217102-40217123TCCTCCCTCGCTCCCTCCTTC-7.44
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_10329chr4:40215716-40216705CD19_Primary
SE_10959chr4:40191443-40249782CD20
SE_11827chr4:40213035-40217061CD3
SE_14402chr4:40193769-40216813CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15401chr4:40213088-40215608CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15401chr4:40216008-40216650CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16318chr4:40212916-40215268CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16318chr4:40215530-40216944CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16853chr4:40193904-40217325CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17299chr4:40190968-40235584CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17767chr4:40191375-40225023CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18266chr4:40191435-40224711CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19152chr4:40211526-40217426CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20751chr4:40215621-40216927CD8_Memory_7pool
SE_21487chr4:40214028-40217046CD8_Naive_7pool
SE_21915chr4:40212046-40217910CD8_Naive_8pool
SE_22292chr4:40191558-40250023CD8_primiary
SE_25424chr4:40213145-40215231DND41
SE_31036chr4:40215967-40216581Fetal_Thymus
SE_58296chr4:40151405-40268478Ly1
SE_58875chr4:40171449-40215497Ly3
SE_60449chr4:40179676-40229305DHL6
SE_62215chr4:40173915-40268314Tonsil
SE_68018chr4:40190441-40215679TC32
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH04I040212chr44021409940217799
Enhancer Sequence
TGACTTCTCT CTCTCTCTCT CTCGTTTCTC TTTTTTTTTT TTTCTCTCTC TCTCTCTCTC 60
ACACACACAC CCATCTTGGG CCAGGTTTGT AAAGCCTCAT GGGAAATGGA ACACGGAAGA 120
GTCTTCTGGG AGGTTTTAAA ATTTAATTTT AGTCAGATTT AGTAAGATTT CTTCATACAA 180
AACAAAACAA AAATTCTCTA AAAAAAATCC TTGTTAGGGT CTGGTTAAGA CAACTAATAA 240
CAACAGATGT GAGGGCATAG TTCCTAGTTA CCAAAGAATC GCTCTGGTGA GAGAGGAGTG 300
GAGGCAAAAA TTCCAGATGG TACCTGGGTA GCGATTGCAC TCAGATGGGT CATCTGAGGA 360
CAGCTGCCCT AGACCGCTGC TCCTGAGCCT CTCCATTGTA ATTTTCCTTC TTCTAGTTCC 420
TTTTTAAAAA TTTTTCTTTT TTGTTGAGAT AGAGTCTTGC TCTGTCTCCC AGGCTGGAGT 480
GCAGTGGCAT GATCCCCAGT CACTGCAACT TCCGCCTCCC AGGTTTAAGT GATTCTCCTG 540
CTCAGCCTCC TGAGTAGCTG GGATTACAGG TGTGTGCCAC CACGCCCGGC TAATTTTTGT 600
ATTTTTAGTG GAGACAGGGT TTCACCATGT TGGCCAGACT GCTCTCAAAC TCCTGTGCTC 660
AAGTGATCTG CCCGCCTCAG CTTCCCAAAG TGTTGGGATT ACAGGTGTGA GCCACTGTGC 720
CTGGCCTAGT TCCTTTATTT TAAAAGCTTA AATGCATGAA GCATACAGTA CTGTGAAGAC 780
TTGCTTGATG TGATGCAGGT TCCTTAATCT CCTCCTTTGC TATTTGGTTC GCAGATGGTG 840
GTACGGGTGG CACTTTGGGG AAGGCGGGGC GGAAGGAAGC TTTCTGATGA ATGTTTGCAC 900
AGTATACGAG AAGGTTACAA GATATGGGCA TCATGCACAG GTGGCGAGGT GGTTAGAGAA 960
AGGTAGATGG TGTTTGGGGA TTACCCTCTG GTACATTTCA ATTCACTTTG GGGTTATGAG 1020
ATTTCAGAAG GTTAGCTAAT GCTTACGTCC TGGGGTGGGC TCTTTTGTAT TTCTTTGTTG 1080
TCTCTTTTTT ATTTTTTAGA GACAGAGTTT TACTATATTG CCCAGACTGG TCTCAGACTC 1140
CTGGCCTCAA GCGATCCTCC CACCTCAGCC TCTGAGTTAC AATTGTCTCT TGAAAGTAAT 1200
TTCAGGTAGG CTTGGGGCTA CCAAGGCAAG CCTAGGGAAG CCTACTACAT GAAGAGGATT 1260
AGAGTCCTCT GGAGAAGTTG GATTCATATG AAGAGATACT AATCAGAAAG TTGGGAGTTA 1320
GTCATCCATG GAAAACAGGC ATGTTTGAGA ATCATATTCT GGCAGTGCCC ATCCATGCAT 1380
TATCAGTGGA GAGAGAACCT TGGCTAATGG ACTTCCCCAG TTTTGATCCC ATGGATAAGA 1440
CCATGGGGGA GAGGGTAAGG CTTAGGCTAA TGCATATTCT TGGATCATTC AGTCACCTCC 1500
TTCCACTCTG AGTCCCTGTT GACCAGGGAA TGTCTTGGTG TCATAGCTTG GCTTTCCAAT 1560
GGCTCTCCCC GTGGGGAAAG AATACACAGG CTGTGTTGAT GGTATTCTAG TCCTGACGAG 1620
AGCTGCGTTT CTCATGGTCA GCAAATGAAT TGGCATCCGA TATATAAGCA AATCTTGTGA 1680
CTGTAAAGTC ATATACTTTC TTGTTAGTTG AGGGAATCAG ATTTCTGAGG GTAAGAGGTG 1740
AAGCCAAGAA CATGGCAAAT TCATTATCTT GATAAAAACT ACCCGGTAAG GCTGCCCATT 1800
TTCTTTCAAA CTGCAACACC ATATGTCCAG CGAGGTTCCT CTTACGAGAC ATCAGGGGTA 1860
TCAGGAGTGG GTGCCAAGCT GGAGTCCTGA GAATGAGGGA AATAGGAGAC CATGAGTTTT 1920
GAGCACCACC GCAATTTCTC TTCTCCTTTT GTCCCTCTTG CTTTAGGTAG TAATGCATGC 1980
CTTAAGATAA TAAAAGGTCT GTCTTTGTGG GCTCTTCATT GCCATAGAAA AATGATTGGT 2040
ATGAGTTTCC CAAGGCCTCG GATAAAAATA TTTCTTCAGA GAGGGTTTTG AAAACTTATG 2100
CCAGTTACCT GGGTGGACTC CAATCTTTCA AGCACTGTGT GTCTTTTCCT GGTCCTCCCT 2160
CGCTCCCTCC TTCCTTTCCT TCCTTCTCTA AACAGAGTCT AAGGTAATGC CCCTCTCCAG 2220
TTTCTTGGGA TAGGGAAGGG GGTGGAATTA CTTCTGACTC ACCCTTACCC TTATGGTGTA 2280
CCCTTTGGGG TTCTGGCTAA AATATATGTA TTGGGAAGTG GGACGCAGTG GCTCACGCCT 2340
GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCCAAGGCG GGTGGATCAC TTGAGGTCAA GAGTTCAAGA 2400
CCAGCCTGGC CAACACCCAT CTCTACTAAA AATGCAAAAA TTAGCCTGGT GTGGTGGTGC 2460
ATGCCTGTAA TCCCAGCTAC TCAGGAGACT GAGGCATGAG AATCGCTTGA ACCTGGGAGG 2520
TGGAGAGGGT GGTGAGCCAA AATCACGCCA CTGCAGTCCA GCCTGGGTGA CAGAGCGAGA 2580
CTCTGTATCA AAAAACAAAC AAATAAGTAA AATATATATA TTGGGGTCCA TTAGTTTTTC 2640
CACCCTGGGT GGACTCTGAC CTTTGACTTC TGTCATCCTT GCCCCATGAA GCCATCGGAA 2700
CTGCAGCTCG TTTTCCGCTT TTTCATCGCC ATTTCTTTCA GCTGACAAAT GCTGTTTACC 2760