EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-20043 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr3:128521540-128524780 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr3:128523963-128523975GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:128523967-128523979GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:128523971-128523983GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr3:128523975-128523987GTTTGTTTGTTT+6.32
IRF1MA0050.2chr3:128523252-128523273ATACACTTTCACTTTCTCTTT+9.12
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:128521570-128521585TGATCTCTTGACCTC-7.23
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_04731chr3:128522619-128524603Brain_Anterior_Caudate
SE_08633chr3:128521768-128524379Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09387chr3:128521714-128526922CD14
SE_18451chr3:128515404-128526881CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_41308chr3:128521578-128527031Left_Ventricle
SE_48362chr3:128521275-128526958Psoas_Muscle
SE_49082chr3:128522777-128523308Right_Atrium
SE_49082chr3:128523519-128524618Right_Atrium
SE_51252chr3:128517753-128529833Skeletal_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr3128522261128523800
chr3128522581128523553
chr3128524007128524103
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I128801chr3128520645128526220
Enhancer Sequence
GGGGTTTCAC CATGTTAGCC AGGATGGTCT TGATCTCTTG ACCTCATGAT CTGGCCGCCT 60
CAGCCTCCCA CGGCGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCTACCA CACCCAGCCT ATTTTTTATT 120
TTTTTTGAGA CAGGAGTCTC ACTGTCGCCC AGGCTGGAGT GCAGTGGCCT GATCTCAGCT 180
CACTGCAACC TCTGCCTCCC CGATTCAGGC AATTCTCCTG CCTCGGCCTC CCAAGTAGCT 240
GGGATTACAG GCGCCTGCCA CCACGCTTGG CTAATTTTTT GTATTTATTT TTAGTAGAAA 300
CGGGGTTTCA CCATGTTGGC CAGGCTGGTC TCGAACTGCC GACCTCAGGT GATCCACCTA 360
CCTTGGCCTC CCAAAGTCCT GGGATTACAG GCATGAGCCA CTGCGCTCAG CCAGTAGGGT 420
AAATAAGTGG GACCAGGACA GGGCTTTACA TTCTAGCTTG GGGGAACCAG AGGATTCAAG 480
ACCTGAAGGT GGAAAAAATA CAAAGTGAAA ACTTAAAAAA TGAAAATAGT GAATACTTTT 540
CACCTTTGGC ATTTGAAAAT ACAGAAAGTA CAAATCATAA AATGTTGAAG ATTGATTAAT 600
AGATTACATT AAACATGTAA ATAACAAGAT TCCCAGACTA ACAAGAACAA ACCACACAAG 660
CAGGTGACAA AGATGATAAT GCCTAATAGT ATCCAAGCAG TAGGTAACCT GGTGGATGCT 720
AGAATATAGG GAGTGGAACA GCCTCTGGTT GATGGTAGGA GTGTAGTAAT GAGTACAACC 780
TTTTCAGTAG AAACTGCCAC TCTGCTCCCC AGTGTTGAAC ATAGACATAT GCAGCAATCC 840
AGAGTTCTGA GTCTGAGTGT ATGGCCTAGA GAAACTTATC TCTGGACATT ATGAGAGAGT 900
TGTAATGAGA GTTATCATTG CAGCCTTGCA TGGGGAGTGA AAAACTGCAA ATAACTCAAA 960
TGATCTGGGG AACTAAGTGA GTCTATTAAA GCAGTGGAAT ATTATATAAC TGTTAACTTT 1020
TGGGAATGAA AAAAGACAAG TTGCAAAAAG CTGTACAGGA TGATAATGTT TATGTAAGGC 1080
ATCTCTTCAG GAGCATTTAC TTGTGGTGAA GAAGGAAGAA AATGCAATGA GGGAAGGGTT 1140
AACTCTTGGA AAAAACGGAT AAAAATAACA GTGTTAATTT TTGTCACATC AGAATATTGG 1200
GTAGACAGTT ATAAGGGTAT AATTTTAAAT GGAGAAAACA AAACATTTTG AAACAAGCAG 1260
GCTGGCTGGT TTCCTGTTTT GATGTGGTCT AGAGAAAAAG AATAAAAGCC CCTTACTCAA 1320
GCTGTAGCTT ACCTAACTTC CAAACAATCA GCAACAAAAA ACCCCGAGAA ACTGTTATCA 1380
CAAGTTCCTG CTTCATGGGG CTAGGGACCT CCCTGGGCCC CCCCCCGCCC CCAGCATGTG 1440
CAGTTAGACT TCAACTTCAA CTTATAGTTA CCTTTTCCTC ATTTTAATGC CAAAAGTCAC 1500
ACCCAGGATG GAGATTTAAC CTGCTAGTGC TACACGCAAT TTCTGAAGAA GCATGTTTAG 1560
CCACTGTGCA TGCACTAGAA AAACCCCTCC TATATACATA TCCTGACATC ACCCCTCCCC 1620
ACAGGAAAGC CCTTTAAAGT TAACTCCCAC ACTGCTTTCA GAGAACAGCT GCCCCTTTCC 1680
TTTTGCAGTG CTAGCTCACT ATGCATAAGC TAATACACTT TCACTTTCTC TTTGCTATTG 1740
TGTCTGGTGA TCTCTCTTGA TTTCTATCAT GGAAGATTCC AAGAACCCAG GTCGCTGTTA 1800
ACAATTTCAA TTAAAATATT AAAAAATTTA AAAATCACAG TCAGCCATAG GACTGTACTT 1860
GTTGATGTTT TGATAAATAT GGCCTTTACT TTTGTAAATT CAAAGTTAAA TTAATTTTGG 1920
TAACTTTCTA GGAACCCGTC AACTTGTTGA CTTCTTTTTG ATGTATTACT TTGCCTTCTC 1980
TGTGTATCTG AGTTCCAGAT GATGAATTGG TTCCACCTAA CAGTAACAGA GTTCTTATGT 2040
AATTTTGCTT GTAGGAGTCT ATCTGAAAAA AGCCATTTGA CATACAGAGA AAGCTCTCTA 2100
TGCTAATGTT CATTGCTGAG TTGTTTATAA TGATAGGAAA TTGTCAGCAA TATTTTCTTA 2160
AAAATAGGAA TCGATGGTTC ACTAAATCTG TTGGGCAGCA GTAAAGTCCA GTGAACCTGC 2220
TCTCCCATGT CACCCCATCT GCTGTTGCCA GAGTGCCCTA GTGCGTGACG GGGTAGAGGG 2280
GAGGAACTTG GGAGAATGTG GAGAGTATCA CATGTGCAGT CTAGGAGTGC AGTCTAGGAT 2340
TTCAGCTACA GAAAACCTCC GCGCATATGA CTAGAACAAG ACATGAACTC CTTCCTGTGT 2400
GGGAGGATGC CAAGTGTTCT TTTGTTTGTT TGTTTGTTTG TTTGTTTGAG AATGGGGTCA 2460
CTTCTCCACT GACAGAGATG CATACATATT CCATGTAGAA CATTGGAGAA CCAGGAGAGC 2520
ACAGGGATGA GTACCACCAG CAGTCCCGAT CCTGTTTAGT CTACATGTGT GGACTTTGTT 2580
TATTGTATCT GGGCAAGGGA GCATTTAGTG CCCTAGCCTG CCGAGAGGCA GTGGAGTCAT 2640
TAGAAATAAA TTTGTCTTTT TTGCCCTTCA TCCTTATATC TGAGTTGTTA TCATGTTCGT 2700
CCGGCTCTGT TTGAGTGCCT GTTACGGATC TAGGGCAGTA AGTATACCCA GCCTTGCTCT 2760
TAAATCTAGC ATGGCAGTGA ATGAGGTGAC CAGCTTAGAG CTGGGCGGTA GTACCTGGTT 2820
TAATCTTTAC TCTGGTGTGT GTTCTCATTG TCTTTCTCTT GATCTCTTTT TGTCAAGAGT 2880
TTTTCATTTG TTTTGTTTTT TGAGGTATAA TACAAATGAA ATATAACATG CTAATCTTTT 2940
TTGTTGTTTA GGCAAACTTT TCTCTTTTTT TTGAGACAGA GTTTCGCTCT TATCACCCAG 3000
GCTGGAGGGC AATGGCACGA TCTTGGCTCA CCGCAACCTG CGCCTCCCAG GTTCAAGCAA 3060
TTCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAGTAGCTAG GATTACAGGC ATGCACCACC ATGCCTGGCT 3120
AATTTTGTAT TTATAGTAGA GACAGGGTTT CTCCATGTTG GTCAGGCTGG TCTCAAACTC 3180
CTGACCTCCG GTGATCCACT GTGCCTGGCT AGGCAAACTT TTCATACAGT AAAATGCATA 3240