EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-20020 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr3:127537750-127540530 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr3:127539457-127539472AATTAATGATTAATT-6.34
HNF1AMA0046.2chr3:127539457-127539472AATTAATGATTAATT+6.47
KLF5MA0599.1chr3:127540444-127540454GCCCCGCCCC+6.02
RREB1MA0073.1chr3:127539207-127539227AACCCACTCACCCACCACCC+6.04
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00025chr3:127531469-127543388Adipose_Nuclei
SE_03564chr3:127539566-127540162Brain_Angular_Gyrus
SE_05617chr3:127539089-127542107Brain_Cingulate_Gyrus
SE_07763chr3:127537508-127543833Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13552chr3:127538631-127542165CD34_Primary_RO01536
SE_23130chr3:127532036-127542823Colon_Crypt_1
SE_24596chr3:127537833-127538408Colon_Crypt_2
SE_24596chr3:127538549-127538958Colon_Crypt_2
SE_24596chr3:127539016-127539306Colon_Crypt_2
SE_24596chr3:127539411-127540254Colon_Crypt_2
SE_25105chr3:127533374-127542626Colon_Crypt_3
SE_27241chr3:127534893-127542939Esophagus
SE_40646chr3:127533729-127543420Left_Ventricle
SE_44715chr3:127538440-127542110NHDF-Ad
SE_44967chr3:127538363-127542083NHLF
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr3127537885127538191
chr3127539467127539812
Enhancer Sequence
GATAATTGTG CCATGCCTTA AGTATAAGAT TTGTTATTAC CGTAAACACT ACAGCATGAA 60
TTTGCCTTGG TACTGCCAAA TGGAGGTTTA AGTTCTGATT CCTGATGATG AAATACGGAG 120
ACTCTGGCCT GCTACGTTAA AAACAGCACT GATGGTAAAG GCTAACCCAA GACATGCTTT 180
CTCTTTCTCA GGGTCCAGTC CGAGGAGGCT GGTGTTTATA CGACAGAATT TGCTTGCATA 240
AAGCGGGTTA AGCCAGGTTC CCAGTGCAGC GGCTGACACC TGTGGCTTAG TGTTGCTCCG 300
AGCCACCTGC AGAGCCAGTC TTGGAACCCA GCAGGTCCTC TGGGGGCAAT ATGTCTCTGT 360
AGGTGCTCAC GGCAGGCTCC AGGAGCTGGA GGTAACTGGT TGGCCAGAAA ATCTACCCAA 420
ACCAGTACTG ACTAACCGAG GCTGGCACAG ATCCTTCTGC ATAATAAGAT ATCCACAGGC 480
CCCCGGGGTG GCTTCTGAGG TCCCTAGGGT CTCTATGAGA AAGATAGCAG AGGCGGGGCT 540
GGAGATGAGG TGCTCTTAAC CCAGGTTTTG CCCACAGTTG GTACAGTAGT GGGGGAGGGT 600
TCAGTCTCCT CTTTTTTTGC CCCTTGCTTT TCCTCCCTTC TTTCTTCCTA ACTGGGAGGA 660
GACAGGATTG CACAAAGCGA GGCCCTAGTT TTGCTGAAGA GGGGTAAAAA GCCTGGGGGG 720
AAAGATTGAA GCCCTGGTGA CTTGAGGTCC CCTCCCTCTT CCTAAAAGCA GAGTGAATGA 780
TTCTGTGCAG GCAATAATAA TAATACTTAT TATAATGATG CTGCGGGGGT CTCCCAGATC 840
ATGCAAGAGG GCAGGCAGGC TGAGCAGCTG GTCTCGGTTA TGAAGATACA GAGGTGTTTC 900
ATGCTGGCTG GCACAAACCT CTGCCCTGAG CCCCCACCCT AGGACCCCCA AGACTGCCCC 960
AAGATCCAGC AAGCACAGGG TTAACATGAG TCATGGCAAG GGGCCTCCAG GACCTCTGCA 1020
TCATCTCCAG GGGCTGGAGG CAGGGCAGGA CAGGTAGGTA GGACCTTGGC CAGCCCCTTC 1080
CTCTTTGGTA AACTGAGGAT AACACTATGG AAAGTGTTCA TACATGCTCA TGGTTCTGTT 1140
GCTCTTTCTA TTTCAGTGCT CCTGCCCTCA ATATTTTTTT CCCTTAACCT TTTCTAGACC 1200
CATAGGTTTC TTCCAAATTC TGGGGCCGAA CTGCCTCAAC CATCCACCTC TGTTCTTAAG 1260
CCCATCAGCA CCCACCACAA GGCGGACGCT GACATCCAAG AGGCAGCTCA GTTTAAATTA 1320
AGAAGTTGAG TTATCATCTC TAACTAGAGC AAAAGCAACG GAGCAGAGAG GGCTCCCTGC 1380
AATGCAACTT CAGCACAGAG ATTGTGAAAA CCACCCGCAG GCGAAGGGAG GGCAGGGCAG 1440
CCAACTTGAC CGTTTCTAAC CCACTCACCC ACCACCCTCC CCCTGTGCCA GGACTGCAGA 1500
ACCTCTTTAT TTTTGTTGAC TTCGAACTAG GACAACCTCA CTACTTAACC AACAAAGCCC 1560
CCCAAGTCTG AGACTCAGAC ATTAAAAACT TCTATTTTCA ATTATTTGTC TTCTTTCTGT 1620
ATATTGATCA AATTACCACA AACCACTAAT CTGTTAGAAA TTAATCCAAG ATTGAGCAAT 1680
TCTACAGCCA GTTAAGTCAG AGTGGAGAAT TAATGATTAA TTAGCATCAT AATGCTCAAC 1740
AACCCCCCCA CTTCCTCTAA TGCGTATGCA CGTACAGACA CATTCTTTAA GAAATGTATT 1800
ACCAGAACTG GTAGGAACTC TTCTCAGCAC GTTACCCACT TGAAAACACT AGAGAGAAAC 1860
CATAGCCAGT CTGTGTAGCT GCCCTGAAGC TATGACTCTA TGCCGGGTTT TAAAAGTCCA 1920
TATCTCTGTG TTTTTAACGT GCAGCTCCCT GGATCATAGA TACCTTGATG AAGACAGAGA 1980
AGAAATTTTA CACCTGTGTG AGGGTTGGGT GATTACTGGA GCACAAAGAG AGACATAATC 2040
CAACCACACA ATGATCCCTA GGAGACAAGA GGCCTACAAA ACAGGTAAAA TGTCCCTGGA 2100
ACAGGAAATG TTCTTGTCAC CAGGCCAATT GGTTACCACA AATAAATTCT TTTTCCAAAT 2160
AACACAAACA AGCAGGGTTT TCCTGCTTCA TCCAAGAGGA GGGAGCAGCA GCAGGAGACC 2220
AGCTGTCTTG TGTATAGTCC CAATGTTTGC TTCTAATAGC AAGACAAATC CTTGATGGAA 2280
AATGTACAAA GTAATTGAGC TGGCAAGGAA TCAGAAGGAA ATACCCAGGC CCCTTTCTTC 2340
CTGGTGACAC ATGTATGCCA TCTTCAGAAG CTCAGAAACA AGCAGGAAAA GTGAGCAAAG 2400
GTGAAGATAT ATGTATTACT TCGGGTTTCT CATCCATCTA GGGGATTTTC CTTAATTGTC 2460
GGGTTTGATT TTAAATGAAT GCCTGTACAA CCGGAAATCA ACTCCAGTAC AAAAAATAAA 2520
GTCATGTGGA ATTTTTGAAA ATTGCCATAC GGTAGGATCC ATATCTGAGT TGTTATAATG 2580
AAAAAAGAAT TCCTGCTTCT TAAATTTAAA AATTATAAAG TATACATTTT AGCTTTGTTA 2640
ACATTGCTCA GCCTAACATT AAAACGGCAG GGGAAGTAGG TCATAGAGAA AGCGGCCCCG 2700
CCCCAGATGG CACATGATAA CGACCAGAGG AGAAGCAGGG GCCATGCTCC CCTGTCACCT 2760
GGGGTGACTT TCTGGGGAAG 2780