EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-19142 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr3:18458570-18462240 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr3:18460915-18460927CCTGTGTAAACA-6.14
Foxo1MA0480.1chr3:18460919-18460930TGTAAACAGCA-6.14
SOX10MA0442.2chr3:18461335-18461346TTCTTTGTTTT-6.62
Number of super-enhancer constituents: 10             
IDCoordinateTissue/cell
SE_15902chr3:18459378-18461238CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17357chr3:18440552-18489888CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18556chr3:18457123-18486790CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_22001chr3:18457379-18462981CD8_Naive_8pool
SE_30918chr3:18455791-18490880Fetal_Thymus
SE_55121chr3:18459413-18460328Thymus
SE_55121chr3:18460520-18461221Thymus
SE_55121chr3:18461719-18462677Thymus
SE_59942chr3:18444087-18488180Ly4
SE_62473chr3:18442750-18489702Tonsil
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr31845950218459782
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH03I018418chr31845969318459892
GH03I018419chr31846069318461428
Enhancer Sequence
CTATCAAAAA GATGAAGAAG AAGAGATGGA AAACCAACAA TCTTCAGAAA TACAGCTTGG 60
GGGTGGCGGG AGGAAATATT AGCCATGAAA ATAAATAATC ACAAGAGATT CACTGTGCTT 120
CCAAGGCAGA CTGGGTACAG TACAGGCAAA TGCACACAAA TATATACATT CTCATATTAT 180
TTAAAGTCGT AACAGAAATA TTTAAGTAGA ATATGAACTT GGTCCTAAGG TAAGCTGTGC 240
TCTAAATTAA CAGTGCATTT TCCAAAAGCA ATGAATGCAG AATTACCTTT CTGATCAAAT 300
AATAATGGTG ACGAAAGAGA AATAAATGTA TCTTCTCTAA TTTGCTATGA GTAGTATACA 360
GTATGCAAAC ATAACTCACC ATTTATCTTC AGAAGAACCC ACCTTTCTAC TGCTTACATG 420
ATTTTGTTAA TAATAAACTT TTCCTGGGTT TGTGTCCAAA CAAATTATCT TCGACCACGA 480
AATTTTCATT TTCTTCCTTT TTTAGATATT AACTCTAACT GGTTCCACAA ATCATTTTCT 540
TCCTTTTTTA GATATTAGCT CTAACTGGTT CCACAAAAAG TACTTAACCA AACTGGTGCT 600
CATAATACAC AATTTCAATA TCTGCATAAT GTAGAAAAAT AACATTTGCT TTTATGAATA 660
CTCATTTAAC CTACCTAACT AAAAAGAGAG CACGGTACCC ATAAGTCTTT AAAATCAACA 720
ATCTTTGTTA CAGTAAATAA GGTAAAAATG AGAGATAGAA AAGGAAACTG ACATACTAGG 780
ATAAAGGAAT CTGCATAGAT TTGGTGTGCT CTCTCTTTAT ATATTTTAAT CCAATACAGT 840
AACTCAGTAG CTAGATGATT AATAAGCACC GGCCACACTA CTATTAGAAA GAGGCTTCTT 900
CTAGAAATTG ATATTACGGA ATGCTGTGGT ACTCAAGGTG TTTATGCAGC GCACTGTCAG 960
ACTTCCAATG ATAACGGAAA AGGGTTAAAA GCAGATGCAT CTGAATTGTA CTGTGGCAAA 1020
CTGCCAGAAG GGTATCATCT TTAGCATAAA TGATGACAAG GGTTACTTTA ACAGGGCACC 1080
CAGGATCCAC AATTAGTCCT ACAATACTAA TGCCTCTATA AGCTCTGTCC TCTGGACTCA 1140
CAGAATCCTA CCAACTTCTG AAGATGACTT AGTGCACACC AACCGTAGCT AAAAATCAGG 1200
ATTTCCTACT GACACCAGAG AGGCCCTTCA AAGATTCTCT ATTTGCTTGT TTCTGCTGAA 1260
CAAAAGCCGG CAATAAAACA GCTACATCTT TCTACATGTG AGTCTTCACC AAAGCTTTAG 1320
TGAACTGTTC ACAAGAGATT CTAGGTCTGA CAAAACCCTT TAGGTTTACT TAGAAAAACT 1380
CACAAACTCA TTCGGAGGTA CCAATAGGCT AGGCATGAAA AACAAGCCGC AGAGCTTGCC 1440
AATATTTTTG TCATTCATTC AGCTGTTTTA TACCAGAGAA AGAACCCGTC GGGGATCAGA 1500
AGACAACTTG GGGAGACCAC AGCAAAAATA GCAATATGCA AACTGGCGAT TCCTTCCTTG 1560
GCTTGAAGGT ATTCTGGCAA AATCGCCTAA ACAAATAAAA CCATTCAATC CCTTTTTCTT 1620
AGTAGTGTTT TCTCATCTCA GCCATAATTT TCATTTAGCA CCTATCAGAC AGAAACCATG 1680
CACATGAAAA ATAAGATGAA AATGTTAATA AAAACCCACA AAAAGACTTT AGTAATTTTG 1740
TTATTTGGAG TATCTGAGAC CCTCCTACAA TTAAACTGCA TTTTTAGAAT ACATCCAAAA 1800
CAAAACAAAA CAAAACCAAA AAGCATTTGA GCAGGAAGTG AATTTACTGT ACTTTTAGTT 1860
TTCCTCCTCC TGTCCTGATA TCTTCAAAGA GTTGGGTAAG TACAACAAAA ATGTACACAT 1920
TCATTTTTCC TTTTGTAGGA TGAATCAGAT GTATTCTACA ATATGCTTTT CCTTAGATCT 1980
ATGAAATAAC TGCAGGGTTT TCAAACTATT GAAATATATT GGATTTATTG TGGATTTTAT 2040
TGATCATGTT TAGAGGTACC CTAAAATAAT AAAGACGGCT ATAAAGTGAC AATAGTACTA 2100
TCTAATTACA GACCTTCTAG CAAACTGTTG CGGTTACCCT CCCGTTTCTG GGAGTAATGC 2160
TGAACACAAG CCTTTTCTGA ACTGTATGAT TATTCGTGCT AGTGTTTGGC GAGAGTTCCA 2220
ACTACAGCAA CTTCATAACC TTCCAGCATT TAAAGGGGAG AGCACTGGTC ACTGCTGAAT 2280
GCTAAAAATA CCACATGATT TAAACCTGAA GGCAGTCTTA GAAGCTTTTG CTGAAGGTTT 2340
ATGAGCCTGT GTAAACAGCA CGTCTGCCAT AAGGAGCAGT GAAGTCTGTA GAATCCTTGT 2400
CTAAAACTGT CCTGGCATTA AAGTTTGCTG TGCAAATATC ACATAATACC AGAGACAGCT 2460
GAAATCTCCT ATTTAGGAAT TTATGGAACT TACATGTTTG CAGGCGTCAG AAAGTCTTTT 2520
TTATACAGCC CCAGTGCTTC ACAGTACAAT ATTAATGCAC TCTGTTTGAA AAGCCGTAAT 2580
AAATTATATT TTTAATGCTC TTACCCTGGC TTTCTTAAGA TGCATACATT CTTGGCAAAC 2640
AATCAATAAA TAGGGTAATC ATGAGTAGAG GCCAAAGAAT TTGCTGAAGT GCTGTTTTCC 2700
CATTTTTAAT AGATAAAGAT CTAACAATAC GGACTGCTGT GTCTGTTCAT TTCAGGATCA 2760
ATATATTCTT TGTTTTCGCC AAACCAAGGA AAAAATAAAT GATTGTATGA TAAATGTTAC 2820
GCATCAAACA CAATGAAATT CCTCTGCCTT CTAACTTTAT CTACTTAATA TTCTTGGTTG 2880
CTAAAATATA GCATTTTTAT CCATTGCTTA GCAAATGTAA GGAAAATCTG ATTCCTATAC 2940
ATGTTATTCA GACACAAAAT GAAGCTCCTT ATGAGGCACA TGCATTACAC CCAGGGTAGG 3000
CACTGCTTTA CAGGAACAAC ACTGTTAAAC ACAGTCCAAG TTGTTAAACT GCATCAATTT 3060
AATATTGGTA GAAAAAAGTC ACACAGTTAC ACATCTTCCC CTTATAAACT TGCCTAAATC 3120
TGTTCTTTCT TCATCAAAAA TACCCAATTA AAACAAAAAT AAAAAACTAG AATCATCAGA 3180
TTTTTTACTG CTAATGAATT TGCTCTTAAG AAAATAAGCC ACAAAAAATA ACATTACCAA 3240
ACTTCTACAT AAGATGTCCA AGATCTCTGA AACTGCCCTA CAACTAAGAA TCTTAGGAAG 3300
AAGCTAGGGT AACTCTCAAA TCACCTAAGT GTTTTATTCT TAATCAGGTT AGTTTGAAGA 3360
AACAGCTGCC TACAATCCTC GACTACAACA CCTTTTGAAT GGACCCTGCC AAAACTAAAA 3420
CCATTATATT TAATTCAGTC CTTATTACCC AAAATGTTCC ATGATTCCAG TCTACAGTAG 3480
AACGCTCCAC CCAAGCATGG AGGCTATACT TTCCAACGTG ATTGATACTA AGGACCCAGA 3540
ATGTAACTAA TGTACGATCA TAAGGAGAAT AAAGGCAGAG TATACAAAAC ATGTTCTGCC 3600
ACTCCACCCC CACACAGTGT GGCCTTGTGT AGACAACAGG GCTTTCAGCT TTTCAAGATT 3660
TGGCTTGAAG 3670