EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-19038 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr3:13003940-13008880 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr3:13007462-13007473AAACCACAGAG-6.14
SP2MA0516.2chr3:13007935-13007952CTTAGCCCCACCCCCCT+6.89
ZNF263MA0528.1chr3:13007780-13007801GGGTGAGGAAGGGGCAGAGGG+6.22
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01221chr3:13003820-13004652Adrenal_Gland
SE_01221chr3:13005151-13009333Adrenal_Gland
SE_01766chr3:12992951-13005733Aorta
SE_01766chr3:13007556-13009242Aorta
SE_03351chr3:13005023-13006057Brain_Angular_Gyrus
SE_03351chr3:13006133-13007365Brain_Angular_Gyrus
SE_04084chr3:13002158-13005028Brain_Anterior_Caudate
SE_04084chr3:13005184-13009096Brain_Anterior_Caudate
SE_04903chr3:13003234-13004596Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04903chr3:13004698-13009224Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05894chr3:12992793-13009263Brain_Hippocampus_Middle
SE_07421chr3:13005043-13009284Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07849chr3:12992803-13009313Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10911chr3:12992747-13009298CD20
SE_41281chr3:13003037-13009272Left_Ventricle
SE_65822chr3:13001339-13004610Pancreatic_islets
SE_65822chr3:13006405-13009109Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr31300800013008689
chr31300748413007800
Enhancer Sequence
GAACCCTTCC AGTTTGTGTG AATGAGGAGG ACTCCTCCCA GCTGGGGACT CGTTCCAATT 60
CTTCCAGTTT ATTAATGATC CCTCTCCCCT CCCATGGGAT CCAGTTCAGC ACCCACACAC 120
CTGTGTGTCC TCTAGTGATT CAAAAGCCCT AGCCTTGGGT TTCCTCACCA TGCAGAAGCC 180
TGTCATGTTC GCATGGGTCC CTCAGTGAGT TAGGGGACAG TCAGTTTTAG TCCTCAGGAC 240
CCTGCTCCAA GCAGAGTCTT GGCCTGGGGC TGCGCACAGC ACACAAGCAT GCTACCCTCA 300
AGAGCCTGCA AGTGCAAAGG ACACTGTCCC AGAATCCTGC CGGAGAGTCT GGGGATGCAG 360
CTCTTGGGTT CTGTGGGGAA AGAGACAAGA TGCCAGGAAG GCCCGGTGAG TGGTCATCAA 420
CCAGCTTGTG GGCTGAGACT TCTGAGAACA TGTTGGGAAT CCTGATACCT GGGGATACCA 480
GACATCTGTT GTGGCAGTAT AGGGAAGAAG CAAAAGGCTC CATTCATGGT GGTGACATAT 540
TTTGCCAAAG ATTATTTAAT CCCAGAGGAA GCAGAGCCTG GCCATGAAGT ACACAGACCC 600
TGAAGCCAGG CAGGCGGAGT TCAAACGCTA ACTCTAGCAC TCTAGCAACT TTAGCACTAA 660
ATGGCAACTG TTGCTATTAC TATTACTACT GAGCTTTGAA CAAAGAGGAA AAAACAAATG 720
CAGTCACAGT GTCTCATCTT TAGAAACAGG GAGGGGACGC TTGCTATGGT TCTCCATCGG 780
GACCTTAAGT TCAAATCAAA CTGTCACCAT GTCAGGAAAC TGCAAACCGA GGAGATAAAA 840
CGGAAAGAAT GGGCATTTCC TCCAAGGAGC AGCGAAGCTG CAGGTACCTA TGAACAAGGC 900
AAAAAAGAAA TTCAAGTCAG AGCAGCTGGG ACCCCAAGAA GGAAGATTTC ACAAAAAGCC 960
ACACAGGCTC TAGAAATCAG TCTTCAACCT CACAAACGAG CAAAAAAGAA AACTGTGAGG 1020
AATCATTTTA ACTCAGCAAC AATTTCACAA ACGGGAAAAG GTGGTAATAA TGATGATGGT 1080
GATAACAGCT ACCATTTGTT GGGGATCTAT CTGTATGCTT TGGTCACCAG GCAAAGCTGC 1140
ACATCCCCCA CCCCCTCCCC AGGGGTTTCT TTTGGCTCCA TTTCATGGAT GAGAAAATCA 1200
AGACTCAGAG ATGGAAGGCA ACATATCTGA GGCCACACAG CCAGGAAGAG GTGGAGTCAG 1260
GGTTTTGTGT GATCCCCAAG TCCTGTGCTC TGTGATGTAC CATTTCACAC TACTAACCTC 1320
AGTGCTTCTA CATCTAGCCC AGGGCCTGGT ACAAAGTTGG TGCTCAGTAA ATGTTTGTTG 1380
TGTGCATAAA GGAACACAGG AAAGTGAAAA GCTGCGTGTC CCCTGGGTCA TACACATCTC 1440
TCCAGAGAAC AACGCACTCC TCCAAGCCCA AGACAGCATG TGTGCACTTG TTAACACCTG 1500
CATTTATGGA TGCTTTCATT CACTGACAAC TGGCTATGTC CGCCATGAGG CCAGGCGCTA 1560
TGCTAGGCAG GCATCGGGGT ACTAGCCACA GGGCCAGGAC TTGGAGGGAC ACTTGCCCAA 1620
TTCAGGGTAC AGCCATGGCA GCCAGGATAG TGGCAGGTCC AGGTGGCATC ATGCCATACT 1680
TCAACCATAA ATGCCATCAA TTTCCTCTCT GCAGCAGCTC ATGCAGTGGG AGCAGCCAGA 1740
TTCTCTAAGG CCATGCCAAT TAATTCTTCA AGAGCCTTAA TGGCCTCTAA ACTCATTACA 1800
ATTTGCTTTT GAGGACAAAC AATAAATCAC ATTCAACAGC ATTTGAGCAT ACTCCCCCTA 1860
CACACACACA CACACACACA CACACATGCT TCCATGGGAG ATCTCTCCCA AGGCCTCCGG 1920
TGGTGTTTGA GCCCATCTGG GCTGTGCATC ATCTTGCCCC TGTGCTTACT GGGCGGATAT 1980
TCCACATGTC ATCATAATTC AAAGGAAATT TACAAAACAG GAAGCAAGAA AATCCAGCGG 2040
GTCATTGGTG CCTGGGAAGA GCAGAGTGCT GACCTGGACA AACATGGCAT TTGACTGGAG 2100
TCCCGAGGAT GGCCAGCTGT GCAGTGGCCT TCAGACATCC ACATTCTCAG AGCACTCCAT 2160
GAAGCAGTGT TATCATTCCC TTTCACAGAA GGGGAAACAG GCTTGGAGGG GTGTGGTAAC 2220
TTGCATACAC TCACGAAACT GAGCTGGGAC TTGAAACAAA ATCTGTTTGC CTCCCCAGGC 2280
CCTTCTTTCC TTAAGTCTCA AGCTGCCCTG GATTCCAGAT TATCCTGGTA AACCAAGATT 2340
CCACAGTATG CAGAGTCCAG ACAGATAAAA CCGTATGCAC ACACAGATGC ACACACATGC 2400
ACACACACAT ATACTGAGCT CCTGCAGCCC TGGGTACCCT GTCCAATACT GTCCAGAAAC 2460
ATCTATTTGC CCAGTTGTCA CACTGTTTGA CTATGCAGCT GTCAGTCCTG TCCATGTTTT 2520
TGAACTGAAG CTGTGTAAAT ATTAGCGCAA CCAGTTCATA GTCCGACTTC CTTGAGTGAA 2580
AGCCTGAAAA TCCTAGCAGG GCTAGCCAGG GCCTCCAGAG GCCTCCATCA CAACATTGGG 2640
GTTCTCCTGT AGGCTCCCCA TGTGATATTC TGGCCCAGTC TCTGGGTTCT CTTAGTGTGT 2700
GTACCCTTAA AAAAACGAGG ATAAGAAGAG TCCTGTGTTT CACAAGGCTC AAACAGCAAA 2760
GTGCCACACA CGCTCTTGGA AAGAAGCCTG TTATTTGTAG AGTGGTGCAT GGTGGCATGG 2820
CTGGACTTGG GAGTGGTTAT CTTGGGCCCG TTACAGACTA AGGGGGGTCC CCTGAGGTTT 2880
CTGGACCGTG CTGCATCCCA TCCGGGTTTA GAGAGGGGGA GACGGCCAGC TTAAAGGGCT 2940
CTGGCCCCTG GGAGCCAGCC CAAGGAGCAT CTAGCTCTGC CTCCACAGGC CAAGGACTGG 3000
GTTGATTTCC TCTACCCCTC CCCCAAGCTT CCCATGGAAC CACATACCAG GTGCTCCAGA 3060
GCAAATGGGA TCCACCTGCT CTGAGGCTGA TGCGTGAACT ATGGGCTACA CCTGAGCGAG 3120
GCTTCTCAAC CTCCAAGACC TCTGCCTCAT GTTCTGAGAC TGGGGGAGCA GCTGTTCATC 3180
ACCAACCCAG ACCACAGAAG GATCCAAGCA GGCTTCCCTG AAGCTGGAAG ATTGAGATGA 3240
GATGCCCGGA GGGACTTCTA ATGAGAAGGG ATGTGGGACT GAGAAGTATG CAAGAGAGGT 3300
GGCCTGGACA TGTCAACTGG AATGGTCCTA ATGGAGGGGC AGAAACCCCT CCCCAGTTAC 3360
TTTCAGCTCA GAGGGAGGCG GGAGGTGCAG CCAGGAGAGC ACGCTAATGG TTTCTTGTTC 3420
CCCACTAGAC TGCTGGTTCC ATGAGGACAA AGACTCCATG TTTTGTTCAC TGCTGTGTCT 3480
CTGGTGCCTA GAGCAGGGAC TGGTACATAG CAGGCACTCA ATAAACCACA GAGCTTTAGT 3540
ACTGACAAGA CTGAATGCTC AGCCTCGATT TGCTCTCCTG CAATATGAGG ATGCTGGTAC 3600
CACAAGGGTA AGAAGCAATT GTAATACCAG GTGGGACAGC TGATGGACTA TGAGGGCCGC 3660
GGGTGTGTGT GGGATATGAA TAACATGACC CCCATGTCCA GACTGCTGCC ACTGATTCCA 3720
GACAGATGGT CTTGCAGCTG CAGCATGCCT GGCCTCCACC CCAGATGCAA GGAGCAATGG 3780
GGTCCTTGAG AAGCCCCCCA ACCCCACTTG GAGGCTCAGG CTCAGCGCTC CAGGCCTCTG 3840
GGGTGAGGAA GGGGCAGAGG GAGACATATG CATGTTCTCA GTGCAACTGC TGGACATGCG 3900
CTGCACAATT TTTGAACTGA AAGATCAAAC AGCTCCAGGT GGGCTTCCTC CAGAGGGGGC 3960
CTGACATAAG CCAAGTCAGC TTGTCAACAA ATCCCCTTAG CCCCACCCCC CTGCTCCTCA 4020
GAAGGGCCTG CAGATAGCTC AGGGGGCAGC TGTGCTGGCC ATCGCAGAGA GGAAATCAAT 4080
ATTCCCAGCA CATACACACA CACTCCCTTT CTCCCTTTCT CTCCATAAAC ACGGGCCCTT 4140
GGAAGCTCAG ACAGCCGCCC ACAGGCCCCT AAGTAGAAAA GGGTTGGCCC CTCTGACACA 4200
CCAGACTCCA TCCCTGACCA CACCAGGTGC ACACGCATCA CCACACAAAG CCCCTCACAT 4260
CCACACTCTG CCACAAACAG CAGCCACACA CCCCAGTGCA CCCCCAAGTG GCCCTGCCAG 4320
GGGCAGAGTA CCCGACAGAA GCTGCTGACA CACCTGGGAC GCCTGTTTGT TCAGGGTCAT 4380
CCACCCTCAC ACACACTTGG GGTCTTGCAG ACAGGACAGA CACATCAATC CAGACATAGG 4440
CCCAATGTCT GGAATAGACA GGCCTGCAAG AGGCCTTCCT GGCAGCTCCG GCCCTGCCTG 4500
CAGTTGGAAA CAGGCACAGA CCCGCTGGGC ACCCTCCCAC CAACTCTCCG CTCTCCCTCC 4560
TGCCCCTCAC CTCACACCCA CACCGAGTCC CACTGTTTCC CTCTCAAGCC CCCAAACTCA 4620
AACTCACCCC CACACCAACT TGCACTCCAA CAGGCCCTCG ATCACACACA CACACTCCCA 4680
TCCTGAGACC CTCCCAGGGC ACACACAGCG CTCCTGTCCC AAGGGCGCGT CTCTCTCTCC 4740
CACGCACAAA CTCGGGTCCT GTTTGCTCTT CTCTCACCCA AACCCACAGT CTGGCGGACG 4800
CACCCCGCCC CGCAGGCAGC TTTCTCTCGC ACGCCGGGCG CCCGGTCCCG ACGGTCACCC 4860
GCACTCCCGC ACAGGCATCC CCACAGCCTG CGCCAGCCCA CCGCTCAGCA CCCGGGAAGG 4920
CCGCTCGCCC CGCGCCGCGC 4940