EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-17215 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr20:30303010-30306290 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:30303964-30303977TAATTAATTATTT+6.71
RUNX1MA0002.2chr20:30305443-30305454AAACCACAGAA-6.32
ZNF263MA0528.1chr20:30303164-30303185ACTTCTCCATCCTCCTCCTCA-6.11
ZNF263MA0528.1chr20:30303167-30303188TCTCCATCCTCCTCCTCAACC-6.3
ZNF263MA0528.1chr20:30303161-30303182CCTACTTCTCCATCCTCCTCC-7.03
ZNF410MA0752.1chr20:30303411-30303428ACCATCCCAAAATATGA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 66             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30297989-30306428Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30302989-30303502Aorta
SE_01656chr20:30304224-30306272Aorta
SE_03156chr20:30303006-30303602Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30303656-30304165Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30304345-30306204Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30303541-30306370CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30304312-30305160Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30303882-30305348Esophagus
SE_26879chr20:30305408-30306284Esophagus
SE_30903chr20:30303024-30306306Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30303005-30303479Gastric
SE_31430chr20:30303528-30304087Gastric
SE_31430chr20:30304321-30306278Gastric
SE_33407chr20:30302870-30306305H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30303427-30306293HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30303934-30306179HUVEC
SE_39853chr20:30303646-30306330K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30305472-30306266LNCaP
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30304163-30305187NHDF-Ad
SE_44995chr20:30304354-30304900NHLF
SE_45708chr20:30304068-30306118Osteoblasts
SE_47264chr20:30303610-30306362Panc1
SE_48182chr20:30304554-30305954Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30302999-30303416Right_Atrium
SE_48890chr20:30304407-30306299Right_Atrium
SE_50155chr20:30304194-30306264Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_52373chr20:30303600-30306295Small_Intestine
SE_53471chr20:30304367-30306295Spleen
SE_55108chr20:30305375-30306100Thymus
SE_55770chr20:30302950-30306293u87
SE_56767chr20:30303028-30306253VACO_400
SE_57375chr20:30303083-30303420VACO_503
SE_57375chr20:30303683-30304041VACO_503
SE_57375chr20:30304250-30306250VACO_503
SE_57919chr20:30304662-30305261VACO_9m
SE_57919chr20:30305360-30306242VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30304565-30305188HSMM
SE_64478chr20:30304021-30306145NHEK
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30302950-30306293u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr203030360030304200
chr203030372330304420
chr203030359430303801
chr203030514130305549
chr203030430430305303
chr203030594030305996
Enhancer Sequence
CTTGCAGTGA GCAGAGATCG TGCCACTGCA CTCCAGTCTG GGAGACAGAG AAAGACTCTG 60
TCTCAAAAAA AAAAAAAAAA GGAATACAGA CCATTCCACC AAAGCCAAAT CCTCATCATG 120
GTCTGTAATG CTGTATGCGA TCTGGCCCCC ACCTACTTCT CCATCCTCCT CCTCAACCAT 180
TCCCTCCCCA CCTTCTACCC TTTTCCCCTT TGCTGTTTCT TCTCCAGCCA CATTGACCTT 240
CTTGCTCATC CTTGAAAATG TCAAGCATGC TCCCTCCTGA GTCCATTCCC TCTGCTTTAA 300
ACACCCTTTG CTGTAGGGTA CCTACATCAT CCACCTCCTT ACCTCATTTA GCGCTTGGCT 360
CAAATAAATT TAGGTAATAC TTTTGTTGGG ACTCAGGACA TACCATCCCA AAATATGACT 420
GTAGGAAAAC AATATGCCAC CCCAAAAATA TACTTCTTTG GCATATTTTG AACTGGTTAT 480
TCTGAGAAAC TGCAGACATA AGAGTAGCTC TGAAAAGCTG TCCTTTTGTA AAAGAAATTC 540
ACATCTAAAA AGGAAATCTA CACTAGTAAA GGTATCTGTA TTAGGAAGAG GGCTGCTCCA 600
GACAAATTTT ATTACCAGAG AGACTTTTTA TTTTTATTTT TTGAGACAGG GTCTTGCTCT 660
GTCACCCAGG TTGGAGCGCA GTGGCTTGAT CTCGGCTCAC TGCAACCTCC ACCTCCCAGG 720
CTCAAGTGAT CCTCCCACCT CAGTACACCC CCTCAACAGT ATCTGGGACC ACAGACACAC 780
GCCACCACCA ATTCTTTCCC TCACCCTGCC ATAACTTGGG TTGCTGCCAC TCAAGCCCCT 840
AACAGAAGTC CCAAGCCCCA TATTCTTTTC TGTAGCTCAG GATGCTATAT AAGCTTCAAT 900
TATCTGACCC TTCTTTGAGC CTCATATTTT GTAGGATTCC TGTGTACAAC TATGTAATTA 960
ATTATTTTTC CTCCAGTTAA TCTGTCTATG TCAATTTAAT TCTCAGCCCA GCCAAAGGAC 1020
CTAGAAGGGT AGAGGAAAGC CATTTTTTTC TCCCTTACAC CTTCTTTGAT CACTCTTTTA 1080
AAACTGCAGC CCCACCCTCC CTTGCTAGAC ATGCCCTATG CCCCAACCTG CTTTATTTTC 1140
TTCATAGCAT GTACAATCAT CTGATATAAA CATGTAATTA TATATTTATT GCCTGTCACT 1200
CCTCATTGGA ATGTGAGCTC CATGAGGACA GAAACTTAGT TTTGCTTACT TTTGTTTACT 1260
GCCATACTCC CAGTATGGTA CACAGTAGGA GCTCAATAAA CATTGTTTGA CTCAACGAAT 1320
GAATTATTAG GTAAATAGCC ACTCCCATTA TTGTTATTCT GGCTTGACAA GGGTCTGTTT 1380
CTTCAGAAAT TTAGTGGGTT TCTCTTCAAT TAGGTATCTG CTATGCCCAA GGCCTCTGCT 1440
CAGTGCTGAG GAAACAAGCA TGGACAAGAT GTGGCCTCCA CCCTGAGGAG CTCCTAAATC 1500
TAGGACAGAG TAAATCTGTT AGAAATGTCT TCTCTGCACA TAATTTAAGC TCTACCAACT 1560
GTTAACTTCT TTTCATTTAT CCAAGTTTTG CCAGGTACCA CACCAATAAA AAAAGACTCA 1620
GTCCCTCTTC CTTCAGATAT CTGAAGCTGG TGATATTCTC CTGGGTCTTC TCTTCCCCAG 1680
GCTAAACAAA AAGACCCAGT GGGATTGCCT GACTCAGGTC TGCCAACTGG GAACAAGGAA 1740
GACAGACTGT CGGATAGAGG GGCAGAAGAG AAGAGGATCC AGGAGTAGAG TGACTCCTTC 1800
AAAGAAAAAA GAGGGAGTCC TTAGGGAGGA CTCTGTGGAA TTAGGTTGGA GGTTGGGTGG 1860
GGACAGGGCC TCTGCTTAAT TAAGGCAGTA GGAGATTATA CTTCCGTAGA AAAGCAGTAC 1920
ACTGGGAATT ACCCCTATGT CTATCCACAT TAAACTCAGG CAAAACCACA GTTGCTTCAA 1980
GAAAGCCCCA TGATGGAAGG CTGAGGGCAC TGGCAAAACC AGGGAGACTG GACACAGAGG 2040
AGGACGCTCA AGCCCACTGG CCTCAGGACA GATATCTGCT GGGGGAAGGG ACAGAGATAA 2100
CAACTGCTGT TTCATGCAGC CCAAACAAAT CTGGGGACAC CCATACAAAA GTCAAGAAAA 2160
CCCTCCAGGT TCCATTGGAG CCCCCTGAAA AAATACCCGG GTAATTTTCG ACAGAAGCTA 2220
AAGGGCTCTG TGGGGCTACT GGGGAAATTA TTCCTAGGAA GTCTGGAAAA CCCTGTGATG 2280
GTAACAGAAT TTTAAGAGCA ACCTCAAATG TACACTCAGA AGAAGTAGGT GTTTCAAGGG 2340
GGAGCCCCTG AGACACTTCT ACTTAATTTT GGGACCCGAA TGAGATTACT AAAAATTTCC 2400
ACATTTGGGG TTTCTAATGG GGTTTCCCTA AGAAAACCAC AGAACTGCCA CTATCTGCAA 2460
AGGGAGCTGA GGTGCTTCAA CTAAGCATAC ATCCATCTGA AGAAGCCACA TTAGGCAATA 2520
AGAGATCTAC AGAAACTCAG ACCACTGAGC CATACAGCTT AAGAAAGGCC AAGTTATGTT 2580
TTCTCCCCCA ACACAGTTCA TTGCTCCCAA CAATTACGTT TCTATCAGGC TAAGGGATTT 2640
CTTCAGGGAC AGCAATCCCA AAGTGGCAAG GCCCACCTGG GTCCCTTCCC ACATTCCCAT 2700
TGGAAAGCAC CAGAAACACT TGTGTCCCTT CGGGGAAGGT CATGTATACA ACATTCCAGG 2760
AAAGTATCAC AGGGACTTTG TTTCTCAAGG AGAAACTCTA GGGGGAAGAG TCAGTTCTCT 2820
GAGGGAAGCT GCCCATTCAT TAAAGGGTTT CCACCCTACA ATTATGGCAG GAGAAGGGCT 2880
TTTGTGCTAG ATCCTTTACT CGAGTCAAGC TATGGCAGCT GGCTATCATT ATTCCATTTT 2940
ACAGGCGGGA GAGACAGATG GACAAGACAG CCGAACAGGT TCAGCATTTC ATCAGGTGAC 3000
TCCAGGCAGG CAGTAATCTG GCTAAGGGTC TACACTTTCA GTCCTTGAAG CATCACTCCA 3060
CCACTAAGTA GAGATACCTG GGGCAGGCCA CCTTCTCCCC ACACGCACAC CACTGTCATC 3120
TATTGGCAGG GCCTGAGAGG GTTTTAACAA TGAAAAAATT GGCCGGGGCC AGGCACGGTG 3180
GTTCATGCCT GTAATCCCAG CATTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCGGATCAC CTGAGGTTGG 3240
GAGTTTGAAA CCAGCTTGAC CAACATGGAG AAACCCCATC 3280