EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-17212 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr20:30279000-30284690 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs77962418chr2030283169hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Atoh1MA0461.2chr20:30281637-30281647AACATATGTT+6.02
Atoh1MA0461.2chr20:30281637-30281647AACATATGTT-6.02
JUN(var.2)MA0489.1chr20:30284057-30284071AGGAAATGACTCAG+6.73
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr20:30280495-30280510GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
POU2F2MA0507.1chr20:30279629-30279642AAATGCAAATTAA-6.25
POU6F1MA0628.1chr20:30281652-30281662ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr20:30281652-30281662ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 89             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30279395-30280429Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30281696-30285303Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30281733-30283797Aorta
SE_03156chr20:30281999-30283103Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30279417-30280416Brain_Anterior_Caudate
SE_03894chr20:30281567-30283497Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30279425-30280690Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04818chr20:30281270-30284805Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30279223-30280583Brain_Hippocampus_Middle
SE_05813chr20:30281178-30285014Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30279302-30280510Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06739chr20:30281314-30284637Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30279293-30280472Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07749chr20:30281635-30284666Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_13448chr20:30279529-30280192CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30282048-30283284CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30279433-30280460CD4_Memory_Primary_7pool
SE_14426chr20:30281409-30284791CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30279215-30280301CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18483chr20:30281400-30284483CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30282128-30282868CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30279239-30280441CD56
SE_20456chr20:30281650-30283580CD56
SE_20764chr20:30279395-30280536CD8_Memory_7pool
SE_20764chr20:30281711-30283729CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30279235-30280336CD8_primiary
SE_22440chr20:30281489-30283485CD8_primiary
SE_23622chr20:30281755-30283243Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30279308-30280593DND41
SE_25330chr20:30281085-30284597DND41
SE_25933chr20:30282095-30284805Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30265155-30280569Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30280920-30284601Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30281639-30284593Gastric
SE_33407chr20:30278956-30284610H2171
SE_34309chr20:30279421-30280621HCT-116
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30283535-30284639HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30282089-30285312HUVEC
SE_39443chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_39443chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_39853chr20:30282007-30284720K562
SE_40644chr20:30279507-30280325Left_Ventricle
SE_40644chr20:30281708-30285386Left_Ventricle
SE_42121chr20:30279585-30280236Lung
SE_42121chr20:30281738-30285363Lung
SE_43515chr20:30277822-30284499MM1S
SE_44365chr20:30279339-30280446NHDF-Ad
SE_44365chr20:30281743-30284710NHDF-Ad
SE_44995chr20:30282790-30284602NHLF
SE_45708chr20:30279296-30280436Osteoblasts
SE_45708chr20:30282527-30285331Osteoblasts
SE_47264chr20:30281358-30285573Panc1
SE_48182chr20:30282429-30283232Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30282722-30283493Right_Atrium
SE_48890chr20:30283773-30284597Right_Atrium
SE_50155chr20:30281748-30284675Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30282135-30284696Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30279332-30280429Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51884chr20:30282308-30284717Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30279549-30280268Small_Intestine
SE_52373chr20:30281728-30285346Small_Intestine
SE_53471chr20:30281646-30284749Spleen
SE_55108chr20:30279357-30280124Thymus
SE_55108chr20:30281743-30283556Thymus
SE_55770chr20:30279474-30280292u87
SE_55770chr20:30281854-30284727u87
SE_56767chr20:30281105-30284651VACO_400
SE_57375chr20:30281767-30282407VACO_503
SE_57375chr20:30282804-30283747VACO_503
SE_57919chr20:30281815-30282417VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30279370-30280443HSMM
SE_63683chr20:30282201-30284731HSMM
SE_65412chr20:30281477-30282819Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30281770-30282750Jurkat
SE_66334chr20:30282888-30283497Jurkat
SE_66898chr20:30278956-30284610H2171
SE_67146chr20:30277822-30284499MM1S
SE_67821chr20:30281854-30284727u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203027940030280361
chr203028176830282654
chr203028173330282000
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031690chr203027835430280760
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
ATACAGTATA TACAATAAGC TCTAGGTATA ACTTAAGTCA TAAATAATTC AAATTTACAG 60
CCTTTAACAC CCTATGGAGG CCAGGCATGG AGGCTCACTT GAGGTCAGGA GTTGGAGACC 120
AGCCTGGCCA ACATGTTGAA ACTCCGTCTC TACTAAAAAT ACAAAAATTA GCTGGGTGTG 180
GTAGTGCATG CCTGTAATTC CAGCTTCTTG AAAGGCTGAG GCAGGAGAAT CATTTGAACC 240
TGGGAGGCGG AGGTTGCAAT GAGCCAAGAC CGTGCCACTG TACTCCAGCC TGGGCGACAG 300
AGCGAGACTC TATCTCAAAA TAAAAAATAA AATAAAATAA AATAAAATAA AATAAAATAA 360
AATAAAATAA ACAGGCTGGG TGTGGTGGCG CCCGGCGAAC AAATTAATCC CAGCTACTCA 420
AGAGGCTGAG GCAGAAGAAC TGAAAGACTA TATTTGTAAC ATGCATAGAC AAAGTATTAG 480
TATTCAAAAT ACATTTTAAA AGCCTACAAA CCCATAAGAA AAAGTCAAAT CAAAAGGAAA 540
TGGAGCAAGG ACTTGAACAT TTTACAAAGA GGAAACATGA ATGGCCAACA GATGTAAGAA 600
AAGATTCACA GCCCCACTTG TAATCTGAGA AATGCAAATT AAAACCGCAA GATACCATCT 660
CACACCCACC AGCTCCATAA AAATTTAAGT CTGACCATAT CAAGTATTAA CAAAGAGGTA 720
AAGTAATGGA AAACCCATAT GCTGTTGGTG GCTGTGTAAA TTCACACAAA CACAGGAAAA 780
CAATCTGCCA TTACCTTCTG ATCAAGCAAT TCCACTTCTG TGTAAACCCT ACAACAATGA 840
TTCTCAGTGA GGTCCCAGGA CCAAGAGTGG CAGCATCAGC TGAGAAGTTG TTAGAAGTGC 900
AAATTCTGAG GGCCCCAACC CTGACATACA CAATCAAACA CTTTGGGGGT GGAGCCCAGC 960
AATCTGAGGT TTAACAAACC TTCCAGGTGA TTCTGATGGG CAGCTAAAGT TTGGGAACCA 1020
CTGCCTGGGA GAAACTCTTG AACATGTGCA TGTGCAGGAG ACACAAACAG TTTTCATAAC 1080
AGCATTGTCT GAAACAGCAA AAACAAGGGG ACAACCCAAA TAACCACTGA CAGCAGAATG 1140
GATACACAGC TTGAGACATG ATCATATAAA TGGATACGAA AATGAACAAA TTATGCTATG 1200
CAAGTAACAT GGATGGATCT CAACCTTGAA TGAAAAAAGG AAACTGCAGA TGATAAACAC 1260
AGCATAATAC CTAAATGAAG TTTAAAAGAA TGCACAGGCT GGGCGCAGTG GCTCACGCCT 1320
GTAATCCCAG CACTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCAGATCAC GAGGTCAGGA GTTTGAGACC 1380
AGCCTGGCCA ATGTGGTGAA ACCCCATCTC TACTAATAAT ACAAAACTTA GGGCTGGGCG 1440
CCGTGGCTCA CAGCTGTAAT CTCAGCACTT TGGGAGGCCG AGGCTGGTGG ATCACGAGGT 1500
CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GGCCAAGATG GTGAAACCCC ATCTCTACTA AAACTACAAA 1560
AATTAGCCAG GCGCAGTGGC AGGTGCCTGT AATCCCATCT ACTAGGGAGT CTGAGGCAAG 1620
AGAATCACTT TAACCCGGGT GGCAGAGGTT GCAGTAAGCC AAGATCGCAC CACACTGCAC 1680
TACAGCCTGG GCGACAGAGT GAGACTCGGT CTTAAAAAAA AAAAATTAGT CAGGTGTGGT 1740
GGCGTGCGCC TGTAGTCCAG CTACTCGGGA GACTGAGGCA GAAGAACCGC TTGAACCCAG 1800
GAGGCGGAGG TTGCAGTGAG CTGAGGTCGC ACCATAGCAC TCCAGCCTGG GCGAGAAAGT 1860
GGGACCGTCT CAAAAAAAAA AAACAAAAAC AAAAACAAAA AAAAGCATGT AGAAGAATAT 1920
CCTATATTGT TTAGGAATAT ATACCTATAT ATATATAGTA AAACTTAAAA AAAAAAAAAA 1980
AAAAAGGTAG CCAGGTGTGG TGGCTCACAC CTGTAATCCC AGTGCTTTGA GAAGCTGAGG 2040
TAGGAGGATC GCTTGAAGCC AGGAGTTCTA GACCAGCCCA GGCAACATAG TGAGATCCCA 2100
TCTCTAAAAA AAATAATAAT AATAATTAAA AAATTAGCTA CTTGGCAGGC TGAGGCAGGA 2160
GGATCACTTG AGCCCAGAGG TTTGAGGCTG AAGTGAGGTA TGATCATGCC ACTGCACTCT 2220
AGCCTGGTTG ACATGGTAAG ATATCACAAA AGAAAACACA GAACTCAGGA GTATGGATGG 2280
TGGGGTAGCT GTGATTGGGG AGGGGGTACA CAGGGGGCTC TAAGGTACTC ACGTTTATTT 2340
TTGTTTGTTT TTAGAGACAA GGTCTCCCTC TGTTGCCCAC ACTGGAGAAC AGTGGCGCGA 2400
TCATAGCTTA CTGCAGCCTT AAACTCCTGG GCTCAGGTGA TCCCCGACTC AACCTTCTGA 2460
GTAGCTGGAG TTATAGGCGT GCACCACCAC GCCCAGCTAT TTTTTAATTT TAGTTTTTGT 2520
AGAGATGGTG GTCTCACTAT GTTGCCCAGG CTAGTCTCAA ACTTCTGGCC TCAAGCATTC 2580
CTCCTACCTC AGCCTCCCAA GTGCTGGGAT TACAGGCATA AGCCATCATG CAAGGCAAAC 2640
ATATGTTTGA TTATTAATTA ATCTGGGTGA TGAGTTTACA AGTGATGATT TTCCTATTTT 2700
TAAAATTGTA CATATGCATT AGATATTCTC TGTTGTATTT ATGATAAATT TCTTTAAAAA 2760
AAAAAAGTGT ACTGAAACAG TGCAATACTC TGAGCCAGAA CTGTAACAAC TAACTCAACA 2820
TATGCAGTGT CCGAAGGGTT AAGCCTGTTT CTCTGCCTGT GGGTGGGAGG GCAGGCAGCA 2880
GCTGGGGCAC AGTGGGAGTT CCTGGCTCCA GCTGGCTCCA GCCTGGATCA AGCACCACGC 2940
CCAGGAACTG GCACCTGTAG GGGGGGCTTC TGGACAGGTG GCACCTGTAG CCCTTGGTGA 3000
CCTGATACAT GTGAGAGGCT GGGCCCAGTC AGATGGGTGG TGGGCTTCTG TCAGAGCCCC 3060
TCCATCTGGT AAGGAAGTTT GCTGGTGGCA GCTTGGAGCT GGTGAGAAGG GGAAGAGGGT 3120
CTAGGACACA GGATGGGGGT GGGGAAGGAA GTGGGTGGGC TGGGCTCAGA TACCAAGGGA 3180
GGGTGGTGGG ATTAGCACCT GCTGAGAATG AGATTAGGTT TCTTGGGAAG GGCTCATCTA 3240
TCTAATGCTC CCCGAAAGCT GTCTCCCTGT GGCTTTTCTC TGCTGGACAG ATGGTGTCTG 3300
AGCTGCCTCT TGGAGGGCGG GCTCCTTGAG GGGGTGGTGG AGGTGGAGTG TGACCTGCTG 3360
CCTGCTTTCC AGAGGACCTT GAGGCCCTGG GACTTCTTGT CTTCCAACAA TAGTAATAAG 3420
GATTAGAGCT AACTCTTACT GAAGGTTTAC CATATGCCAG GCATTGTCCT AAGCCCTTCA 3480
TACAAATTAC CCTCATTTAG TTTTCACAGC ACCCAACTGC CTATCATCTA GACAGTAGGC 3540
TTACATTGAA GGAAACTAAG GCTTGGCAAA GTCAAACACT TGCTCAAAGT CAAACAGTAA 3600
GCAGGGCCTG GTGGCGTACC TATAATCCCA GGAAGATAGA GGCGGGAGGA TCACTTGAGC 3660
CCAGGAGTTC GAGACAAGCA CAGGCAACAT AGTGAGACCT CATCTCAAAA CAACAACAAA 3720
AACAAAACAG TAAGCAAACT AGGACTTGAA TGCAGGCAGT TCAACTCCAC AGCCCTAGCA 3780
GGAAATCACT ATCAGCCAAG GCATCTTCCC CTTATTAAAT GGCAGTAAGG ACTTTCCAGT 3840
TTCTTAAGCC AAAAACCTGG ACTCCTTTCT CTCTCACCTC TTATCCAGCA AACATCAGCA 3900
AATCCAGTTG GTCCAACCTT CAAATTGTAT TGAAGCTCTG ACCACTGCTC GCCACTTCCA 3960
CCACCCATCC ACCCTGGTAT AAACTGCTGT TATCACCCAC CTGGCTTCTC ACTGGTCTCC 4020
TGCTCCCGCT CTTACCCATA GAGTTTGTTC TCCACATCAG AGAGATCCTT CTAAAACCTG 4080
TCACTTCTTT GCTTAAAAAT CCTCCATGCC TTTCCACTGC CCTTAAAGCA AGGTCCCATG 4140
TGGCCCTACA AGACCTGGCC CCTGGTGACG TCTCAGACCT GATTCCTACC ACTGGCTTAC 4200
TCTACTCTGG CCATACTGGC CAACTTGCTG TACTTTAAAT ATGTTGGAGA GTCTTTTTTT 4260
GTACTTGCTT TATTTTTTAA TTTTTTTGAA ACAAGGTCTT GCTCTGTCAG CCAGACTAGA 4320
GTGGAGGGAC AGGATCATAG CTCACTGCAG CCTCAAACTC CTGGATTTAA GCCATCTTCC 4380
TGCCTCAGTG TCCCGAGTAG CTAGCTAGGA CTACAGACAT GCACCACTAT GCCCAACTAA 4440
ACTCTGGCTT TGTCGCTCTG GCTGATCTCA AACTCTCAGC ATCAAGTGAT CCTCCTGCCT 4500
TGGCCTCCCA AAGTGTTGGG ATTATAGGCG TGAGCCACTG CATCTGGCTT TTTTTTGTTT 4560
TACGGCTTGC TGTTCTCTAT GCCTACAACA CTATTCCCCC ATATATCCGC ACAGCTCATG 4620
CCCTCACTGC ATTCAGATCC AATGTCACTT TATCAGAGAG GCCTTCCTAA CTACCCTACC 4680
CTTCCTTTTC CCATCCCTAA TCCCTTTTCT CTGCTTTATT TTTCCCTATA TCACTAAATA 4740
CTACCTCACA TGTTATTTAT TTTTTAGAGG TGGGTTGTCA CTATGTTGCC CAGGTTGGTC 4800
TCGAACTCCT GGGCTCAAGC AATACTCCCA CTTCAGCTTC CCAAAGTGCT AGAATTAAAG 4860
GCGAGAGCCA CCATGCCTAG CCCTGACATG TTAATTTACT TAAAATCTGT CACCCACCTT 4920
GGAATGTCCA CTGGGTGAGA ATAGGGACTT TGGTTCGTTC AGACTGTATG TCCAACCTTT 4980
AGCTCAGTCC CTGATATATG ACAGGAATGC AATAAATACT TGTTAATGAA CAAATGAATG 5040
AATGACCAAT ATCCCTCAGG AAATGACTCA GACTCAAAGG GGAGTAAGGC TGCCTGAGTG 5100
TCCTTGGCTT TCACAGCCCT GATGACCTTT GGTACCCCAT GGCAGCGGTC AACGTCCTTC 5160
CCTATTATGA AATGTCCTGG GTGCATAGCA TCACCACTGT GTCATCTACT TGTGCCTGCA 5220
CCCATGCAAA CACACAGGGA CACAAAGCTG GAAAAGGGCT GGTTTTGAGA AGGAGTAAGC 5280
CTGGGCAGTT GAAACCCAGG TTCGGTGTAC TCTAGGGCAC TTACTTCTAG GTGACTGTCC 5340
TTGCCACTGC TGGCGTACCA AGGTCTCCCA GTCATATGCC CATGCACTGT ATACATTTTG 5400
GCATTTATTC TCATGAATAA AGTGTCATTA GAGGCCAGAC ACTGCTGGCT AACGCCTGTA 5460
ATCGCAGCAC TTTGGGACGT CAAGGTGGGA GGACTGCTTG AGCCCAGGAG TTAGAGACCA 5520
GTCTGGACAA CACAGTGAGA CCTTGTCTCT ACTAAAAATT TAAAAATAAG CTAGTCGGCC 5580
GGGTGTGGTG GCTCACACCT GTAATCCTAG CACTTTGGGA AGCCGAGGCG GGTGGATCAT 5640
CTGAGGTCAG GAGTTCGAGA CGAGCCTGGC CAACGTGGTC AAACTCTGTC 5690