EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-14225 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr19:39173150-39177710 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs973009chr1939174332hg19
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr19:39176207-39176218CTAATCCTCTC-6.02
Foxd3MA0041.1chr19:39175584-39175596GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39175588-39175600GTTTGTTTGTTT+6.32
Foxd3MA0041.1chr19:39175592-39175604GTTTGTTTGTTT+6.32
RREB1MA0073.1chr19:39177414-39177434TGGTTTGGGTTGGTTGGTTG-6.4
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA-6.43
SRFMA0083.3chr19:39174375-39174391TGCCCATATAAGGCAA+7.04
STAT1MA0137.3chr19:39175026-39175037TTTCCTAGAAA-6.14
Number of super-enhancer constituents: 79             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39172709-39178176Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39172839-39177657Aorta
SE_02408chr19:39172990-39177649Astrocytes
SE_02946chr19:39173560-39175782Bladder
SE_02946chr19:39175844-39176424Bladder
SE_02946chr19:39176426-39177590Bladder
SE_03166chr19:39174301-39175014Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39175825-39177560Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39172941-39177792Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39173279-39175506Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04868chr19:39175517-39177731Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39172836-39178090Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39173207-39177647Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39173597-39177838Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13194chr19:39173530-39174621CD34_Primary_RO01480
SE_13490chr19:39171584-39177811CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39172843-39178692CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19537chr19:39173158-39178239CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39169957-39177919CD8_primiary
SE_23062chr19:39172808-39177650Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39172948-39175688Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39175772-39177606Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39172745-39175747Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39175790-39177583Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39172863-39178234Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39173105-39177586Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39172828-39178145Gastric
SE_34299chr19:39171460-39178238HCT-116
SE_34681chr19:39170836-39180506HeLa
SE_35430chr19:39173018-39177757HepG2
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39172846-39178074HUVEC
SE_38896chr19:39172978-39177574IMR90
SE_40018chr19:39173109-39177708K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39173026-39175372LNCaP
SE_41601chr19:39175790-39177612LNCaP
SE_42097chr19:39171618-39178328Lung
SE_44161chr19:39172957-39177683NHDF-Ad
SE_44797chr19:39173417-39177160NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_46686chr19:39173697-39175316Ovary
SE_46686chr19:39175843-39176491Ovary
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39172966-39175743Pancreas
SE_47461chr19:39175774-39177484Pancreas
SE_48075chr19:39168529-39178289Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39172970-39178180Right_Atrium
SE_49449chr19:39173064-39175397Right_Ventricle
SE_49449chr19:39175778-39177507Right_Ventricle
SE_50056chr19:39172842-39178237Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39172773-39177883Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39173163-39177229Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39168564-39178308Small_Intestine
SE_53291chr19:39172716-39177734Spleen
SE_54534chr19:39172958-39177716Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39173251-39174352Thymus
SE_55638chr19:39174378-39175365Thymus
SE_55638chr19:39175739-39176457Thymus
SE_56725chr19:39172594-39175708VACO_400
SE_56725chr19:39175804-39177608VACO_400
SE_57359chr19:39173016-39175736VACO_503
SE_57359chr19:39175799-39177608VACO_503
SE_58038chr19:39172904-39175754VACO_9m
SE_58038chr19:39175814-39177664VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39172985-39177528HSMM
SE_64225chr19:39172977-39177763NHEK
SE_65266chr19:39168886-39178027Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39172837-39175413H9
SE_68725chr19:39175534-39177843H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr193917500039175365
chr193917734039177518
chr193917587739177590
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CAAGAAGTCC TGTTAGCTCT GCCTTCAGAA TCTACCCCAG GTCCTTTTAG TTCTCTCCAG 60
CCTCACTGCT GGAACCCTCA CCCAAGCCAC CACCTTGCAG TCCACACACG GCCACTGGGA 120
TTGGGGCGGC GTTCTCCGCG CGAAATCTGG CTGTGCTCCT CCCCCATGAG GCCCTCCAAA 180
GGCTTCCTCT TCTTAGGATG AAACCCACAC TGCCAGCCGA AGCTCCTCAG GCTCCCACCC 240
TCTACAAGCT CCTTCTGCTC CAGCCACACT CACCAGGCCC GAGTTCCCAC CTAGCACCTT 300
CCCTGGGAAT GATCTCCCCC TGGTTGGCTC TTTCTACTTA TTCAGCCTCA AATGTCATCT 360
CCACTGAGAG GCCTTTCCTG ACCTGCTGAG CTTGATTCCC TCCCCTCCCC AGTCACATTA 420
CTCCGTGTTA TGGTACCCAT CCCTGTCTCC TTAGCTTGTT TTTGTCTGTA TTGGCTCTTC 480
CACTAGACTG TAAGTTGCAT GAGGGCAGGG ATGTCTGTTT AATCCCAGTG CTCAGGATAG 540
TGTATGGCTC GTGATAGATG CCTAGTACAT TTTAAAATGA GAACGAATGA AGTTTGGGAG 600
AGGCTCAGAG CAGTGAGTCT CCCCCTTGTT GGGGGACTGG GGAGTGCCTG GGAGGGGCTA 660
TCTGGTGCCA GCGGTTTGGA GTGGCTGGGA TGACTCTGGA ATCCTGTGAG GCCCAGTCAG 720
TTTCTTTGGT TCTCATGCAG TGCAGTGCCC TCAGACCTAA CCATTTTGTT CCGTGCTGGC 780
TTGAAAGGGT CTGCCTCCCT CCCAGTGCAG CCCCTGCCTC TCCTCTTTCT CGCCCCCCGC 840
CCTCCTCCAG AGAAAGCAGG TGGTGAGGGC TCTCTAACCC AGACAGGACT TGCTGTTCAG 900
CCCCAGCTTG AAATTGATTT CCTCCAGCCC TCCTTGAGCC AGGCCCCGTG AACAGAGGAG 960
GGGTCTGAGC CAGGCCTCCT AGGCCATTGG TGGGAGGGAG AATGAGACAG CCATTTGGCC 1020
CACAGGCCAC CAACTTTTCC CCCCCTTCTC TAAAAGACAC ACAATGGCAG TTGGGCTGCA 1080
CCTTTGTGAG TCACCGGTGA TAGCCCATCA TAAATTGTTA TTTCCTATAT TTCCAGAGCA 1140
GCTTTATCGG GCGTTGCCTG TGCAGTCCGG GAACCGATTT GGTATGGGGT CAGTTAACAT 1200
GCTGTCTTGT TGAAATCTGT CATCATGCCC ATATAAGGCA AACTCCTTGG ATTACTTTTT 1260
ACCTTGGCAG AATCACAGGA ATGTCAAGGT AACCAGGCCA CCTCAGCATA GCTCTGATTC 1320
TCACCCGGTC ACCTGACTTG CCCGCCCTCC CCCATGACTC ACCCAGTGGC TCAGCATGGG 1380
GCCTGCTGCA CTGTGGCTGC TGGAATCTGC CAAGGACCTC CTGGGACTGC CCTTGGTTTT 1440
GTGTCTTCCT TAGAGTAGAT CAAATGAGAG GAACCATGTG AAGTAGCTCA CACAGGGCCT 1500
AACAGAGCAA ACACAAGACG TGGAAAGCAG ACTTGGTGAG GCTTGAGTTT AGTTTGGGGG 1560
TTGCGGGGGT CCCAGCTCTG CTGCTTAACA GCCCTGTGGC CATGGGTATA TCCCCCAGCA 1620
TTCAGAGCCT TATCTGTAAA ATTAGAGCAC GCAGAACAAA CCCTGGTACA CACTAAGTGC 1680
TCAATAAATG TGAGTCATTT GTGTAATTAT AGTAGGGTAG GCCTTATGCC CCACCCAGTC 1740
ATAAAAATGC CTCTTGCTGT TGTTGGTTCA GGCTCAGCCC CTTAGTGGCT TTCATGGGGC 1800
AGGTTGACAT GGTACCCAGA GTCCTCCTCG GTCCTCTTCC CATGGTGTAG TGAGAGCACT 1860
CAGGACCACC TAGGCCTTTC CTAGAAAACT GAACCCACAC CTTCCCAGTG CTGCCCCACC 1920
CTGGTCCCCC ACCCCCTGCA GGACAAACCA CTCCTCCCTT GTTTTGGGGC CAGGAGTCAG 1980
ATCTGCCCCT GAGAGCAGCA GGGGCCCCTT TGTCCTTTGA CGTCATACCC ACACCGCTCC 2040
TGGAGACAGC CACCCCTTCA TGCCAGCCCC AGGAAGGCTT GTAGGTGGGG CGAGCCAGGG 2100
TGAGAGTGTA GCCCTGTTCC TCGGCCAGGG CAGATGTTTC ACCATTTTTA ATGGAGCAAT 2160
TATGAGTCAG AGGTTTCAGT CTCTACTGGT TCCTCCCGAT CCTATAATTA CTCTTTGGCT 2220
ATAGAATCCT ATTTTGATCT CTTCTTTTCT TTTCTCTTCT TTCTCTCTCT GTGGTCATGG 2280
TCAGGTTTTT CTTTTTTTAA ATCCTCCCAA GACACTGCTA ATGTTGTCTG TCTCATGCAT 2340
CCAAGGAATC TGAGATGGAC TGAATATTGT CAAGGGAAAA AAAAAGAGAC CCCCAAATCC 2400
AGAGTGATTT CTTAACCCAC CCAAATGGCT TTTTGTTTGT TTGTTTGTTT GTTTGAGACG 2460
GAATCTCGCT CTTTAGCCAG GGTGGAAGGC AGTGGCGTGA TCTCAGCTCA CTGCAACCTC 2520
TGCCTCCTGG GTTCAAGCGA TTCTCCTGCC TCAGACTCCC AAGTAGCTGT GATTACAGGC 2580
ACATGCCACC AAGCCCAGCT AATTTTTGTA TTTTTAGTAG AGATAGGGTT TCACCATGTT 2640
GACCGGGATG GTCTCGAACT CCTGACCTCG TGATCCACCC ACCTTGGCCT CCCAAAGTGC 2700
TAGGATTACA GGTGTGAGCC ACCGTGCTTG GCCAACCCAC CCAAATTGTG TACCCTACAC 2760
CATCCTAGTG CTTGGGAGCC AACACCCACT CACAGGAGGC TAAGGGCAAG TTTAGGTAAC 2820
TCTTAACACC ACGAATTAGT TGCCTGCTGG CAAACTTCAA ACTCCAAGCC TGAAATTTCT 2880
GGTTGGAGTC ACCTCCCAGA TGGACTCAGG GATTCATTCA CCCCCTCATC CAGTGCTCAC 2940
GGAGCCTCTG TGAGGTGCAG GCCTGGAGAG GAGCCCTGTG GCCTCAGCAA AGGGCAGGCA 3000
GGCTGGTGAG CACCCAACCT CTGGATCGAG GGGACTCAAT TATGCGGATA AAGGCCCCTA 3060
ATCCTCTCAG TGCTCCAAAC TCACTCTGCT TCTGAAAGGG ATCTTCGTAC CCTGGGTTCA 3120
GAGAGTAGGA AGCCCGCAGG GACCGAGTAT GCATGAAACA AGCCCAAGTC TGTGGGGGCT 3180
GTACATGGTC AAGATCACAG ATTTCCAGAC CAAGCCAGCT CCACCCTAGC TGGGATGCCC 3240
ACCCTGAGAC ACCCCTCTCT GCTTTCACTG GAATAGGATG GCCCTGACTT GGCCGGGTGG 3300
ACTGTTGAAT CAGAGCCTCT CAAAACAGGA AAAAGGAAAA GGATCACCAA GCAGGAGTTT 3360
CAGTTGTCAA AGACAAAACC CTTACCACGA TTAAAGATTA CTCCAGGGCC TCGCATATTC 3420
ACCCTTCCAC CAGCAGGGCC CAGTTTACGG ATCATTTGAA TACTAGCAAA AAAACAAGCC 3480
ATCTGCTGGA GAGATTGAAC AGAGGGAGAA ACAGGAGTGT TTGCCCTGCT TCCAGACACC 3540
CCTTTCCTGT GGCAGTTCCT GCACCTGGCA AGATCTACTG GGGAATTCCC GGGGTCCCAC 3600
TAGCTCAGGA CGGGTGTGTA GCACTTGCCT AAATAACAAT CCCATCAGTG CCCTGTCTGA 3660
CCTTTTCTCC CCAAATGCCA AAGGCCTCTT GTCTGGATGA ACAAATCCCT GGGCGGATTT 3720
GTCCAGACTA AAACGTTAAT TCTAAAGACT GGGCCCCTTA GGCACTCGCT AAGATTCCAG 3780
GCCACACTGT CTCAAGGCCA GAATTGGCTT ACTTGGCTAT CTTTTTGAAA GATCAAAGTT 3840
TAAACCAGAT GATCTGTAGT CCCCCACCCC CACCCTGAAA CCTGAGCTTA GCTGTAAGCA 3900
TTGAAAGTAA ATGGGGTGTT TGTAGCTCAC CCTCCCTGTT CTCCAGGTGA AGGGCCCCGT 3960
GTGCCTGATC ATTTCATAGC AAAATGCTAG ATGGGGCCAG AGGAGGCCCC AGCCTCTGCT 4020
GCTGCCCTAA TTTTAAAACT GCCTTTTGGG AGTGTAAGTT TCCTCTGTTA AAGGTAGTTA 4080
TTTCAAGGTA GGCCTCACCA TCTCCTCCTC CTGGTGAGAA GCTCTGCCTG GAGGGCTGAG 4140
CACTGCCTCC CGCTCTGTGG GCCCCACCTG CCTTGGGTTG AGACCTATCT CTTCCTGGAC 4200
TCTGTGTGGG GAGTGCAGGC TCTTCCCCTT GGGGAGAACC CAGTTCTTTG ACGTATAATC 4260
TGAGTGGTTT GGGTTGGTTG GTTGGTTGGT TGGTTGGTTT CCCATGTGTG GGATGGCTCC 4320
GGAAGTCTGT TTGAGAACAG AGGCAGGCTC AGATGGGAGC AGCTCCTACC CCGGGCCGCC 4380
TATCCCCCTT TACCCTGGGG TTTCTTTTAG CTCCAAGCAT CCATTCCAGT CTAACAAATC 4440
TGGTGGCAGA GTCTCTTTTT TTTTTTTTTT TGAGACAGAG TCTCACTCTG TTGCCCAGGC 4500
TGGAGTACAG TGGCACAATC TCGGCTCACT GCAGCCTCCG CCTCCTGGGC TCAAGCGATT 4560