EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-12777 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr18:2958200-2960640 
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr18:2960385-2960406AATAATTTTCAGTTTCCCTTT+6.19
IRF1MA0050.2chr18:2960391-2960412TTTCAGTTTCCCTTTCCCTTG+6.65
IRF1MA0050.2chr18:2960336-2960357ATCTAGTTTCTGTTTTGCTTT+6.77
IRF2MA0051.1chr18:2960390-2960408TTTTCAGTTTCCCTTTCC-6.41
Lhx3MA0135.1chr18:2959845-2959858CATTAATTAATTT-6.54
POU6F1MA0628.1chr18:2959846-2959856ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:2959846-2959856ATTAATTAAT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 35             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00574chr18:2955664-2962654Adipose_Nuclei
SE_09781chr18:2957955-2964204CD14
SE_10621chr18:2956157-2963999CD19_Primary
SE_11211chr18:2955421-2965599CD20
SE_11888chr18:2954270-2965406CD3
SE_13797chr18:2959029-2959837CD34_Primary_RO01536
SE_13797chr18:2960020-2960860CD34_Primary_RO01536
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SE_15580chr18:2958273-2965388CD4_Memory_Primary_8pool
SE_16149chr18:2959566-2962287CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16392chr18:2958193-2965256CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16996chr18:2958261-2964094CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17424chr18:2953224-2965618CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17870chr18:2953882-2974054CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18346chr18:2955510-2974150CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19436chr18:2954812-2965462CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20084chr18:2955732-2964153CD56
SE_21011chr18:2958230-2964978CD8_Memory_7pool
SE_21798chr18:2959152-2964179CD8_Naive_7pool
SE_22207chr18:2958088-2965485CD8_Naive_8pool
SE_22362chr18:2953866-2965617CD8_primiary
SE_26140chr18:2958139-2962798Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28431chr18:2959830-2962157Fetal_Intestine
SE_29294chr18:2959203-2961178Fetal_Intestine_Large
SE_31871chr18:2959820-2960346Gastric
SE_32704chr18:2956087-2964115GM12878
SE_46307chr18:2958145-2960053Osteoblasts
SE_46307chr18:2960219-2962620Osteoblasts
SE_51026chr18:2959588-2960299Sigmoid_Colon
SE_52825chr18:2958971-2960373Small_Intestine
SE_52825chr18:2960375-2962329Small_Intestine
SE_55616chr18:2958976-2960334Thymus
SE_58874chr18:2954099-2995404Ly3
SE_59888chr18:2955879-2985795Ly4
SE_62302chr18:2955378-2999752Tonsil
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH18I002955chr1829552532963963
Enhancer Sequence
TAATCAAGTA ATCAGCTTTT TCTGATATCA ATAAATTTTA AAATATCAAG TACACATTTA 60
CCTTCTAAAA GTAAACTCCT AAGTTACTAA ATTTACTGGG AGTACTGCTG TTCTACCAAA 120
CAATTACGTA TCAATGGCAG TGGGAAAATT ATTATACTAC ATCTCTCTAA ACAGTGGTTT 180
TAAGGTGGTC ATGATTTCAA ATTCACTTCA TAGGTACACC CGTATTTGAA AATTTGGGGT 240
CTTACTTTCA CATCAATGGC CAGCTTTCCC TAACCCAAAC TGACTTAAAA TAAGACAAAT 300
AGTTAATGCA AATTGCCAGT GTATCTCAAA GTAGGCATGA TTTCAGTTTT ACTCTCACAG 360
TTTTTCAGTT TTCTCACAGG AAAGCTGTTT TGGTAAATCA AATGGCCAAA TTTCCTCCCA 420
AACATATTCT TTGGGTTTCT GAGATACTAA GGGAGTAGGA GGAAAAAAAT TCTCTTTTCC 480
TGTGTCTCAT GAGTACATTC CTATTAAAAA TGCAACGTTT TGACAAGATA GTAACACAAC 540
GATTGTGTAG CTTTTGCACA GGAATTGTAT TATTTCCTAA ATTAGAGGCA CACAGCAAGC 600
AGGAAAAGGT GTTTTATCTA CTTGGTCACC ATTTACAGAT GCATACATGC TTATAAATAC 660
ATCTGCCTTC AGGTTCCATT TTGAAAGGCC AGACACTGAT CCAATGTGAT AAAAAACAAT 720
CTCAGCAAAA AAAAAAAATA ATGATGATGA TACCTTATCA GCAGTTTTAC AATAGATCCA 780
TACACAACTA ATGGGAAATT TCAGTTTGTT GCCAATTCCC CCAGAACAGG TCCAGTCTGA 840
AAGTACTATT GGTGTTACCA CAAAGAAAGA AAAAATTTCA GAGAACCTAA ACTATGGCTA 900
AATAACACTG TTTTGCAATG GAAAGTTTCT AAGTCCCTAA GTAAACTGCA ACTGCTTTTG 960
CTTTCTAAAG GGTGACTCTG AACAGAGGCC AGACCACACA AGCCCTGCTA CCCTGAAATG 1020
TGGTTCTCCA GTGGAAACTG ATTTTGTAAT ACCTAGAAAT GAGATGTTTT TCCTGGAGGA 1080
AAAAAAGAAA AAGAATATCT AGTTTTGTGA AATCCATTTT CTTTCACTCT CAAAATAACA 1140
TTTAAGTTTA ATTAAATAGA GGGAAATTTC TATTTAAAGC TCAGCTATAT AAAATAGCAA 1200
AAAGCTGAAA ATAAATGTTT TCGACTTACA CCAGTGGTCC TCTACCACAT ACTTTTAGGT 1260
CTGTGCCAGA AAATGGTGAG GCTCTTTTGT TGTGCTTTAA AATGTTGACA AAGCCTTTCT 1320
ATGTTATTTA AGTAGATACT GCGAGGCAAG AATAGAAAGA GAAATCTGTG TACCTGCCAA 1380
GTGTTATTAC TAGCTCTGTT TTCTAATTTG ATTGACATCA GATATACTAG CAAAACTTCC 1440
AGCTGCTCCA TAACCTGAAG AGGATAAGAA AAACCTACAC AAATATCTTC TTCCTGAATG 1500
AATCTTCCCT AAAACAAACA AAAGTCAACC AGCCTATGGT CTGTTGGTTA GCATTTCAGT 1560
CAAATATGGG GACAAGTCCT GGTATCAACA ACAGAATTTA GATTACAAAA GTTTTTACAG 1620
CTTTGTCAAA ACAAACAAAA TGTGGCATTA ATTAATTTCC TTTAAAAAAA AAAATATGGC 1680
CAGGTGCGGT GGCTCTACAC CTGTAATCCC AGAACTTTGG GAGGCCGAGG CCGAAGCCGG 1740
TGGATCACTT GAGGTCAGGA GTTCGAGACC AGCCTAGCCA ACAAGGTGAA ACCCCGTCTC 1800
TACTAAAAAT ACAAAAAATT AGGGGGGCAT GGTTGCACGT GCCTGTAATC CCAGGCACTT 1860
GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TCGCTTGAAC CTGGGAGGCG GAGGTTGCAG TGAGCCAAGA 1920
TCACACCGCT GTACTCCAGC CTGGACAGCA AAGCGAGACT CCGACTCAAA AATGTGTGTG 1980
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTTCT TGATTATACC CACCTATTCC 2040
ATTTACAATT AGTATGAAGG TATTAGCCTA AGTATTTAAA AATACTATAT AAGGTAAAGG 2100
AAATTTTTCT TTTTCTAAAT ATGTCTAAGT TCCCCCATCT AGTTTCTGTT TTGCTTTTCT 2160
GAGTTGCAAC ATGTAAGATT ATTATAATAA TTTTCAGTTT CCCTTTCCCT TGAAGAGACT 2220
TCTGCAGTCG AGCTTTGTGG TTTTCAAAGT AACTTCAAAA GCAATACATA AAGGTTGACT 2280
TCTCGTAACA TTGTCTCAAC ATCATTCAGG TTAAAAAAAA AAAAAGGCCT AGAAAACTCA 2340
CAATAGCGAT TTATTCATAG AGGATGACTT TTCTACTCCT TGAGGACACT CACTCACTTT 2400
CTCTTTGAAT CTCAGGATGA CTTTTCCTCT CCTTGAGGAC 2440