EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-04767 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr11:65243690-65247480 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs686320chr1165244538hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246290-65246308GCATCCTTTCCTCCTTCC-6.19
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246294-65246312CCTTTCCTCCTTCCCTCC-6.56
HNF4GMA0484.1chr11:65246233-65246248TGACCTTTGCTCTCC-6.09
RREB1MA0073.1chr11:65245283-65245303ACACCACACACCCCACCCCA+6.78
TFAP2AMA0003.3chr11:65245431-65245442TGCCTGAGGCG-6.62
ZNF263MA0528.1chr11:65245371-65245392CTCTCCGTCCCCTTTTCCTCC-6.05
ZNF263MA0528.1chr11:65244555-65244576AGAGGATGAAGGGCGAGAAGG+6.15
Number of super-enhancer constituents: 108             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00783chr11:65244461-65245009Adipose_Tissue
SE_00879chr11:65243737-65247689Adrenal_Gland
SE_01577chr11:65243681-65245828Aorta
SE_01577chr11:65245864-65247837Aorta
SE_02242chr11:65243690-65245837Astrocytes
SE_02242chr11:65245846-65247850Astrocytes
SE_02898chr11:65243900-65245721Bladder
SE_02898chr11:65245861-65247649Bladder
SE_03165chr11:65243833-65245629Brain_Angular_Gyrus
SE_03165chr11:65245855-65247985Brain_Angular_Gyrus
SE_03882chr11:65243488-65248309Brain_Anterior_Caudate
SE_04846chr11:65243590-65248492Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06693chr11:65243625-65248376Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07762chr11:65243485-65248309Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08788chr11:65243930-65244325Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65244350-65245047Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65245100-65245564Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65246013-65247878Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09268chr11:65243462-65246742CD14
SE_11317chr11:65243218-65247007CD20
SE_12675chr11:65244377-65244982CD34_adult
SE_12675chr11:65245163-65245544CD34_adult
SE_12859chr11:65243747-65246162CD34_Primary_RO01480
SE_13317chr11:65243305-65247514CD34_Primary_RO01536
SE_14049chr11:65243474-65246108CD34_Primary_RO01549
SE_14376chr11:65243250-65248236CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19912chr11:65243461-65246522CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20736chr11:65243345-65248112CD8_Memory_7pool
SE_23775chr11:65243752-65245648Colon_Crypt_2
SE_23775chr11:65245744-65247567Colon_Crypt_2
SE_24819chr11:65243713-65245815Colon_Crypt_3
SE_24819chr11:65245945-65247705Colon_Crypt_3
SE_25770chr11:65243454-65248568Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26547chr11:65243712-65247764Esophagus
SE_27634chr11:65243475-65248010Fetal_Intestine
SE_28555chr11:65243470-65247915Fetal_Intestine_Large
SE_29556chr11:65243690-65248034Fetal_Muscle
SE_30929chr11:65243697-65247190Fetal_Thymus
SE_31424chr11:65243704-65247822Gastric
SE_32522chr11:65243694-65245937GM12878
SE_33163chr11:65244384-65245646H1
SE_33445chr11:65243783-65246412H2171
SE_33445chr11:65246425-65248022H2171
SE_34266chr11:65243277-65248485HCT-116
SE_34617chr11:65237426-65277580HeLa
SE_35831chr11:65243480-65248037HMEC
SE_36925chr11:65243656-65250247HSMMtube
SE_37995chr11:65243474-65247266HUVEC
SE_38870chr11:65243701-65245815IMR90
SE_38870chr11:65245883-65248011IMR90
SE_39628chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_39628chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_39847chr11:65242346-65247990K562
SE_40612chr11:65243484-65248051Left_Ventricle
SE_41603chr11:65243830-65245629LNCaP
SE_41603chr11:65246191-65247746LNCaP
SE_42107chr11:65243459-65247905Lung
SE_43442chr11:65243703-65245696MCF-7
SE_43442chr11:65245821-65247985MCF-7
SE_44137chr11:65243645-65248494NHDF-Ad
SE_44750chr11:65243565-65248057NHLF
SE_45562chr11:65243454-65248511Osteoblasts
SE_46695chr11:65244339-65245629Ovary
SE_46695chr11:65245876-65247656Ovary
SE_47127chr11:65243490-65277571Panc1
SE_47538chr11:65243903-65245646Pancreas
SE_47538chr11:65245995-65247517Pancreas
SE_48070chr11:65241375-65248038Psoas_Muscle
SE_48581chr11:65243560-65245838Right_Atrium
SE_48581chr11:65245850-65247830Right_Atrium
SE_49457chr11:65243757-65245718Right_Ventricle
SE_49457chr11:65245877-65247582Right_Ventricle
SE_50062chr11:65243572-65247904Sigmoid_Colon
SE_51077chr11:65237462-65248280Skeletal_Muscle
SE_51697chr11:65243660-65245825Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51697chr11:65245863-65247937Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52357chr11:65243567-65248006Small_Intestine
SE_54467chr11:65243714-65247868Spleen
SE_54503chr11:65243495-65276614Stomach_Smooth_Muscle
SE_55162chr11:65243857-65245663Thymus
SE_55162chr11:65246193-65246851Thymus
SE_55732chr11:65243661-65248051u87
SE_56764chr11:65243730-65245661VACO_400
SE_56764chr11:65246058-65246660VACO_400
SE_57390chr11:65243794-65245665VACO_503
SE_57390chr11:65246011-65247348VACO_503
SE_57928chr11:65243807-65245743VACO_9m
SE_57928chr11:65246166-65247148VACO_9m
SE_58932chr11:65238587-65276390Ly3
SE_59720chr11:65237780-65272476Ly4
SE_60674chr11:65238641-65271340DHL6
SE_61239chr11:65237836-65278618HBL1
SE_62240chr11:65238321-65275907Tonsil
SE_63249chr11:65244238-65267283GLC16
SE_63391chr11:65243820-65268347NCI-H69
SE_63485chr11:65243646-65248049HSMM
SE_64233chr11:65243668-65247416NHEK
SE_65811chr11:65242911-65247755Pancreatic_islets
SE_66427chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_66427chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_66874chr11:65243783-65246412H2171
SE_66874chr11:65246425-65248022H2171
SE_67468chr11:65243661-65248051u87
SE_68042chr11:65238458-65277023TC32
SE_68043chr11:65238458-65277023TC32
SE_68495chr11:65243635-65267694TC71
SE_68496chr11:65243635-65267694TC71
SE_68897chr11:65244262-65245818H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr116524595465247012
chr116524627965246484
chr116524463865245303
Enhancer Sequence
AGAATCGCTT GAACCCAGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC GAGATCGCGC CTCTGCACTC 60
CAGCCTGGGC GACAGAGCAA GACTCCGTCT CAAAAAAACA AAAACAACAA CAAGAAAAAG 120
AGGTGTGTTA TTTAACCTTT TCTTAGAAGC TTCTCTGCTG CCCCCAATCT TTCTCAGCAA 180
TCCTAAGCCT TGCTCCAGTT ACTGGTTAGA GCTGGGCCAA TAGTGGTCTG ACCACACGTG 240
GTGGCAGCAT TCTGAGCTCT GAGGAGACAA CCTGGGCTCT TGTCTTGAGG CCTAAACTGG 300
GCCTGAGAGA GCAGGAACAA ATCTGCCCTC TCCCTAAGCT CAGGGAGTCC ACAGCGGGAC 360
CCTCACACCC AGTCTAAGGA GACCACTGGG CAGAGCTGAG ATCTTAAGGA CAAGCTGGAG 420
TTCCCTCAGT TTTGGGAAAG GAGTTCTGGG GTGAGCGAGG AACATCAGGA GAAGCTGGAA 480
CAGAGAGGGG CAGCCAAGTC CTGAAGGGCC TGCTGTAACC CAAGAGAGAG GCCTGGCTTT 540
ATCCAGCAAG GCCAGGGTGC GGTCGGAGCA AAGGTTGTTT TATTAAAAGC TTCCTATGGC 600
TGGAGCCCAG GAGTTCGAGG TTACAGTGAG CTATGATCAC ACTACTGCAC TCCGGCCTGG 660
GCAACAGAGC CAGACCCTGT GTTTAAAAAA AATCCTAAAA AGCCACAAAA CTTCCTGAAT 720
GCAGACAATG TAGGGGTTCA AGGAGCTAGG GAGTACAGCG GAGACAGTGT TTGAACAGGC 780
CCAGGCCTGG GCAGGTGGCT GCCTTGGATG CCCGAAGGGA AAAACAGAAC AAAATCAGGA 840
GGAATTGGAG CCTAAGTGAG GGAGCAGAGG ATGAAGGGCG AGAAGGGGGC ATGGGGCTGA 900
CAAAGCCGGG GTGGCAGCCC GTCCCACCCC ACTCAGTGTG GGTTCCCGCG GTCTGTTCGG 960
CGCAGCCACA GGGTCCTCCC ACCACCCTCG CGGCCCTTCG CCAGCCCAGA TACCGTTTTC 1020
CCGACTTTGG AACGGAGACC ACAACACCCG CCCCGGAACT ACTGAAGGCT CAAGTTAGGT 1080
CAACCCGGCA GGAAACCGGT TCCCAAATCC CAAGGCGGAC CCAGGCCCGC GGTTCCCTCC 1140
CTCAAGGCTG GAACAGCGCG CAGTGGCCAC CGCCGCCGGG TCTCCAGCCC CCAGGAGCGC 1200
GGCCTCCTCC CGGACTCTCT CCGATGCGGT CCTGCCCTGG GGACACGGCA GGAAGAAGGG 1260
ACCTGGCTGG GGGACGTGGC CCCGGCGCGG GGGCAGGGGA GGCAGCGCGG GACTCCCAGC 1320
GGCCCCTGCG CGGGTGCCCA CCCGCCGTCA CGTGACACGC CGGGCGCTGA GTCACCGGGA 1380
AGCATCTGGC TGGGCGGCCG GGATTGGCCA ATCTGCGGGA CCGTCTGGAG CGGAAGGGCG 1440
GTGGTAGCTG GCCCTGCTTC TCCCTCCCCA GGATCTCTGC ACTGGCCTTA CGAACTGGGG 1500
AGTCCAAGGG GTTCCAGGAC GGGAAGGGGA GTTTGAGACC AGCCTGGGCA ACCTGGCCAG 1560
ACCCGGTCTC TATTAAAAAT ACGCAAAACA CACACACCAC ACACCCCACC CCACACAGCC 1620
CACACACCCC ACACGGCCAG CAGCCCTTTC TGTCACCGAC TCCGTTCCCC TGGCCAGTGA 1680
GCTCTCCGTC CCCTTTTCCT CCCTTTTCGC ACACGTGCCT TTCCTGCCTG CTCCCACCTG 1740
GTGCCTGAGG CGTCTCTGCG CCTCAGCACT GGCTGTTCGG TTTGCACTAC GGAGGGCAGT 1800
GTAGGTTTGA AAAGGAAAGT TTCATTATAT AGAACACTAC CAAGGCAGGG CGCGGTGGCT 1860
CACGCCTGCA ATCCCAGCAC TTTGGGAGAC CGAGGCGGGT GGATCACTTG GGGACAGTAG 1920
TTCAAGACCA GCCTGGCCAA CATGGTGAAA CCCTGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAATTAG 1980
CTGGGAGTGG TGACACTTGC CTGTAGTCCC AGCTACTTGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC 2040
GCTTGAACCC AGGAGGCAGA GGTTGCAGTG AGCCGAGATC CGGCCACTGC ACTCCAGCCT 2100
GGGAGACAGA GTGAGGCAAG ACTCCATCTC AAAAAAAATA ATAATAATAA TTAATAAAAA 2160
AATAAAAATA ATTAAAAGAA AAAGAAAAAG CACTACAGAA GAGTGCAGAG GGGCGCCTCA 2220
GCTAGAGGAC TTAGGGATTT TCCTTAGGGG CATTTATGGA CCTTAAAGAG GGAGCTTAAG 2280
GGTAACTTGG ACCACACTAG CCACATAGGT CATGATAAAT GATTACATTT GTAGACATTT 2340
TGGTGCCTAA TGCCAGTCAG CAAGGGTTGT TGCACAATGA GTTTGGACAG GCATGCATTT 2400
GCAGAGATGT ATAGAAATTC TAATTACTTG GAAATTTTGT TGGACCGGAG CTAGGAACCA 2460
AATGGTATAG GGAAGTCTCA TTACTTCTGA ATTCCTCAGA TAAAGAGTTT TGCCTCTGCC 2520
TGGGCTGCTC GATGGCCACC AGGTGACCTT TGCTCTCCTC AGGGGCTGCT GTGGGTCCAG 2580
AGCTGGAAGG AGAATGGGCC GCATCCTTTC CTCCTTCCCT CCCCGCAGCA GCAGGGGCTC 2640
TGGCTGCGGG GGCGGGCTGA GCTCCGTCCG GGGTGATGCG AAGGGGGTCA TGCCGAGGGG 2700
GTGACTCCCA GCTTGCACTG CGTCCCACAG TCGCGCCTCG CCTCGCCTCC CGGAGCCCGA 2760
GTCTTCCAAG GGCGCTGGCA GCTGCGTCAG CTCCCGCTGC CCGCCCCAAG CGTCCAGAGC 2820
TAGGAGGGAG TTACGGGGCG AGGCCCAGGG CTTTTCAGGG CCGGGGGTCG TGCGGCCAGG 2880
CGCGGGTGGA CTAGGCCAGC GGCCACTGAG GGGCAGAGAG GTCTGGGGTT CTAAGTTTAG 2940
CCCACTCCGC GAATGTGGAT TGCTTTGTTT GGATGTGATT CCCTTTCCAG GTGACTGTAG 3000
GTTACCCCCA CACTGCCCTG GCATGGAAGA GATTTAGGCT GTCCTAGGCC TTCACCCTTC 3060
CCTAAGACGA GAATCCAGAG GAGGAGCCAT TTAACAGCTC CCTGGCTTCT CTCACTTACA 3120
GGGAGCTCAC TACTACTACT AAAAACATTT TGAAGTTAAC ACCCCCTTAT GCCTGGCTCA 3180
TTCGTGCATT CAACAGATGT TTACTGAGCA CAGACTGTGT GTTGGAGACT GGCCACTGGT 3240
TTACATAACG AGCTGTGATA AAACAAAGTC CCAAGCCTCT TGGTTGATGT TCTCAGGCTT 3300
TTTTGAGGTG TGAATCACTT CTCCCTGGAA GCCCTCCTAG CTATGCCACC CTGGCTTAAG 3360
ACTGACTTTT GTGCTCTAGT GGCCCCTCAG GGATTCCCCA CATCAGCACT GACTAAATGT 3420
CCACTTCCAT GAGCTAGAGG AAGGTGGCGC CTCTTATTTG GCCTGGAGCA GGGAGCTAGG 3480
GCTCCTGCAG CCTCCAGATC CCTTACTGGG CGTCAGCTCA AGGGTGGGAA GGCCGGGGGC 3540
CTGCACCCCC TGGGAAAGAT GTGGGCATTT GTTTCAAGGC AGGTGGTGGT GGCTGAAGTC 3600
TGGAGGCAGG GAGAACGGCT GCGTATTTCA AACTTGTAAG CAAAGGACAG GGGACCTATT 3660
ACTGGGAAAT TTCCCACATG TGCCAGGGGG AAGGAACAAC CCTCTCCCTG TGGAAGGTGG 3720
GGGGAGCGAG CTCACCTCCC AGAGAGACAA CTCTGTCACT CTGGCGCCTC TGCCCGCCCT 3780
TGTTCTTCCC 3790