EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-03535 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr10:82252490-82254840 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6586028chr1082253984hg19
rs6586030chr1082254047hg19
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr10:82253113-82253128AAGTTAAAAATAGAA+6.55
NFAT5MA0606.1chr10:82252999-82253009AATGGAAAAT-6.02
NFATC1MA0624.1chr10:82252999-82253009AATGGAAAAT-6.02
NFATC3MA0625.1chr10:82252999-82253009AATGGAAAAT-6.02
RREB1MA0073.1chr10:82253512-82253532GGGGAGTTGTTGGTTAGTGG-6.23
Number of super-enhancer constituents: 28             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00012chr10:82242422-82272741Adipose_Nuclei
SE_04012chr10:82253206-82254985Brain_Anterior_Caudate
SE_09209chr10:82243703-82266302CD14
SE_12039chr10:82252567-82254468CD3
SE_14580chr10:82252505-82254658CD4_Memory_Primary_7pool
SE_17018chr10:82252681-82254245CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17363chr10:82243778-82255908CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17861chr10:82243686-82255843CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18324chr10:82243758-82266083CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19180chr10:82252605-82255652CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20438chr10:82252424-82255965CD56
SE_22394chr10:82252457-82265817CD8_primiary
SE_26561chr10:82253136-82255955Esophagus
SE_31654chr10:82253925-82254494Gastric
SE_35810chr10:82252588-82254662HepG2
SE_38294chr10:82254177-82255946HUVEC
SE_39636chr10:82253528-82254765Jurkat
SE_40835chr10:82253145-82254558Left_Ventricle
SE_42164chr10:82253189-82255687Lung
SE_48782chr10:82253290-82254378Right_Atrium
SE_50150chr10:82253051-82254670Sigmoid_Colon
SE_52532chr10:82253392-82254454Small_Intestine
SE_53353chr10:82253068-82255885Spleen
SE_55160chr10:82253292-82254573Thymus
SE_56703chr10:82252739-82256056u87
SE_58559chr10:82213055-82265607Ly1
SE_62319chr10:82212748-82296810Tonsil
SE_64280chr10:82253199-82266970NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr108225260082253879
chr108225310782253197
chr108225324382253833
chr108225393282254019
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH10I080492chr108225255882267597
Enhancer Sequence
GAACCCGGGA GGCGGAGCTT GCAGTGAGCC AAGATCGCGC CACTGCACTC CAGCCTGGGC 60
GACAGAGCGA GACTCAGTCT CAAAAAAAAA AAAGACTTAT TTTCACAATA GCATTCTTTA 120
TAGATAAATA CCGTTTGGTA CCTAATAGAT TTTTTTAAGC TCTCTTTCTG ACTTTGGGGC 180
CAAGGTTTTC CCGGGATTGT TAAAACCTGC TTGGGATAAG AAATGTGGAT GCCACTGATG 240
TTTGCATGTC TGTTCTGAAC CTCTTGGTTT ACAGAATGAG AATGGAATGG GCTTCATGAG 300
GTTCTTATCA CAAGGATGTT AGGGAAAATA TGCTTCCATG CAACATGGCT TTTTGAGAGC 360
GCTAGTGTTT TTTACTTACT GAAAAAATCA TTCTTTGGTT GTGCTAGACC TGTTTTTAGT 420
GCAAAAATCT CACTTTGACT TAGGAAATGC AAATCAAAAC CACAATGAGA TACCACTTCA 480
CACCCATTGG GATGGCTATT ATTTTAAAAA ATGGAAAATA ACCGATGTTG ATGAGGATGT 540
GGAGAAATTG AAACCTTTGT GCACTGTTAG TGAAAATGTA AAATGGTGCA ATTGCTATGG 600
TAAACAGTAT GGTAGTTCCA CAAAAGTTAA AAATAGAATT ACCGTATGAT CCAACAATTC 660
CACTTCTGGG TATAACCAAT AGAGCTGAAA GCAGGATCTC GAAGAGATAT TTGTACACCT 720
ATGTGCACAT TCATAGCAGC ATTATTTACA GTTGCCAAAA GGTAGAAACA ACCAAAGTGT 780
CCATAGATGA TTGAGTGGAT AACCAAATGT GATATACAGA TGTGAAAGAG CTTAAAAAGG 840
AAGGCAGTTC TGTCACATGC TACAGCATGG GTAAACCTTG AGTACATAGT GCTGAGTGAG 900
ATAAGCTAGA TGCAAAAAGA CAAACACTGT ATAATTCCAC TTATATGAGG TGCCCACAGT 960
AGTCAGAATC ATAGAGACAG GAAGTAGAAT GTTGGTTGCT AGGAGCCCGG GAAGGGAAGA 1020
TTGGGGAGTT GTTGGTTAGT GGGTACAGAA GATCTCACTT TGATGTGCAG AGGAAGGGAA 1080
GCTGGGAGAG GCGTACACTG GAGGAGTGGC ATCTGGCTCT TTGTCTTTGT TCATTTATAC 1140
CCCCCACTGG TTCCACAAAG CACTTGGACT TTTCTAAGTT TGCCGAGTGA ATCCTCTAGA 1200
GGGATGATTC CGATAATGTC TGCAACTCCA GGGTTGGTTT CCAACACAAG CATTGGCTTT 1260
AATCTGCATG CAGAGGTTGG ATGAAGTCCT TGCCTGGATC TGCTTCAGAG ATGGATTAAA 1320
AGTGAAGAAC TGAGACCCTT TCTAAATAGA CTGTAGGCCT GTGTTACACA GGAAAGTCCT 1380
TTGCTTGCCT TTAGTTTAAA AAAATTTTTT TTAAATGACA TTCTGCCATT GGCTTTCTCA 1440
GTGACTTGGG TCTGTTTGAG CCTACCCTTG TAAAATGTGT GAATTCACCT CTGCGCAGCC 1500
TGTTTCTGAG TGAGATGAGA GCCATGGACA TCTGTGCTCT GTGACCAGCA TGGCTTAAGG 1560
CCTATTCCTT CAAAGTCACA GATGCCTCCT GTGAGTAGGG CGAACATGTA ATCTGTGGTT 1620
CAACTTTTGA CAGTAAGAGA ATTTTGAGAG AGTCTTGCGA ATTTTGCCAG AACAACAGGT 1680
GTACCCCAGG CCTCTCCTGT GCAAACCTGG GCATGTGGCC ACCCTGCACA AGAAAGGGAA 1740
GACAAGCCCA AGGTGGAAAG ATCAACTCTC TTCCCTTACC TCTGTGTAGG GCATCTTTGC 1800
AGGTGGGGTC TTATTCTCTT CCTCTGACTT TTATTATGCT CCTCTTTATA GAGGACTTGC 1860
CACCTCCCAG GATAGTCTGC TGTTCCTGGG CTCTTCTGAC TGATGGAAAA TTGCCCTTAT 1920
TTGAGCTGAA CTCTGCTCCT TTGATATCAG ACCCCAAGGC CTGATCCCTA GATCTTCAGA 1980
CAAATGATTT CTTCATTTCC ATCTCAGTAA TGCAGTCAAA AGGGAAAAGT CTAGTGTTTT 2040
AATAATGTAT ATAGTGTATT TTTGTTTTCA CTGCTGGGAA GATGTCCCTT TTTCTCTTCA 2100
GGTAGTATTT AATCAACTTT TGTAATTTCG TGGAAATTCA TAAAGGCTAA ACAAGGCATC 2160
CCAGGTTTAC TGCATTTCCT CTTCCATGCC CCAGCGTCCT GTCTGCAGGC ACACAGTTTC 2220
ATATCCTGTG AGTAGTATCC TTGCAGTCTT AAGATACGCA TTTTCACATC AGCATCTGCT 2280
AATATAGAAC ATCTACTAAT ATAGAACATT CCAGGTTGCA ACATTATCTT TCCAATTGTA 2340
TTTTTAGAAA 2350