EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-01627 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr1:156465560-156470270 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10908505chr1156468243hg19
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468381-156468399CCTCCCTTCCCCCCTCCC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468377-156468395CCTTCCTCCCTTCCCCCC-7.1
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468373-156468391CCTCCCTTCCTCCCTTCC-8.06
Klf1MA0493.1chr1:156465719-156465730TGGGTGTGGCC-6.62
MYCMA0147.3chr1:156466230-156466242GGGCACGTGGGG-6.07
ZNF263MA0528.1chr1:156468377-156468398CCTTCCTCCCTTCCCCCCTCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:156468373-156468394CCTCCCTTCCTCCCTTCCCCC-6.65
ZNF263MA0528.1chr1:156468372-156468393TCCTCCCTTCCTCCCTTCCCC-6.67
ZNF263MA0528.1chr1:156468388-156468409TCCCCCCTCCCCCCCTTCCCC-7.07
ZNF263MA0528.1chr1:156469853-156469874AGAGGAGGGAGAGGGAGGGAG+7.53
ZNF263MA0528.1chr1:156468389-156468410CCCCCCTCCCCCCCTTCCCCC-8.08
ZNF263MA0528.1chr1:156468380-156468401TCCTCCCTTCCCCCCTCCCCC-8.36
Number of super-enhancer constituents: 98             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156465189-156476309Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156465123-156476044Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156465207-156468384Aorta
SE_01624chr1:156468387-156476109Aorta
SE_02565chr1:156469795-156476049Astrocytes
SE_02937chr1:156468807-156469775Bladder
SE_03183chr1:156465551-156470721Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156468701-156469223Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156465334-156466278CD19_Primary
SE_10496chr1:156468612-156471986CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156468582-156469168CD3
SE_13036chr1:156466540-156467469CD34_Primary_RO01480
SE_13036chr1:156468049-156468754CD34_Primary_RO01480
SE_13036chr1:156468793-156472076CD34_Primary_RO01480
SE_13485chr1:156465196-156476191CD34_Primary_RO01536
SE_14170chr1:156465715-156466589CD34_Primary_RO01549
SE_14170chr1:156467146-156468304CD34_Primary_RO01549
SE_14170chr1:156468402-156476146CD34_Primary_RO01549
SE_15064chr1:156468335-156476467CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156468699-156473244CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156468726-156472622CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156468445-156472542CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156466294-156476695CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_18886chr1:156466624-156476417CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156467906-156476154CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156466814-156476634CD56
SE_21124chr1:156468394-156476159CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156468468-156476440CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156468381-156476957CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156465636-156467896Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156467923-156468409Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156468420-156470673Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156468521-156470659Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156468482-156469101Colon_Crypt_3
SE_25163chr1:156469338-156475883Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156465342-156477016Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156465154-156476164Esophagus
SE_28187chr1:156466638-156468184Fetal_Intestine
SE_28187chr1:156468391-156476221Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156466454-156468169Fetal_Intestine_Large
SE_29274chr1:156468218-156476064Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156468651-156480271Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156465385-156476063Gastric
SE_32703chr1:156465262-156472841GM12878
SE_33523chr1:156465372-156473390H2171
SE_34669chr1:156467034-156476478HeLa
SE_37054chr1:156464710-156476367HSMMtube
SE_38176chr1:156467537-156476177HUVEC
SE_39310chr1:156468423-156470654IMR90
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156465586-156466685LNCaP
SE_41764chr1:156468497-156471403LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156465634-156466275NHLF
SE_44813chr1:156468511-156476032NHLF
SE_45962chr1:156465453-156476220Osteoblasts
SE_46671chr1:156466803-156467897Ovary
SE_46671chr1:156468431-156470688Ovary
SE_47855chr1:156468651-156470639Pancreas
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_48580chr1:156467911-156476055Right_Atrium
SE_49466chr1:156465535-156467898Right_Ventricle
SE_49466chr1:156468478-156470678Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156465545-156467660Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51995chr1:156468480-156469739Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156465351-156469748Small_Intestine
SE_52473chr1:156469779-156476230Small_Intestine
SE_53429chr1:156465373-156476196Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156468465-156468974Thymus
SE_55197chr1:156469022-156469677Thymus
SE_55197chr1:156469792-156476120Thymus
SE_57194chr1:156468590-156471295VACO_400
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156465531-156467660HSMM
SE_63769chr1:156468416-156469749HSMM
SE_65297chr1:156461973-156472274Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1156465576156467000
chr1156466392156467540
chr1156468556156468776
chr1156468000156468081
Enhancer Sequence
AAAAAAAAAA GCTCCCTCTG CATGGTTTCC TCGTCTGCTC AGCTCCTAGG AGAGTGGCCA 60
CAGCATCCAG CCAGAGGCAC CAAGCCAAGG TCAGTGACCA GGCCTAGAGC CCAGAGCCTC 120
CTGGGAGGGT AAGTTTAAAT GAGTAAATAT GGTCCCACCT GGGTGTGGCC AGCGACAGGC 180
CAGAGCTTCG GACATGTCCC TCCCCTCCCA GCCTACAGCA GAAAGAAAAG AAGTCAGACA 240
GGCACAAGTG CCTCCCGCCC CCTTGGCTAT CAGGGTCCTG TGCAGAATCA ATGAATGCAT 300
TCCCCTGTCT CCACACCAGC CAGGACTAAC CAGAAGCATA ACTTGGCTCT CAGGAAAGAG 360
AGGCTTGTAG CCTCAGCCTC AGGAAAAGGA AAATGTCAGA TGAAGAGGGC CTTGGGGATC 420
ACCTAGGCCA AGGATCTACC CCCAGATGCC TGATGGCTTA GATGTAGTCT TGATGCCTCA 480
CAGTGGCCTT GCTCATCAGG GTGAGCGGGG AGGGCAACAG AGACCAGCGA CAAACCACCA 540
AAACACCCAG GTGTTAATCA CCGAAAGGCG AAACTCTGTA CATCTGGAAA GCTGGGGCCC 600
AAGAGGAGGG ACCCGGGGAC ACACGGTCAG TGTGAGGGGC AGAGGCAGGC TGTGCCAGGA 660
ACACAGAGAG GGGCACGTGG GGGAGGGGTA AGGGGCAGGG ATGGAAGTCA GCCAAGGCTC 720
CTTGACTCAC AAGCCATGCT CTTTATTTTG CAGACAGGGC TCTGCCTGCC CATCTGTGGT 780
CTAACCTTAA TCCCTCCTGC TCCAGTCAGC CCTTCTCTCT TCAAAGTTCT TGCTATGCCC 840
TTCGCCTTCT TGCCTCCGGT CCCCTCAACC CCATCCCAAC TCTCCAATCC TTTAATCATC 900
TTTGCCATTC ACTACCCCCC ACCTCCCGCA GTGCAGCAGC TGCTCTGTGG GTGTCTACAT 960
ACCAGTGTGT ATGTGTTGCA CACTTTCCTG CATGTGTACC ACTAAATGCT GTGGACTGCA 1020
TTGGGCATGC CTGTCTACAT GAGACCCTTA TCTAGCTCCC ACTACTGGGG GAAAGGGGCC 1080
TAATGGCTAT TTCTCCCACA GCTCCAGGAC AAACGCCTCA GAATACTTTC AGCCATAAGC 1140
AGGGAGAGGA AAAAGAAGAT AAATATTCCG AGATCCAAAT AGCACCGACC CCACCAAGCC 1200
AAAGGTCAAG GCCTTTCCTT TCGGGAGAGC CACTGGAAAA GAAAGTGCTT TGAGTTCCCC 1260
TCCTTTCCTA TGCAAAATTA GAGCCATCTC TCTCCCCCCC AGCTTCCCCA CTGGGAAGTT 1320
CTTCCTGAAG TCTAAGCTCC ATCCTACCTG CTGTGATCAT GGATAGACAG AGTGACATCG 1380
ACCACAATAC AGTCAGACGT CCAGCTTCTA GAACACAGCT TCTAGTACCT AACCGCCCCT 1440
CCCTCCATGA GTAAGTCACC AAACTGGGAC AGAAGGACAG ACAGTTGGCC GGACTCCGGC 1500
CCCATGACTG GCTCATAAAA GCCACCAGCA ATTACAGTGA TGCTGAGGTT GTGCCGGCCT 1560
GCCACCATTT CCTCCTTCTC TATAAAAAAG AGATAGTTGC CTCAAACCAG CTGGCCTGAG 1620
AGAGCCTCGA GAGTCCCAGC CATGGTCCCG TGGGATGGGG AGAATCCCAG CACCACAGTG 1680
CCATGAGACT CAGAACCTGA CCCTTGATGA TGGGTTCCAG GCTCACATCG GATCCTCATA 1740
CCCACTTATA GAACCTGATG AACACCAACG ATGACCTGTG TCCAAGAGGT CAAGGCCTGT 1800
ATTAAGTCAA GGCCCTCAAC TCCTCTTTTC CAGTAAGGCC ACCACTCTCT CGACTAGAGG 1860
GGCAAAGAAG CAGGGGGCCT GACTCAAATA GAACTAGGGA AATGTTGGGC CCACCCACTT 1920
GCTCCTGGAC TTCCCTTGTC CCCATAAAGG TACTCAGGTG TGTGGCAAAG TGTCCAACCA 1980
AGGGCCCACA CCAGGCCAGC GTAAGTCCTG AGATTCTGGA TCCAGTGCCA ACCAGGGAGA 2040
GCAGGGGGCC CAGCTGGTCA GGAAGAGAAA GTTGACAAAA TGGGGAGAGG TCCAGGCCTC 2100
TCTGGGGGTA TAAGAGCCAG GGACGACCAC AGCAGAGGGA CCCTCTGAGG GCACGGTAGA 2160
GGAGAAGGGT CTGAGGGGCT GGGCCATAAT CAATGAGGGC CTATCCCCAA GGCCTCCTCG 2220
GGGGCCAAGG CACCTCCCAC TCCAAGCTTC CTTACTACTG CTCCTTTAGC TCCCCCCAAC 2280
CTGAAGAGTC TCCCTCTGGC TTCTCTTCCC TATCACATCT CCCAGGAAAG ATTAAAAAAA 2340
AAAAAAAAAA AAAAAAAAAC CCTGCTACAG AGAGATTATA TAACAGCAGC CAGAAAGACT 2400
ATCATATCTC CCAGCCTATG AGAAGAACCA GGAGCCAAGG GGGCAGAGCC AGGATGCCCA 2460
GGCCCTCCAG CCCAGGGGCA CCAAGCACAG AGTGGGGTGG ACACGGACAG CACCTGCCAC 2520
CCCTCCAAGT CCTCCACCAA TCTTTCAGGC ATTGAGTACA GCAGACAGAA GCTCTAGCCA 2580
ATTCCCCATG CCCATCCCCC AACACAAGGA TCATGAGGCT CTCTGGGTCC TGCTTCTTCC 2640
CTTGGACTGG GGCTTCCATG AACACGGACT GTATGTCTCC CTTCCCAGAA TCCCTCCCTA 2700
CTATGAAGTT GTGCCTAAAA GAGTGGAAAG ACGAAAGCTC TGACACAGAT TTGCTGTGTG 2760
ATCTCAGGTA AAAAACTCAA CCTTTTGGGT CCCTACAGGG GTGAGTAAAA GCTCCTCCCT 2820
TCCTCCCTTC CCCCCTCCCC CCCTTCCCCC CAGAGAGACC AGAGACCTCT CCCTTTACAA 2880
ATGTACATGC ACACACATAC ATATACACAC ATATGCAAAC ATACAGGGTG TGTTGGCGGG 2940
GGCAGGGGAG TTACAACAAA GAGAATATAA TCACTGAGAC CCAAAGGTCC AAATGCCTAT 3000
GCTGGGGCAA GTGGGGAAGG AGCTCCATAT AAGCTCCAGT GTCCCCCAAT CACCCCGTAT 3060
AAAGAGGTCC TCAGCCACTC CCACAATAGT CCTACCCCAC CCCCATCTCC TGCCCAACAC 3120
ACTGGGAAAC CACAGGAAGG AAATTCATTC CCAGGCAGGG CCGTGGGAGC TGGGACAGCC 3180
AGACTAAGTC CTGGGGCGGG TGTGACCCCG TGGCCACAAG CGGGTGGACA TCTGTGAACA 3240
CTGACATGTG CCTTTTCAAT GCTCTCCTCA GCTACTGAGA CCTTCCTGTT GGGGTTGGGA 3300
GAGGAGTGGG AGGTGGACAG CTCCCAAACG CCAAAACACC CAATCTCAGG CTGACCTGCG 3360
CTCCCCTCCT ATCTCCAGGC CAGAGCAGCC CAAGGTCACC GCCCCAGACG GCAAACTTCC 3420
CATAGTCTAG GCTGGACCCT GAATTGCTGC GGAGACCCAC TGAAGGGATA GGAGGAGGAG 3480
TGGATAAGGG CCACCTCCAC CCCAAAGCAA AGAAACCAGG ACTCTGAGGA AAACTCAAAT 3540
GGGGGTTGGG CACAGCAAAG AGGGACACAG GATCCCCCCC AACCCGCTAT ACCCTCCCCC 3600
AACCCATCAA CAATGCACCA AGCAATGGGA GGCAGAGGGA GGCTCCCATT CAGAAGGGCA 3660
AACCTGGGAT AACCCGGTCG GTGGCTTCTA GAGTGCCTTC CTTTCAGGAG GAGTCCTCGG 3720
AAGGCTGCTG AGAGGACAGC GTGATTCACT AGGGGGAGGG GGCCCCTTTC CCCATCCCCC 3780
TAAGACCCGA ACCTGGTAGG AGAGAAGCTG GCATTGGAGT GGGGGACTAA AAGCATTTTG 3840
GTCTCCTTGG CCCATCCTCC CAAAAGCCCC CCCAAACTCC CTAAACCCCC GCTCGCAGCC 3900
CAGCTCCGCC TGCCATAGGT GGAAAGGACT AGAGAACTCT TGCCCAGATG TTGAACAGCT 3960
GCAAACTTCT GGCCAGGGAG TTCTCCAGTT GGGGTTACTG ACAAACCACA TCAGGGGTCT 4020
CGGAAGCGGG GCTAGGAGGT CTCAAGGAAG GGTCCTGCGT GCCCACCTCG TGGCGACTCC 4080
GCGTCCCAAC TCCACAGGCA CCCGGCAAAC ACGGGCCCCG GAGACACACA CACTCACACA 4140
CCCCAACCCA CTACCCCGGT GTCATCTGAA CAACATCCCC CCTCCCTCCC CCGCTTCCCA 4200
AACAGCTGCG GCTCCCCCCG CCTCCACCCT CCCGCCGCCC TCCCAGGCCC CCTTCTGCAC 4260
CATTTCGGGC CAAGGAGGAG GGAACAGGCG GCGAGAGGAG GGAGAGGGAG GGAGGGCCGG 4320
CTGTTAAAAT GTCAGTCGCT CCCGACTGTC ACCGGAGACC CCCTCGGAGG ATGGCGCCCC 4380
GTCCCAGACC GCTCGGAGGC CGTCGTAAAC CCCCTACACG AACAGGCGGG CGCGCCCCCA 4440
ATCCGCCCGT CCCCACCCCG TACTCCCAAC ACCCAAGGGA ATTGCAGCCC ACTCCACTTG 4500
TCCCCCACGA CAGACTCCCT GACACAAACA GTCCCCTAGG TAATCCCCGC CAACGCCACA 4560
CGAAAACACG GCCCGCTTCG CGAGTTCCTC CCGGCCCGGG GGCTGCCCCA TCCCACCCCT 4620
CAGGGGGACG GTCTAGACCA CCCTCCACCC CAACCCCTGG ACCGGGTGGG GGAGGGGGCC 4680
TCTTAAAGTG GCAGGCGCAT TATTTTTCTC 4710