EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS051-01602 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_thymus 
Coordinate
chr1:155936930-155938940 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:155937983-155938004CTTTTCTTTCTTTTTTTTTTT+6.41
Myod1MA0499.1chr1:155937739-155937752TGCAGCTGCCCCC+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155938583-155938603CCCCCACCCCACCCCCTCCA+6.14
RREB1MA0073.1chr1:155938584-155938604CCCCACCCCACCCCCTCCAC+7.01
ZNF263MA0528.1chr1:155937603-155937624CTCTCCAGCTTCCCCTCCCCC-6.35
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155935629-155941788Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155934724-155941198Aorta
SE_03231chr1:155935411-155941178Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155936927-155937325Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155937326-155938520Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08811chr1:155938679-155939364Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155936457-155939358CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155937235-155938653CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155936695-155940384CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155935980-155938209CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19282chr1:155938352-155941313CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_26270chr1:155936615-155938673Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26270chr1:155938718-155940935Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155935912-155941094Esophagus
SE_29653chr1:155935863-155942574Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155936039-155937982Gastric
SE_32195chr1:155937995-155941084Gastric
SE_37367chr1:155935140-155941528HSMMtube
SE_39002chr1:155938017-155941141IMR90
SE_40938chr1:155934691-155941319Left_Ventricle
SE_42293chr1:155934607-155941204Lung
SE_45406chr1:155937214-155937779NHLF
SE_45406chr1:155938586-155939581NHLF
SE_47089chr1:155937159-155937866Ovary
SE_47089chr1:155938546-155939070Ovary
SE_48803chr1:155935124-155941166Right_Atrium
SE_50236chr1:155936031-155941345Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155935853-155941418Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155936908-155938578Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155938679-155941227Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155936636-155941195Small_Intestine
SE_53512chr1:155935694-155941433Spleen
SE_55468chr1:155937112-155937974Thymus
SE_56150chr1:155938459-155941237u87
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155936894-155941241HSMM
SE_69165chr1:155935996-155938187H9
Enhancer Sequence
CCAAGGTGGC CTGAAGGGCG GACCAGAGGG GAGCAGGGGT CACTGGCTGC CAGAGATGAG 60
CTCAAGAAGC ACGAAGGTGG TTGCGAATGG CAGATGGAAG AGAGGACTCC CACAGAACAG 120
AAGATGGCAC AGAGGCAGCC AGAATGGGGG CTAGGGGCAG AGGGGAAATT TACATTCCCT 180
GAGCTTTTAT AATAGTAAAT GTTCCACATT TACTTAATCC TAACCACCCG TAGAGGGAGG 240
TTCAGTTATC CTCATTTCAT GTATGAGGAA CCTGTCCTGG AGTGGCTAAA TCGTCCATCA 300
GAGGTCACAC GGCTAGTGGG AGAGGTGGTG TTTACACTCC GGTGGGCCTG AATCCAAAGG 360
CCGTGCTCCT TCCCTCGCAC CACATGCCCT GGACTCTGGC TGGGCCTCAG CAGCTCCAAG 420
GCTGATTGAT GGCTCCAGTG GTAAAGAAGG GACAGGCAAC TCCCCACCAA GCCTGGCCTT 480
CTCCCTTCCA GGCCCAGGGA GTCCTGTTCC CCCAACTCAG GCAAATCCAC AGCTCCCACA 540
CTCCATCTGC TTCTCCGCCA TCCTCCACCC CACCTTGCCA TGGGGTAGGA GAGAAGAAGA 600
AAGGAGGATT CGCTGAGCCT AGGCACTGGG ACCCTGGCCG TGCCCTTCCC AGACATGCCC 660
TCAGCTCCCG GCCCTCTCCA GCTTCCCCTC CCCCATCCAA CAACACCGGA AACTCTGCTA 720
ACTCTTTCAG ACAATACCCA GCACCACGCT CACTTCCACA AATACAAGGC AAACAGGGTG 780
GAGCAGAGGG GGCAGACAGA AGTGGGGGTT GCAGCTGCCC CCACCCCCCT GGAGCTCCCT 840
TCTCCTACCC CCAACACTCA GTGTCTCTGG ATTGAACCTC CGCTTTCCAC CTGCTCTCAA 900
AATAGTGCTG CCCGCCTCCC CTGTTCCCCT GGCAACAAGC TTCCGGATTG GGAATTTTGT 960
CAGGTCTCTA TAGGGATCTA GATTGGGGTT CCCTCCTCAT CCTCACAACT CTAAATTGAA 1020
CAGTGAGGAA AGTAGGGAGG CTTCACTGGT TTTCTTTTCT TTCTTTTTTT TTTTTTTTTT 1080
GAGCGGTAGC AAGCTTTATT GTGAAGAGCA AAATGACAAA GCTCCCACAG CGTAGAAGGG 1140
GACCCGAGCG GGTTGCCCAT CACTGGTCCT TTCTGGGGGT TCCTTCCCCA AGTTTCATAG 1200
GGATTTACAG GCTAGAGCTT TTGTCCGCTA TTCAGTAGCA GGTCACAATA CCTTCAATCC 1260
TGCTCTAATC AGAGGCATCT CTGCCATAAC TTCAGGAGGA ATTGAGGGAG AGGGGGCAGC 1320
AGGAGCCCTC TGTGTACTGG GGAAGGAAAG AATTCCTGGC TTATACTCCC TAAAGACAGG 1380
ACTACACTCA GATGTGGATG AAGGGCAGGA ATTCTAACCC CTGCCCCTCA ACACACACAT 1440
CCCTGCTACA TTCCCTCTTT CTCACTAGAA ATTTGAGATG AAGGGTCCTA ATCACATCTT 1500
CTGCTTGAAA CAGCAGAGAT TTCAGGCTCC ACCCATAGTC AATAGAAAGA AAGGGGCAAG 1560
GGGACTGTGA AGTCCTGAAT GCCCAGCTCT GCGCAGGAAG ACAGGCAGAG CCAGCTGCAA 1620
GGCTGGCAGC TTTCCACCCA GTTCCTCTGT CACCCCCCAC CCCACCCCCT CCACACATAC 1680
AACATTCCTG CTCCTTCTCC AATCAGTTCC CCTAACCCTT AGCAGCTGTT CGGGGAGCAA 1740
GGGGGGTGCC TGGTGGATGA CAGCTGCAAG AGGAGCCAGC ACAGCCTCCC CTCCCCCACA 1800
TTCCCAGATA GTCCGGCTTA TGCCATATTC CAACAGCCAC CACCCCTCAG AGTGAGGACA 1860
GGGAGCAAGG GATCAAGCAA CTGGCCCTGG CATTTGGGCC CAGCTGGGGA TCAGAGAGAA 1920
GAGTGACCCT CATGGATCCA GGCAGAAAAA ACAGATGAAA AGATCAGGGT CAGTGGGCAC 1980
CGAGTCTGGG TGACTCTCAG GGTCCAAACA 2010