EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS050-51722 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_stomach 
Coordinate
chr4:88442290-88444850 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr4:88442902-88442923TGTTACTTTCTTTTTCTTATT+6.62
MEF2AMA0052.3chr4:88443024-88443036GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr4:88443024-88443036GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr4:88443023-88443038TGCTATTTTTAGCAA-7.4
NFE2L1MA0089.2chr4:88443346-88443361TCTGCTGAGTCACCA-6.39
NKX2-3MA0672.1chr4:88444586-88444596TTCAAGTGGT-6.02
Nfe2l2MA0150.2chr4:88443348-88443363TGCTGAGTCACCATC-6.16
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:88444195-88444210GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
RREB1MA0073.1chr4:88443785-88443805CCACCAAACACACACACACA+6.95
STAT1MA0137.3chr4:88443063-88443074TTTCTGGGAAA+6.02
STAT3MA0144.2chr4:88443063-88443074TTTCTGGGAAA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 9             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00609chr4:88439055-88454377Adipose_Nuclei
SE_03658chr4:88442364-88442989Brain_Angular_Gyrus
SE_03658chr4:88443081-88444229Brain_Angular_Gyrus
SE_08500chr4:88441161-88444539Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09074chr4:88443374-88443817Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_25841chr4:88440495-88454410Duodenum_Smooth_Muscle
SE_29866chr4:88441218-88444286Fetal_Muscle
SE_29866chr4:88444309-88445006Fetal_Muscle
SE_54577chr4:88436429-88454473Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr48844288488443576
chr48844326788443740
Number: 2             
IDChromosomeStartEnd
GH04I087520chr48844135388443959
GH04I087523chr48844431088445006
Enhancer Sequence
TATTTGTATT TGATTTATTT TCAGTTCCTA TAGTTTTTTA GAACATTAAT TTACATTTAA 60
ATTTTAAAAG ATAAATTTTA TTTTTGAAGT TCTGTATATT GCCATGCCAC TTAAATCAAC 120
TTAGCACACC TGCTCCCCTG GGCACTTCTT GCCTTGCTGT ACTTCTTCTT TCTATCTTCC 180
TTCTCTTTCC TTTTCTCTTA AGCATTAATA AGCTGTCTGA ACACTGAACC AGACTGTAAA 240
CGCAGTCATC CATACCTCTG AAAGGAGGAA CAGGATTCCT CTTTCATATT GGCCACATCA 300
GTGACTCCCT GGAAATTTTA GTGCTGGTAG TTATTGCTTC AAGTCTTTCT AATTGAATTT 360
TCCTTGTGTT GCCTAGCATT CCCCTGGTTT CTGAACCCTC CAGTCTGAAC CCTCCAGTGG 420
TTAGCTCCTT CTGTGGCAGC CTCAGCAAAA TTTACAAGTC CTCTTCCTTC CCTTCTGGGC 480
CTAGGGAACT TGTTTCAATA TTTTTGGGTT TCAAGGCAGA TGATGACAAC TTGATCTGTT 540
TATCACTTTG TCTAAAGTTT AATGAACTAA GAAAGACATA CCATGTGTAC TAGAAAAAGG 600
AGAGGTTTGT CTTGTTACTT TCTTTTTCTT ATTACTCTTG GCCTATCATT TCCTGGAGTA 660
TGTACATCCA TGCATCCAAA TAAGGCCAGG TATCTTCTGT TGAATTTGTT TATATCAGAG 720
GAAGCCTGTA GACTGCTATT TTTAGCAATT ATTACAACTA TGGAAAAATT TCCTTTCTGG 780
GAAATGTAGT AAACAAAACA ATTATTATAG GTACTTTATA AACAGACTCA GAACGTTCCT 840
GTTCACCTTG TTTTTACATA ATAGTCAAAG GCCTTGTTAT CAGAGAGCAA ATCTCTTAGT 900
CATATTTTGG CTAACATATA CGTGCTGTTA CCTGATCCAG TGTTAACACT GATGCTTTAG 960
AGCTTTTAAA GTATTAATGA GTCTCTGGGG AGAGCTCTAT GGTTTGGCCC TAAAGTCATC 1020
TGAAGGGTGA AAAAGACGTT CTTCTATTTT GAGTTCTCTG CTGAGTCACC ATCTGACATC 1080
AAGGTGTCCC AGCCCTGTGA GTGTATATGA TATACTCAGA GTCAATGACT TAAGACTTTT 1140
CTGGGCATCT GACCTTCAAC TGCCCATCAT CCTTCCTAAT TGAACCTACC ACCATAAGAG 1200
TCTGAGCTAG GGATAGACAT GGTCATGCCT GTTGGGGCTT TGAGACTAAC CAGAAATCCA 1260
TCCAGACGTT AAAAGTATAC ATTAAACCTG AATCAAGCAA AGGGCACATA CATTTAGTGC 1320
TCAGGGAAGG GAGTATTATG GAGATTTACA TCTTCCACTG CTCTGCCCTT GCTCTCGGGA 1380
GCTGGCTGCC TCTCAGTGCC TCAAATAGGC CACGATCCCT CTTGCTCCAG GGTCTTTGCA 1440
CAAGTGTTCA CGCTGTCAGA ATTCTCTCTC CAGCACCCGC TCCTCCCAGC CACCACCACC 1500
AAACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACGCACAC ACACAGAGTT 1560
AACCTCTATT CAGACTTCAG ATCAAGGAAA GCCATTATTG ATCCTGAGTG GAGGTCAGGA 1620
TCCTTATATA CTCTCTTGGA ACAAAGGTGT TTTGCCTTCA TAACACTTAT TTCAGTGTAT 1680
CATTATATAT GGCATGTGTT CAAATAAAAT GTGTTTTTTC TCACGCCACC AAATCCTGCC 1740
GTAAAAAAGA GGGATTTGAC TTATATTCAA GTGCTTCCAA AGTTTCTTCA TTTTGAGCAG 1800
CAAAGTACTA TTCAAAAAAA CAATTAGAAA TCATCTCAAG AGCTGGGCAC AGTGGCTCAT 1860
GCCTGTAATC CCAGCACTCT GGGAGGCCGA GGTGGGTGAT CACCTGAGGT CAGGAGTTCA 1920
AGACCAGCCT AGCCAACATG GCAAAACCCT GTCTCTACTA AAAGTACAAA AAATTAGCCA 1980
GGCGTGGTGG TGCACACCTG TAATCCTAGC CACTCAGGAG GCTGAGGCAG AAGAATTGCT 2040
CCAGCCCAGG AGGTAGAGGT TGCAGGGACC CAAGGTCACA CCACTGCACT CCAGCCTGGG 2100
TGACAGAATG AGACTCTGTC TCAAAAAAAA AAAAAATCTC AAGCAATGCT TATTTTTATT 2160
CTTAGGAAGG TCACCTTGAC AAAATGGATG AAAAAATAGA TAAAGATATT TAAAGCAGGT 2220
TTAGTCATTA TTCCTGAGGT ATGACTTCAT TATTGCAAGT TGGAATCACA TAGTTTTAGA 2280
AAGCCACACT TACAGTTTCA AGTGGTTTTT AAATACGCCC TTTAAAAAGC ACTGGAAAAA 2340
CAATCTAGTC AGTAATGAAA GTGTGGAGAA CATGACCACG AGTGAGGACT AATGCCTGGG 2400
GATTAAATTT GCAGCATCAG CAGATGTTTA GCAACTTGCA GAAGGATTGA TGATGTGCTC 2460
TGTATTAGAT AATTACAGCG TGGATCCAGT GAACATACAC ATTGGTGTTA AAGATGCGTA 2520
TGAAGAGTTT TAACAAAATT GTTTCATGAA ATGTGAGAAA 2560