EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS050-36613 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_stomach 
Coordinate
chr2:54802550-54804740 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs28517733chr254803211hg19
rs10180713chr254804693hg19
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MSCMA0665.1chr2:54803575-54803585AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr2:54803575-54803585AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr2:54803575-54803585AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr2:54803575-54803585AACAGCTGTT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 66             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54795695-54808079Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54802657-54804663Adrenal_Gland
SE_04102chr2:54803461-54804376Brain_Anterior_Caudate
SE_10400chr2:54794677-54803227CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54795467-54804954CD3
SE_14488chr2:54795303-54804872CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54795663-54803273CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54798421-54804026CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16386chr2:54795629-54803366CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16936chr2:54795657-54803270CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54795021-54811216CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54795631-54804015CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19520chr2:54804469-54808160CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54795681-54809753CD56
SE_20822chr2:54795629-54803439CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54795741-54803316CD8_Naive_7pool
SE_21502chr2:54803372-54804830CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54795626-54804551CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54795196-54811289CD8_primiary
SE_23128chr2:54802519-54803197Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54803525-54806250Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54802742-54803169Colon_Crypt_2
SE_23914chr2:54803607-54804069Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54802604-54803195Colon_Crypt_3
SE_25070chr2:54803569-54807926Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54795570-54803197Duodenum_Smooth_Muscle
SE_25877chr2:54804084-54808059Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54798913-54803836Esophagus
SE_27627chr2:54794756-54809409Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54794775-54810703Fetal_Intestine_Large
SE_31160chr2:54795567-54803312Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54802687-54805201Gastric
SE_32493chr2:54794685-54809919GM12878
SE_35301chr2:54797810-54803653HeLa
SE_35875chr2:54796741-54804603HMEC
SE_38000chr2:54803941-54807936HUVEC
SE_39396chr2:54802725-54803250Jurkat
SE_39396chr2:54803412-54807973Jurkat
SE_40773chr2:54802491-54803321Left_Ventricle
SE_40773chr2:54803413-54806814Left_Ventricle
SE_42137chr2:54796708-54803360Lung
SE_42137chr2:54803569-54804912Lung
SE_46220chr2:54795768-54803253Osteoblasts
SE_47832chr2:54803648-54803971Pancreas
SE_49907chr2:54795402-54803294RPMI-8402
SE_49907chr2:54803392-54808037RPMI-8402
SE_50115chr2:54795848-54803359Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54803395-54807898Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54795955-54803388Small_Intestine
SE_52386chr2:54803599-54807890Small_Intestine
SE_53342chr2:54795939-54803322Spleen
SE_53342chr2:54804076-54805887Spleen
SE_55277chr2:54799481-54802818Thymus
SE_55277chr2:54802878-54803341Thymus
SE_55277chr2:54803647-54803963Thymus
SE_56813chr2:54802778-54803224VACO_400
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_64270chr2:54795687-54804439NHEK
SE_66257chr2:54802725-54803250Jurkat
SE_66257chr2:54803412-54807973Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr25480363954803743
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054566chr25479411254810964
Enhancer Sequence
ATTTGCTTAT CATTGATGTT GCAAGAGCGT AACATTGGAG GGATGAGTAA TGCATCTGCA 60
TATCTCGAAG GACAAAACTG ACGTCCACCC ACTTGTGGAT ACGGTATTTG GTAAAAGTAA 120
CTAAGGTAAA ATTGCCTAAG GGCATTTAAC TTGAGCCATA GCTTAAATTC AGGTGATATT 180
GAGCGTTGAC ATATCAGGAT TCTTTTGTAC ACAGAGACGT GGATGTAGAC CCACTGGTAG 240
CAATTGCAAA GGCTCTGGAT TTTTAGCTGC TGGATGAAAT ACCTGCAGCT GAACATCTGT 300
TATGATGCAA TTAAGCAGTG ACTCAGTGGC GTGAAGGCTC AGTTTCGATG TATCGGGAAC 360
TCCTTTGAAT CTGTCCACAA ACTTCTCAAC CAAAAGGAGA GGAGAAATGT GTACAGACAT 420
TTGAGAGGCT GGGTCTCAAC ATGCCTCTGC CTAGGCAGTC ATGGGAACCT GGTCTTTTCT 480
CCTGAGACAG GAATTAACCT GTAGTACGAG AAACATGGTT GGATGAGTGG TTAAAGCAGG 540
GCCCAGACTT TGGTACAGTT TAGGTTATGG TAGCAGGGAT AGGGAGAGAG GTGGATGATG 600
GTAATGGTCT GTGTTTTTTT CCTTTTGTCA CTCAGATCCA GCTTTTTTTT TTTTTTTTTG 660
AGAGACAGTC TGGCTGTGTC TCCCAGGCTG GAGTGCAATG GTGCGATCTC GGCTCACTGC 720
AACCTCTGCC TCCTGGGTTC AAGCGTTTCT CCTGCCTCAG CCTCCCCAGT AGCTGGGATT 780
ACGGGTGCCT GCCACCACTC CCGGCTAATG TTTGTATTTT AGTAGAGACA GGGTTTTACC 840
ATGTTGGCCA GGCTAGTCTT AAACTCCTAA CCTCAGGTGA TCCACCCACC TCGGCCTCCC 900
AAAGTGTTGG GATTACAGGT GTGAGCCACC GCGCCCGGCC TTCAGCTCTT CTTTCTGCTA 960
TTGCTTTGGC CTAATTAATA ACTTAAAGCT GGAACGTTGA TGTCAGGTAT GTGTAGGTCC 1020
AGGAAAACAG CTGTTGGCTC TGTTACTTCA ATTTTTTTTT TACTCTATAC TTTGAAGAAG 1080
TAGTACTTTC TAGAACTTGT ACTCAAAACT CAACTGACAA ATCCTGGAAG GCCGTTGCTT 1140
ATACGCTCTA GTTGATGCGC CACAGCTGCC TGGCTGTGAG AATGGAGTAG CATGTACCTC 1200
TTAATTAGCC AAGAATAAGT GCCGTGGAAG AAGGCAGGAT GACTTTTTAG AACCCATTTT 1260
TAGCTTGAAG ATCACTGAGG GAGCCATCAA ATCCATCCAC CTGTTCAATC AATATTCAGC 1320
CAGCAAGTGG GTGTCAAGGT GAGCAGCTTA CAGTGCTGAG CACACTGGAA ACACAGGTGT 1380
GTAAGGGACA GCCACGGTCT CAAATTACAT TCTGAAAGGG AATACTAGGT AAGTGATCCC 1440
AAACATGCAA ATATCATTCC TTGGTCCTGG GATGTGGGGG AAGCATTTTG GAGGAATTGA 1500
CATTGATTGC AAGTTTTTAA ATATGACCTG GATTAGATTA TGAGATGATG GGTGCTTGGG 1560
GGTAGGGGTG TACAGAGGGA GTCATGAAAC CATGGAGGAT GTTGGGGAAT GGCTAGAATT 1620
CTACTTGGGA CATCATGCAA GTTTTTTTTC CCCTTCCATT TCATTTGTTA ATGCTTATTA 1680
TTAGTTGGGG GTTTTGCCTC CTTTTTGTTA GCCAACAGCC AGCTAATCTT GGCACAGGTC 1740
CCGGGAATCA GGTGCTGCTT AGCAGCTGAT GTTGGTTAAA TGACCTTGGA CAAGTGACTT 1800
GCATTTCAGT TCTCTAACCT GTTAGGGTTG TAGATTGTCT GATACAGATT TGAAGGCCCC 1860
TGCAAATAAA TGCATGGCCG TTTACTCTGG TCACTTTCAT TTTACCGAAT GTGCTCCCCC 1920
AAGGCTCTTC TGGGTAGATG CCCACTGCCA AAACATTAAG CATTTTTGGC TTCTCATGCT 1980
TTGAGCTCAC AAAATCAGTC CTGTGGGAAA CCTAACAAGC TACAAAGGAG AGGGAAAGCA 2040
AAAGAAAAGG TATATGGATT CTCATGCAAA GAGAGAAGGA AAGTAGGTCC CTACCTAAAG 2100
TCTAGCCCTG TATTGGTGGT GGTACTGATA ATGGTAATAG CCACCAAAAC TTCTTGATAC 2160
TCCCCTTGTG CAGGCATTGT CCTAAGTACT 2190