EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS050-00995 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_stomach 
Coordinate
chr1:20802240-20805260 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr1:20803829-20803840GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr1:20803837-20803850TAATTAATTAGTT+6.22
Lhx3MA0135.1chr1:20803833-20803846TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803834-20803847AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:20803830-20803843ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:20803835-20803845ATTAATTAAT-6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.02
RFX2MA0600.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6.29
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC+6.07
RFX5MA0510.2chr1:20803092-20803108CGTCCCCATGGCAACC-6
mix-aMA0621.1chr1:20803838-20803849AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03446chr1:20803030-20803671Brain_Angular_Gyrus
SE_03446chr1:20803754-20804585Brain_Angular_Gyrus
SE_05163chr1:20802127-20814849Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06168chr1:20800960-20809454Brain_Hippocampus_Middle
SE_06941chr1:20801073-20814394Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08044chr1:20802020-20815753Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23263chr1:20802154-20804475Colon_Crypt_1
SE_24162chr1:20802438-20803173Colon_Crypt_2
SE_24162chr1:20803198-20804404Colon_Crypt_2
SE_24976chr1:20802327-20803850Colon_Crypt_3
SE_24976chr1:20803865-20804568Colon_Crypt_3
SE_27987chr1:20800622-20814579Fetal_Intestine
SE_28809chr1:20799528-20814863Fetal_Intestine_Large
SE_41848chr1:20802447-20804302LNCaP
SE_41848chr1:20804758-20805193LNCaP
SE_65794chr1:20802035-20804918Pancreatic_islets
Enhancer Sequence
TGACTGAGGA CAGGTTACTC AGAACCTCTG GGCCTCGGTT TCTTTGTATG TGAAATGGGC 60
ATGATATATA GTTGTAACTG GCACACACCA TAAACATGAT TCCTAGGGCT GCTGTGAGAA 120
TTAAATAAGA AAATGTACAC GGAACACTTA GCACTGTGGC ACATGACAAG AAGGCTATTA 180
AGAAAATTTA AATAATGGAA AAAAAATAGA ATACCGATAG TGATAACTGC GCACTCATAC 240
AATGCCTTGG TTGCAGAGGT CATTCCCCCA CATTACCTTG TGGGGTTTGA TCAGCAGTTC 300
TGGAAGCACC TAGGGCAGGA ATCACCACCC CAGGGTCACA GATGAGACTG CTGAGGTTCC 360
CAGAGGACCC AAGCAGGGCT GCAGGTGCCC TGGCTCCCAA CTCAGTCAGT GCTCTCTGGT 420
TCCGGAAAAG AATTCTGGGT GAAAGCGGGA GGGGGTGGGA AGCTCCTTCC CCCCAGGTAC 480
CCCTGAGGTC TAACTCTGGA ACTCCTTGGA TAATGAGAAA AGGGGGGCTT CGGAACCCAG 540
GACGTGGGTT CCACATCCTG CGGGGGCAGG GAGGCCGCGC GGGAGGCCGC CAGACGCAGT 600
AAATAATTCA CACAGATGAA CTGGAGATAA GGGCGGCTTC GTGGAGGATC GAGTTCAGGT 660
CGGAGGAGGC TCAGACGGCT GGGGGGACTT GTGGTCTCCC CGGTCTGAGA GGGGAAAATT 720
CCTGGGACTC TGGCTGCCAG GAAAACACAG TCCCCAGGTG CCGGCTTGGT GCCACTCCCT 780
GCCATTGGCG GGAGGGAGCT CCCCGGAACT GCCCCGCGGG GCAACAGGCC TGGCCAGCCG 840
CCTCCGCCCA GCCGTCCCCA TGGCAACCGG CTGGCCTGGT CCAGGGTTCA CGGACAACCG 900
GATCCTCTGT CTCCCCTCCC CCACGGGAGG CTGGGCGTCT TAGACTCCCA ACTGTGTTCT 960
CTGGGAGCTT CCAGCTGCAG GAACCTACAG AATCATCCTG TCTGACCCCC TCGTTTTATG 1020
GGAGTAGTTG AGACCACGGA CTCTGGGGAC CTGCCCGTCC TGGTTGCAAG CCCCGCTCCA 1080
CCATTTCCTG CTGTAGGATC CTAGGCAGGG GACTTGGCCA CCCTGTGCCT CGGTGTTCAT 1140
TATCTGTAAA ATGGGGATGA TAATAAGTGA CTGTCTTATA GGGTTGTGAA AATTGAATGG 1200
ACTAAATGCA AAGAGGGCAG AGTGGTTACT GGTCTGTAGC CAGCACTGAG GAAGCATTAT 1260
TTTCCATGTT GGGAAGGTGA CGGTCACACA GCATGCTATT AGCAGATTTG GGATTGGAAT 1320
GCAGTTGCCA ATTCTTCCTA AAACACCCAG GGTGGCCACA TTGGGATTCT CCAAGGGTTA 1380
CCTGTGCTTC CTGCGGGCCC ACCCAACCCC CCTCTCTAAC CTCTTGACAG TCACAGTCAT 1440
TGAATTGTCT TTGACCAGGC AGTAAAATCC CTGAACCAGA AAAGGTCTTG CTCTAGCCAG 1500
CCCGGTCTCC CCAGTGCCAA GCACAAACCC GTTTCCTGCA CCTCCACTTT CCACCCCATG 1560
CCTGGTAGAG GAGTTGTTGA ATGAATATAG ATTTAATTAA TTAATTAGTT CATCTCCTCT 1620
ACCCAAACAC CCTCCCAGAG CAAGCTCCTG AAGCCCCTGG CCACCCAGCT CTCTCTCTTA 1680
CAGGACACCC CTTACGCTGA CCACTTCCTG CCATCAGCCC CCACCCCACC CCACTGCCAT 1740
CACCATGCTG TTCACAGTTC CCATGGCACA TTGCCTGGGT CCTCCTCCTC CCTTCAGCCT 1800
GCCCTCCCTC ACTTCCCTCC CCGGTTAGTG ACCCTTTGTC CTCAAAATGG CTGTTTTGGG 1860
GTCAAGGACC CTCCTCCAGG TCCAGAGGTG TACATTTCCC CTGGGTTAAG GAAAAACCCT 1920
CCAATGTGAG AGGCAACAAA GTAAACCGTC CTCATCCCCC ATCCTGGGGG AGACAAATGG 1980
GGGCCTGGTA CTGCCACGAT GGGTGTAGGG GTAATCCAGC GGCTTTCTGG GACTCTCCAT 2040
CCCACTAGGG AGGTGGCAGG GGCTTTTGGA CGCAGAATCT CTGCCCTTAG GGGCCACCCC 2100
ACAAGCTCCA GCCCAGCTGC CAGGTTTCCT CGGATACGGC CCAGTCGCCT CTGATTTATT 2160
TTTGCATGTG GTTTGGGAGA ATCTCTGTTG CTGGAATAAC GACAACCTTT TTTTTTCTCT 2220
CTCTCTTTTC CTTCCCTCCA ATAGGCAGAC TTTATAAACC AGAGCAGCTG CCTGAAGGTT 2280
TCCAAGAAAA AAATTCTGCA CAGTTTCTAA CCAGGGTGAC AGTTCCCCTC CACAGGAAGT 2340
TACTTTTATT AATTTTTTTA TCTCTTCTTT TGTAAGACTA TATACTGGTC ATCAGGCAGC 2400
ACCTGTGGGC ATTTTCTTAT TTCCCCCCAC TGCTCCCATT TGCCTGGAAT TCATTATTAA 2460
ATCTAACTCA TAGTGGCCTT GCCCAACACA GGGGCGAAGT TCAAACTACT GAAAAATGGG 2520
TCACTCAAAT CGCCTGTGCA GAAGAATCCC AAATAATTTA TGGAGATACT CCTCCCTCAA 2580
GGCGGTGAAA CATAAATCCC TGTCCCTGAA GTGTGGGCTG TGCATAATGA TTTCCTTCTA 2640
TGGAGTATAG TATGGAAAGC AGGGGGAAAG AGTAATCTTG CAGGAGAGAA ACCTGACAAG 2700
CACTAGCTCA GCCAGATGGC CAAGGTCAAC ATCAGCAGCG ATCAGTCGTG TCTATAGCAT 2760
GGACACTTGA TATGATGTGA TGGAAACAGC ACATCACCCC CAAACCCATA ACCACAGTTG 2820
AACCATGAGA AAAACAGCAG ACAGACCCCA CCTGAGGGAC AGTCTACAAA TTACCTGACC 2880
AACAGTCCAT CAAAAGCAAG GAAAGTCTGA GAAACTACCA CAGCCAAGAG CAGCCTAGGG 2940
AAATAAGATG GCTGCATACA ATGTGAGAGA CCCTGTGGAA CAGAGAAAGG ATGGTGGGTA 3000
AAAACTAATA AAATCCAAAT 3020