EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS049-05777 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_spinal_cord 
Coordinate
chr3:149270280-149273110 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr3:149271181-149271192ATTTTAATTAA+6.62
NEUROG2MA0669.1chr3:149271649-149271659AACATATGTC+6.02
STAT1MA0137.3chr3:149271806-149271817TTTCCCAGAAA-6.02
STAT3MA0144.2chr3:149271806-149271817TTTCCCAGAAA-6.32
Stat4MA0518.1chr3:149271803-149271817TTATTTCCCAGAAA-6.06
Number of super-enhancer constituents: 7             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02491chr3:149270423-149274195Astrocytes
SE_29965chr3:149270269-149274186Fetal_Muscle
SE_36488chr3:149270261-149274411HMEC
SE_37944chr3:149270182-149275024HUVEC
SE_45617chr3:149270013-149274866Osteoblasts
SE_47102chr3:149241114-149342648Panc1
SE_55791chr3:149271719-149272989u87
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I149552chr3149270313149274840
Enhancer Sequence
CTCATCTTCT CTAGAGGATG CATTTTAACC CTTACCTCTA GAGTTTCATA GGGGAATATC 60
CAAAGGGTAC CACATTCTAG TTGCTGCTTC CTCTTACTTC CAGAGCATAG TTGCCTGCTT 120
AGCCCCATTT CATTCTGAGT TTCACACATG ATTTACAAAC TCATCACTTT CCCCACAGCA 180
CTCATTATAG GTGAGGGCCA TGTATTTACC CGAGTTTGTG CTATCACCAT AGAAATTCAG 240
GATAGAAGGG TCTTAGTCCA TTTAGAGCAA TGGTTCTCAA ACTTTTCTTT AGTAGTAGAA 300
TCCTTCTCCA GAGCCAAGTG TACGGCTTGA AGCAGAGGCT ATCCTTATGT CCCAGGGTTC 360
TTTCATCAGC TGAGGAAATT AGCACTTAAA GTCAGCACCT TTGACTGTCT TCTCTAAATC 420
ATCTTGGTCT TGCTTTCACT CTGCTTTCCC TTCAGGCATT TCTCAAGTGT CATGCTGAAA 480
CTTTAAACAA ATGTTTAAAA CACATTGAAC AGGGCCCAGC TTTTGGAAAC TGAACACTAA 540
GGTTAGCTTC TGCTCACATC CCCCTGAGAT TCTAGCATGG GACTTTGGGA CAGACTTTAA 600
AACCAATGAT TTAGACTAAT TCAGTTATTT TAGAGATGAA GAATATTGGA AGATTAAATG 660
CCTCAGCCCA GATCTCAGGA ACAGGCTGCG ACAAACCTAG GAAACCCGGA ACGCCTGCTA 720
GAATACTACA GCTGGCATCA GCTGCATGGA TCACCAATTA CTGCCCAATG ATCACCAACG 780
GATCACCAAT CACTGCCCAA TCCTTTTTCG TAGTCATCAA AATATACGTG ATAAGTTAAA 840
TTTGGTGATG AGGCCAAGTA GTGTTTCCTT TTCCCTATTT CATGAAAAAG TCTAACAGAC 900
TATTTTAATT AACTTATTTA CTTTAAAATG ATGGGATCAA CGTGAATCGC ATGTTTTGAT 960
GACACCATTT GTGTGACCTC ACTTTATAGA AATGGTAGAG CATTTTGTTC TTCAATCCTC 1020
CAAAAAAAAA AGACAAAAAT CAAATAAACT TTGAAAACTC ACATTTCATA ATTTAGAAAG 1080
GCTTATATAT GGGAAGGAGA GGTGCTGCCA TCAGCCAATG GTAGACCTTC TGGCCATAGA 1140
GGCTTTGTGG GAATAATGAT ATGCAACTGA AAGAAGCAAG CCAAAACATA CAGGTGTAAA 1200
TCGTTTCTGA CTTATGTGCA GACCCAGCCA CATCAAGCTT TGAAAAATAT TTCAGCATCA 1260
AGAGTGTCTG GGTGCAGCTG CGGGTCTTTT CCTCTGTTTA TGCGCCGTCC ATGGCTTAAC 1320
TCATGTGAAC TGGCCAACGT CAGGTGTCAC GCAGCCCTGT CTGATGGAAA ACATATGTCT 1380
ACAGAGGTAG GAAGAAAAAC CCAGCCACAA TCCAGCCTTG ACTCAGTCAC GATACAATGA 1440
AGGGAAAAAA AGGGCTGCAG ACGCGTCTCT CGCCCTCCTT GTGTCTCTCT CAGCTCCTGC 1500
CAACAATGAG CCGCTTGTTT CTCTTATTTC CCAGAAACAG TATTAGCCAT CCAACAAGGT 1560
CAGCAAAAAA AAAGCAGCTT TTCACTTCAG GGTGCATTTG GTTCCAAAAA TCTGTAAAGT 1620
ATTAAACCGA GAAGTTGTAC TATCCCAACT TCACACTGAG CCCTTTATTC CAATTCTGGG 1680
TGAGAATAAC TGCAAGGAAA TTTCTCAGCC GGCTCAGTTG ATAAGGCACA GAGCTCTGGA 1740
ATATATGTTG ATTCAGCCAC ACTTTCCCAG CTTCACTGTT TCAAGCCTTA AAACCACTTC 1800
CAGGTGCCCC AAAGCTTGCC AGATGGGCCT CCGGTCCTCC AGATGCCCCA AGCCTGTCTA 1860
GTTTTAGACT TGTAACCCAA GCTTCGTTTA CTTCACAGGA AACCCTGAAT TTTTAGCACC 1920
AGGAAATGAT TTTCCTACTT GCTATCCTGC CTGCCCATCC AAACAATAAT GTAGTCCACA 1980
CACCAGTGTG CAAGTATCTA GGCAACTCTC CTTTTTCAGG TGTAAAATAG AAATGCCTGT 2040
AACACTGGCT TTTATATTTT CATAATAACT GCATTACCCC AAATGTATAT TTTATTGGCA 2100
TTTAAAGGAT TCAGACATTA GTTCTCATCA TTATAATATA TCCAGGGAAG TCTAGGGAAA 2160
AAAAAAAATC ACATCTTTCT GGCAGGCTGA TTTCTTCTGG ATCCTTTTTC CTGTAAAGAA 2220
AGAACTCTTT CTTCCACCTA AAGCAGCATC AGAATGTGCT ACTCTGACTC CATTTGATTG 2280
CAGGGATATC TCAAGATTTA TCACAAGTGG CCCGTGGCAG GAAGCACCTC TATGGAGTTA 2340
GTGAATTTAG AAAAACAATT ATCTAGCCTG TGAAAAAGAG GAAATTTAGT TATTCACTTT 2400
GCTGCTTCAC AAAGTTGTCC TTGTGATTTT GAATATAATT CCATGGTTGG GCAATAGCAG 2460
TACAACTACA ACTGTTTTGT TATCTTCAGA CAATAGGTAT ACTTTTATCC AGCAGGAAAT 2520
GGAAACTCTG ATTCATGCAT TTATTTTTCT TTAGTCAGTA GAGAGTTTAT TGTAGCTTTT 2580
TATTGGTTAG CTTTCCTGAA TCATTTTAAA ACTACTCCAG GTGCGAAGTA TGGCAGTTGC 2640
CCAAGCTAAG AGAAAACGAA TCTACAGCTG TGTTCCACAC GGAATGGAAG AAAAGTTGCC 2700
AGCGTGAGTT GCTAGTTTTT AATGTGTGCA TGTGTTTTTT AATAGCATGC CCTTTTAGTA 2760
AACATCTTTA TTATGGAGAT CATGTAACAG ATACTAAGAT TCCAAGAGGT AGTCAAAAGA 2820
CTTGAACGAT 2830