EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS049-01847 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_spinal_cord 
Coordinate
chr12:58227970-58232690 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr12:58229323-58229341CTCTCCCTCCTTCATTCC-6.04
IRF1MA0050.2chr12:58228917-58228938AAAAGGAAAAAGAAAGAAACC-6.37
LMX1BMA0703.2chr12:58229789-58229800GTTTTAATTAA+6.14
Lhx3MA0135.1chr12:58229793-58229806TAATTAATTATCC+6.87
Nr2f6MA0677.1chr12:58231699-58231713AGGGTCACAGGTCA+6.28
Nr5a2MA0505.1chr12:58229150-58229165GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RxraMA0512.2chr12:58231699-58231713AGGGTCACAGGTCA+6.12
ZNF263MA0528.1chr12:58228318-58228339AGAGGAGGAAGGAGGGGTTGG+6.16
ZNF263MA0528.1chr12:58228313-58228334GGGGCAGAGGAGGAAGGAGGG+6.1
ZfxMA0146.2chr12:58228665-58228679GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 50             
IDCoordinateTissue/cell
SE_01109chr12:58226603-58228684Adrenal_Gland
SE_01109chr12:58229144-58229841Adrenal_Gland
SE_01109chr12:58229984-58231383Adrenal_Gland
SE_01109chr12:58231492-58233313Adrenal_Gland
SE_01602chr12:58226611-58228740Aorta
SE_01602chr12:58229102-58231368Aorta
SE_01602chr12:58231486-58233306Aorta
SE_03465chr12:58229158-58230032Brain_Angular_Gyrus
SE_03465chr12:58230345-58231287Brain_Angular_Gyrus
SE_03465chr12:58231934-58232672Brain_Angular_Gyrus
SE_04181chr12:58226531-58228863Brain_Anterior_Caudate
SE_04181chr12:58229147-58231440Brain_Anterior_Caudate
SE_04181chr12:58231499-58233391Brain_Anterior_Caudate
SE_05429chr12:58226535-58231419Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05429chr12:58231503-58233453Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06149chr12:58226649-58235406Brain_Hippocampus_Middle
SE_07273chr12:58226521-58228941Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07273chr12:58229141-58231438Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07273chr12:58231509-58232847Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_24546chr12:58229193-58229734Colon_Crypt_2
SE_24546chr12:58230426-58231211Colon_Crypt_2
SE_24546chr12:58231891-58232366Colon_Crypt_2
SE_26211chr12:58227895-58233002Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26717chr12:58227932-58228719Esophagus
SE_26717chr12:58229150-58233319Esophagus
SE_29576chr12:58229220-58233373Fetal_Muscle
SE_31793chr12:58228101-58228722Gastric
SE_31793chr12:58229158-58231336Gastric
SE_31793chr12:58231409-58232682Gastric
SE_42147chr12:58226430-58228883Lung
SE_42147chr12:58228910-58233523Lung
SE_48108chr12:58226483-58228747Psoas_Muscle
SE_48108chr12:58228985-58235118Psoas_Muscle
SE_48620chr12:58226564-58228737Right_Atrium
SE_48620chr12:58229120-58231370Right_Atrium
SE_48620chr12:58231495-58233326Right_Atrium
SE_50105chr12:58227949-58228711Sigmoid_Colon
SE_50105chr12:58229005-58233329Sigmoid_Colon
SE_51099chr12:58226619-58231341Skeletal_Muscle
SE_51099chr12:58231506-58248418Skeletal_Muscle
SE_52596chr12:58227931-58228726Small_Intestine
SE_52596chr12:58229095-58231434Small_Intestine
SE_52596chr12:58231483-58233314Small_Intestine
SE_53450chr12:58226575-58228601Spleen
SE_53450chr12:58229072-58233294Spleen
SE_65570chr12:58225309-58228839Pancreatic_islets
SE_65570chr12:58228919-58231366Pancreatic_islets
SE_65570chr12:58231529-58232251Pancreatic_islets
SE_68875chr12:58229101-58231488H9
SE_68875chr12:58231513-58232431H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr125822816058228599
chr125822917658229606
Enhancer Sequence
GAGTCTCATT CTGTTGCCCA AGCTGAAGTG CAGTGGTACA ATCATGGGTC ACTGCAGCCT 60
TGATGTCCCA GGCTCAAGCA ATCCTCCTAC CTCAGCCTCC CAAGTAGCTA GGACTACAGT 120
CTTCTTGGGA ACTTTTGCTC TCTGCCTCTC TAGGATGAGC TGGTAAAGGA CCAGTCTGGG 180
GTCTAGCCCC TACCCCTTGC CCCAGGTTTT CTTGGGCAGG ATGTCAAAGT TGGAAGGGGT 240
AAAACAGCAC AAGGCTCTGG GATTCCACTC CAGGGAATCC ACCCCCACCC CTGCCTGCAC 300
CTGCTCTGAC CAGCAGATAC CTCTGGGGGA TCAAGATGAC AATGGGGCAG AGGAGGAAGG 360
AGGGGTTGGA GCCAGGAGCT TTGGTCCAAG ACCTGCATTG TTCCTTGGTT AAGGGTGAGG 420
GAACCACAGA GTTCAGAGAG GGATCTGAAA CTTGTGTCAA AGAGCCTTTC AATGGCTCCT 480
TTCAGCCAGC ACTCAGCATT GTGTCCTTGA CAGCCAGGTG CAGGCCATCC CCTACCCATC 540
TGTGTGTGAT GGGGAGGGGC ACAGCCTGCC TTTCCAGGAG AGGAACACTG GGCACAAGAG 600
GATTTACAGG CCCACAGCGA TTTCCTTCTT TAAAAACAGA ACAAAAAAAC AGAGGCTGGG 660
CATGGTGGCT CATGCCTGTA ATCCCAGCAC TTTGGGAGGC CGAGGCGGGC GGATCACCTG 720
AGGTTGGCAG TTTGAAACCA GCCTGACCAA CATGGAGAAA CCCCGTCTCT ACTAAAAATA 780
CAAAATTAGC CAGGTATGGT GGCACATGCC TATAATCCCA GCTACTCGGG AGGCTGAGGC 840
AGGAGAATCG CTTGAACCCA GGAGGCAGAG GTTATGGTAA GCTAGAGATC ATGCCATTGC 900
ACTCCAGCCT GGGCAACAAA AGCAAAATTC CATCTCAAAA AAAAAAAAAA AGGAAAAAGA 960
AAGAAACCCT GTCTCTACTA AAAATACAAA ATTAGCCAGG CGTGGTGGTG CATGCCTATA 1020
ATCCCTGCTA CTTGGGAAGC TGAGGCAGGA GAATTGCTTG AACCCAGAAG GCGGAGGCTG 1080
CGGTGAGCCA AGATCACACC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAAGAGCGA AAATCCGTCT 1140
CAAAAAAAAA AAAGGGATGA GGTCTCACTA TGTTGCCCAG GCTGGCCTTG AACTCCTGGG 1200
CTCAAGCAAT CCTCCTGCCT CATCCTCTCA AAGTGCTAGG ATTACAGGCA TGAGCCACCA 1260
TGCCTGGCCC CCGTAGGAAA TTCATTGCAC ATGGTTTCCC CAACCAGGGA GGGCAGGACT 1320
CCAGCGGATG CCATGTAGCC CAACTACGAG CTGCTCTCCC TCCTTCATTC CCTGCTACCC 1380
TCTGCGGACA CCCAGCCCTC CTCTTCTGCC CAGATGCAGA TGTGCTTCTG CTTTCTCTGC 1440
CCCAAACATT TGGTTTGGGG CTAGATGTCT GAGAGGACTA GCACAGACCC AATGAGGGAA 1500
GCAGCTCTGG CTTAAGAAGA AAGTGAGCTG GTGGCTGAAG ACAGGGAAAC CAGGCCAGCC 1560
ATCCAGCTCA CTGCTGCGAG TCTTCCTACT GAGGCGGGGT GTGAGGAGAA GAGGGGATGT 1620
GAGGAGTATG CCCCCACTGA GGATCATCAG GGCTGGGGTC CAGGCTCTGC CAGTTACTGA 1680
CTCAGCCACA CAGCCTTTTG GAGCCTTAGT TTCCTCATCC ATAAACTGGG ATAACAGCAA 1740
GCCCTCACTC AGGACTGAAA GGATAAACGA AGTTAGAGAG TAAGGCACTG TGCTAACTCT 1800
AAAGCTAAAT GCTGCGCTTG TTTTAATTAA TTATCCAAGG GGAGATGACC ACTAAATGGC 1860
AACATCATGG GCCTCATTCC AGGAGGCCAG CAACAGACCA GGAGCCCTCC CACCATCATC 1920
ACGTGGATGA AGCCCAAGAA GATGAGGGAA AGGTGCCTGA GAGCTCTGAT CATGAGCAGG 1980
TTTCAGAAAG TCAAAATAGC CCCTATACCT TCTCCCAAGT CCACAACAAA ATTTGTTTTC 2040
CAGCTCACAA ACTCCCTGAC TGGGTATTCT GTGAAAAACA AAAGCAAGTA AGACTGTTTC 2100
ACTTGAGACA AAAATCGCTG TCTCCCCTGG TATTCATCCC CACTACTCTC AAGAAGTACC 2160
AGGTAAGGAC ACTATTTGCC CCTATGCATG GGCCGGGGTA GGTGGCTCAA GCCTGTAATC 2220
CCAGCACTTT GGGAAGCTGG GCCGGTTGGA TCACTGCAGC TCAGGAGTTC AAGACCAGCC 2280
TGAGCAACAT GGCAAAATCC TGTTCTACCA AAAAAAAATT AGCCAGGTGC ACCTGCAGTC 2340
CCAGCTTGGC AGGCTGAAGT GGGAGAATCA CCGGAGCCCA GGAGTTTGAG GCTGCGGTAA 2400
GCCGTGATTG CACCACTGCA CTCCAGCCTG GGTGACAGAG TGAGATTTTG TCTTTAAAAA 2460
AAAAAAGTGT ACATGTACAA ACACGTGAAC ACGTGCACAC ATACACACAA ACGAAGACCA 2520
GAGTGACCAG GGCAACACTG TTTTTAATCT TCTCCTGAAA GTCAGGTCCA GATACCACTT 2580
TTGTCAACAA CACAGCTTTG TGTCCCAGCA AAGGAACTCC TCACACATCT GCCTGCGATT 2640
CAGCAGAAGG TAACCTCTGA GACAATCAGA TTTTAACAAG CCCATTCAGG TAGAAAGTTG 2700
CTTTCTTTTT TGGTTCATCC CCAGAAGTAC TTCCTTCCCC ACCACCTCCC ATCCCCCACA 2760
GCAAAGGACT TAGCCTTAGC CTGGCTATCA CTATAAAATG GCCCCTCTGA GGGGCCTCCT 2820
TCCTCTCAGC TATTGGAGGA AGGAGAGTAT TTGGAGCATT TCCGGCCCTT CTTGGACGGC 2880
TGCCTGAACC CTGCAGCCAA GACACATTTG ACTGGGACTC CCCCATGGAG AGAAGTCCTC 2940
CCAGGTCCTC TGCAAGGGGC ATCTGTTCCT TGGCTATGGA CATGCCCTAA AGTGCCAGGT 3000
GGACGGAAGA GCTCCTGGGA CCAGCAGGTG AGTCGGCAGG GAACAAAAGA GGGTGAGATG 3060
CCTAGACAGC CCCCACACAC AAAAGACTGC AAACAATGGG GAGGGTGTAC TGCTTTCATG 3120
CCTGGCCACT GACACTGTTC TCTACAGCTA ACAAGCAAGG CAGGGCCGGA CCCAGCTTAG 3180
CACCGGCTCC CGAAGTTCCA AAAAGTAGCT GTGTATCTAA CTGCATGGGC ATTTTTTGAA 3240
AAAAGCAGTT TTAACACTTT GGGGGGCAAA GGCAGTGGGG ATCACTTAAG GTCAGAAGTT 3300
CGAGACCAGC ATGACCAATA TGGTGAAACC CCATCTTTAC TAAAAATGCA AAAATTAGCA 3360
GGGTATGGTA GTGAGCTCCT GTAATCCCAG CTACTCCGGA GGCTGAGGCA CGAGAATCAC 3420
TTGAATCCAA GAGGTGGAGG TTGCAGTGAG CCGAGATCAC ACCATTGCAC TCCAGCCTGG 3480
GGGACAGAGC AAAACTCTGT CTCAAAATAA ATAAATAAAT AAATAAAATT TAAAAAATTA 3540
AAAAGCAGTT TTAGCCATGC TGTTTGGCCC ATACCAGCAT GTTGTATGCT GGTGCCCTCT 3600
CTGCACCAGC AACTGGGGCA GCTCTACCTA AGCCAGTGTC TCCATTAGTT CCCTTTCCCT 3660
GGGCAGGAGA GCTCCCTATA TGGCTGTCTC TTCTTTCAGA CCTGAGTCCT TAATGCCACC 3720
TGTGGGGCGA GGGTCACAGG TCACACACTT TCTTGTCTCT GCCCCTTCAG CAATCTGTTC 3780
TCTGACCTCA GCTAGAGAGG TAAGAGGACT CAGTTTTGGG AGCAGGGGAT TTCTGGCAGT 3840
TCTAAAGCAC GCTGATTTCA GAATCAGCCT CTAAAGGAGG TATTGCCAAA ACACCCTCCT 3900
GGGCAGCTCC AACGTACTTT AAAAACGTGC TGGGTTGGGG TGGGCCTCCA TAAGTAGCAG 3960
ATCCTGGACC AGAGACAGAG GAGGCGTTTC CTCATAGACA AGTCAGCTGC AGGCTCAGCC 4020
CTGCAAGCCC CACTCCAGAG GACTCTTGAG GGATGTCAGG AAGTGATCTA ATAGCCCACA 4080
GGGCAGCAGG GACAAGCCTG AGATGCCATC CAAGAAAACT CAAAGGACTG GATCCTGCCC 4140
CTGCCTCAGC AGGAGACCCT GCCCTATGTA GCACCAGCCA GAGCAAAGGT ATCATTGTGA 4200
GGGATTGGAA ACCACACTTG CCTACCTGGA GTTACCCCTC CTTCCCCCTA AGGAGGTGTA 4260
TAACAAGCCC CTGTGGGAGG GGCTACACAC AGACAACCTC TCAGTGAGTG TTTCAAGTTC 4320
CTGCCTTAGT GCTGTGCCCT TGACTCCTGG AATGCTTAGA TATAGTTGAA GCCTAGGAAG 4380
AATCCACTGC TTCTTTCCCT TCCAGGTATG TAGGCCTGCT TTAGGTTGAT ACAAACGTGA 4440
GCTGGAGAAA GCAGTGAGGA CACAGGACAA AGCAAGGGTA TCTGTTCTGA CCAGGGAAAA 4500
ATACAGTGGT GACACAAGGC ACCCAGACTT GAGTTCGAAT CTAGGCTCTG CCATGTGTAA 4560
GGTATGCAGC CATGGGCCTC AGTTTCTTCA TCTGCAAAAT GGGAAGACTA CCTATTTCTC 4620
AGTGTCAGAA TTGCAGGGAG CTCAGGGAGT GTCCTGGTCC TAACAAAAGC TTTGTAAGTG 4680
TCAACTGCTA CTCATTAAGT GCAAAGTACT TTCATACTCT 4720