EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS049-01408 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_spinal_cord 
Coordinate
chr11:65243770-65247780 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs686320chr1165244538hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr11:65245036-65245046GTCACGTGAC-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246290-65246308GCATCCTTTCCTCCTTCC-6.19
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65246294-65246312CCTTTCCTCCTTCCCTCC-6.56
HNF4GMA0484.1chr11:65246233-65246248TGACCTTTGCTCTCC-6.09
RREB1MA0073.1chr11:65245283-65245303ACACCACACACCCCACCCCA+6.78
TFAP2AMA0003.3chr11:65245431-65245442TGCCTGAGGCG-6.62
ZNF263MA0528.1chr11:65245371-65245392CTCTCCGTCCCCTTTTCCTCC-6.05
ZNF263MA0528.1chr11:65244555-65244576AGAGGATGAAGGGCGAGAAGG+6.15
Number of super-enhancer constituents: 106             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00783chr11:65244461-65245009Adipose_Tissue
SE_00879chr11:65243737-65247689Adrenal_Gland
SE_01577chr11:65243681-65245828Aorta
SE_01577chr11:65245864-65247837Aorta
SE_02242chr11:65243690-65245837Astrocytes
SE_02242chr11:65245846-65247850Astrocytes
SE_02898chr11:65243900-65245721Bladder
SE_02898chr11:65245861-65247649Bladder
SE_03165chr11:65243833-65245629Brain_Angular_Gyrus
SE_03165chr11:65245855-65247985Brain_Angular_Gyrus
SE_03882chr11:65243488-65248309Brain_Anterior_Caudate
SE_04846chr11:65243590-65248492Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06693chr11:65243625-65248376Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07762chr11:65243485-65248309Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08788chr11:65244350-65245047Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65245100-65245564Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08788chr11:65246013-65247878Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09268chr11:65243462-65246742CD14
SE_11317chr11:65243218-65247007CD20
SE_12675chr11:65244377-65244982CD34_adult
SE_12859chr11:65243747-65246162CD34_Primary_RO01480
SE_13317chr11:65243305-65247514CD34_Primary_RO01536
SE_14049chr11:65243474-65246108CD34_Primary_RO01549
SE_14376chr11:65243250-65248236CD4_Memory_Primary_7pool
SE_19912chr11:65243461-65246522CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20736chr11:65243345-65248112CD8_Memory_7pool
SE_23775chr11:65243752-65245648Colon_Crypt_2
SE_23775chr11:65245744-65247567Colon_Crypt_2
SE_24819chr11:65243713-65245815Colon_Crypt_3
SE_24819chr11:65245945-65247705Colon_Crypt_3
SE_25770chr11:65243454-65248568Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26547chr11:65243712-65247764Esophagus
SE_27634chr11:65243475-65248010Fetal_Intestine
SE_28555chr11:65243470-65247915Fetal_Intestine_Large
SE_29556chr11:65243690-65248034Fetal_Muscle
SE_30929chr11:65243697-65247190Fetal_Thymus
SE_31424chr11:65243704-65247822Gastric
SE_32522chr11:65243694-65245937GM12878
SE_33163chr11:65244384-65245646H1
SE_33445chr11:65243783-65246412H2171
SE_33445chr11:65246425-65248022H2171
SE_34266chr11:65243277-65248485HCT-116
SE_34617chr11:65237426-65277580HeLa
SE_35831chr11:65243480-65248037HMEC
SE_36925chr11:65243656-65250247HSMMtube
SE_37995chr11:65243474-65247266HUVEC
SE_38870chr11:65243701-65245815IMR90
SE_38870chr11:65245883-65248011IMR90
SE_39628chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_39628chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_39847chr11:65242346-65247990K562
SE_40612chr11:65243484-65248051Left_Ventricle
SE_41603chr11:65243830-65245629LNCaP
SE_41603chr11:65246191-65247746LNCaP
SE_42107chr11:65243459-65247905Lung
SE_43442chr11:65243703-65245696MCF-7
SE_43442chr11:65245821-65247985MCF-7
SE_44137chr11:65243645-65248494NHDF-Ad
SE_44750chr11:65243565-65248057NHLF
SE_45562chr11:65243454-65248511Osteoblasts
SE_46695chr11:65244339-65245629Ovary
SE_46695chr11:65245876-65247656Ovary
SE_47127chr11:65243490-65277571Panc1
SE_47538chr11:65243903-65245646Pancreas
SE_47538chr11:65245995-65247517Pancreas
SE_48070chr11:65241375-65248038Psoas_Muscle
SE_48581chr11:65243560-65245838Right_Atrium
SE_48581chr11:65245850-65247830Right_Atrium
SE_49457chr11:65243757-65245718Right_Ventricle
SE_49457chr11:65245877-65247582Right_Ventricle
SE_50062chr11:65243572-65247904Sigmoid_Colon
SE_51077chr11:65237462-65248280Skeletal_Muscle
SE_51697chr11:65243660-65245825Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51697chr11:65245863-65247937Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52357chr11:65243567-65248006Small_Intestine
SE_54467chr11:65243714-65247868Spleen
SE_54503chr11:65243495-65276614Stomach_Smooth_Muscle
SE_55162chr11:65243857-65245663Thymus
SE_55162chr11:65246193-65246851Thymus
SE_55732chr11:65243661-65248051u87
SE_56764chr11:65243730-65245661VACO_400
SE_56764chr11:65246058-65246660VACO_400
SE_57390chr11:65243794-65245665VACO_503
SE_57390chr11:65246011-65247348VACO_503
SE_57928chr11:65243807-65245743VACO_9m
SE_57928chr11:65246166-65247148VACO_9m
SE_58932chr11:65238587-65276390Ly3
SE_59720chr11:65237780-65272476Ly4
SE_60674chr11:65238641-65271340DHL6
SE_61239chr11:65237836-65278618HBL1
SE_62240chr11:65238321-65275907Tonsil
SE_63249chr11:65244238-65267283GLC16
SE_63391chr11:65243820-65268347NCI-H69
SE_63485chr11:65243646-65248049HSMM
SE_64233chr11:65243668-65247416NHEK
SE_65811chr11:65242911-65247755Pancreatic_islets
SE_66427chr11:65243730-65245030Jurkat
SE_66427chr11:65245043-65245652Jurkat
SE_66874chr11:65243783-65246412H2171
SE_66874chr11:65246425-65248022H2171
SE_67468chr11:65243661-65248051u87
SE_68042chr11:65238458-65277023TC32
SE_68043chr11:65238458-65277023TC32
SE_68495chr11:65243635-65267694TC71
SE_68496chr11:65243635-65267694TC71
SE_68897chr11:65244262-65245818H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr116524725565247724
chr116524595465247012
chr116524627965246484
chr116524463865245303
Enhancer Sequence
GACTCCGTCT CAAAAAAACA AAAACAACAA CAAGAAAAAG AGGTGTGTTA TTTAACCTTT 60
TCTTAGAAGC TTCTCTGCTG CCCCCAATCT TTCTCAGCAA TCCTAAGCCT TGCTCCAGTT 120
ACTGGTTAGA GCTGGGCCAA TAGTGGTCTG ACCACACGTG GTGGCAGCAT TCTGAGCTCT 180
GAGGAGACAA CCTGGGCTCT TGTCTTGAGG CCTAAACTGG GCCTGAGAGA GCAGGAACAA 240
ATCTGCCCTC TCCCTAAGCT CAGGGAGTCC ACAGCGGGAC CCTCACACCC AGTCTAAGGA 300
GACCACTGGG CAGAGCTGAG ATCTTAAGGA CAAGCTGGAG TTCCCTCAGT TTTGGGAAAG 360
GAGTTCTGGG GTGAGCGAGG AACATCAGGA GAAGCTGGAA CAGAGAGGGG CAGCCAAGTC 420
CTGAAGGGCC TGCTGTAACC CAAGAGAGAG GCCTGGCTTT ATCCAGCAAG GCCAGGGTGC 480
GGTCGGAGCA AAGGTTGTTT TATTAAAAGC TTCCTATGGC TGGAGCCCAG GAGTTCGAGG 540
TTACAGTGAG CTATGATCAC ACTACTGCAC TCCGGCCTGG GCAACAGAGC CAGACCCTGT 600
GTTTAAAAAA AATCCTAAAA AGCCACAAAA CTTCCTGAAT GCAGACAATG TAGGGGTTCA 660
AGGAGCTAGG GAGTACAGCG GAGACAGTGT TTGAACAGGC CCAGGCCTGG GCAGGTGGCT 720
GCCTTGGATG CCCGAAGGGA AAAACAGAAC AAAATCAGGA GGAATTGGAG CCTAAGTGAG 780
GGAGCAGAGG ATGAAGGGCG AGAAGGGGGC ATGGGGCTGA CAAAGCCGGG GTGGCAGCCC 840
GTCCCACCCC ACTCAGTGTG GGTTCCCGCG GTCTGTTCGG CGCAGCCACA GGGTCCTCCC 900
ACCACCCTCG CGGCCCTTCG CCAGCCCAGA TACCGTTTTC CCGACTTTGG AACGGAGACC 960
ACAACACCCG CCCCGGAACT ACTGAAGGCT CAAGTTAGGT CAACCCGGCA GGAAACCGGT 1020
TCCCAAATCC CAAGGCGGAC CCAGGCCCGC GGTTCCCTCC CTCAAGGCTG GAACAGCGCG 1080
CAGTGGCCAC CGCCGCCGGG TCTCCAGCCC CCAGGAGCGC GGCCTCCTCC CGGACTCTCT 1140
CCGATGCGGT CCTGCCCTGG GGACACGGCA GGAAGAAGGG ACCTGGCTGG GGGACGTGGC 1200
CCCGGCGCGG GGGCAGGGGA GGCAGCGCGG GACTCCCAGC GGCCCCTGCG CGGGTGCCCA 1260
CCCGCCGTCA CGTGACACGC CGGGCGCTGA GTCACCGGGA AGCATCTGGC TGGGCGGCCG 1320
GGATTGGCCA ATCTGCGGGA CCGTCTGGAG CGGAAGGGCG GTGGTAGCTG GCCCTGCTTC 1380
TCCCTCCCCA GGATCTCTGC ACTGGCCTTA CGAACTGGGG AGTCCAAGGG GTTCCAGGAC 1440
GGGAAGGGGA GTTTGAGACC AGCCTGGGCA ACCTGGCCAG ACCCGGTCTC TATTAAAAAT 1500
ACGCAAAACA CACACACCAC ACACCCCACC CCACACAGCC CACACACCCC ACACGGCCAG 1560
CAGCCCTTTC TGTCACCGAC TCCGTTCCCC TGGCCAGTGA GCTCTCCGTC CCCTTTTCCT 1620
CCCTTTTCGC ACACGTGCCT TTCCTGCCTG CTCCCACCTG GTGCCTGAGG CGTCTCTGCG 1680
CCTCAGCACT GGCTGTTCGG TTTGCACTAC GGAGGGCAGT GTAGGTTTGA AAAGGAAAGT 1740
TTCATTATAT AGAACACTAC CAAGGCAGGG CGCGGTGGCT CACGCCTGCA ATCCCAGCAC 1800
TTTGGGAGAC CGAGGCGGGT GGATCACTTG GGGACAGTAG TTCAAGACCA GCCTGGCCAA 1860
CATGGTGAAA CCCTGTCTCT ACTAAAAATA CAAAAATTAG CTGGGAGTGG TGACACTTGC 1920
CTGTAGTCCC AGCTACTTGG GAGGCTGAGG CAGGAGAATC GCTTGAACCC AGGAGGCAGA 1980
GGTTGCAGTG AGCCGAGATC CGGCCACTGC ACTCCAGCCT GGGAGACAGA GTGAGGCAAG 2040
ACTCCATCTC AAAAAAAATA ATAATAATAA TTAATAAAAA AATAAAAATA ATTAAAAGAA 2100
AAAGAAAAAG CACTACAGAA GAGTGCAGAG GGGCGCCTCA GCTAGAGGAC TTAGGGATTT 2160
TCCTTAGGGG CATTTATGGA CCTTAAAGAG GGAGCTTAAG GGTAACTTGG ACCACACTAG 2220
CCACATAGGT CATGATAAAT GATTACATTT GTAGACATTT TGGTGCCTAA TGCCAGTCAG 2280
CAAGGGTTGT TGCACAATGA GTTTGGACAG GCATGCATTT GCAGAGATGT ATAGAAATTC 2340
TAATTACTTG GAAATTTTGT TGGACCGGAG CTAGGAACCA AATGGTATAG GGAAGTCTCA 2400
TTACTTCTGA ATTCCTCAGA TAAAGAGTTT TGCCTCTGCC TGGGCTGCTC GATGGCCACC 2460
AGGTGACCTT TGCTCTCCTC AGGGGCTGCT GTGGGTCCAG AGCTGGAAGG AGAATGGGCC 2520
GCATCCTTTC CTCCTTCCCT CCCCGCAGCA GCAGGGGCTC TGGCTGCGGG GGCGGGCTGA 2580
GCTCCGTCCG GGGTGATGCG AAGGGGGTCA TGCCGAGGGG GTGACTCCCA GCTTGCACTG 2640
CGTCCCACAG TCGCGCCTCG CCTCGCCTCC CGGAGCCCGA GTCTTCCAAG GGCGCTGGCA 2700
GCTGCGTCAG CTCCCGCTGC CCGCCCCAAG CGTCCAGAGC TAGGAGGGAG TTACGGGGCG 2760
AGGCCCAGGG CTTTTCAGGG CCGGGGGTCG TGCGGCCAGG CGCGGGTGGA CTAGGCCAGC 2820
GGCCACTGAG GGGCAGAGAG GTCTGGGGTT CTAAGTTTAG CCCACTCCGC GAATGTGGAT 2880
TGCTTTGTTT GGATGTGATT CCCTTTCCAG GTGACTGTAG GTTACCCCCA CACTGCCCTG 2940
GCATGGAAGA GATTTAGGCT GTCCTAGGCC TTCACCCTTC CCTAAGACGA GAATCCAGAG 3000
GAGGAGCCAT TTAACAGCTC CCTGGCTTCT CTCACTTACA GGGAGCTCAC TACTACTACT 3060
AAAAACATTT TGAAGTTAAC ACCCCCTTAT GCCTGGCTCA TTCGTGCATT CAACAGATGT 3120
TTACTGAGCA CAGACTGTGT GTTGGAGACT GGCCACTGGT TTACATAACG AGCTGTGATA 3180
AAACAAAGTC CCAAGCCTCT TGGTTGATGT TCTCAGGCTT TTTTGAGGTG TGAATCACTT 3240
CTCCCTGGAA GCCCTCCTAG CTATGCCACC CTGGCTTAAG ACTGACTTTT GTGCTCTAGT 3300
GGCCCCTCAG GGATTCCCCA CATCAGCACT GACTAAATGT CCACTTCCAT GAGCTAGAGG 3360
AAGGTGGCGC CTCTTATTTG GCCTGGAGCA GGGAGCTAGG GCTCCTGCAG CCTCCAGATC 3420
CCTTACTGGG CGTCAGCTCA AGGGTGGGAA GGCCGGGGGC CTGCACCCCC TGGGAAAGAT 3480
GTGGGCATTT GTTTCAAGGC AGGTGGTGGT GGCTGAAGTC TGGAGGCAGG GAGAACGGCT 3540
GCGTATTTCA AACTTGTAAG CAAAGGACAG GGGACCTATT ACTGGGAAAT TTCCCACATG 3600
TGCCAGGGGG AAGGAACAAC CCTCTCCCTG TGGAAGGTGG GGGGAGCGAG CTCACCTCCC 3660
AGAGAGACAA CTCTGTCACT CTGGCGCCTC TGCCCGCCCT TGTTCTTCCC TCCATCTGAA 3720
ATCTTCCCCT CTTCTCAAAG CTGGTGTATT CTCATCCTTT AACTCTCCAC TCAAATGTCA 3780
CTTTCCTTGT CAACCCTTGT CAAAATTGGT CCCCTCCTCT GTTCCCTTTA TTCCATCACC 3840
TATATTTTCT CAGAACATGT ACAGTGCTCA TTCACTAGGA TTGTTACCCG AATCCTCTGC 3900
TAGAATGTAA GCTCCAGGAA GGTGGAATTC TTGCCTTTTT CCTGCCTTAT TTTTACTAGC 3960
TGTACCTTGC ATAAAGGGTG TTTGTTGAGT GAATGAAGTT CTGTCCTAGA 4010