EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS049-00558 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_spinal_cord 
Coordinate
chr1:155943070-155947860 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:155945882-155945900GGAATGAGGCAAGGAATG+6.3
IRF1MA0050.2chr1:155943550-155943571AAAAGAAAAAAGAAAGAAAGA-6.11
KLF4MA0039.3chr1:155944110-155944121CCACACCCTCT+6.02
Myod1MA0499.1chr1:155944747-155944760GGGGGCAGCTGCT-6.03
PLAG1MA0163.1chr1:155947698-155947712GGGGACAAAGGGGG+6.08
RREB1MA0073.1chr1:155947633-155947653GGGGTGGTGGTGGTGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr1:155947542-155947562ACCCCAGCCACCCGCCCACC+6.3
ZNF263MA0528.1chr1:155947307-155947328GGAGGAGGAGGAAGGGCAGGG+6.28
ZNF263MA0528.1chr1:155945257-155945278TCCTCACTTCTCCCCTCCCCC-6.68
ZNF263MA0528.1chr1:155947310-155947331GGAGGAGGAAGGGCAGGGAAC+7.1
ZNF263MA0528.1chr1:155947304-155947325GGGGGAGGAGGAGGAAGGGCA+7.39
ZNF263MA0528.1chr1:155943091-155943112TTTCTCTTTTCTCCCTCCTCC-7.4
ZfxMA0146.2chr1:155943296-155943310GAGGCCGAGGCGGG-6.01
Number of super-enhancer constituents: 59             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00371chr1:155941812-155954742Adipose_Nuclei
SE_01845chr1:155943468-155954747Aorta
SE_02626chr1:155944686-155950278Astrocytes
SE_03231chr1:155943838-155950206Brain_Angular_Gyrus
SE_03962chr1:155934540-155952025Brain_Anterior_Caudate
SE_04939chr1:155933998-155950544Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05884chr1:155934346-155954766Brain_Hippocampus_Middle
SE_06771chr1:155934659-155951687Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07892chr1:155934208-155950911Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08811chr1:155943981-155947946Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09348chr1:155934545-155952363CD14
SE_10611chr1:155944922-155954549CD19_Primary
SE_11511chr1:155934212-155955089CD20
SE_13030chr1:155943238-155950634CD34_Primary_RO01480
SE_13504chr1:155935749-155952228CD34_Primary_RO01536
SE_14255chr1:155943527-155950426CD34_Primary_RO01549
SE_14748chr1:155935670-155954509CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18702chr1:155935061-155954101CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19282chr1:155943689-155952043CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_21118chr1:155944387-155954735CD8_Memory_7pool
SE_26270chr1:155943880-155954619Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27178chr1:155943540-155954349Esophagus
SE_29653chr1:155943497-155954685Fetal_Muscle
SE_32195chr1:155943835-155950402Gastric
SE_34744chr1:155944639-155954826HeLa
SE_36575chr1:155944054-155950067HMEC
SE_37367chr1:155943411-155954717HSMMtube
SE_39002chr1:155943945-155954683IMR90
SE_40164chr1:155944018-155954524K562
SE_40938chr1:155943868-155954680Left_Ventricle
SE_42293chr1:155943432-155954731Lung
SE_43728chr1:155943835-155954686MM1S
SE_45406chr1:155945111-155946504NHLF
SE_45406chr1:155946520-155950447NHLF
SE_47089chr1:155944170-155950162Ovary
SE_48803chr1:155943444-155951076Right_Atrium
SE_50236chr1:155943456-155954539Sigmoid_Colon
SE_51497chr1:155941703-155954664Skeletal_Muscle
SE_52309chr1:155944861-155946413Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52309chr1:155946616-155947212Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53045chr1:155943486-155954414Small_Intestine
SE_53512chr1:155943435-155954278Spleen
SE_55468chr1:155943829-155945106Thymus
SE_55468chr1:155945161-155949969Thymus
SE_56150chr1:155944721-155954706u87
SE_57594chr1:155947238-155949021VACO_503
SE_58809chr1:155914126-155961123Ly1
SE_59086chr1:155939045-155960951Ly3
SE_59715chr1:155907656-155970179Ly4
SE_60754chr1:155943974-155952549DHL6
SE_61625chr1:155913651-155954372Toledo
SE_62496chr1:155912775-155960919Tonsil
SE_64071chr1:155944167-155946550HSMM
SE_64071chr1:155946602-155947446HSMM
SE_66797chr1:155943888-155945154Jurkat
SE_66797chr1:155945231-155946165Jurkat
SE_66797chr1:155946303-155950580Jurkat
SE_67350chr1:155943835-155954686MM1S
SE_69165chr1:155944816-155949957H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr1155946363155946660
chr1155945743155946196
chr1155945200155946600
chr1155944562155945214
Enhancer Sequence
AGAACCTTCT GTCTCTTCTT GTTTCTCTTT TCTCCCTCCT CCTGAAGGGC TCTAAGCCAT 60
TCTCTCCTAT TTCCTTTGAG TTTAGACCCT GAGGGTTTCC TCTGGAAGTC AGAAGACCAA 120
CCCCAAACTT CCTTCCACTG TCATCCCAGA TCTCAGTCAC TTTTGGGAAA GAAAGACAGG 180
GCCAGGCCGA GCGCAGTGGC TCATGCCTAT AATCCTAACA CTTTGAGAGG CCGAGGCGGG 240
CAGATCACTT GAGATCAGGA GTTTGAGACC AGCCTGGCCA ACATGGCAAA ACCCCATCTC 300
TACTAAAAAT ACAAAAATTG GCCGGGTATG GTGGTGGGCA CCTGTAATCC CAACTACTCA 360
GGAGGCTGAG GCAGGAGAAT TGCTTGAACG CAGGAGGTGG AGGTTGCAGT GAGCCAAGAT 420
CATGCCACTG CACTCCAGCC TGGGTGACAG AGCGAGACTC TGTCTCAAAA AAAAAAAAAG 480
AAAAGAAAAA AGAAAGAAAG ATGGGAGCAA TGGCAGAGGG CATTGTGGAT CTCTACTGAA 540
AAGCTCAAAG GCAAACACAG TCTCCCCTCT TCTCTCCACT TTGTCTCCCA GAATAAGGGA 600
TGAGGAAACA GTGACGTACA TGGAGGGGAA GGCAATGCCA AGGCTAGGAC TTTGGCTTCC 660
TGGGCTCCCA GCAGGCAGCA AGGCCAGGCA GATCCACCCA GGCGAGGTAG AGCTTCTCCA 720
AGCAAGCCCT AAGCTCTCAT CTGACTTTTT TTTTTTTAAT AATAGATTTT AAAAACTTAA 780
TGTTTTTGTA GAGATGAGGT CTCACTATGT TGCCCAGGCT TGTCTCAAAT TCCTGAGCTC 840
ATGCGATCCA GCTGCCTTGG TCTTCCAAAA TGCTAGGATT ACAGGTGCGA GCCACTGTGC 900
CCAGCTCTCT CAGCTGCCTT TGCTTCTCTC TCAGGTATGT CCAAATCAAG ACTTCTGGGA 960
GAGTCACAGA GTACTCAGAA TCACCTCTCC TCCAGCTGTA CCTGGCAGCA GCCCCTTCCC 1020
CAAGATGGTG ACACCTCTGT CCACACCCTC TGTAATAGTG ACCGGAGAGC CTGTGGAGCA 1080
TTCCACCAGG ATTCGAGTCA CCTGTGGCTC AGCCCCTGTA CAGCAGAGGC GCCGTTGGCT 1140
ATGAAGGGCA CTGAGTCCTG GAGGAGGAGC TATAGGGCTG GGAAATGAAG AGGTGAGGGA 1200
TTGCTGGGGG TGGGACTGAG AAGAGGGCTT GGGGTGGTCT CAGCCGGGCC CTGCTCCTTT 1260
ATGAGCTTCC AGGGACAAGA TGAAGACAGG AGGCAGAGGG GAAGGCAGCC AAGTGGAAAC 1320
ACTAATGCCA AAGCCAGAAA CAACACAGAA AGACATCACT GCACACACAA AGGCACTTAA 1380
TAAATGCTTG CTTAGTGAAT GAAGATGAGA CACTGGCAAT GGGAGTGGGT ACGGGTGAAA 1440
CGGAAGAGGA TTGCTAAGGG CCACAAGGAA TAAATCAGGT TAGGGACCCT GAGACCCAAG 1500
CATCCTGGAA CCCAGCCTGC CCCCTACGCG GCCACACCTG TCAGGCCAGG AGAGAGAGAC 1560
AAGCAGAAAG AGAGGGGGGG TAAGCGATGC AAACAGACAG GCATTTGTGC AAGTGAACAA 1620
TAGCTGTGCC AGGACTCCCT GCCCTCCTGG CACAAGGCAG GCCGGCTGGG TTGGGAGGGG 1680
GGCAGCTGCT GCCTGCAACC CCACCCCCAC CCTCTCCCAA AGAGACATAA ACAAACCCGG 1740
AAGGGTCCAG CCAGCTCCTC TCAGCCTTTT CTCTTACCAG CTTCAGAAAT CCTAACCAAT 1800
CCGCTCACTC AGCTCCTAGA TGATATTTCC AACCAGAAAC TGAAGCTAAG GATGAAGCTA 1860
CTTCCTCGTG GCCAGAGAGC ACGAACCCCC TACTTTGCTG ACCACTGTTC AAAACAGTAG 1920
CCCAGAGCAT CTGGGTACAG AATAGGAGGG CAGGCAGGCA GACAGACACA CTGACACACC 1980
AGCACACCAG TAACATGCAC ACAGGGGATG CACACATTCA CATCTGTCCC CTCCTTGATT 2040
CCAAGGTCAA ATTCCACAGC CAGAGTGGCT AAGATCAGAC CCCACTGTAA CTCCTCTGGT 2100
CGGCCTCAGT AGGTCCTTCT CTAGGCCCCA TCTAACCTCC TGCAAGTCAC TCAGTGACTT 2160
CCCTAAGCTT TAGACTCCCT TCCCCTATCC TCACTTCTCC CCTCCCCCTC AACTCTCTCC 2220
CTAACCTCCA CGACCCCTAG AATTTTTGTC TATGTCCCCA GAAGCCTCAG CCACCAGGAG 2280
GACCCCCCAT TCTTCCACTC TCCTCCAACA CCGTCAGCCC TCTCAGCTCC CTCCTGGGCT 2340
CCCCCAGCTC TCCTCTCCAC TGCACTCCTA GTCCTGCACA CAAAGCCAGC CACCTCTCCA 2400
TTCCTCAGAA CAAAGAAATA GTCGCTCTGC ACACTCCCCA CTCCACCTGC CCACCACAGA 2460
GATTCCAAGG GGACCCCCAG CCTCCACAGC CATCCCTGGA CCTCTGGTCC CTGCTTGGCA 2520
GAAAAGGACC CTTTGTTCTA AGGGATATGA TGGTTGGGGT TTGGGAAAGG AGAAAGGGAA 2580
GAACAGGGGA CTAAAGAGAG AAAGGGGACC TGTGAGGTTT GGGGCTTGTG GAGGTAGGAA 2640
GTAGAGCAGA GAGAACAGAG GAGGTGGAGG ACTGAAGACA GCCTGGGAGA ACAGAAATGG 2700
AGTGAAAAGA AAAAGGAAGC ATGGAGGGGG CTACACAGAG AGATCCTGTG AGGATGGGAC 2760
AGAGAAAGGG GCAGGTTAAA CTTACATTCC TCCTCCTAGG AGGAGCTCCC AGGGAATGAG 2820
GCAAGGAATG GGGAGGGGCT GAGGTGTCAG GGCTTAGCTG TGACCCATCC CCCCAAGGAG 2880
GTAGCAGGGG ACACCATCTT CTTCAAATAA TGTCTTTTCC AGCGGGTGCC CCTCTACTTC 2940
CCACCACAGT ATAAAAAGAA AGGAGACAGC TGGTGTGCTG GGGGGAGGGG GAGAGGGGAT 3000
CCAGGGTTTG TTGGCTAAGA ACCAACTCCC CCTTCTGTAA CCACAGTTTT CCGGAGGTGG 3060
CCCTCCCCTT CCGACCGGCC CAAACTGACA ACCACCCTTC TCCGGTGGCC TCTTTGCCCT 3120
CTCAGATCCA CCCACTCAGC CCCCGACTCC CTGCTGCCAG CCAGATTCCC AAATTACCTG 3180
CCCCACACAG CCAGCCCCCA TAGTAGAAAG AAGAGCCAGT CCCCCCACCA CCAAAAACAA 3240
AAACAAAAAC AGAGCATGAA CACCCAGATG TCTGACGTCC CAGCTCCCCA CAATAATGGA 3300
AAAGGGATCC CAGTAGCTAC CTGCCCCCAC AGAACCGCTC TCTATACCCC CTAGCCAGGT 3360
CTTCCCCCAA CCAGCTCCCC CATGGCTTTC CTTTTTAGGG TGGAACCAAA TTTCTGCGGT 3420
TTCAAAAAAC CTCCCCCGCC CCCCTTGGCT CTACTCCAGG GTCTCAGCTC AAACGGTTGA 3480
AAAAATAAAC AGACTTTTGG AGCTGGGGCC TGGGCTGGCG CAGGCTGTGA AGAGCCTGTC 3540
TGCCACCCCA CTGTTCCACC ACACTTCAGC CACCTCACCC CGGCCCTCTG TTTGTCTTAG 3600
GCCCTACTCG AATCCCCAGT TGCTTTCCAG ATAGCAAAAT CTAATCCCAA CCCCCTAAGG 3660
AAAGTCCTTT TAAAGCTGCT TTCCCTGGCC CTCCACCCCC AACCCAGGAT GGAACCTCTG 3720
TCTCTCCCAG TTTAGCATCA AGACAGGTAG CCTGGCTAGG AACTACCAGG GAGGTGGAGG 3780
GGAGGGCTTT CCATCACCCT TAAGGACTCC TAAGGGGTAC TGCTCCCTTG GCTGAAGTTG 3840
GTGATCAGCA TAGGCTGGCA CCAGGGTAGT AGGGCACTCA GGTTGGAGAG AAGCCAGAGA 3900
TTAAACCAAC TCTGGGCTGG GACCTGTCCT TTCTGATAAT GGGTACAGTG CGGGGGCCCC 3960
AAAGGAGCTG GGAGGTGCTG TCTGCAGGCA CCACCTTCCT TTCAGCTCTG ACTTATTCAC 4020
CTGCAAGTCA GCTTCATCAT TTCCTGGGGT CTGGGTGTGG AAAGGTCAGG GCACTTGGGA 4080
ATGGGGCTGG GTACAAAGGC AGGGATAAAG GGTACTTGGA GAGGAGTGGC CAAGAGGTCA 4140
TGATGGGGGA GGCGTGTGGA TAATTATACA CCCAGACTCA TGAAATGCTA GGTGAAGGGA 4200
CCCCAAGACG AGCAGATAAG AGAATGAGAG CGCTGGGGGA GGAGGAGGAA GGGCAGGGAA 4260
CACAATGCAT AGTGCCAGGT GTGTCAGCCT AAGGGTTTCA GGTTGGGAGA AGGAAGAGCT 4320
AGGAGGCTGG CGGGGCAGAT AGGGATGGAG GCCCTATGTT CCAGGCAGAA GGGCTCAGGA 4380
TGGAGGAAAG GAGCCCAGCT ACACAAAGAC CTCTGCTCCC TTCACCTAGA GGTGATGGTT 4440
TGGGGGAAGT AAGCCGTCCC TCGGCCGTCC CGACCCCAGC CACCCGCCCA CCCAGAGGGG 4500
AGAACTGAAT CACAGCTGGA AAGTCCATTT GCGAGGAGAG GAGGAGCTGA CTTTTGTCTT 4560
GGAGGGGTGG TGGTGGTGGT GGGAGGAAGC CGGGAAACCA CCCCCTCCCG TCCCCTCCGC 4620
CGGATGGCGG GGACAAAGGG GGAACGACCA AGCCAGCGAT TGGGGAGTGA TGGGGGGTCG 4680
CCACGCCAAG CCCAAGCCGG TGGGGCCCGG GGTGAGAGGA GGTGCCGGAG CTTCCACCGC 4740
CCCCACCCGC GAGACACACA CCTCCCTCTT CCCGCTCCGT CCCTTACCGG 4790