EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS049-00515 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_spinal_cord 
Coordinate
chr1:150539470-150542690 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs72700829chr1150540181hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
E2F6MA0471.1chr1:150540770-150540781GGGCGGGAAGA+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:150540092-150540113GAAGAAGAGGGGGGTGGAGGA+6.32
Number of super-enhancer constituents: 80             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00755chr1:150531631-150544092Adipose_Nuclei
SE_01227chr1:150539000-150541802Adrenal_Gland
SE_01735chr1:150537832-150541914Aorta
SE_01735chr1:150541930-150543119Aorta
SE_02312chr1:150538694-150543027Astrocytes
SE_03050chr1:150538954-150541795Bladder
SE_03050chr1:150542018-150542463Bladder
SE_03708chr1:150539819-150541671Brain_Angular_Gyrus
SE_04228chr1:150538692-150542114Brain_Anterior_Caudate
SE_07310chr1:150538444-150542117Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07310chr1:150542293-150543121Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_08618chr1:150538730-150541912Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09026chr1:150540109-150540693Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_10265chr1:150532493-150542117CD19_Primary
SE_11160chr1:150532177-150553440CD20
SE_11968chr1:150538585-150541907CD3
SE_12974chr1:150539454-150540256CD34_Primary_RO01480
SE_12974chr1:150540269-150540950CD34_Primary_RO01480
SE_13457chr1:150539536-150542072CD34_Primary_RO01536
SE_14155chr1:150539378-150541737CD34_Primary_RO01549
SE_15431chr1:150538918-150542057CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15874chr1:150539289-150541325CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16367chr1:150538875-150541810CD4_Naive_Primary_8pool
SE_16925chr1:150539285-150541776CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17377chr1:150532162-150553370CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17879chr1:150532111-150553231CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18425chr1:150532151-150553362CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19272chr1:150538655-150541875CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_19272chr1:150541910-150543410CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20081chr1:150532355-150543156CD56
SE_20809chr1:150539093-150541834CD8_Memory_7pool
SE_21519chr1:150539174-150541573CD8_Naive_7pool
SE_21978chr1:150538653-150542121CD8_Naive_8pool
SE_22540chr1:150532459-150546461CD8_primiary
SE_23425chr1:150539650-150540018Colon_Crypt_1
SE_23425chr1:150540076-150541750Colon_Crypt_1
SE_24490chr1:150540133-150540547Colon_Crypt_2
SE_25044chr1:150540130-150541468Colon_Crypt_3
SE_26032chr1:150531381-150542256Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27715chr1:150538686-150542465Fetal_Intestine
SE_30770chr1:150538593-150543400Fetal_Muscle
SE_31016chr1:150538591-150541880Fetal_Thymus
SE_32586chr1:150533309-150543254GM12878
SE_33016chr1:150539633-150541760H1
SE_33943chr1:150538842-150541855HCC1954
SE_33943chr1:150541926-150543152HCC1954
SE_36042chr1:150538542-150543022HMEC
SE_37389chr1:150531646-150544455HSMMtube
SE_38169chr1:150538408-150543237HUVEC
SE_39064chr1:150538812-150541759IMR90
SE_40964chr1:150530832-150543289Left_Ventricle
SE_42054chr1:150539572-150541428LNCaP
SE_42054chr1:150541451-150541820LNCaP
SE_42411chr1:150530284-150543186Lung
SE_43688chr1:150532235-150541859MM1S
SE_46030chr1:150532378-150543410Osteoblasts
SE_47642chr1:150538913-150540578Pancreas
SE_47642chr1:150540671-150541781Pancreas
SE_49753chr1:150540131-150540564Right_Ventricle
SE_49753chr1:150540681-150541760Right_Ventricle
SE_50200chr1:150531037-150543263Sigmoid_Colon
SE_51405chr1:150530419-150544422Skeletal_Muscle
SE_51911chr1:150538607-150543077Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53505chr1:150530243-150543121Spleen
SE_55206chr1:150538746-150541804Thymus
SE_55206chr1:150542149-150542815Thymus
SE_58716chr1:150532377-150553189Ly1
SE_58896chr1:150532323-150553188Ly3
SE_59735chr1:150532367-150553203Ly4
SE_60541chr1:150532429-150553188DHL6
SE_61243chr1:150532496-150553036HBL1
SE_61580chr1:150532299-150553306Toledo
SE_62270chr1:150532150-150553368Tonsil
SE_63690chr1:150538668-150543114HSMM
SE_64390chr1:150539574-150543233NHEK
SE_65428chr1:150539386-150541513Pancreatic_islets
SE_67307chr1:150532235-150541859MM1S
SE_67962chr1:150539806-150541743u87
SE_68344chr1:150532799-150553352TC32
SE_69013chr1:150538863-150542064H9
Enhancer Sequence
GCCCAGGCTG GAGTGCAGTG GCACGATCTA GGATCACTGC AACCTCTGCA TCCCAGGTTC 60
AAGCAATTCT CATGCCTCAG CCTCCTAAGT AGCTGGGACC ACAGGTGCAC ACCACCACCC 120
CCATTTTTAG TAGAGAGAGT TTTGCCATGT TGGTCAGGCT GGTCTCAAAC TCCTGACCTC 180
AGGTGATCCA CCCGCCTTGG CCTCTCAAAG TGCTGGGATT ACAGGCATGA GCCACCGCGA 240
CTGGTCAAAT TTTTCTTTCA TACAGTAGCA CTGATACATC TTTCATGGTT CATGATGGGG 300
AAAGGAAGAT ACAGCGACTT CCATCCTGTT TCATACCTGA CCCCAACTAC CCAGCTTTGA 360
AGTGGGGCAA GGGGCAAGGA AGCAGGTAGC CCAGCACTCC TCCCCGCCAT CACCAGGCTC 420
CTCTGCAGAG CTGTTGTTCC TTAAAGCTGA CAACAAGCCA CCTCATTTCA AAACACACAC 480
ACACAACCTC ATTTTGACAC AAAGTTGTTT CCCTCTTTCT GTTTCTCTGC TTTGCCTCAT 540
GAGGGATTTC TGAGAAATGA AAAAAAGTCA CCTCCCACAG CCGCAGCCTG CAGTTTTGTT 600
TTTTGGTTTT GTTTTTACAG ATGAAGAAGA GGGGGGTGGA GGAAAGGAGT ATACCGCTTA 660
AGCATCTAGT ATTAATCCAA AACTCTGCAA AGTAAGAGAA ATGCTCTTCC CATAGCCCTT 720
CACCTGAGGT GTGTGCCCCA CTTTCCTTAG ATTTGGGCTC TCATGCAAAA GGAAATAAAC 780
AAGGTATCCT CCCCTCAGGA AAGTTCAGTA ACAAAGCAGT GAAACCGAAC AGCTGCTCCC 840
TTGCAGCAGG CCAGCTGTCT CCCCTCCCCC CATTTCCACC AAGGGCCGGA GACGGTGGGA 900
ACTGCTCCAG GCAACCTAAA GGATGGCGTT GTGAGCTGAG AAAGGCAGGC CTGATAGATC 960
TGGGCATAGG AGCTTCAGGA ATAAAATGCA TGTGAATGCG GTGTTTCCCA GGGAGAATTA 1020
ACCGCATTCT CGCCTTCAAA TCTGAATACC TGAGAGTCAT AACCAGCCCA GTAGGGTAGA 1080
CTATGAAATG TATAGCAAAA TTTTCAAAAC CAGCTCCTCC TACCAGACAA GAAAATTAAC 1140
ATTTTTTAGG GCACAGAACT GAAAGCATTT TTACTGAAAT CTAATCCAGG ATGAAACCTA 1200
ACAGTTAAAC ATTCTTTTCC TTCTCTGCTT CTTTGGCTCT CTATCCCAGC ACACCTTGTC 1260
CCAGGCTAAC TTGAGTAAAC ATACACATGT GACCACATGA GGGCGGGAAG AACACCAAGT 1320
GGGGGTGGTG AAATTCTGAA TGGAATGCAG CCCCAGCTAG TTAGGGGGCC CCGGGCTGAG 1380
ACCTCTGGCA CTGGCAGTAG ACTTATACAG GCAAAGAAGC CAAAACAATG AGCTCATGGG 1440
CAAGAATGCA GCCTGTGGGG AAGTCTGGGC AGCTAGAGCA AACTGGTTTT TTGAATCAGG 1500
ATGGGAATAG CAATAGTTGA GTCTCCCACG GGAACAGGAT CAGGGAGAGT GGAAGCCACC 1560
ATTCAGTATC TTAGGGTTCC AGTTAAATAA CTTTTGGAAG CTCTTATTAA AATTCTGTTC 1620
TGCAGACAGC ATAGTGCTCT TAGGCAAAAC CTTGGTTCCT TTCCCTGACT ATGTAAAACC 1680
TAGAGGGTGA AGGACCAGTG AGGCTCCAGT GACCTACCTT AGGTGATGCT CTTAAAAGAG 1740
CAACTTTATT CAAACCAGGC CTGCCAATGC CAACTCCTTC AGTCTAGATC CAAAGATGGC 1800
TATGATCCTG AGATTGTGTG TTTAGGGTCA CCACTTTAAC ATGATACAGG AAGCAATTGA 1860
GTCTTTTCTA CTTCCTAAAC ACAGTCCATC CAGTTGTGTG TCATTTATAC CCAGTCCAGA 1920
CTTATTTAGA CCAAAGAGCC TTTTTTTCCT ATCAGTGTTT TCCAAATTTT ATCTTAAGAG 1980
GCAGGGTCTT GTTATGTTGC CCATGCTGGA GAGCAGTGGC TATTCACAGG TGCAATTCTA 2040
CTACTGAGGA GCACAGGAGT TTTAACCAGC TCTATTTCCA ACCTAGGCAG GTTCACCCCT 2100
ACTTGGGCAA CCTGATGGTC CCCCACTCCC AGGAAGTCAC CATATTGATG CAGAACTTAG 2160
CGTGAACACC AGATCAACGT AGCACACTAT AGCCCTGAAC TCCGGGGCTC AAGTGATTCT 2220
TCTGCCTTAG CCTCCAGAAT ATCTGGGACT ATAGGTACGT ACAACTGTGC CTGGCCAAAT 2280
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTG AGATGGAGTC TCGCTCTGTC ACCCAGGCTG GAGTGCAGTG 2340
GCGTGATCAT GACTCACTGC AGCCTCTGCC TCCCGGGTTC AAGTGATTCT GGTGCCTCAG 2400
CCTCCCGAGT AGCTGGGACT ACAGGAATAA GCCACCACGC CCAGCTAATT TTTTTGTATT 2460
TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC GCCATGTTGG CCAGGCTATC CTCGAACTCC TGACCTCAGG 2520
TGATCTGCTT GCCTCGGCCT CCCAAAGTGC TGGGATTACA GGCATGAGCC GCCACGCCTG 2580
GCTCTAATAT TTTTATATAA GGCCTGAGAT GGGAAAAACT GAAGTCATAC AGTATTCACT 2640
GACCAAGAGC GGCGAGCAGA GAAAGAAGGC AGGGAAGGAA GATGGAATAA GAAAATTACC 2700
TACACAGTCC ATCCCTGCTT CTCCCATCTC CATACACCCA GAGGGTCTTT CCCAATTCCA 2760
TGCTTTGGTA CGTGTTTCTT ACTCATCTTT TTTTTTGAGT CTCGTTCTGT TGCCCAGGCT 2820
GGAGTGCAGT GGCATGATCT CGGATCACTG CAGCCTCCAC CTCCCGGGCT CAAGTGATTC 2880
TCCGGCCTCA GCCCCCCAAG AAGCTAGGAT TACAGGTGTG CACCATCACG CTCATCAAAT 2940
TTTTGTGTTT TTAGTAGAGA TGGGGTTTTA CCATGTTGGC CACACTGGTG ACCTCGGGTG 3000
ATCTACCCAC CTCAGCCTCT CCAAGTGCTG GGATTACAGG TATGAGCCAC CGTGCCCAGC 3060
CTCGTTACTC ATGTTTTAAG GTCCAACCTC ACATTTCTTA TGAAGCCTTC TTTACCACCC 3120
TCTACGTCTA GAAGTTGTCA CCCTGCTTTT TCCCAACCCT ACAATGCTTT GTACAGTGCC 3180
TTCTAATTAT TTCTGTCCAT GTCTATGACT CTTACTAGAT 3220