EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS048-20374 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_small_intestine 
Coordinate
chr2:54815160-54818960 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2CMA0497.1chr2:54816765-54816780TTCTATTTTTATACA-6.2
NFE2L1MA0089.2chr2:54817536-54817551TTTGCTGACTCATTG-6.41
ONECUT3MA0757.1chr2:54816257-54816271ATTATTGATTAATT-6.01
RARA(var.2)MA0730.1chr2:54816608-54816625AGGTCATAGAGAGCTCA+6.04
ZNF263MA0528.1chr2:54815323-54815344TCCCCTTCCTCTTCCTCCTCC-10.18
ZNF263MA0528.1chr2:54815317-54815338GCCTCCTCCCCTTCCTCTTCC-7.15
ZNF263MA0528.1chr2:54815326-54815347CCTTCCTCTTCCTCCTCCTTT-8.33
ZNF263MA0528.1chr2:54815320-54815341TCCTCCCCTTCCTCTTCCTCC-8.78
Number of super-enhancer constituents: 70             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00006chr2:54811575-54819309Adipose_Nuclei
SE_00896chr2:54815485-54815909Adrenal_Gland
SE_00896chr2:54816252-54816814Adrenal_Gland
SE_04102chr2:54814941-54816073Brain_Anterior_Caudate
SE_07789chr2:54813346-54816182Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07789chr2:54817129-54819221Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_10400chr2:54816091-54818335CD19_Primary
SE_11005chr2:54790737-54825699CD20
SE_11903chr2:54815334-54816100CD3
SE_11903chr2:54816161-54819079CD3
SE_12885chr2:54814124-54818971CD34_Primary_RO01480
SE_13387chr2:54812274-54819355CD34_Primary_RO01536
SE_14098chr2:54814276-54819273CD34_Primary_RO01549
SE_14488chr2:54815487-54818959CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15498chr2:54816054-54817245CD4_Memory_Primary_8pool
SE_15859chr2:54815876-54818061CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16936chr2:54816201-54817676CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17333chr2:54793892-54821363CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17873chr2:54814925-54818752CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18341chr2:54795035-54821330CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19520chr2:54815499-54818365CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20164chr2:54815127-54817586CD56
SE_20822chr2:54816241-54817869CD8_Memory_7pool
SE_21502chr2:54816159-54819303CD8_Naive_7pool
SE_21966chr2:54805854-54819252CD8_Naive_8pool
SE_22380chr2:54814371-54819185CD8_primiary
SE_23128chr2:54815488-54816009Colon_Crypt_1
SE_23128chr2:54816282-54816797Colon_Crypt_1
SE_23914chr2:54816303-54816784Colon_Crypt_2
SE_25070chr2:54816175-54816858Colon_Crypt_3
SE_25877chr2:54817070-54818113Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27348chr2:54816242-54816827Esophagus
SE_27627chr2:54814586-54819090Fetal_Intestine
SE_28537chr2:54814445-54819018Fetal_Intestine_Large
SE_29772chr2:54816185-54817593Fetal_Muscle
SE_31160chr2:54815014-54818854Fetal_Thymus
SE_31545chr2:54815469-54815973Gastric
SE_31545chr2:54816117-54816901Gastric
SE_32493chr2:54815176-54816073GM12878
SE_32493chr2:54816110-54818206GM12878
SE_35301chr2:54815908-54818232HeLa
SE_38000chr2:54811565-54818799HUVEC
SE_39396chr2:54811057-54819524Jurkat
SE_40773chr2:54814413-54816146Left_Ventricle
SE_40773chr2:54816224-54817045Left_Ventricle
SE_40773chr2:54817130-54818249Left_Ventricle
SE_42137chr2:54814409-54816036Lung
SE_42137chr2:54816119-54816971Lung
SE_42137chr2:54817415-54818240Lung
SE_47832chr2:54816285-54816759Pancreas
SE_49296chr2:54815259-54816007Right_Atrium
SE_49296chr2:54816123-54816962Right_Atrium
SE_49296chr2:54817612-54818194Right_Atrium
SE_49907chr2:54809659-54819600RPMI-8402
SE_50115chr2:54814479-54816047Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54816208-54817004Sigmoid_Colon
SE_50115chr2:54817065-54818427Sigmoid_Colon
SE_52386chr2:54815289-54815982Small_Intestine
SE_52386chr2:54816241-54817008Small_Intestine
SE_52386chr2:54817085-54818259Small_Intestine
SE_53342chr2:54814421-54816087Spleen
SE_53342chr2:54816141-54818248Spleen
SE_53342chr2:54818516-54819105Spleen
SE_55277chr2:54816248-54816810Thymus
SE_55277chr2:54817364-54817991Thymus
SE_60008chr2:54784446-54818579Ly4
SE_61167chr2:54784367-54847020HBL1
SE_61474chr2:54749764-54818736Toledo
SE_62304chr2:54783676-54846716Tonsil
SE_66257chr2:54811057-54819524Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr25481528954815330
chr25481660954817000
chr25481680054818302
chr25481740154817794
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH02I054584chr25481156454820841
Enhancer Sequence
TTAATTTGAA GTGGAGTCTA ACAAATGGGA TGTGGGATCA ACAGTATTAT TATATTGAAA 60
TGTTTTAAAC CAGGACATGC CAAACTTTTT CTATAAAGGA CCAGATAATA ACTGTTAGGC 120
TTTGTGGGCC ACATGGAGTC TCTATGGGGT ATCATCAGCC TCCTCCCCTT CCTCTTCCTC 180
CTCCTTTTAA CCACCCTCTT AAAATGTAAA ACCTGTGTGT CTCCCAGGCT ACATAAAAAG 240
AGGCTACTGG CTGAAGTTTG CTGACTCCTA TTTTATATTA ATCTTTTAAC TCAGTCTGAA 300
GGAACTGACC AGACATGGAT GGTTATGAGT TTTTTCTTCT TGTTTTGGGG AGGTGATGTC 360
TTGTTTTCCT CAGGCAGTGT GGGATGGTGG TTGGAACTAA ATAGATACCA TCCCACACTC 420
CCTGTGTGGG ATGGAGTGCC TCAGGTGCTT TGGGATTCTG TAGGGTTCAG ATAAATGTGG 480
GCTCTAATTC TGGGTGTTTA TTTGCTAGCA GCATGCCCTC GGGGGGATCC CAAAACCAGT 540
CTGTGCCTCA GCCACCTCAG TTAGTTAGAA ATCACAGGCT GTAATGAAGG AGGGAAAGTG 600
AGTGAAGATC CTAATGCAGC ATCACTAGTG CACACCTGGG CTTACTTCAG CCTTTGCCCT 660
AACTGATCAG TCACCCTGAC TGCAGTTCCC ATCCTGTAGA GATGGAGAGT AGCAGGTTAA 720
TGGGCTCAGG ATATGACTTC CTGTATGTGA AAGCAGTTTG GAAGCATGCT ACCCATTTTT 780
AGTCAAACAC AGTGAACAGT TACTGAGAAT TTTATCACAA GGTCCTAATT CTGTTTTTTT 840
ACATTTGCTT TTTCCACCTG GTTTTGGCAC CTTACACTAT TGGTTTTTTT TGTTTTGTTT 900
TTTAAAAAAT ATTTTTAACT TTTGTGGATA CATAGTAGAT GTATATATTT ATGGGGTATG 960
TGATGTTTTA ATATAGGTAT GTGATGCTTA ATAATCACAT CGTGGAGAAT GGGATATCCA 1020
TCCCCTCAAG CATTTATCTT TTGTGTTACA AACAATCCAA TTATACTCTT AGTTATCTTT 1080
AAATGTACAA TTAACTTATT ATTGATTAAT TCACACTGGT TCCCACCTTA GCTCTCATCT 1140
TAGAAGAGGT AGTTGTGTTG CTTTGCCTCT TATTTTCGGA GAAAGCCCCC ATCATAACCT 1200
CAGCTCCCTC CAGAGTCTTG GCTTCTTATG GATTGTGACT TTATGCGGCT CACCTTGACG 1260
TACGACTGTG ACAGAGGCAG GACCCTGGTG ACAGAGCCTC ATTTCTCAGT TATTGTGGGT 1320
CTCCTCTCAG AAGTTGTGCC TGCAGTGCCT TGGTCTCCAC ATTGGCAAAC TGGGGTTGTG 1380
CCGCTCAGAA GAAAGGCCCT CTGGAAGCTG CAGGAGGGAC TGCCCAGCAG ATGCAACCTG 1440
TAGGTGCCAG GTCATAGAGA GCTCATGGTG GGTTTTGTAG TCGGCCCATC AGACAGTTAC 1500
TAGCAGACAA TTGCATATTT GCTTCACATG CATTTAGAGC AAATATTTAC ATGTGTTTTG 1560
TCCATGATGC AAGTTAAACA GTTAAGGAAA CTATTGTAAC TCAAATTCTA TTTTTATACA 1620
AATCAGCAAA CATGAATTTA AGGCCTTCAG ACTAGTCCGT CACAGGGAGG ACTTCAGTCA 1680
AAAGATTAGT TTCCTTCCTG TTGCTGCCTC AAGATAACAG TTGGATTCTC TGTTATCAAT 1740
ACAGCCAGCT GCCTGTTTCC GGCTTCCTGC TCTGTGTATT TTGCATGTTA CTCATGGGAA 1800
ATGATTTATT TATTTTTTCA AGCTAAGGCA TATAGGGGGA CTCCACCCTA CCACTATTCT 1860
TTTGTTTTGA GTTAAGATCC TTTTTTATTC TTTATTTTAA AACAGTTCAA GAATTAAACT 1920
TTAATATATA AATTGTTAAA GTTGCAACAA ATTAAGTCTT GTGACAATTG ACCTGATTGG 1980
GTCATGTTTA AATAATGTTG TAATATGTTA CAATGATGTC CTAATCACAC CGTTGTGTAT 2040
TTTGCAACTT CACTTTACCG TACAGGTATG TGGTGGCAAT TGCCCAAAGA TAAAACAAGC 2100
AAACAAAAAA CAGAATTTGT CAAACATTTT AGTTTGGCTC TGGACCCATT TTAGTCTGAA 2160
TGACAGCACC ACAAAATTGC ATTTTTATCC GTATTTCAGA CATTGAGGAA TTGCAAGAAG 2220
CAGTTCACCT GTCATATATT TTTAGTGCTA TACAATGACA ACATTTAACT GCCTAGGGCC 2280
TGTCTTTGTG ATATGAAATT TCCCTCCTCA ACAATTTCAG TGAGACCACC ACCAACAATA 2340
AGATTTATCG AGAACCTAGT TGTTGGACAC TGGAGGTTTG CTGACTCATT GAACAAATGT 2400
TTATTGTGCA CCTCCTTTAT GTCATGTATA TGCTAAAGCT CTAAACATGA ATAGGATTGA 2460
GCCTTTGCCT CTGAGCCAAC TGCAAGTTAA TTGAAGAGAT AGGACACAAG ACGTATAATA 2520
AAAGATGAGA GACCACATCC CATCAAATGA TGATTGCTGA CATCTGATAG GAGAGGGCCT 2580
CTTGGTAGAA CTAATCTTGG CTGGATCTTA AAGGAAGGGT AAGAGAAAAC TGCCTTCTAG 2640
GTTAGAAGAA TGATAGAAGC AAAGATGGGA AAAAGCAGTG TGCAAGGTGA GAGTTCAGAG 2700
CATGAGAGTA AGACCTGTTA GGTTGGAACA AAAGACGGCA TGTCAGGGAA GTTCCCAGAT 2760
GAAGCTGATG CCTTAGGAGA GCCCGTTTGG GACCTTTAAA TGCCAGGTTC AGAGATTTGG 2820
ACTGTCTTCT GGATAGCTGG GGTCCGTTGA AGGTTTTGGT GCAGTGCTGC AACTTTGAAA 2880
AACCACTGAT TGAGGAACAT GGCTATGGTA GTGATGTTTA AGGTGGATTA GAATGCGGAG 2940
AGAGGCCCAA GGCAGGGGAG TTCAGTTGGG GTCTGAAACC ACCCAAATTG TGGTGAGCTT 3000
TGTTCAAAAC ACGCAAAAAT AGATTGTCAA AATTATTCTC TTAGCAACTG ATCTTGTACT 3060
TCTTTGTAAT GTCTTTTTGT TATTTTTTAA CTTTTTATTT TGTATCCCCA GCTAGATTTC 3120
TAGTTCATTG AGGGTAAGAG ACTTTATCTT AGACACAGAG TTCTAGGTAA AGTATGCACT 3180
TTGTAATATT GGAGCTCACT AATACTCTCA ATTTCAGATT AGTCAGCTAA CACAGTATTA 3240
TTGATTTAAA TAGTGGGGAT ATGTTCATGG GATGATTGCT TCCTCCCCTT TTGATTTCTT 3300
CTTAACTTCC ATCCCTGTAA TTCCTTTCTT TCTTACTTTG AACCCAAGAC TACACCTAAC 3360
TTAACTATAT GTCTGTGCAA AGCAAAAACT ACATGATTGC TGTCTCTTAC TTAGGGGGTA 3420
GGCCATTATC TTAGCACAAT TGAAGAGCCT GATAGAAAAT ATTACTGGGT TATACGTGCA 3480
GGTTCAGACT ACTTGAAAAG TAAAAGAAAG ATTCCTTCTC TTAAGCCAGG TATAAATTCA 3540
GTCTTTAGGG GAACAATGAA TAGGGTCTTT TGACAGTTCC TGATTCTATG TTTCCTTTTT 3600
TTTCCATCCG GAGATGTTCC ATGCCTTCAG GCTTTCCTTC ATTCCTGGCT CCCATCCCTT 3660
TCCATAACCA GAACTGTGGC ATATGGTGAA TATAGTTGTG TTTAGCACTC TGTGCTGAGG 3720
GTATTGCAGA AAGATGCCGT ACAATCATTT CCATCATGCA GTGCCCTTCT GCTCATCAAA 3780
GCTATTTCTG TATCCTAACT 3800