EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS048-00088 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_small_intestine 
Coordinate
chr1:3163010-3169690 
TF binding sites/motifs
Number: 25             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:3163829-3163840TAATTCAATCA+6.14
FOXP1MA0481.2chr1:3164459-3164471CTCTGTTTACTT-6.37
FOXP2MA0593.1chr1:3164460-3164471TCTGTTTACTT-6.32
HNF4GMA0484.1chr1:3166848-3166863TGGACTCTGACCTCT-6.15
Hnf4aMA0114.3chr1:3166846-3166862GGTGGACTCTGACCTC-6.32
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KLF5MA0599.1chr1:3164072-3164082GCCCCGCCCC+6.02
LMX1BMA0703.2chr1:3168382-3168393TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr1:3163822-3163835AGTTAATTAATTC-6.15
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Myod1MA0499.1chr1:3168879-3168892TGCAGCTGCTCCT+6.15
POU2F2MA0507.1chr1:3166169-3166182TTAATTTGCATGT+6.5
RESTMA0138.2chr1:3168641-3168662GCAACTCTCCTGGGTGCTGGG-6.57
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RFX1MA0509.2chr1:3166456-3166472GGTTGCCATGGAAACT-6.69
RFX2MA0600.2chr1:3166456-3166472GGTTGCCATGGAAACT-7.06
RFX2MA0600.2chr1:3166456-3166472GGTTGCCATGGAAACT+7.17
RFX5MA0510.2chr1:3166456-3166472GGTTGCCATGGAAACT+7.06
RFX5MA0510.2chr1:3166456-3166472GGTTGCCATGGAAACT-7.1
SP1MA0079.4chr1:3164069-3164084TTAGCCCCGCCCCCA+6.76
SP2MA0516.2chr1:3164068-3164085GTTAGCCCCGCCCCCAC+6.93
SP4MA0685.1chr1:3164069-3164086TTAGCCCCGCCCCCACC+7.06
ZNF263MA0528.1chr1:3165788-3165809GGGGCAGGGGTAGGGAGGGGA+6.34
ZNF263MA0528.1chr1:3164991-3165012GCTTCTCTATCCCCCTCCTCC-6.49
ZNF263MA0528.1chr1:3166671-3166692GTCTTCTCTCCCCCCTCCCCC-6.62
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
SE_31389chr1:3164913-3169639Gastric
SE_65324chr1:3163786-3165587Pancreatic_islets
SE_65324chr1:3166406-3169714Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr131640003164400
chr131678003168107
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I003248chr131646513169114
Enhancer Sequence
GAGCTCAGCG CAGGGTACCA GAGCCAGCAT CGGGGGCGTT GGTGGGCGGT CCTGTCCAAG 60
CAGGCCTCCT GACCCCAGCC CAGGGCTCCT CCCTGCCGCT GCCCTGCAGG CCCAGTCCGA 120
GGGGCTGGGG GCTGCCTGGA GGAGGCACCC AAGTCCTCAG GCACAGCTCC ACCAGAGGGG 180
GAGGCTGCCA CACAGCACTG CCTGGGCCAT CAACTCATAG TTTTTTCAGC CTCCGCAATA 240
AACACCGTCA GCGTCTGGAG GATTCGAGTG TTTGCCAAGG CCATGCTGGT GGGAGAATCA 300
GATCCCTAAC CCCAGGGCTC AGACTGGACC CGTTCAGTTA CATTTCTAGG CACTCTCGGG 360
GAGCCGGGGG GGTTGGGGCT GAGAGACTGA GAGACATGAG CTAAAATTCA AAGGCAAAGT 420
CTTCAGACTC GGGGGCCAGG AAGACCAGGA CAGACAGCCC TCGAGTGGGC GTCAGTCCAG 480
ACGGAGACCC CACCCTGCAA ACAAATGCGC CACTTAGAGC TGTTGGTATA GGTGCGATGT 540
GTGGATTGCT GCCGTAACTG TGCGCACCGC GGTGCTGTTT TCAGGATGAA TTCAGTACAG 600
TCCTTCCTTA TAGGATGAGA ACTCTGGTTT AGGGGTTTTG TAGTTTGGGT CACCCAAAGG 660
CACACTTGGG AACATTAAAA ACCTCATAGG GGAACATGAC GGGGGTGGCT GTGTGACCTG 720
TGGGTGGGCA ACTCCTGTGT CTGGCTTCAG TTCATCCACC TCTGGGAGGA TTACACTTCC 780
TGTTCTTTAT CTGCCTCAGT GAAATGTGAC GAAGTTAATT AATTCAATCA GCAGCTTGGC 840
ATATGAGCTG CAGAAAAGGT GGTATTTTGT GAGGAAGCCA CGGTTAGGAA TTCTAAGTAT 900
CAGAGAGTGA GGTTTCTGAA GAGGCTGGAT GCAGGATGAC TCTACTCAGA ATTTACAGGC 960
GAGGGCGGCC GGGCCGAGGG TTGTATGGAG GCCTGGGATT CGAACTCAGG ACTGTGGCGC 1020
GGGGCCTGGC TCCTGTGGGC GCTACAGAGG TGCCTCCCGT TAGCCCCGCC CCCACCCCAG 1080
GAGGGCGGAG CCACCGCCAG GCGCAGGGGA CGGTCCTCCT CCGTCCTTCC TGCGCCCCTT 1140
CAGCTTCGCC CTGGACTCCC GCGTTCCCTC TGTCTCACAC CCTGGTCTCT GCGCCTTCGT 1200
TCACTCCGCA GCCCTTGCGC CCGCGCAGCC CAGAGCTTTG GCGCTGGCCC GCGCTCGCTC 1260
TGGTGCGCTC GCCCTGGTGC CCTATGCGTG CCCTCGCCGT CCCTGCGCCC GTCCTGGTGC 1320
GCCCTGGGCG CGCGTCACCG GCGCTTCCCA AAAAGTCACA TTGGCTGTGG GTCGGGCTGC 1380
GTCGCGCCTT TCCTGGCCGC GGTGCGGGGA CCTCTGGGAC CGCTCCCTCC AGCGGACTCT 1440
CTATTTAGTC TCTGTTTACT TAGAGGGAAA GCCCGGGGGC TCCTGGAGAG CAAACATCTG 1500
CGGGAGATAA TCTAGCGAGT TGTCCATCCA TCACTCCGGG CGCGCAGCTC CCTGGAGAGC 1560
CCGCCGGAGC CGGTAATAAA AAGGCCGGGC GAAGAGGCTT TGGGGACGAA TCAAGAGCCG 1620
TGTTAAGGGC TCGCTGAAAA TGGATGGAAG ACATTATTAA GGCTCAATGG CCATCTTATC 1680
AAAATCCAAT AGGATAGACA TTTGGCAAAA GGCTTAAATT TATTCTTTGA CTTTCTGGAG 1740
GGCTTGAATT TATCCGTTAA CAAGAGTGTA GTCCACCCGG GAGATGCTAT CAGCTGAAAG 1800
AATTTTGATT CAATCTCTGG CGATATGAAA GGGGAAACAT GGCCCGGCAG CCTTTCCCTT 1860
TGTCCACTTT ATCGTGTTTT CCTTCCCCCT CTTGAAAAGG AAGGACGTGT TAATACAGAA 1920
CGGGAAAACA CAAACAAAAG GAAGTGACCT TTTCTCTTAT TTTTATTTTC TCTTCCCCTC 1980
CGCTTCTCTA TCCCCCTCCT CCCAAAAATA AATACATCGT GAATTCGCAT GGGAGGGCTA 2040
GGCCTGGGGA CCTGGAAAAA AAACCCTTCA GAAGCTTCGG AAAAAACGCA TCCACCCCAG 2100
CCAGCCCCTA GGGCGAGGGG CGGGAGTGCA GAGGCTTAGA GGAGGGTCAA AAATAAATCG 2160
AGCTAATAAA GTCATTCCGC CGGAAGAGGG GCCGGTGATG GGTCCATAAA TCTCTCCCGG 2220
TTATTATTAT TACGTACAAA ATGCTACAGG TCATAAAAGT CGTCTGATAG CCCAGCCTTG 2280
CATTGTCCAA ACAGGGTGAT TGATTGATAA TGACGATAAT TTGTGAAATG ATTATTTGGA 2340
TGTTAGAACC ATGGCCTGTC CCACTGGGCT GTTCTGTGGG CGTTTTCTAT AGCCCGGCCC 2400
GGGCAAAATG CCTCTGGTAA CGAGGAGTCC AGAGGTTTCC TGGGTCCCTC CCGTGGGGAC 2460
TGGGGGCTAA TGAAGGATGG CTGCTGAGCC CAGGAAGTTG GGAGCGAGAC AGACAGGCAA 2520
CTGCTAAGTG TCTTTTGTGC AGCAGTTACT GGAGGAGGCC ACACACCCTG AGGTCTAAAC 2580
GCAGCTGGGA CCTCGCTGGG ACTCCAGGCA GTTTGTGAGC AGGATATACC GAGTTCCTGG 2640
CCATGCCAGG CTTTTAGCCC AGCACAGCAC CACGCAGCCG GAGACTGCTG TTCGGTGTCC 2700
AGTCCTGTGG CTCACTGTGT TCTGTTTGTA TTGTTTTCCT CCTAAAGGAG GCTGGAGGGC 2760
TGGGGAGGAA GGGAGTAGGG GGCAGGGGTA GGGAGGGGAG GGGATGTGGT TGGAGAGATG 2820
GAGGGACCCT CAAACACAGA GCTGCAGAAG GAGGCGCTGC TATGCATGCA TCGGGCTCAG 2880
CTGGTGGGTA TGGGAACTAG AAGGCTCTCT GGGATGTACT GGATCTAGAA GGCTTTCTGC 2940
GGCCTCCCTA AGCTTGGTTT TGCTGAGGCC TGTGCCAGCG AGGTGAGTGA GGTTCAGACC 3000
GCCTTTTCCC GTTCCCTTAC CAGCCAGCCA GCAACACAGA TCCCGCCGGA GTGCCGTCAC 3060
TAAACTGCAG TTTACCTACC CATGCACTTT ATTACCAAAA AAGAAAAAAA AAAATACACA 3120
CCAAAATCCC TAACCCTAAG AACCCTGCTA TCCAAATTAT TAATTTGCAT GTGGGATCAG 3180
TTATGTCTTT ATGAAATCCA AGTGTGTTTA GCTGCCCCGG AGACAGCCCC GAGTTGATTT 3240
TGATAATCTC AGCCTGAATA GACTTGCTTC GTCGCAGTAA GCCGCGGACA AAAGGCTGGA 3300
CAGTGGCTGA AAGCCCTTTG ACAACATGTC TCTCTTTCCA TTGTCCCAGG GTTGCTGATA 3360
AAAGAATCGG GAGTCCATTA ATTCAGTGAA TGAACATATA GTAAAGTCAG TCCCCTCTTG 3420
AGAACAATAA TGTTGAGGTC AGCTACGGTT GCCATGGAAA CTAAGTATTC CTAAGAAGTT 3480
TGCATCCTTG ATTTTGCTGA ATCAAAGGCT GCAGGCAGAG AGGTGTAAGG CGGCCCAGGC 3540
AGCAGAAAGT CGGAAAGCAC CGCCCACACC ATCCCCTTCC CAAGGCAGCG CTGGGCCGTG 3600
GCCCTGGGGA CCCTCATCCG CCCCTGGGGA CCAGCCCAGG TGCCTGGCTT CCGCTTCCTC 3660
CGTCTTCTCT CCCCCCTCCC CCCACCCCAC TCCCAGGATC CCGTTTTCAC AACTGTTGCG 3720
GCTTGTCTGG GGAGGCCGCA TTGCTCCTGA GGCTCCAGTC CGCAGGGCAG AAATCAGGCC 3780
TGAGGGAGGG GCCGCAGCCA CAGCTCCCGT GGCCTCCAAG GTGGCAGCCG GCCCTGGGTG 3840
GACTCTGACC TCTCGCCACC TCGCCACACC TGAACTTGCC CCCTGGGGTA GGGCGGTCCC 3900
GCAGGGGCCC CTTCACAGGC TGATAAGGGT GATTAATGGC CCGTTAGCAT GGCCCAAGGT 3960
GAGTTATGGG GCAGCTCCAG GCTGGGTGAC AACTTTATCA ATGTAACCCT TTTGCCGCCG 4020
CCCCCCCACC GCCATTCTAA ATTGAGTTGA TTCTACTTAC CCCACCCCCA CCTCACCTGA 4080
AGGATCCCTT AAATCAGCTG AAACCGTCAG ATTCGGCTGG GAGAGGTGCA GCTAATTACC 4140
GTCCTATGCA GTGGTTTATT ACCTGCTATG CTGGTGCCAT GGTCTCTACC ACCCTGCGTG 4200
TCTGAGGTGG CTTCCTTTCT GCTCTGCAAG GCCCCAGGGC CTGAGGGTGC AGGGGGCTCA 4260
GGGCAGCCTG GGAAAGGCAT TGTTCACACA CATCCAGCCC AAGTCCAAGA GCACATGGGG 4320
GGACGTGAGA GTTTAACTTG TCCTTTTTCT GTGTCAGTGA AAGAAGAGCC TGGGCTTCTC 4380
TCTGACCCTG AAGCGTCCTG GGAAGCCTGC GAGGGTACAG CCTGGGGGAA AGGCCCTGCA 4440
GAAGTGGGGC TGGAGTGGAT GGAAACTGGG AGGCAGGGCA GGGGGCTGTG TCCCCCATCT 4500
CGGGGTCCCT GGCTCAGCAT GAGAACAGGT GGCTCTGGGG ACCCTGCTGT CATCAGAAAT 4560
GACTTCTATT GTGCTGAGGC TTTAGGCTGA AACTTAAATT CCAGTAGGAG ACGAAACATC 4620
ACAAATTTTA GAAGGACACA CTCAGACGCT GCCTTAACCC CAAGTTAAAC AGAGGGGTCT 4680
TCTTACCTTG GAGACCCAGA GGAGCCGGAC CAAGCCAGGG CCCCTTCCCC ACCCACCCCT 4740
GCCCTTTGGA CCTGGTTCTG CCCGGGGCAG CGCGGCCCTC AGCCTTGAGC TCCAGGCCTG 4800
GCCGTTTGGT TTCCTCTTTT GCAATGGGAG ATAATGAGTC TCACGTGCTG CGTGGTTCAG 4860
GGGTGAGGTG GGGTGAGGGC GCAGCCGTGA GGCACAGCTC TGGGTACCGA GGGTGAGGTG 4920
GGGTGAGAGC GGAGCAGTCA GGCACAGCTC TGGGCACCCG GCGTGAGAAC CCACGTCCAG 4980
GGCTTGGCTG CTCTTTACTA GGTGTGGGAA CGAGGGACCA GTCAGGGTGG TGGGAACCCA 5040
GCGACCAGGG TAGGGGGCCC CTGGGCAGAC ACCTGCCTCT GAAGTGGTAT CATGGCACCT 5100
GCAGGGGTCA GGGTGCACAG GTGCTGCCCT GGAACCAGCA CCCCTTCTCC ACAACCGAAC 5160
CGACGCCACA GGGTGCCCAG GGCAGCCCCT CCGTTGTGGC CACCCAAGCA ACTCCCACAG 5220
CAGGGTGCAA GGGGAGGCCG TGCAGACAGG ACACCTCTCG CAGGCGCCTA GTTCTGCAGC 5280
AGGATTTATT GGCTACATTA CCAGCTTTAT AGGAGCCAGA TGGTGGCGTC AATAAACCCT 5340
GTCCATAATC TTCAGGTGGG TGCAATATTG AGTTAATTAA ATTGTGCTGC TCTATTAGGA 5400
GAGAAAAATA GATCAGCTCT GAGCCCTGGT TAGCCTCTTC TGCTTTAAAC ACGAACACAC 5460
ACCTCAGCAA AGTCTGTGGT AATTGGTTTG GGCGGGGAGT TCTCTCTTCC ACACAGCCAC 5520
GCCGCCTCCC TCCTAAGATA CCTGCCAAAC CTCGTTACCA CGATTCTCAT CAGCTGGGCT 5580
TATGCATGCT AGTGAGCCGG GTGGCGGGGT TCCCCTCCAG TGTAAAAGAG GGCAACTCTC 5640
CTGGGTGCTG GGACTCCTTG GGACCCTTCC CGAGGCCTGG CTCCTCGCTT CTGTGACATC 5700
ATGCTGTGCC CCCCTCTTCC TGAGCCCTAT CTCCCTGTAG CTAGGTGCCC AATGGCCTGA 5760
GCATACCTCC CTCTCGTGGT GCAGGTTGAG TGCTCCCGGC TCCGAGGGCC AGCTCTGAGG 5820
TCCTGCATGC CCAGCGGTGT CCCTGTGCGG GCATTGGGGG GCTGGGCTCT GCAGCTGCTC 5880
CTCTGCATAA CGGTGTCCAG GCCGGGCCCC AGGTGGGCCC TGAATCCCTC AAATAGAGGG 5940
GGGATCTTCC CTGGCTTCTT GGGGCCCAGT CCTGCTCTAG AGCCAGAAGA AGGCTCTGGG 6000
GAGAGTGAGG GCCTCATGTG CCCAGTGGGG GCCGCGGTGG AGGTCCCTAA GGCCTATCTG 6060
GCTGGTGGAA ATTTTCCGCA GGAGGTGGGC CCCTCGTGGA AGGTGGTATC TCCCCACCTT 6120
ATCTAAGAAG CCACCTGCTG TTAGAGAAAG CGCCTGCCCT GGGGGTGGGG CTGGTGGGCA 6180
GCAGGGTGGG GCAGCCAGGT CCCAGGAGAA GGTTGTAGAT CCACTAGCAT CCCGGGCTCG 6240
TGTTCCATGA GACTACTTCT CTGGTGGGGG CACTGGCTTC CTGGGGCCGA CTGTGATCCC 6300
ACAGCTGCGT GGACCGTGGG GGTCCCAGCT GGGACCACTG AGCAGCAGTG CCGAGCCTCC 6360
CCCTCCTGCC TCACTACCAC AGCAGGTTCC AGGTTGGCCT TGAGACAGTG TGTGTTCAGC 6420
CTTGTACTGC GGGGTGGAGG CGGGAAGGAG GGTCATGCAG GAAAGAAGGA GAAAGGCAGG 6480
GGTGTGTGCT CGTGGAGATG TGGCATTCCC CCTCCCTGGC TCCGACACCG GGCTGTCCTC 6540
TACCAAACAC CAGCCGCGTG TGCAGGAACC CCTCGAGCCT GCGCGCTGCT GCTGCGCTTG 6600
TCACCCTCGC TTACAGAATG CTCGCCAGGC GCCACGTGCT CTGCAGCCTC CACGATTCTC 6660
CTGCATGGAT CCCCACACTA 6680