EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-24001 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr3:58033270-58038900 
SNPs
Number: 5             
IDChromosomePositionGenome Version
rs11707429chr358033834hg19
rs12494328chr358035497hg19
rs858215chr358036811hg19
rs732527chr358036935hg19
rs732526chr358036962hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ESX1MA0644.1chr3:58033864-58033874ACCAATTAAC+6.02
KLF4MA0039.3chr3:58037766-58037777CCACACCCTGC+6.62
NFE2L1MA0089.2chr3:58038185-58038200ATGGCTGAGTCATGT-6.2
NKX2-3MA0672.1chr3:58034318-58034328TTCAAGTGGT-6.02
NR2C2MA0504.1chr3:58033638-58033653TGACCCTTCACCCCC-6.01
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58037833-58037848TGAACTCCTGACCTC-6.22
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58035975-58035990TGAGCTCTTGACCTC-7.23
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr3:58033509-58033524TGAACTATTGACCTC-7.41
RARAMA0729.1chr3:58033506-58033524TCGTGAACTATTGACCTC-6.16
ZfxMA0146.2chr3:58035998-58036012CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 25             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00762chr3:58032174-58039716Adipose_Nuclei
SE_01957chr3:58034706-58035838Aorta
SE_01957chr3:58036187-58037788Aorta
SE_01957chr3:58037976-58039178Aorta
SE_23194chr3:58034815-58035733Colon_Crypt_1
SE_23194chr3:58038002-58038849Colon_Crypt_1
SE_26498chr3:58033363-58039459Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27681chr3:58033703-58037597Fetal_Intestine
SE_27681chr3:58037756-58039153Fetal_Intestine
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SE_30574chr3:58034058-58035832Fetal_Muscle
SE_30574chr3:58036943-58038968Fetal_Muscle
SE_36024chr3:58033449-58039332HMEC
SE_37989chr3:58025669-58040227HUVEC
SE_41579chr3:58034780-58035730LNCaP
SE_41579chr3:58036203-58037368LNCaP
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SE_45969chr3:58032377-58039419Osteoblasts
SE_47269chr3:58019885-58040171Panc1
SE_56289chr3:58032310-58039346u87
SE_64106chr3:58033450-58035902HSMM
SE_64106chr3:58036259-58039158HSMM
SE_65730chr3:58034390-58037100Pancreatic_islets
SE_65730chr3:58037283-58039024Pancreatic_islets
SE_67942chr3:58032310-58039346u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr35803351558034395
chr35803500658035314
chr35803683758037638
chr35803799458038685
chr35803814758038335
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH03I058046chr35803243758041425
Enhancer Sequence
GCTCTAAAGA TGCATATCAC ACACTTTTTT TTTTTTTAAT TTATTTTTGA GACAGAGTCT 60
GGCTCTGTCG CCCAGGCTGT AGTGCAGTGG CATGATCTTG GCTTACTGCA TCCTCTGCCT 120
CCTGGGTTCA AGCGATTCTC CTGCCTTAGT CTCCTGAGTA GCTGGGATTA CAGGCACGGG 180
CCACCATGCC CAGCTAATTT TTGTATTTTT AGTAGAGATG GGGTTGGCCA AGCTGGTCGT 240
GAACTATTGA CCTCAAGTGA TCCTCCTGCC TCAGCCTCCC AAAGTGCTAG GATTACAGGA 300
GTGAGCCACC ATGCCTGGCC ACATGCGTGT TTTTTATTGA ATCATTTGAA AGTACTCAGC 360
TCGTATCATG ACCCTTCACC CCCACATACT CCAACAAGCA TCTCTAAGAA AAAGGACATT 420
CTCCTAACCA CAGTGTCTCT GCATTCCCAG GACATTCTTC TAACCACAGC GTCACTGCAT 480
ACCCAAGAGG TTAGCACCGA TACAGTAATA ACATCTTGTG TAAAACTTCC CAAAATGCTC 540
CCAAGTGTCC TTTATGACAG TTTAAAAAAA AATGGCATTT TTTGGGATCC AGGAACCAAT 600
TAACGATTAC TCAATTGAAT TTGGTTTCAA AGTCACATAC CTCAACTTTT CCTTTAATCA 660
AGAACAGCCC CCCTGCCTTT TACACATTTT TTTGTCTTTC GTGACCGTGT CATTTTTGAA 720
GAAATCAGGC CCGTTGTCTT GTAGAACTGG TGTTTCTCAA GTGTGCTTGG GAGGGTCTTG 780
GTAAAATGCA CATTCTGATT CTGGAGAACA GGGTGGAGCC TGGGAATCTG CATTTCCAGC 840
CAGCATCCCG GTGATGCCAG TGCAGCTGGT CTTCGGCTGT AGAATGTTCC ACATTCTAGG 900
TCTGTCTGTT TCCTTGTGAT TAAATTCAAG TTGAATATTT TTGGCTAGGG CACTTCCTGA 960
GGTCATAGGT ACTTCCCACT GCCTCACAGC ACAGGCTCAC AATCTCAGTT TGTCCTGTTA 1020
CTTCGTGGTG CTAAGTGTGG TCACCTGCTT CAAGTGGTGT CCGCCTGCTC TCTGTTGAAA 1080
CAATACCTTT CTCCTAGTAT AATGATTAGG TAACCTGTGA TTGTAATTGG TAAGTAATCT 1140
TTGAGACTAC ATGAATATCC TGTTCCCCAG CAGTTTTCAC TCATTGGTGA ACTGTTTTGG 1200
GAAAAATAAT AGCATCTTAC AGTTATAATA CCCTGCTGGT AACACATGGC TCTTACATAA 1260
TCAGCAGTTA ATTGTTTGTA TGTGTGTTAA TTTTTATTTT TAAAATGTAA CTAGTGACTG 1320
GTAACTCTCA TTTGTATTTT AAACATTGGC TTTTACAGCT TCTCAGTACA TTTCACTCTG 1380
TGTATGTTTT TGGTAGAGCA TTTGTTGTCC TGTATAATGG TTTAGGAAAT CCTATAGGCC 1440
AAATGAAGGG CTGGAGACTC ACCTGTGTTC CCACCACTGT GTTTCACTGT GTATTGCCAG 1500
AGAAAATACA GTTAAATTTG AATTTCAGAT AGACAATGAA TAACTTTTTA GTATAAGTAT 1560
GTTCCAAGTG TGGCAGACAG CTCTCACAAG TTACAAGTCG TTGCGTAGGA CATACCTATG 1620
CTAAACGATT TGATGTTTAT CTAAATTAAT ATGTAACTGA TATCTTGTAT TTTTATTTGT 1680
ACGATCTTCC AAGCCCACGT CCCACCGCCT TCTCGGGGAT GGCCACCATT TGTGTTTGCT 1740
GCCTGGTGGT GTTTGCAGCT GCGAGAAGGG CCTTGGAGGA GGAGCAAAGT GTAGTGGTAT 1800
CTCCGTGCTG TGGCCTTGGG CACTGGGGTG GGGGTTAGAT GAGTAATTAG CTGAATATGA 1860
CCTCACCCAT GAAGAATGTG CCCTTGCTAG GTATTAGCAG AGGTTTAGGC TCCAGGGAGC 1920
CATTGTCAGA AGCTTGTCAG TGATGTCATC AGCTGGAAGG GCCAGCTTTC AGGCCTCAGG 1980
AAAAAGCTTG AAAGTCAGGG CTCCAGTTTT GGTAATAAAT GGGAATGGAG TTTCACAGGT 2040
AGGGTGTGGA GGAATTTATT GTGACAGGAA GCCTGATGGA GCCTCTTGCC TGTGTGCAGC 2100
CCCCAGCCAG GTTTCTGAGT TCTGATGAAC TACCAGAAAC TTCCACCACG GCCTGTGATT 2160
ACACTGTTGG CCCAATGCCC TGGAAAAATT GGCTTGCTCT CGGGGAACAC TCCAGGAGCT 2220
GCAAAGGGGG TGTCAGGACT GTTGTGCAGC TCCCCTTAAA TTGGGGAGGA GGGGTGGCTG 2280
ATGTGGAAAC TGTTCATTAG ACTGCTCAGG GTAGTGTGAG AAAACGTGTA ATCTGTGGGC 2340
ATCTACCCCT AGCTGCCCCT CTGATCTCAC CCACTACTGT GGGAGGACCC CGTGGATGGG 2400
GGCAGAGGAG GGTCTTCTGG ATTTAGACAC TCACAAAACT TCCTTTTACC TTGTTCATTG 2460
GAAGAAATAG AAAATGCCTT TTTTTTTTTT TTTTTCTTTT TTTTTGAGAC AGAGTCTCGC 2520
TCTGTTGACA GGCTGGAGTG CAGTGGCATG ATCTTGGCTC ACCGCAACCT CTGCCTCCCG 2580
GGTTCTAACA ATTCTCCTGC CTCAGCCTCT GGAGTAGCTG GGACTACAGC CACGTGCCAC 2640
CACACCCAGC TAATTTTTGT ATTTTTAGTA CAGACGGGGT TTCACCATGT TGGCCAGGAC 2700
GGTCTTGAGC TCTTGACCTC GTTATCCACC CGCCTCGGCC TCCCAAAGTG CTGGGATTAC 2760
AGGCGTGAGC CACCATGCCT GGTCTCTTTT TCATTTTTAA AGGGTAATTT GCTGTGCAGG 2820
AGTGGGCTCT CAGACCAGAA GTGGGGACCT GAATGAAATC AAGGACTGAG TATGGTAACT 2880
ACAGCCATTT AATTTTATTT GAAGTCTCCC GTAAAATGTT CTGGAAAAAA CAGGGGTTCC 2940
AGGGCTGGGT GGGCAGTTTC AATCATGGAC TGGATTTTGT GGTTCAGATT TCTCTGGGCC 3000
TGTTGGAGGT TCCCCTTAAG CAATTACCCA AGGCAGTTCT GCCCAGCTGA AGTACTGATT 3060
ACCTGCACAC TATACCAGTG AGGACTCATG GGTGAGCAGA TGGGAGGCAC TGAGCTTGAT 3120
TCTGAAACCC TGGCCTCCAT CCCACCTGAC ATTCAATGTC AGATTAGAAT TTGGAAGACC 3180
CTAAGTCTCC AGATTGGTGC ACTGGGTAGC TCCTGAAATG GGGTGGCTGA GACAGGTCCT 3240
CTGTGCCCCC TTCCACAGCT TCCTCTGGGG CCCTTCTGCT CACTGGCATG TGCTTCTGGG 3300
CAAATAGGCC TCTCCCAGCA TTTGTTTTGG CTCTGTGAAA TGGGGTAATA TTTGTTCCTA 3360
TTGCGGGTGA AGCGCTGCTG TTGGGATGCT CAGGTAACTC ACTCCGTGGG TAGCTGATAT 3420
TGCCTGGGCA AGTGGCATTT TAGAGGAAAT CTGTGCCATC AAAAGAGTTG GACCTGATCA 3480
CACTTTTGCT TTTGAATATG CTTTGTCCCA GCCTGGCCAT TCGTCACTTG GGACCCCCTG 3540
AGTCTCTCTG ACCCCACTGT AAAATGGATA TGCCATGGAG TTGTCCCAGG AATCAAGGGC 3600
AGGTCCTCTC CAGTGAGTGA TGGGCTTGCC TCTCACTTCT CTAACACCCT TCTGCTTCCT 3660
TGTGTAAGAT TTCACTATTA GTGGCTATTC TCTTTTACAG AAGAAAAAGG GAGACGCATG 3720
CCTCTTCCAG TTCACTGTTC ACCATTGCAG CATATTTATT CCAAGGGACT GGCCGAATCA 3780
TCCCTTTCTT TGTTAGAATG TGGTTTTGTT GCCTTGAGAC AAGTGGCCCG CATGTCTGCA 3840
CTGAAGGAGG CTTTGCGCAA TAGCCTTGGG CACCTCCGGT TCTGCAAGCA TGTACAGTAC 3900
TTGCTCTCCT TTCCCTTTCT TTGTATACTT TTTCTGGTCT GCTACGTGTC CATCTGCATG 3960
TGGATAAAGG GTCGTCGTCT TGAGTAGTGA TTTTGCTGTG ATGTGATTCC TGTGAGGTCT 4020
AGTTGCACAC AGTGATTCCG AAGGTAGACC CAGCTGGAAA GCTTTTAAAT TGCTGATACT 4080
CCAGCCCCAC TCCCCAAGAG ATGCTGATTT TGTTTTGTTT TGGGGAGGGC AGTTTTTTTG 4140
GGTTTTTTTT TTAAGCTTTT TGATGTGTAG CCAGGGTTGA GACTGAAGTG ATTTTTGTGA 4200
GTAACGGAGA AGTGTTAAGG CTTGAGAAGT TGGAAGAGCC ATGCTTGAGA TAGGACCAAG 4260
GTCATATCCC CGGCATTAGC ACAGAGCAAC CCTGACCTGT TGGAGAGTTG GGCTGGATGG 4320
ATGCGGTCAG GGGAGAGACT CGCTTTATTT TATTTATTTA GAGATACAGT TTCACTCTTG 4380
TCACCCAGGC TGGAGTGTAA TGGCACGATC TCGGCTCACT GCAACCTCTG CCTCCTGGGT 4440
TCAAGTGATT CTCGTGCCTC AGCCTCCTGA GTGGCTGGGA CTCCAGGCAC GCGCCGCCAC 4500
ACCCTGCTAG TTTTTGTGTT TTTACTAGAG ACAGGGTTTC ACCATTGTTG GCCAGGCTGG 4560
TCTTGAACTC CTGACCTCAG GTGATCCGCC CACCTCGGCC TACCAAAGTG CTGGGATTAT 4620
GGGTGTGAGC CACTGTGCCC AGCCTCGACT CGCTTTATTA TATCCACACT TGGAATACAA 4680
TTCGGATTGA TTGTAGTGGG GCATTTTATA ATTAGGAAAA ATTAATCAGG AAAAATCACT 4740
CCATGTAGAT TAGTACCACC ATATGAGGGG ACAAGAATTT CTTCAGATTA GGAACTTCTT 4800
CCAACAGGAC TGACAGGGTC CAAAACTACT CTTGGATCCA GCTTTAAGAT GGACCCAGCC 4860
CACTGTTGAG TCCCCTCTGA GGTCTTCTCT CTGTGGATGG ATTTGATTGT TAACAATGGC 4920
TGAGTCATGT GGCACCCAGC CCGGTGAGTA AGACAGCTGA GTAAGAGGGG AAACAGGGCC 4980
TTTGGTCAGA AAAACCAGAC TGACTTCAGT CTTATCTGTT TAGAGAAGCC CCAGAAGCTG 5040
CAAAAATTGC AGCTTCCAGA CTTTAGTGTG CCGTGGTCAT GACATCGGTG TGGATGGCAG 5100
GTTGTCATCT GAGCAGTCAG GGTGGCAGCA CACAGCTTGC GGGCTGGCTG ATGGCCGAGG 5160
TGTGTGAACT GACCTGCCCC AAGTGACTTC AGTGCTGGGC ACAGCATAGG AGCAGTACTA 5220
ATGATATGGA CAGTATGCTC AGAGGACGTT AGGGAGCACA GCTTTGTGTA AAGGGCATGC 5280
CCTGCCCTGT CCGGATTTAA AGCAGCTATA GCACTGAAAC CCCATGGTCA CCCTCGCATT 5340
TCTACACTTC TGCCTGTGCC AAGTCTAGTT TGTGTGCCTC CTCCATTTTG TGTGTACATG 5400
GGGGTATTTT TTTCTGCTAG GCAACTGCTA TTTATGCCTC TCAGTACTGT ACTTAGTGTG 5460
TACCATTCCT GCAAGGTATA GACATTGTCA GCCCATTTTA CAGATGAGGA AAATGGAGTT 5520
TTTGAGAGGG TGAGATCATT CAGTGGCAGA ATGGAATGTT AACCCAGGTA GTCTAACCTC 5580
TCTGCTGTAG ATCTGATGTC CATTTGAACT TTAGACTTCC CATCTGTGTC 5630