EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-21093 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr20:30303620-30309450 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6087771chr2030306724hg19
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr20:30303964-30303977TAATTAATTATTT+6.71
RUNX1MA0002.2chr20:30305443-30305454AAACCACAGAA-6.32
Number of super-enhancer constituents: 103             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30297989-30306428Adipose_Nuclei
SE_00546chr20:30306461-30312254Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30304224-30306272Aorta
SE_01656chr20:30306371-30311908Aorta
SE_02627chr20:30307051-30311961Astrocytes
SE_03109chr20:30308258-30309433Bladder
SE_03156chr20:30304345-30306204Brain_Angular_Gyrus
SE_03156chr20:30306497-30311444Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30297618-30312523Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30291888-30312530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30291812-30312465Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30297611-30312332Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30292115-30312408Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30307109-30310334Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30303541-30306370CD34_Primary_RO01536
SE_13448chr20:30306439-30312272CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30302978-30312324CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30302871-30312578CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30302979-30312159CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20764chr20:30302878-30312381CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30303825-30312264CD8_primiary
SE_23622chr20:30304312-30305160Colon_Crypt_1
SE_23622chr20:30306472-30311911Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30302953-30312495DND41
SE_25933chr20:30303441-30311921Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30303882-30305348Esophagus
SE_26879chr20:30305408-30306284Esophagus
SE_26879chr20:30306378-30312004Esophagus
SE_27731chr20:30306378-30312126Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30306317-30312080Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30303024-30306306Fetal_Thymus
SE_30903chr20:30306355-30312106Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30304321-30306278Gastric
SE_31430chr20:30306417-30312032Gastric
SE_33407chr20:30302870-30306305H2171
SE_33407chr20:30306334-30312298H2171
SE_34309chr20:30291576-30306320HCT-116
SE_34309chr20:30306323-30312556HCT-116
SE_34643chr20:30298140-30312397HeLa
SE_35852chr20:30303427-30306293HMEC
SE_35852chr20:30306311-30312155HMEC
SE_36989chr20:30297525-30312332HSMMtube
SE_38141chr20:30303934-30306179HUVEC
SE_38141chr20:30306459-30312236HUVEC
SE_39144chr20:30307380-30311380IMR90
SE_39443chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_39853chr20:30303646-30306330K562
SE_39853chr20:30306390-30312315K562
SE_40644chr20:30297536-30312142Left_Ventricle
SE_41648chr20:30305472-30306266LNCaP
SE_41648chr20:30306474-30310131LNCaP
SE_42121chr20:30295482-30306315Lung
SE_42121chr20:30306366-30312046Lung
SE_43515chr20:30291879-30312193MM1S
SE_44365chr20:30304163-30305187NHDF-Ad
SE_44365chr20:30306380-30312027NHDF-Ad
SE_44995chr20:30307052-30312090NHLF
SE_45708chr20:30304068-30306118Osteoblasts
SE_45708chr20:30306812-30312173Osteoblasts
SE_47264chr20:30303610-30306362Panc1
SE_47264chr20:30306465-30312746Panc1
SE_47861chr20:30307071-30308101Pancreas
SE_47861chr20:30308207-30309183Pancreas
SE_48182chr20:30304554-30305954Psoas_Muscle
SE_48182chr20:30306387-30312048Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30304407-30306299Right_Atrium
SE_48890chr20:30306370-30312050Right_Atrium
SE_49684chr20:30307804-30310082Right_Ventricle
SE_49886chr20:30307003-30312251RPMI-8402
SE_50155chr20:30304194-30306264Sigmoid_Colon
SE_50155chr20:30306356-30312043Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30303939-30312172Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30307061-30311605Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30303600-30306295Small_Intestine
SE_52373chr20:30306397-30311994Small_Intestine
SE_53471chr20:30304367-30306295Spleen
SE_53471chr20:30306475-30312120Spleen
SE_55108chr20:30305375-30306100Thymus
SE_55108chr20:30307049-30311900Thymus
SE_55770chr20:30302950-30306293u87
SE_55770chr20:30306834-30312280u87
SE_56767chr20:30303028-30306253VACO_400
SE_56767chr20:30306433-30312207VACO_400
SE_57375chr20:30304250-30306250VACO_503
SE_57375chr20:30306412-30311876VACO_503
SE_57919chr20:30304662-30305261VACO_9m
SE_57919chr20:30305360-30306242VACO_9m
SE_57919chr20:30306425-30311882VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30304565-30305188HSMM
SE_63683chr20:30306862-30311641HSMM
SE_64478chr20:30304021-30306145NHEK
SE_64478chr20:30306344-30311737NHEK
SE_65412chr20:30308226-30312394Pancreatic_islets
SE_66334chr20:30308115-30311313Jurkat
SE_67146chr20:30291879-30312193MM1S
SE_67821chr20:30302950-30306293u87
SE_67821chr20:30306834-30312280u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 6             
ChromosomeStartEnd
chr203030372330304420
chr203030514130305549
chr203030430430305303
chr203030660230306752
chr203030594030305996
chr203030772030308274
Enhancer Sequence
ATTACCAGAG AGACTTTTTA TTTTTATTTT TTGAGACAGG GTCTTGCTCT GTCACCCAGG 60
TTGGAGCGCA GTGGCTTGAT CTCGGCTCAC TGCAACCTCC ACCTCCCAGG CTCAAGTGAT 120
CCTCCCACCT CAGTACACCC CCTCAACAGT ATCTGGGACC ACAGACACAC GCCACCACCA 180
ATTCTTTCCC TCACCCTGCC ATAACTTGGG TTGCTGCCAC TCAAGCCCCT AACAGAAGTC 240
CCAAGCCCCA TATTCTTTTC TGTAGCTCAG GATGCTATAT AAGCTTCAAT TATCTGACCC 300
TTCTTTGAGC CTCATATTTT GTAGGATTCC TGTGTACAAC TATGTAATTA ATTATTTTTC 360
CTCCAGTTAA TCTGTCTATG TCAATTTAAT TCTCAGCCCA GCCAAAGGAC CTAGAAGGGT 420
AGAGGAAAGC CATTTTTTTC TCCCTTACAC CTTCTTTGAT CACTCTTTTA AAACTGCAGC 480
CCCACCCTCC CTTGCTAGAC ATGCCCTATG CCCCAACCTG CTTTATTTTC TTCATAGCAT 540
GTACAATCAT CTGATATAAA CATGTAATTA TATATTTATT GCCTGTCACT CCTCATTGGA 600
ATGTGAGCTC CATGAGGACA GAAACTTAGT TTTGCTTACT TTTGTTTACT GCCATACTCC 660
CAGTATGGTA CACAGTAGGA GCTCAATAAA CATTGTTTGA CTCAACGAAT GAATTATTAG 720
GTAAATAGCC ACTCCCATTA TTGTTATTCT GGCTTGACAA GGGTCTGTTT CTTCAGAAAT 780
TTAGTGGGTT TCTCTTCAAT TAGGTATCTG CTATGCCCAA GGCCTCTGCT CAGTGCTGAG 840
GAAACAAGCA TGGACAAGAT GTGGCCTCCA CCCTGAGGAG CTCCTAAATC TAGGACAGAG 900
TAAATCTGTT AGAAATGTCT TCTCTGCACA TAATTTAAGC TCTACCAACT GTTAACTTCT 960
TTTCATTTAT CCAAGTTTTG CCAGGTACCA CACCAATAAA AAAAGACTCA GTCCCTCTTC 1020
CTTCAGATAT CTGAAGCTGG TGATATTCTC CTGGGTCTTC TCTTCCCCAG GCTAAACAAA 1080
AAGACCCAGT GGGATTGCCT GACTCAGGTC TGCCAACTGG GAACAAGGAA GACAGACTGT 1140
CGGATAGAGG GGCAGAAGAG AAGAGGATCC AGGAGTAGAG TGACTCCTTC AAAGAAAAAA 1200
GAGGGAGTCC TTAGGGAGGA CTCTGTGGAA TTAGGTTGGA GGTTGGGTGG GGACAGGGCC 1260
TCTGCTTAAT TAAGGCAGTA GGAGATTATA CTTCCGTAGA AAAGCAGTAC ACTGGGAATT 1320
ACCCCTATGT CTATCCACAT TAAACTCAGG CAAAACCACA GTTGCTTCAA GAAAGCCCCA 1380
TGATGGAAGG CTGAGGGCAC TGGCAAAACC AGGGAGACTG GACACAGAGG AGGACGCTCA 1440
AGCCCACTGG CCTCAGGACA GATATCTGCT GGGGGAAGGG ACAGAGATAA CAACTGCTGT 1500
TTCATGCAGC CCAAACAAAT CTGGGGACAC CCATACAAAA GTCAAGAAAA CCCTCCAGGT 1560
TCCATTGGAG CCCCCTGAAA AAATACCCGG GTAATTTTCG ACAGAAGCTA AAGGGCTCTG 1620
TGGGGCTACT GGGGAAATTA TTCCTAGGAA GTCTGGAAAA CCCTGTGATG GTAACAGAAT 1680
TTTAAGAGCA ACCTCAAATG TACACTCAGA AGAAGTAGGT GTTTCAAGGG GGAGCCCCTG 1740
AGACACTTCT ACTTAATTTT GGGACCCGAA TGAGATTACT AAAAATTTCC ACATTTGGGG 1800
TTTCTAATGG GGTTTCCCTA AGAAAACCAC AGAACTGCCA CTATCTGCAA AGGGAGCTGA 1860
GGTGCTTCAA CTAAGCATAC ATCCATCTGA AGAAGCCACA TTAGGCAATA AGAGATCTAC 1920
AGAAACTCAG ACCACTGAGC CATACAGCTT AAGAAAGGCC AAGTTATGTT TTCTCCCCCA 1980
ACACAGTTCA TTGCTCCCAA CAATTACGTT TCTATCAGGC TAAGGGATTT CTTCAGGGAC 2040
AGCAATCCCA AAGTGGCAAG GCCCACCTGG GTCCCTTCCC ACATTCCCAT TGGAAAGCAC 2100
CAGAAACACT TGTGTCCCTT CGGGGAAGGT CATGTATACA ACATTCCAGG AAAGTATCAC 2160
AGGGACTTTG TTTCTCAAGG AGAAACTCTA GGGGGAAGAG TCAGTTCTCT GAGGGAAGCT 2220
GCCCATTCAT TAAAGGGTTT CCACCCTACA ATTATGGCAG GAGAAGGGCT TTTGTGCTAG 2280
ATCCTTTACT CGAGTCAAGC TATGGCAGCT GGCTATCATT ATTCCATTTT ACAGGCGGGA 2340
GAGACAGATG GACAAGACAG CCGAACAGGT TCAGCATTTC ATCAGGTGAC TCCAGGCAGG 2400
CAGTAATCTG GCTAAGGGTC TACACTTTCA GTCCTTGAAG CATCACTCCA CCACTAAGTA 2460
GAGATACCTG GGGCAGGCCA CCTTCTCCCC ACACGCACAC CACTGTCATC TATTGGCAGG 2520
GCCTGAGAGG GTTTTAACAA TGAAAAAATT GGCCGGGGCC AGGCACGGTG GTTCATGCCT 2580
GTAATCCCAG CATTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCGGATCAC CTGAGGTTGG GAGTTTGAAA 2640
CCAGCTTGAC CAACATGGAG AAACCCCATC TCTACTAAAA ATACAAAATT AGCCAGGTGT 2700
GGTGGCGCAT GCCTGTAATC CCAGCTACTT GGGAGGCTGA GGCAGGAGAA TCACTTGAAC 2760
CCGGGAGGCA GAGGCTGCAG TGAGCTGAGA TCGCGCCACT GCACTCCAGC CTAGGCAACA 2820
AGAGCGAGAC TCCGTCTCAA AAAAAAAAAA AAAAAGAAAA AATTAATAAG CAGCTCACTC 2880
TGGGCAAAAC CCTGATGCCC ACTTGAAACC TGCCATGTCT GAGTTTTACC AGTGCCAGAA 2940
TCTGAGGCTA CCAACACGCC TCTGGGAACC TGCTACTGCC AACTATCCTT CCCATAGCTA 3000
CCTGAACAAA GCCAGTTATC AGTCCAGAGT GAGCACCTTC ACAGGCATGG TTTGCTTGGC 3060
CCAACAGCAT CTCTGGCTTT CTGGGCCAGC ATGTCTAGGT CACTTTATTA CTCCCTGGAC 3120
AACTTGATAG GATGAAAAGT GTTGGCTTTA GAATTATGCC AACCTTGGTG TAAATTCTCA 3180
TTCAGACACT TAACTGGCTG AGGGACACCT GGGGTCAGTC ACTTAGGCAC AAAGACCTTC 3240
ATGTGTAAAC TGGGAATAAA CTCACCTTCC TTGGAAGGTT ACTGTAGAAT ATATGAAACA 3300
GCATGCCGTT TCCATGAAGG AAGGTACCAT GCGTGGCTTA TGGCCAGCAC CTAGTACACT 3360
GCTAGCTTCA CAGTAGATGC TCAAGAAACA CTGGTTGCAT AAGTAGAGGA CCTAACACAG 3420
TGCCTAGTAC TTAACAGGTA CTCAATAAAG ACTAATTTCC TTCCCCTTTC CTGTAGGGAT 3480
GCTAAATTTA GAACATAGCC CTGAGTAGAA TAGCCCATAA CTCCTACCCT TAAGGATCTC 3540
CCAGCCGCAG TCTCCAGGAT AATTACCCGA TGCCACCACA GTAGCCAGTC GGTGCAGCTT 3600
GGAACAGGAT AATACCTGAG AGGAAGGGGG CGGGTACCTT CTACCCAGGC TCAAAGGATC 3660
CTGAGTCAAA TGTTCTTTAC TCCCTGGCCT TAGGGAGAGA ATGTGTGCTC AGAAATGGTT 3720
CTGATATAAC TGGCTCTTCC ACACACATCC CCTCTGTTCA CCAAGAGGAA GTGACATGTG 3780
GTATGTTGTC CAACAGGCTC TGATGATTCT TAAGCAAAGA GATGGAAGAT GGAATTTCAA 3840
CCCCATGGAG ATCTAATAAA CTTACCCAGA GTTGCTGTGT CTAAGACCTC TTTCATATGC 3900
ACCACTGGGC AGCTGGCAAT TCTCTGGTAG GGGTAGCCTT CTGCAGAGGC TGGCTAGCAG 3960
ACCAGGCACC TCTCCCAGAC TGCCTTTTGT TTATAGCTGG CAACAACCCA CCTGGTATTA 4020
GGACCACTGG CCAAAGACAA TAGTCAGGCA AAGTGGGCAA GCAGCCTCAA TCCCTACTTG 4080
GAGATGCCTC AGAGGGTGTG TCTGCAGTAC TGGAATCCTG TCCCTCCTGT AATCAGCTGA 4140
ACAAATATTT GCCCCAAAAG AGAATCAAAG CAGGAGGGAA CAGGAGAGGT CACTGCACAA 4200
ACCAACAGGA ACTATTTAAT CATTTATCCC CCTAGAGAGT TCATTTACAG AATGGCTTTC 4260
AAGTCTAGTC AGCTAGCTCA AGAGAACCCA CCACCTTTAC CTCCCCTGAC CCCACCCCAG 4320
TTATCTGACC TCTATTGACT TGACCCCCTT GCCTTTTACA AGAGCTGGCA CAGACGAGTT 4380
GAAATTGCAA AGAAATGCAA AATGAGAGAG GGGGTGGGGT TCCAGGGCAA ACTCAGGAGG 4440
TCTCTTGCTC AGTGGTAAAG TGAAGTGCCT GCCACACCCT AGGCCCAGCC TATAGACAGT 4500
TGCATTCTTG ACATTCCTGA GTCCATGGTG CATGTCCCCT TCCACCTCAG CTCCTTCAAT 4560
GGATGACTTA TTTTCCACAG CTTGATGCTT TTCTGCATAC TCTGAGGGGA TAGAACATCT 4620
CTCATAAAAC CTGCACCTCC GCTAGGTAGG GAGATAAGCA AGAAAACAGG ACTGAATTCA 4680
CTGAAGAGCA AAACTTGCCT ACAGTGACCA CTGGTAAAGA AGCTTTCACC ACCATCTCAT 4740
CCTGGCTCAG TGATGGGCAG GAGAACTCTC CCTCCCTGGA AAGGGAATTT GCTGGTGTCA 4800
GTCACTGTGC TCACATTATC GCCAAGATTT ACAATACACT GTAAGGCAAG GAGAGCTTGC 4860
CACATTTTTT AGTGAAAGAA ACTAAGCCTC AAGAAAGTAA CCCAGCCTGT CCAAGGTCAC 4920
ACAGCTAGTT ACATGACAGA ACTGGAACTT ATACCTGCAT GTGAAGTCTG TTACTAAATC 4980
TCAATGTCCC ACAGAGCCCC AAAGACTAGG TTCTTGCTTT GCCAGCAAAC AGTGCTTGAA 5040
GAGGCCCCTG GGCTCTGGCC GGAAAGTAAC AGGCAGAGCA GCTGGAGCTC CCCAACCGAC 5100
CCCAGGCAAT GAGGTGCAAA GTCCCCTGGC TTAATGTGTG ACACAGCAAG TGCTCCACAA 5160
ACAAGGCAAC CATGCAGAAA GTCGCACACT TTGGGGGAAA TGAACTTAGG GGGCGCAGTG 5220
CAAACACAAT CTGCACAGCC TACACTGCCC CAAAATCTGA CAATTCTCAG CCATTCAACC 5280
CAGTGGGAAC TCCTGCCTAT GGCCATGCCC TAGTCTGAGA GGAGAGTGCC ATACACGCAA 5340
ACTTTGAAAT AAAGGGAACT TGATTTGGGG GAGAGAAGCC CAGGATAGGA CTGAGACCCC 5400
TTGGGGGGAA CAGATGGAGA GGTCTGTGGG TCATTGATGC TCATCATCTT CTCCAGGCAT 5460
TATACTCATC ACCCCTTTGT GTGTGAACCA TTGTATAAGG TAAGGGAAAC ACCGAACTAA 5520
CTTCCTACCC TCACAGGTTT GGGACTTAAT GAACACATAG GCTACAGTTT TCTTTGCTGA 5580
GAAACTGGAA CACAAGTATG GAATAGTGGA GTCATGGGGG TGACCAGGGT GAAAGATGCC 5640
TGATCTCTGA AGCACAGGGT CATTTGTATT TCCAAGGAGT TAACCTCTTG TGGTGAAATG 5700
AGGCCAGTCA GGTTTCCTCA ACTATCAACG TCTCCAACAA TCACCCAACA CAACAGAAAG 5760
AGATACAGAA GAAGGGCTGT TGGGGATCTC TGACCAGAGG CCAAAGAAAA GGGACACACA 5820
AGGGGCTTGG 5830