EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-21089 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr20:30286050-30288890 
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr20:30287836-30287857ACTCAGTTTCATTTTCTGTAC+6.55
Number of super-enhancer constituents: 71             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00546chr20:30285914-30290417Adipose_Nuclei
SE_01656chr20:30286536-30289005Aorta
SE_02627chr20:30286460-30288538Astrocytes
SE_03109chr20:30286419-30287781Bladder
SE_03156chr20:30286548-30288932Brain_Angular_Gyrus
SE_03894chr20:30286146-30289176Brain_Anterior_Caudate
SE_04818chr20:30285752-30290530Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05813chr20:30285526-30290713Brain_Hippocampus_Middle
SE_06739chr20:30286157-30289233Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07749chr20:30285525-30290582Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08789chr20:30286618-30287903Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_13448chr20:30286373-30288569CD34_Primary_RO01536
SE_14426chr20:30285971-30289231CD4_Memory_Primary_7pool
SE_18483chr20:30286164-30289073CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19226chr20:30286373-30288645CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20456chr20:30286524-30287948CD56
SE_20764chr20:30286371-30287968CD8_Memory_7pool
SE_22440chr20:30286355-30289018CD8_primiary
SE_23622chr20:30286599-30287706Colon_Crypt_1
SE_25330chr20:30285768-30289021DND41
SE_25933chr20:30285935-30289194Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26879chr20:30285884-30288535Esophagus
SE_27731chr20:30281838-30288694Fetal_Intestine
SE_28698chr20:30282053-30288849Fetal_Intestine_Large
SE_30903chr20:30286335-30288967Fetal_Thymus
SE_31430chr20:30286060-30288986Gastric
SE_33407chr20:30286348-30287887H2171
SE_34309chr20:30281429-30289008HCT-116
SE_34643chr20:30281430-30289269HeLa
SE_35852chr20:30285817-30288911HMEC
SE_36989chr20:30277814-30290195HSMMtube
SE_38141chr20:30285416-30289224HUVEC
SE_39144chr20:30286359-30288952IMR90
SE_39853chr20:30286529-30288860K562
SE_40644chr20:30285851-30288970Left_Ventricle
SE_41648chr20:30286800-30287453LNCaP
SE_42121chr20:30285414-30289018Lung
SE_43515chr20:30284537-30290340MM1S
SE_44365chr20:30285831-30288996NHDF-Ad
SE_44995chr20:30285926-30288667NHLF
SE_45708chr20:30285814-30288971Osteoblasts
SE_47264chr20:30285629-30288991Panc1
SE_47861chr20:30286630-30287685Pancreas
SE_48182chr20:30285753-30288791Psoas_Muscle
SE_48890chr20:30286555-30288558Right_Atrium
SE_49684chr20:30286541-30287553Right_Ventricle
SE_49886chr20:30286550-30288884RPMI-8402
SE_50155chr20:30285869-30288969Sigmoid_Colon
SE_51509chr20:30285595-30290402Skeletal_Muscle
SE_51884chr20:30286350-30288800Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52373chr20:30285428-30288947Small_Intestine
SE_53471chr20:30285965-30288824Spleen
SE_55108chr20:30285903-30286551Thymus
SE_55108chr20:30286561-30288235Thymus
SE_55770chr20:30285683-30288979u87
SE_56767chr20:30285910-30286508VACO_400
SE_56767chr20:30286579-30288939VACO_400
SE_57375chr20:30286582-30288547VACO_503
SE_57919chr20:30286762-30287447VACO_9m
SE_58612chr20:30249012-30312162Ly1
SE_59155chr20:30248900-30312556Ly3
SE_61228chr20:30249013-30312452HBL1
SE_61455chr20:30248898-30312277Toledo
SE_62770chr20:30248811-30312352Tonsil
SE_63330chr20:30279572-30311864NCI-H82
SE_63683chr20:30286344-30288924HSMM
SE_64478chr20:30286331-30288179NHEK
SE_65412chr20:30285884-30289501Pancreatic_islets
SE_66898chr20:30286348-30287887H2171
SE_67146chr20:30284537-30290340MM1S
SE_67821chr20:30285683-30288979u87
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr203028658330287977
chr203028617630286226
chr203028869330288840
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I031693chr203028097730290157
Enhancer Sequence
CTCTTTTTTC TGAGACAGGA TTTTGCTCTG TCGCCCAGGT TGGAGTTCTG TGAGATGTGT 60
TCATAGCTCA CTGCAGCCAT GAACTCCCAG GCTCAAGTGA TCCTCCCACC TTAGCCTCCT 120
GAGTAGCCAA GATTATTGGC ATGTGCCACC ATGCCTGACA AATTTTTTGT AGAGATGGAG 180
GTCTCACTGT ACTGCTCAGG CTGATGTTGA ATTCCTGGGC TCAAGTGATC CTCCCACCTC 240
AGACTCCCAA AGTTTTGGGA TTACAGGCAT GAGCTACTGG ACCCAGTCGA TTTTCCTTCT 300
TTTTTTTTTT GGAGACGGTC TCGCTTTGTC ACCTAGGCTG GGGTATAGTG GTGTGAACAT 360
GGCTCACTGC AACCTTGACC TCCTGGACTC AAGTGTTTCT CCCATCTCAG CCTCCCGAGT 420
AGCTGGGAAT ACAGGTGCGA AACACCACAC CCGGCTAATT TTTGTATTTT TTTGTAGAGA 480
CAGAGTTTCG CCATGTTGCC CAGGCTGGTC TCAAACTCCT AAGCTCAAGC AATCTGCCTG 540
CCTCAGCCTC CTAAAGTGCT CAGATTACAG GCATGAGCCA CCACACCTGC CCTTTTTTGC 600
TTTTCAATTA GTGAGTCAAG GGGAGATCTC CAATATATCT CCAATAGTGT GGTGGCTGGT 660
CTGCTCTGAA ATGTAAGCAG TTTTTTTTTG TCCCCTTGAC CAGACTCTAA AAGTCTTAAG 720
GTCAAAAAGT CCACAAATAA CGTTTTGTTT ACCCATCCTA CAGTGCTAGG CCTAAGCCTC 780
GGACTTAGGC AAAGGAGATC AGAAGGGTCA TATGGCTAAA TGTAGGTGGA CAAGAGGGAG 840
TCGGGGAGGG CCTTCCTGTG AATCCTCCTG CCTCTCAAGG ACGCTCTGTT CCCTTAGCTT 900
GAGAAGCCTT GAGGAAAGCT TTTTCCATGA ACAAGCTTTT AAAAACCTTT TAGCTCTTTA 960
AAAGCAGCAA GTACCATTCC AGTCATGACC CTGCAGACAG GTGGAACACC CATACTCCAG 1020
CCTCATTCTG AAGAGACTTG CAGAGCAGGA AGGAAGGGGT AATGACTTTC AGTTCCAGTA 1080
ATGTATCTAG AAGCAGCAGC TGATTCAGCT AGATGATGTC ACCTTCCCAA ACCTCCTGAC 1140
CAGCAGCTGA GATGGTAAAA GCAGGAAACA GGGGATACTC AGCTGGCTAA GTCCGAACAT 1200
GCCTCTGGCA AAGGCCTACA GTAACCCCAG GCTCTGGAGG CATCCTCCTG AAGATGAGGA 1260
GAAAGAGTCC TCTCAGCTGG GAGTACAGTA GGTGTCCTTC AAGACCCTCA AACCAAGATG 1320
CTTCTCCAAC TCTCCTTTTG CTAAGCAGCT TTCTGCATAT CCTGAACCAA CAATCCTTCA 1380
TTTATTCCAA GAGTGGAGCA GGGGAAAGAA GCCTGGCTTT AGAGCCAGCC CAATCTAGGT 1440
CCAAATCCAG GATTCACCAC GTAAAGCTGC AGGACCCTGG CATGCAACTT CACTTATCCA 1500
AACCTTAGTT TCTTTACTGG AAAAGAAAGT AGGGCTAATG GACCATTTAG CACACAGTCT 1560
AGGTGAGGGA ATTAAATGAG AAAATGCATG TAGAGTACCT GACATGGGCT AGGTGCTCAA 1620
TAAATGGTAG TCAACCATTA TCCCATTGGA TCTCTGCAGA GGAGATTTGA AAGATCACCT 1680
CCATCTATAA CACAAAAGGA AACAAAGGTA CCAACTAGAC CCAACAGTGT CAAAGCTGAG 1740
TAACTGAGTT GGCCCATGCA TATAGTTGCT TCCTAGATAT TCCATTACTC AGTTTCATTT 1800
TCTGTACAGC ATTTAACCCA ATCCCTGAAA TAATCTTGTT TGTTTCTCGG GCTAGCTGTC 1860
TCTCCCATTA AAGTAAGAGT TCTACAAGAG CAATGTCCTT GACCTTATCT TGTTTATCTT 1920
AGCATCTTCA GCATGTAGCA CAGGGCCTGG CACATAGTTG GTGCTCAATA AACATTTGCC 1980
GAATCGCCAA ATGAATAGCA CCTGGGATGG CCAAAAGCTA AACTGACAAT GGCCCCACAC 2040
TTAACTCCTC CCCTCACTAT TAGTTGAAGG CTCTGGCTCC CATTTCAGAA GCTGCCATTG 2100
CCACCTGGGA ATCAGCAGCC CAACCAGTGG CCAGCATGGG CATTAGTCCC TGGGCACGAC 2160
CTATCTATTG GGATACCAGG GCTGCCAAGG AGGGCCTTGG AATCCTCCCC CTGGCACTTG 2220
AAGATCCTAC AAACCTGGTT CTAGCTGACC TTTTTGGCTT TATTACCTAA TGAAAGAGAC 2280
CCCTCCACAT ATGCCTAAAA TTTGACTGCC ACTGCCCACG GGTCTCTTCT TGAGAGTTGG 2340
TCTCAGCCTG CAAATCTTAA CCCACATTGA CTCTCCTACT GGGAGCTACA GCCCCTCTTT 2400
TCTCCGCTTT GTGGTAAGGC TCGGTGTAAA CCTCACCTCT TCTGTGAAGT CCTTCCCTCA 2460
TTTGGCATTT AGCATTTATT GTTGGCTTTT ACAAGATCTC CTTTCATGTA TATTATGTCT 2520
TTTCTCTCTA ATTCAACTGG AAGTATCTTG AGAGCAGAAC TGGGTTTCCA ATGGCAATAT 2580
CTCAATTAAT AAACCTTCTA CAGAAAAGAC TCCTTGAAAC AAAGTTAGCT AGGTCCAGAG 2640
AGGACTGGAG AGGGGTCTAG GCTCCTCCCT GCTGGACCAG CCCCTTTGGC AAAAAGAGGA 2700
GATCGTGTTG CCTCAATCCA GGAGCCCAGC TGATGAGGCA GGAAGGGAGC CAGCAAATCC 2760
TAGACTATTA GGTGCAGTCT GGGACAATCC CAAGGTCATC TATGTAATTA GATTTTTTTT 2820
TTTTGGAGAC GGAGTCTTGC 2840