EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-17473 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr19:39178620-39180670 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr19:39180298-39180313AGTTAATTTTTAATT-6.49
NFE2L1MA0089.2chr19:39179695-39179710ATATGACTCAGCAAT+7.68
NFYBMA0502.1chr19:39180631-39180646CACCTGACCAATCAG+6.15
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT+6.02
OLIG2MA0678.1chr19:39179966-39179976ACCATATGGT-6.02
Number of super-enhancer constituents: 32             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39172768-39180290Adipose_Nuclei
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
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SE_14624chr19:39179374-39180514CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20865chr19:39170480-39179166CD8_Memory_7pool
SE_25779chr19:39179417-39180269Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39179021-39179809Esophagus
SE_26525chr19:39179873-39180389Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
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SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_40018chr19:39179218-39180516K562
SE_40594chr19:39179201-39180442Left_Ventricle
SE_42097chr19:39179722-39180563Lung
SE_44161chr19:39177919-39179043NHDF-Ad
SE_44161chr19:39179045-39180304NHDF-Ad
SE_44797chr19:39179102-39179721NHLF
SE_45660chr19:39172827-39180503Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_51136chr19:39179021-39180428Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39179204-39179729Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51705chr19:39179740-39180298Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53291chr19:39179735-39180329Spleen
SE_56725chr19:39178407-39179038VACO_400
SE_56725chr19:39179083-39180391VACO_400
SE_58038chr19:39179862-39180220VACO_9m
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39179071-39179729HSMM
SE_63494chr19:39179752-39180316HSMM
SE_64225chr19:39179057-39180305NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193917865339178869
chr193917903439179144
chr193917945139180013
chr193917950339179787
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CAAATGGTCA ATAAGCACAT GAAAAGGTGT TCGATGTCAT TACTAATTAG GGCAAATCAA 60
AACCATAACC ACTACAAATG GTCAATAAGC ACATGAAAAG GTGTTCAATG TCATTACTAA 120
TTAGGGCAAA TCAAAACCAT AACGTGGTTG GGCCTGGTGG CTCATGTCCA TAATTCCAAC 180
ATTTTTGGAG GTAGAAGTGG GAGGATGGCT TGGGGCCACG AATTGGAGAC CAGCCTGGGC 240
ATCATAGTGA GACCCTGCCT CTACAGAGAA TTAAAATAAA AAATTAGGCC GGGTATGGTG 300
GCTCATGCCT GTAATCCTAG CACTTTGGGA GGCCGAGGCG AGTGGATCAC CTGAGGTCAG 360
GAGTTTGAGA CCAGCCTGGC AAACATGGTG AATGAAACCT TGTCTCTACC AAAAAAAAAA 420
AAAAAAAAAA ACCCACAAAA ATTAGCTGGA CATGGTGGTG GGCGCCTGTT GTCCCAGCTA 480
GTGGGGAGGC TGAGGTGGGA GAATCGCTTG AACCTGGGTG GGAGAGGTTG CATTGAGCCG 540
AGATCACGCC ATTGCACTCC AGCCTGGGCA ACAGGGTGAG ACCCTGTCTC TAAATAATAA 600
TAAAAATGAG AAATTGGCCA GGTGTAGTAG CATATTCCTG GGAGGCTGAG GTGGGCAGAT 660
TGCTTGAGCC CAGGAGTTCA AGGCTGCAGT GAGCTATGAT GACACCACTG TACTCCAGCC 720
TGGGCAACAG AGTAAGACCC CAACCCTAAA ACAAAAAAAA ACAGAAAACC ACAATGAGAT 780
ACCACTGCAC ACCCACCATG ATGGCTATAA TCAGAAAGTC AGATAATAAG TATTGACTAG 840
GATGGGAGAA ATCAGAACCC TCACATTGCT GGTCAAAGTG TAATGTGGTG CAGCTTCTTG 900
GGAAAACAGT CTGGCAGTTC CTCAAAATTT AAACATGTTT TGTATTTTTA GTAGAGACGG 960
GGTTTCACCA TGTCACCCAG GCTGGTCTTG TCTCAGCCTC CCAAAGTGTT GGAATTACAG 1020
GCATGAGCCA CCACGCCCAG CCAAGTTCCT CAAATTTTTA AATATAAGAG GTATCATATG 1080
ACTCAGCAAT TTTACTCCTA GGTATATGCC CAAGGCAGTT GAAAACATGT CCACATAAAA 1140
CTTGTACATG AATATTCACG GTGGTGCTAA TATCCAAAAG ATAGAAGCAA CACAAATAAT 1200
GCCCATCAGC CAATGAATTG ATAAATAAAA TGTGGTATAT CCATACAATG GAATGTTATT 1260
CAGACAGGAA CGAAGTACTG GTACATGCTA CAACATGGCT GAACCTTGAA AACATGCTAA 1320
GGAGAAGCCA AACTCAAAGA TCATATACCA TATGGTTCCA CTTATATGAA ATGCCCAGAA 1380
TAGGTAAATT GCAAGAGACG AAAGAAAGGT AGGTTAGTGG TTGCCAGGGG CTGGGGGCTG 1440
GGTAGGAGGG AAGTGGGGTT GGAGAGTAAC TGTACCAGTT TTGCGGTGGT AGACATGTTC 1500
CTTGTATTTT TGGTTTTTTG TTTTGTTTTG TTGTTTTGAG ATAAGGTCTC ACTGTCGCCC 1560
AGGCTAGAGT GCAGTGGCGC TGTCATAGCT CACTGTAGCC TCGAATTCCC AGGCTTAAGT 1620
GTTCCTCCCA CCTCAGCCTT CTGAGTAGCT GGGACTACAG GCAAGAGTCA CCATACCCAG 1680
TTAATTTTTA ATTTTTTTTT TCTTTTTCTT TGAGATGGAG TCTCGCTCTG TTGCCCAGGC 1740
TGGAGTGCAG TGGCGCGATC TTGGCTCATT GCAACCTTTG CCTCCCGGGT TCAAGCGATT 1800
CTCCTGCCTC AGTCTCCTGA GTAGCTGGAA CTACAGGCGT GCGCCACCAT GCCCGGCTAC 1860
TTTTTGTATT ATTAGTTAGA GACGAGGTTT CACCATGTTG GCCATGAGAG ACAGGACTAG 1920
CTGGATTTCC TAGGCCGACT AAGAATTGCT AAGCCTAGCT GGGGAAGGTG ATCGCACCCA 1980
CCTTTAAACA CCGGGCTTGT AACTCAGCTC ACACCTGACC AATCAGGCAG TAAAGAGGGC 2040
TCATTAAAAT 2050