EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-17471 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr19:39164540-39168170 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr19:39164640-39164655TGAACTCCTGACCTT-6.04
ZfxMA0146.2chr19:39164663-39164677CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 71             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39165147-39167595Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39164613-39166814Adrenal_Gland
SE_00865chr19:39166901-39167874Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39164445-39171596Aorta
SE_02946chr19:39166206-39167906Bladder
SE_03166chr19:39164661-39165957Brain_Angular_Gyrus
SE_03166chr19:39166126-39167588Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39164983-39168193Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39164489-39168342Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39164448-39170203Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39164765-39168166Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39164796-39167643Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39164511-39180526CD14
SE_13490chr19:39164569-39168138CD34_Primary_RO01536
SE_14624chr19:39164572-39168378CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20249chr19:39164561-39178319CD56
SE_20865chr19:39164617-39170179CD8_Memory_7pool
SE_22709chr19:39165018-39168386CD8_primiary
SE_23062chr19:39165306-39165967Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166087-39166803Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39166892-39167972Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39166141-39166668Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39166954-39167795Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39166028-39167370Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39164448-39177989Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39164610-39168530Esophagus
SE_27614chr19:39164407-39180553Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39164574-39167863Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39164629-39166814Gastric
SE_31384chr19:39166841-39168068Gastric
SE_35812chr19:39164437-39168549HMEC
SE_36926chr19:39164423-39168326HSMMtube
SE_38012chr19:39166134-39168129HUVEC
SE_38896chr19:39166079-39167996IMR90
SE_40018chr19:39164614-39168462K562
SE_40594chr19:39164568-39178326Left_Ventricle
SE_41601chr19:39166914-39167674LNCaP
SE_42097chr19:39164441-39171613Lung
SE_44161chr19:39164690-39165914NHDF-Ad
SE_44161chr19:39165948-39168436NHDF-Ad
SE_44797chr19:39165055-39165813NHLF
SE_44797chr19:39165893-39167853NHLF
SE_45660chr19:39164558-39165979Osteoblasts
SE_45660chr19:39166130-39167979Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39166251-39166741Pancreas
SE_48075chr19:39164445-39168285Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39164445-39168503Right_Atrium
SE_49449chr19:39164658-39165488Right_Ventricle
SE_49449chr19:39165542-39166833Right_Ventricle
SE_49449chr19:39166954-39168021Right_Ventricle
SE_50056chr19:39164598-39172640Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39164476-39168293Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39164591-39167784Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39164439-39168563Small_Intestine
SE_53291chr19:39164439-39168017Spleen
SE_54534chr19:39164447-39168169Stomach_Smooth_Muscle
SE_55638chr19:39164641-39165676Thymus
SE_55638chr19:39165817-39166888Thymus
SE_55638chr19:39167040-39167924Thymus
SE_56725chr19:39164643-39166779VACO_400
SE_56725chr19:39166876-39167993VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39164405-39167784HSMM
SE_64225chr19:39164570-39167858NHEK
SE_65266chr19:39164394-39165412Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39165862-39166710Pancreatic_islets
SE_65266chr19:39166857-39167918Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39165582-39166750H9
SE_68725chr19:39166945-39167695H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 4             
ChromosomeStartEnd
chr193916472439166067
chr193916609339167732
chr193916800239168130
chr193916630239166492
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CCTCCTGAGT AGCTGGGATT ACAGGTGCCT GCCACCACGT CCGGCTAATT TTTGTATTTT 60
TAGTAGAGAT GGGATTTCAC CATCTTGGCC AGGCTGGTCT TGAACTCCTG ACCTTGTGAT 120
CTACCCGCCT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGCG TGAGCCACTG CGCCCGGTGT 180
GATTATTTTT ATGAAGGAAA AGACCAGAGT CCTTTAAGAG GGGACAGTGG GGGACTTGCA 240
ATAGATTGTG TGGGAGCTGT CAGGGGAGAC TTTCCAAGAT GATGACAGTG AAGTGAGGCC 300
TGGAGGGAGA GTTAGAGCCA ACCTCAGAGA AGGGAACACT GTTCTAGGCA GGAGGACCCA 360
GGGTTGTGGG AAGAGAGAAA TAAAATGAGA CCAAGACAGT GGGGAGAGCA GTGTGAGTTG 420
AAGTCAGAGG GGTGACAGCA GCCAGAATGT GCCGGTAGCG AGGATCTTGG ATTTTATTCT 480
AGCTGCAATG AGAGCTTTGA TTCTACAAAT ATTTATTGCG TGCTAGTCAC TGTTTTAGGT 540
ACTGGGTGTA CAACAGTGAA AAAAGAACTT CCCAGCCGAG TGGAATGCCG TGGAGCATAT 600
CTGTTTCGAT GCTGGGACAG ATCCCTAACA CAGCTCATTA AAGCAGATAG CACCATTCCG 660
TCTCTTTCTT CAGCTTCACT TTACGTCAGT CCCAGCATTT TTATCCCTAC CCTTACAGAT 720
GAGAGAACTA AAGTTCAGAG AGGTGACGTG ACTTGCCCCA GGCCCCTCAG TCAGTAAAAG 780
ACAGAACTGA GAATCCAACC AGACTCTTCC CTTTTTAGGT TATTTCTCTA ACATTAGGGC 840
CGAGTATCGA TTCTCTTTAC CTCTGACTTC GTGTCCCTGG TATTAAGACT CAGGGCCCAC 900
AGTGCCTCTT GGAATTCAGG CATATGGTGA CATCAGTGTG CCTACCATTC AGGTCTTGGA 960
GAATAGGGTA TGGCGAAAGG AGAGAACTCG TGATATCGCT GATTCAGTAG CCCAGAGTTG 1020
TACGAGTCCT TGGGTGTTTC ACCTTCATCC AGGCATCTGA GATTGGAGAC AAGCATGTGG 1080
CTGAATGACG TATCTGGGGG AAGCTGTCTA AACAGCCGTG TGGAGTTGGA GAGTTGAATT 1140
AGCTCTGTGG CCAAACCTCT GGGCTCAGTC TGCCTATATA TGGCTTGATC TCAAAGAACA 1200
GGTGATAGCA GTAGGAGTTG TTTTCTGTGT TGCTGGTGGG AGATGCCCAG GCACATTCCT 1260
TTGTAGACAA GCACAAACTA GATATTTTTG AAATCGGAGG TCTGAAACCA GCCGAAGAAT 1320
TAATCCTGGC CTGGAAAGCA TATGGGAGAG TACAGCCAAC CTGGCTTGGG TGTTGCTTTC 1380
TTGGTTTTGT TGCATTTTTG AGGCAGGGTC TTGCTCTGTC ACCCAAGTGG GATCACAGTG 1440
GTACAATCAT GGCTCATTGC AGCCTTAACC TCCTGGGCTC AAGTGATTCT CCTGCCTTAT 1500
TTTTTGATTT TTTTTGTAGA GGTGAGGTCT CACCATGTTG CCCAGGCTGG TCTTGAGCTC 1560
CTGGGCTCAA GTGATCCTCC ACCTTGGTCT CCCAAAGTGT TAGGATTACA GGCGTGAGCC 1620
GCTGCCCCTG GTGACTTTGT TGCTTTTTAA TAAGCCCAGA AATTTCTTTC AAGAGGGAGG 1680
ATCTTTGTGA ACATCTTGAG CCGCGTTCTT GATCGCTGGC TGTGGAAGCC TCCACCTATC 1740
AGGCTCAAGT CCATGTTGCT ATCATGTGCA CTTTGGCTGG TGAGGTGCTG AGCAGAGGTT 1800
TCAGCCTCTA CCACAAGGTT TCCTGATGAA AGGTCAGCTG GGTGGGCCCA GCTTCTCCTT 1860
ACCCAACTGA GAGGCCTCAT AGAGCACAAG GCCTGGGTAC GGAGGTTCCT GGGGCTCCTG 1920
CCATACCCAG CCAGGCCAAG CAGAGGGCCC CAGTGTGTTG TTGGGTGCTG AGAGGCTGCC 1980
CGCAGCTCTC GCCTGTGTTG GAAGGCTGTA GACTTGGCTT CTCCCAAACG TAAGCTGTGA 2040
AGCCATGGAC TCAGATTCTC AGCCTGGCCC TGCTACTTAC TGTGGGACCT TGGGCAAGGA 2100
AGTCTCCATT TTCTCTTTTA CAAAATGGGG CCAATAATCT GACTACCACA GGGCTGTCAG 2160
GATGCAGCGG GATGGAGCCT TTATAGGGTC TTGTTCTGTG GGATCTGGAG TCCCATATGG 2220
GAGTTATTAG TTGAGGGACG AGGCATCTGG GAATCTTTAT TCAACTAGGA AACTTCAGCC 2280
AAAGAACTAA TGCCATAGAG ATGTCTTATG GTGTCTGCAT TTGAAGCCAG CGGTTCTTTG 2340
AAAATTTATC CTGAGTTCCA GAAAGCCAAC TGCTAGATAA GTAAGCATTG AGCATTTAAG 2400
GGGTCCTGGA AGTAAGATTC CTGGAAAGAA GCAGCAATCT CTTACTCATC CCCGATTATC 2460
TCAGACACAG AGTGGTGGAT GGAACCTTTG TGGTTTAGGG GCTGACTCTT GGTATTGCTG 2520
GATAAGGAAT ATGAGCCAGT AGAGACGAGT GTGTTGTATA GCAGTGTCCT GCGACTGGGC 2580
TGGAGACGTG GCTGAGGGAG GCCAGGGGGC CTCAGAGTGC ACGGGAGGAG GCTTACAGAG 2640
GTCTTTTGCA TCCTGCAGAA CACCACATGT GTCCTTCCCT CTGGGAAACC TCCCACCCGG 2700
GCAGGGCCTC TGGGGCCGGA TGTGGAAGGT AAACAGGCTG CCTTTCTGCT CTCTACCACA 2760
GACAGGCCCG GAAAGGCCTG AGTAGGAGCT TTTCATCTCA GGAAGCCCTG AGGTCCCACA 2820
GCTTCTCCTG AAGCAGCCTC ATTGTCCCTT TGTAAGAGCA TGACCAGGTG CTCTAGCTCC 2880
TGGAGCACCA GTGGAGAACT AGAGTGGCCC AGGTGCTGAT GCCAAGTTCG AGCAACAGCT 2940
CCTGGCGGGT TTCCCTGCAT CCCCCCACTC ACTCCCATCT ATTCTTCACA TAGGGGCCAA 3000
AGAACATCCT GCTTGACATC TTGATCAGTG TCCCTTGCCC TCAGGATCAA ACCTGCAAGT 3060
CCCCAAGGCC CTGCAGGATC TGTTTTCTCC TCTCTGTGCT CCGGGCGCAT GCCAGCTGCC 3120
TCTCTGCTCC ATGCTCATTC CTGCCTCCTG AGGGACTTCA CACGGGGCCC TTGCCTCTGC 3180
CCCTTTCGCC TCAGCTCGCC ACCTACCTCC TCCTCATTCT TCAGATGGCA GTTTATGCTT 3240
CACTATTTGT AGGGCCGTCG CACCTGACAC CTCCAGCCTA GGTTAGGAGC ATGTCCATCA 3300
CCTCTACTTC TCCTTTTAAC TCCAACCATC CTTGGCTCTC CCTCTCGAGG GTCACGAGAG 3360
CAGAGAGAGA ATCTATTTTG TTCACCACTG TGTCCCTACC ATGTGGGACA TTGTCAAGGC 3420
AAATGTAAGT GTGCACTAAA TAAATATGTA TTGAATGAAT AGATAGCCAA ACAGACAGAA 3480
TGGATCTGCC ACAACACAAA CAGGATGCTT TTCAAGTGGG CAGAAGATGG AGACATCACT 3540
TGTCGAGACA CTCAAACAAG TGGCTGGATG GATGAGTGGC AGATCCATTC TGTCTTTCTG 3600
CTTGGCTTTA GGAGTAGAGG GATCACCCAT 3630