EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-03112 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr1:223893310-223895120 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr1:223894355-223894366AGGAGATAAGA-6.14
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr1:223894565-223894580GAGGTCAGGAGTTCA+6.22
ZNF263MA0528.1chr1:223894171-223894192GAAAGAGGGAGGGGAAGAAAA+6.35
Number of super-enhancer constituents: 38             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00224chr1:223891886-223912166Adipose_Nuclei
SE_01908chr1:223891964-223894610Aorta
SE_01908chr1:223894875-223896024Aorta
SE_02306chr1:223892116-223896302Astrocytes
SE_04026chr1:223892317-223894515Brain_Anterior_Caudate
SE_05972chr1:223891995-223895701Brain_Hippocampus_Middle
SE_07996chr1:223892580-223894588Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_23408chr1:223893759-223896170Colon_Crypt_1
SE_25230chr1:223894802-223895832Colon_Crypt_3
SE_26209chr1:223892263-223896172Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26925chr1:223892455-223896502Esophagus
SE_31491chr1:223892450-223896280Gastric
SE_33950chr1:223892039-223897144HCC1954
SE_34545chr1:223893587-223897272HCT-116
SE_34979chr1:223893945-223896369HeLa
SE_36294chr1:223892209-223896197HMEC
SE_37129chr1:223886879-223896561HSMMtube
SE_38254chr1:223892197-223897487HUVEC
SE_38957chr1:223892076-223894679IMR90
SE_38957chr1:223894705-223896262IMR90
SE_41495chr1:223892178-223896347Left_Ventricle
SE_42269chr1:223892060-223896221Lung
SE_44530chr1:223892152-223896327NHDF-Ad
SE_44904chr1:223892205-223896189NHLF
SE_45872chr1:223889824-223896323Osteoblasts
SE_49408chr1:223892167-223893562Right_Atrium
SE_49408chr1:223893604-223894625Right_Atrium
SE_49408chr1:223894922-223896214Right_Atrium
SE_50365chr1:223893595-223896281Sigmoid_Colon
SE_51879chr1:223892369-223896155Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_53249chr1:223893884-223894596Small_Intestine
SE_53249chr1:223894745-223896091Small_Intestine
SE_55958chr1:223886755-223897239u87
SE_63671chr1:223892313-223896169HSMM
SE_64794chr1:223894664-223896174NHEK
SE_65644chr1:223893499-223896161Pancreatic_islets
SE_67677chr1:223886755-223897239u87
SE_68376chr1:223892363-223922876TC32
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I223704chr1223892008223897501
Enhancer Sequence
CTTGCTGATG GGAATTATGG ACGGGGCCAA CTCCTCTCCC AGCACCCTGT GGTGCTGACA 60
TCTGAGGTGA TCACTTCCCA TGGAGTGGAG AAAAGCATGC TGCTCTATAT TTGTTCCCTA 120
CAACAGGAAG CGTGAAAACA GGATTTGCTG CCACATGTCA AGTACTCATG TGCCTGTAGA 180
AGAAAGGGGC CATTGCTGCT GATGATAACA ATGATAGCAT CTAAGGTTTT ATAGTTCCCC 240
AAATAATTTC ACATACACTG TGATTTGATG CTTATAACAA CCGTGTGAAC TATGCAAAGT 300
AGGTATTATT TCCCCATTTT AAGAGATGGG AGAATGGATA GTTAGTATTT TGAAAATTGC 360
CAGACCCCAC ACTTATAAGA CTACATGTAT TATTAGTAAA ATTACTACTA GGGGACCCCA 420
GCTATGAAAA CCTCTCTGGG AGATAGCACT GGTGGGTGAG GGGCAGCAGC TTCGGCTCTT 480
GCCTCCTGGC AAGGGTGGGA TGTAATACCC TAAGCTCCAA CAGACTGGGG AAAGAGAAGG 540
GGCTTAGAAA ACTGTCTGGG CTGCTGGATT TCTTTCCGGA GTTTCCCTCT CTCCTTCTAC 600
TGTCAGCACG TCCCATCTTT TGCAACACCA GGGAGAAGCC TTTCCATGCC TCTTCAGCTC 660
TTGGAATCCC TCCAGAAGCC CCCTCCCTCC TGAGTGGCAT CTAACAGGCC TGTCCAATAC 720
TCATGCTACA GCTATGAGGA AAGAATAAAC CCTGCAGCTG CTTCAGAAGA GAAAGAAATC 780
TCTTTTCAAA TGAAACCGTT TTTTGCAGCC CTGTGGAATT CATATTCTCT GTGATCTCCT 840
TTGGATTCAA ATCACGGACC TGAAAGAGGG AGGGGAAGAA AACAGGTTCT TTTCCTCTGC 900
CTGGGCCTGC CGTTCCCTCT GCCCTCCTAC ACTGGGTATG GACAGACCCC AAGGGACCAT 960
GGTCTAGGTG TTGGCAGCCA GGCTGGCTCT ACAACACAAC ATGTCAGCTG CTCTGCTGGG 1020
CCTCTGTTTA CTCATCCATT AAATGAGGAG ATAAGATCTC CCTTGACTGG CTGTGAAGAT 1080
TAAGTGCACA AATATGTGTA AAGTGCACAA ATATGTCAAA TAAAAACTGA GACTGACACG 1140
TGGAGGTGCA AAATTAAAAA GGAAGCTTTG GTTAGTATCT CCAGAACCTG GCTAGGCACG 1200
GTGGCTCACA TCTGTAATCT CAGCGCTTTG GGAGGCCGAG ATGGGTGGAT CACCTGAGGT 1260
CAGGAGTTCA AGACCAGCCT GGACAACATG GCGAAACCCC GTCTCTATTA AAAATACAAA 1320
AATTAGCTGG GCATGGCAGT GAGCCCCTGT AATCCCAGCT ACTCAAGAGG CTGAGGCAGG 1380
AGAATTGCTT GAACCCGGGA GGCGGAGGTT GCAGTGAGCC GAGATCACGC CACTGCACTC 1440
CAGCCTGGGT GACAGAGTGA GACTCCACCT CAAAAAAAAA AAAAAAAAAA TCCAGAACCT 1500
GCAGATTGTG CCTCTGATGC ATCTCAAACA TCCAGGGCCA GGGAGAAAAT AATCTAAAGA 1560
AAAATACTAC TGAAAAAGAT TCCATTGCCA TGGCCCTCTG AGACACACAC ATTCTTATTC 1620
TCTTATTTTC TCTCTCTCTC TCTCTTCTTC TCTCTCTCTC TCTTTCTATC TCTCTCTCTC 1680
ACTCCCTCTC TCATTTACTC ACAAGGTCAG TGGCCCAGAC CCAGGCAGTT CTGGATAATC 1740
CCAGCTGTTT CTGACTCACC ACCATCCTCA GGGCTGGCTG ACTCACTCCA GGAAGGTTTT 1800
CCACCATGAA 1810