EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-02270 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr1:156457550-156460300 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
Number of super-enhancer constituents: 77             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
GAGGCCTGGG CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA 60
TTCTTCTCCT GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG 120
GCTGCTTCTC TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG 180
GGAGGACTTG GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG 240
GCCCCAGGGC CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT 300
ATCTATGTCA CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA 360
TTCACCTGAC TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG 420
GGTTGGGACA GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG 480
GACATTTGGC AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA 540
ACTACAGGGC ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC 600
CCAGAGAGGG AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC 660
TTCACAAATG GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC 720
AAAGAGAGCT GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA 780
ATCCCAGGTA CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC 840
ATGATGTGCA AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC 900
AGGTCCCTGC CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT 960
CGGGTTTCAG AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA 1020
GAGCGGTGAA GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG 1080
CTGTCCTTCC CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT 1140
TTCTTGCTCT TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA 1200
TCTGTTCCCA TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG 1260
CTCCCATACC AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT 1320
CGCATCACAG AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA 1380
TTAGGCAGGC CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA 1440
GGGGAAGGCA GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC 1500
TGGGCTGCAG GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA 1560
CCTGTCACCC CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG 1620
TGGGTGAGGC AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG ACACAGGAAA 1680
GATGACAGAG AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG GCAGAGACAG 1740
ATAAGGAGAG GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA GATTCAGAGA 1800
GAAGCAGGTA GAGAACAAGA GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA CTCCTGGCCC 1860
AGCGCTGGGG GAATAACTCA ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT TGCAGTGCAG 1920
CCAAGAGACA GACAAGGGAG GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG 1980
GGGCCCTTGG GGGCCTGGAC TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG 2040
GCAGGCCGGC CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG ACAGCTGCCC 2100
AGCTGAATCC CCAGGCCCTG CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC AACCTTCCTA 2160
GTCATTCTCT CTTCCAACTT CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG ACACAGGCTA 2220
AGGAGCTCTG GGAGACAGGG CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA CACCCAGGCA 2280
AGATGGTCCA GGATCATTCT GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA AAAGAAGTGG 2340
GGGGCATTAC CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC CCTCTCCCCA 2400
TCCCACACAC AGCCCAATTC TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC 2460
TCCTGGGCCC CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC 2520
CGCCCCCTCC CACAGCAGCC TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG GTCTGATCTC 2580
AAAGGCAGAG ACCCAGCCCC AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA CTACCCAAAT 2640
CCCTGGTTCC CACCGTCTTT CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC 2700
AGGGCTGGGC AGGGGCTATT TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 2750