EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-01050 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr1:39605440-39609820 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:39608709-39608721AAACAAACATTT-6.27
RORA(var.2)MA0072.1chr1:39608627-39608641CTGACCTACTTTTC-6.66
TBXTMA0009.2chr1:39607083-39607099TAGCATATAGGTGTTA+6.01
TBXTMA0009.2chr1:39607083-39607099TAGCATATAGGTGTTA-6.07
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00416chr1:39607432-39609721Adipose_Nuclei
SE_02052chr1:39608108-39608826Aorta
SE_25799chr1:39606480-39609540Duodenum_Smooth_Muscle
SE_32006chr1:39608179-39608893Gastric
SE_35822chr1:39605780-39609757HMEC
SE_36947chr1:39605532-39611756HSMMtube
SE_42256chr1:39607415-39608945Lung
SE_42256chr1:39608965-39609690Lung
SE_45768chr1:39607341-39608639Osteoblasts
SE_47164chr1:39606982-39608398Panc1
SE_51765chr1:39606612-39609191Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_54583chr1:39606659-39609601Stomach_Smooth_Muscle
SE_63563chr1:39606612-39609205HSMM
SE_64261chr1:39605649-39609602NHEK
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr13960951339609564
chr13960680039608800
chr13960926939609360
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I039139chr13960551239609683
Enhancer Sequence
CTTAAAAGTA ATAGTAATAA CTGACAACAT TCAGAGTCTG TTACAAAATG TTTTCACATG 60
TATTAGCTCA TTGGAACCTC ACAGATGTTT TTCATCACTC CTGTTTTACA GCTGAGGAAA 120
TTAAGGCTTA AGGAGATTAA GTAACTTGCC TGAGGTTACC CATAATTAGA ACTAAATCTT 180
TTTTTTTTTT TTTAATTTTT TTTAGAGACA AGGTCTTGGC TGTTGCACAG GCTGCAGTGC 240
AGTGGTGTAA ACATGGCTCA CAGCAGCCTC AAACTCCTGG GCTCAAGAGA TTGTCCCACT 300
CCAGCCTCCT GAGTAGCTAG GACTATAGGT GTATGCCACT ACACCCAGCT AAATTTTTGT 360
GTTTTTTGTA GAGATGGGGT CTCACTGTGT TGCCCAGGCT GGTCTTGAAC TCCTGACCTG 420
AAATGATCCT TCTGCGTTAG TCCTCCAAAG TGCTGGGATT ACGGGCATGA GCCATCATAC 480
CTAGCATAAA TCTAAATCTT ATGACCTCAA ATCCCATGTT TTTTCCACCA AACAGTGCTA 540
TCTTACGATT CTTATCACTT GCTACTATGG GTTAGAATTA CTTGTGTAAA TGTCACATCT 600
GGCCTACTAC TTTGTACTGT CCTTAGATGA AGAGTTAATG CCTTATTCTT TGTCTCTGAC 660
ATCCCATAGC ACAGAGTATT GCGTATAATA AGGCTTCAAT AACCATTGCT GAAAGGCTGA 720
CAAGTTGAAG AAATGTTGAT GAATGCATGT GTCTAGCACA GTGCCTCGCA CATAGATGCC 780
TAATAAACAT TTATTGAATT TAATTGTAAA ATGGATCAAA GACCATAGTT AATAAGAGCT 840
TATAGGGCAC TTAATAAGTG CCGGGCAACT GGGCACGGTG GCTCACGCCT GTGATCCCTG 900
CACTTTGGGA GGCTGAGGCA GGCGGATCAC GAGGTCAGGA GATCAAGACT ATCCTGGCCA 960
ACATGGTGAA ACCCCGTCTC TACTAAAAAT ACGAAAATTA GCAGGGCTTG GTGGCACACG 1020
TCTGTAATCC CAGCTACTTG GGAGGCTGAA GCAGGAGAAT CTCTTGAACC CAGGAGGCGG 1080
AGGTTGCAGT GAGCCGAGAT TGCACCACTG CACTCCAGCC TGGGTGACAG AGTGAGACTC 1140
TGTCTCAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAGTGCC AGTCACTGTT ATAAATGCTT 1200
TATGTCAAAT TAACTAATTT AATCCTTAGA ACCTATCTCC ATTTTACACT GGAGTAAACT 1260
GAAGAACAGG AGGGCATAGT GATTTGCCCA GGGACACACA GCTGTTAAGC AGCAGAGTTA 1320
GGTTTCACAA TTTGCTCTAG AATTCTCATG TACTCAAACA TTATGCTATA ATCAGTTGTT 1380
CATAATATTT TCACGCTGTT AAATTCCTCC TGAATGCCTG TCTGTCTTGG GTGTAGCTCA 1440
AAGAATGAAA AGCAGAAGCA GCATAACTTG TTGAATATAC TCTTGAGCCT GCGTCAGAAT 1500
CACCTGCAGG GCATGTTAAA ACACAGATTG CTGGGTCCCA TCCTCAGTTC TGATTCAGTA 1560
GGTCTGGGGT GGGGCTTGAG AAATTATATT TCTAACAAGT TCCCAGGAGA TGCTGATGCT 1620
GCTGGTCTGG GGACCACTTG GTGTAGCATA TAGGTGTTAA GAGCATGGAC TCAAGCTGCT 1680
GAGGTTTGAA TCTCAGCTCT GCCATTTATT AACTGAACTT GGGCAAGTTC TTGAACCTTT 1740
CTGTGCTTCA GTTCTCATCT GTAAAGTGTT TTACTGTTAC CACATATATC ATAGGATTCT 1800
GACGGAGATT GAATGAAATA ACATGTAAAG TGCTTAAAAT GGTGCTTGGT TTGTAGTAAG 1860
CATGCAGTCT TAGCTACAGT AATGGGGATA GGACATGTTT CTTGCCTTGT AGATTTTAGA 1920
GTCTAGTTAT TAGACTTAAA TCTAATAATT TTAAAAAGTA CAAATTCAGG TATTAGTTTA 1980
CATGGTTCTG ATTCTACCTT AGATTTGGAA AGATGAAATG CGTGTATCTT GGGGGATATG 2040
GTGGGTAGTG GGAGACCAGG AGGAGGAAAG GTACATGAAA CTAGAAGATA ATGGAAAGTT 2100
ATATAGTCAG AATTTAGAAA GGTTGGAATT GCCAGTGGTT TTGGTATTAT TACCTGAGAA 2160
CTTGAGGGAG ATAGAGGAAG GTGCCTGTGC TCTCTGTTTG CCAAAGAGAT AACTGACTCC 2220
TTTTCCCATT TCTCTTTCTT AGAGCTGGTA TCTGGTCTGC AGGCAGTTCC GGCAGCATTT 2280
GCTTTTTGTG GGGAACAGTG GCTAAGGAAG TGATTTGCTA CTGGCTTCAG AAGTTGGGCT 2340
CTGCTGCCTT TATCCTCCAC AGCTGCCTCA CATAGTTTTG ATTCTTCCTG AGAAAGGCAG 2400
TTGTTAGGTT TGGAAGTCTT CAGATTCCAG AGACAGCTGG ACAGCTGACC CTCTGGTAGC 2460
TATTTCCCAA ACTGCCAGCC TCCTGTTGCC TCATCTCCCT GGGCCCCTTC TTTTTTGCTT 2520
TGAAGCAATA TCCTATATTT AGTGAACTAA CCAATTTGAG GTTAGAGGAA ATTTGATGGG 2580
GGAGTCTCTC CCACCTTAAA ATCCTGGATG GATGGAGTAT TTGGGCCCAG GAACAAGATG 2640
TATCCTGTTA AAAAAAATTT AACACCTTCA TCAAGTATAC TCCAAATGAC AGCTTACAGT 2700
GCTATGAATG TACCTCTAGC TCATGGGTAA GGAGCAGTGT TTATTTTTGG GTGCCCTGAA 2760
GAAAATATTT GGGGGAAGGA GTGGGGAGAA GCTCAGGCAG CTCCATTTAT GGTTGAGCAA 2820
TGCTTGGTAT TCTACAGAAG GGACCATATG GACAGTGGAA GAGAGTTTAG CATTCTGATT 2880
GTTCACCTCT TGCTCCTTCC ATTCTGATGG CTAATTAGGG ACACCTCATT AGCTATCAGA 2940
GTGGAACAAG TATTTGCCAG GCTGACATGA GCCTCAGCCC TGCATCCTGC ATCTTCTGCT 3000
TTCCCAACCT GCTGAGTCAC CACCTAGGAA TGGCAGTAGC CAGGTTACCA CCTGGAGCAC 3060
CTGGAGCACT CTTGGCATAA TGCACTGTTG ACTGGTTTTG GTCTCCTAGA CACAGCTTGG 3120
GCCTCTCCAA GCCTGTTGGA GTGATAGGCT GGGTCTTAGC TCTCCTTCCA GCTTGTTCCA 3180
CAAGGCGCTG ACCTACTTTT CAGGGACAAT TAAGTGTTTG TGAGCAAAGG AAGGCGGTGA 3240
CCCGAGTGAA GGTGAACCAG AGCTGCATTA AACAAACATT TGGAGTCACT TTTTCTATCT 3300
TACACAGGAG GGCCCATCTC AGTCCAAATG GAATGGCAGA TCAGGCTGAT TGTGGTAGCC 3360
ACATTCTAGA TGCTTATCAA GATAGTCAAC TAACCCTTGA ATTTTTATTC TTTCTATCAA 3420
TGTACCTTAA TATCAGAAGT TACTTTTCAT AATCATTGTA CCCCTTGTCT GTGGGCTATA 3480
CGAAAAGATT TGGAAGCAAG TTGGGGCTCT TAGAGTGAAT TATTGATACA AGCTAGCTTT 3540
TGATATACCT TTTGGTGTAT CAAAGATACA CTTTCTGGTG GCAATGTCTG GTTCATTTGT 3600
AACATCTTGG AGAGGATTGG AATCTCTTTT CCTTTTTGTA TCAGGCCAGG ATAATAGGAT 3660
AGAGGAGAGG CCAGATCTGT AGAGAATGAG CAAGTGGCTT GTTTAGGGTT TCCTGCCCTT 3720
GTGAGGTAAG GGCTCAAGGA TTAGATTCAG TCTTTCCATT TGCAGTGAAA GGAAGTAAAC 3780
TCACTTTCCC ACCCTCATCC TGGAGGTTAC TTATGTTATT TGCAGACCCC AACTTCTGCC 3840
TCTCTGTTAA GTATACTTCT TATGCAGGTT GCCCTTACTG TTACATCTTA CCACTGGGGG 3900
AAAGATCCAA GGCTCTGGGA AGGACAGTGA CAGTTGTCCT ACATTGGCTA GTTTCAAGAC 3960
CCTGAGGGAA TTGCCAAGCC AGCAATTAGG CAATTTCTTT TTCTTTTCTT TTCTTTCCTT 4020
TTTTGAGATG GAGTCTTGCT CTGTCGCCCA GGCTGGAGTG CAGTGGCGCG ATCTTCACTC 4080
ACTGCAAGCT CCGCCTCCTG GGTTCACACC ATTCTCCTGC CTCAGCCTCC TGCCTCAGCC 4140
TCTGGAGTAG CTGGGACTAC AGGCACCAGC CACCATGCCT AGCTAATTTT TTTTCATTTT 4200
TAGTAGAGAT GGGCTTTCAC TGTGTTAGCC AGGATGATCT TGATCTCCTG ACCTCGTGAT 4260
CCGCCCGCCT CGGCCACCAA GGTGCTGGGA TTACAGGTGT GAGCCACGGC GCTTTTTTTT 4320
TTTTTTTTTT GAGACGGAGT CTTGCTCTGT TGCCTAGGCT GGAGTGCAAT GGCACGATCT 4380