EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS047-00272 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_placenta 
Coordinate
chr1:12512250-12515680 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RUNX1MA0002.2chr1:12515004-12515015CTCTGTGGTTT+6.14
Sox3MA0514.1chr1:12513684-12513694AAAACAAAGG-6.02
Number of super-enhancer constituents: 24             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00009chr1:12506389-12526105Adipose_Nuclei
SE_01743chr1:12511532-12515011Aorta
SE_03005chr1:12513269-12513663Bladder
SE_03005chr1:12513943-12515024Bladder
SE_15065chr1:12506299-12515319CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20910chr1:12506384-12515111CD8_Memory_7pool
SE_26086chr1:12513098-12515726Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26716chr1:12506659-12513255Esophagus
SE_26716chr1:12513330-12515524Esophagus
SE_28215chr1:12513081-12514952Fetal_Intestine
SE_29231chr1:12512885-12515007Fetal_Intestine_Large
SE_29871chr1:12514499-12515348Fetal_Muscle
SE_33776chr1:12506505-12516452HCC1954
SE_37319chr1:12513768-12518184HSMMtube
SE_39882chr1:12506572-12512625K562
SE_39882chr1:12512832-12515652K562
SE_41209chr1:12512181-12515171Left_Ventricle
SE_42647chr1:12511538-12515195Lung
SE_45864chr1:12513386-12516437Osteoblasts
SE_49026chr1:12513381-12515085Right_Atrium
SE_50544chr1:12513372-12515427Sigmoid_Colon
SE_51539chr1:12512592-12515650Skeletal_Muscle
SE_52815chr1:12513220-12515041Small_Intestine
SE_54847chr1:12512158-12515661Stomach_Smooth_Muscle
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr11251340412513748
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH01I012452chr11251265812518656
Enhancer Sequence
GACTGGGTGT GTAGTGGATT TGTACTTGCT CATATCGGGA CTCATTTTTC CTTCGTCTGA 60
ATAATCTGGA CCTCTATCTC CAGGCTTTAC TTGTCACAAG ACAGTGGGAG GATGGGATCA 120
TGAAGGATGG CCTGGGCCAG TCACTCCCTA CATGATGGTG TAGCTCTTTT GGGTATCTCT 180
GCCCTGTTTT GATGACCATC TTCAAAGTCA AGGACCTGGG TAAAATAGTG CTTCCAAGCT 240
TCAGAGAAGA GCAAGGCCAG AGGGCACCCA TGATGAGCAC CACTGGAATT CCCTCCCTCC 300
ACAGCCCACT TGTTTTCTGC TGTCTTTGAG GGAGAAATAA TGGCTGGGCA GGACTTACCT 360
TCCCACTGAG GTGGGGAATG GGGTAGAATT AAGGATGCCT AACTAAATGC CTCCATAGTA 420
AAAGGAGGCC ACATGCTTTA TGGTAGCCTG GATTCAATCC TCAGAGTGCA GTGAACTGGC 480
CCAGGGCCCT GCCTTTACCA CTGTATCCAT CATTTGGCTG GCTTTGGTTT AGTTTCTGTA 540
AAACGTCTTT CCCAGTAAAA TCTGATTAAC TACTCATCAA TACAGGTTTG GTTGGATCAT 600
AGATTTCAAC ATCTACTCAA GTTTTCTGGG TTCTCAAAGC TGTATTTCTA GGGGTGAAGA 660
CTTTTGTAAT GGTTGACTGT TAACAAGTGG CAAAGGACAA GTCCAGTTGG CTTGCATAAG 720
CAATTTTTTA TGGACAGAGA AACAGGAATT CAGACAGAAG TCCTACAGTA AGTTGAGATA 780
GGTGTAGGTA CCTTTCCATG GCAAAGGTCT TCATCTTACG GAAGAATCCA GCATTAGAGG 840
GAAGAGTGAT CTCTTAGGTC ATCTCATCCC ATCCTCCTTG GGTCAATACA TTGTCTTTGT 900
ATAGAGAACA CCCAGGACCC AGTTGGTGCT GGGGAGCTGA GGCTGCCACA GCAGACTTAG 960
TTGGAAATTA AGCTTTTGGC ATAGGCTCAC TCATCAACTT TGGATATTAA TTGATGGGAG 1020
TAGAAGAAGA GGGAGTGATA TTGGGTATTC TGCCTAGATT ATTCTCCCAT ATTCTCTTGG 1080
TGGGGGAGTA TTATAGGATT TTTAACTTCC TCCTAGTTAG CTGCCAGAGA TAGGTAAAGA 1140
GCACTTTACC CTATCTGTCT TCCAAGAAAG AGAATGTAAG CTCTTAGAAA GAATATAAGA 1200
GCTTGAGAGA AACAGGAAAG ACCTGAATAA GACCCTGAAT TGGCTGCGGT GCTCCTGGGT 1260
CTCTTCAGGT GGAGATGTGT CCCCTGGAGA CACACAGGAC ATGGGCACGC GTCACTTAAC 1320
TGTGGTTCTC ACAGCGTCTG GGGCACCAGA GAGACACGTT TTTGTCTGGA ACCTGAAGAA 1380
CGCTGGCAGC CTACATAATT CTAAACATAG CAGGCACTCT TATTGATTCT TTCCAAAACA 1440
AAGGTCACAT TTCCTTTCTG TGTAGTTTGT GTCCTGGGTT CCTGCTGACT GTTTTGTGTA 1500
TACGATTGTT ACCTTCTCAA AGAGACTGTC AGTTCTTGAG GGCAGGGTTC AAGGCTGCTG 1560
TTTGTTTGTG TTCTTCAGCA GTACCTAAAT CTGTCCTGGG CTCAGAGGAA GTATTTAGTA 1620
AAGACATTCT ACCTTGGGTT GTAGGTCACA CAGTGCCAGA GCTGGAAAGG ATTTTGGAAA 1680
TCGTAGAGTC CAACACTCTA ATTTTGTAAG TGGTACCACT CCAAAAACTT ACTTGGGAGG 1740
CTGGTGTTTA TCTGCTGGAA AGAGAGGATT TTATTATGTT AAACTATAGT GCAAATGACC 1800
ATAATTCTAA ACCTTTGACA GGCTTCCCTC AAACGCTGCA GGCATGTTCC TCCTTGGACT 1860
AGTAGCAGAG TAATAAGAAC AGTAAGAATG CTAACTAGAT ACCAGGCCCC CGAGCCATTG 1920
TCATGAATGC TTCCAGCCAC ATGACAAAGT AGGTACTCTG GCTATTCTCC AGATGCAGAG 1980
GAGGCTCAGA GGTAGGTGAC CTCGCTCAGG GTCATGTAGT TACCAGAATG GTCGAGGGAG 2040
GACTGAAGTT TGGTCAGATG CCCCAGCTTG TGGCCCTTCT CCTATACTGT GGTAACTCTC 2100
AGATGGGGTC TCTGACTGAA GCCACTCCTT AGTGATTCAC GGTGCTAGCT TTGCAGCGTC 2160
GTGTGGTGTT TCCAGTTGTC CTAAAGGAAG TTATTAATTT TCATTAACTT TAATTCTCTC 2220
ATTAGACAGG CAGTGATATG GAAGGCAAGG CAGAAAGCAA ACAAATAATG ATAGGGGTTA 2280
CATCTCCAGA AAGGTCAGGA ATCACTGCCC TAGGTTGTAA AATATTTGGA CTGAGTAAAA 2340
GGCATGAGTC TTCCCATAGC TTCTTCCAGG AACTGTTGCT TTACATGGAA TTGCTGCTGT 2400
GTTCACTAGT CCCTCTTCTG TGCCCAGAAC TCACTGTCAC ATGTGTCAAG AATCCTCATG 2460
ACTGAGGTTT CCAGGGCAGA TCTGATCTGT GTAACACGCA CCCTAACCCC CTTGCCAAAG 2520
GAGAATGAAA TAGGCCCCTA GATGGCCACC CAGTTCCTGG GCCTTCCAGG CAGGCAGCTT 2580
GCCTTGAGGC TTTCCCCTGA GCCTTGTATC TAAGGAACAT TCCTGTGAGT TTTCTAAGAG 2640
GTTAGTCCTG GGTCATTGGC ACTTAAACCA CTTGTTTTGG TAGATCCTTC CTGAGAAGGT 2700
TAATTATATA TTTGATATCC TTCTCTTTTT ATGCCTGAAT GATGAGGATA AGTACTCTGT 2760
GGTTTATTAA CTGTCACTTT AAACCTTTTC AGATTGTCTT GTGACAAAAC AGAGTTTTAT 2820
GTCCTTTTTA TCCCAGCTTT GATGGATGAG ACAGCTTTTC TGGTTAAAGT ATGCCAGGAT 2880
AAATAAAATC TCTGAATTGT GGAAAGGGTG GGTTTGCATT TGAAATCATG AGTTCAAGTC 2940
TGCCACCTCC TATGAACGGT GACCTAACCT GTTAATCTTT CCATCGATTT CGTTTTTGGC 3000
TTTTGACAAA TGGAGCTTGG CACCTCATAG GTACTCAGTA ATTATTGAAT AAATGAAAGA 3060
CAGCATTACT GGAGGGAGTT TGATGTCTCC AAATATTTGA TACCAAACCC TAAAGCAACA 3120
ATCTGACACA TTTCCTGTTT TGAATTCCAC TAATTCTTAG AGCAAAGAGC CTATGTTCTT 3180
ACCATGATAC AGTCCTGAAG CTCACTTCTC CCTCAAGACT ATTTTGTTAT ACCTCTGATT 3240
TTTTCAGTAA ATTTGGAGTA GTATTCTGGA AAGTGAATGT CATTAAAGAT TTTTAGTAGT 3300
TGCTTTGCAA AGCCTAGTGT CCTCCATTGT ATGCATCCCC CAATTGGTAT GTGTCCAGTC 3360
CTTTTGAGAA CCACTCAACC TGGGGCAGAC AGTATAGGTA ACTGCATTTA AAATATTTAA 3420
ATTTATTTAT 3430