EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS046-02135 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_muscle_leg 
Coordinate
chr1:156457200-156460300 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata1MA0035.3chr1:156459286-156459297ACAGATAAGGA-6.14
MEF2AMA0052.3chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.44
MEF2BMA0660.1chr1:156460264-156460276GCTATTTTTAGC-6.92
MEF2CMA0497.1chr1:156460263-156460278GGCTATTTTTAGCCT-6.68
PLAG1MA0163.1chr1:156459529-156459543GGGGCCCTTGGGGG+6.3
POU2F2MA0507.1chr1:156458371-156458384ACATGCAAATGAG-6.54
Number of super-enhancer constituents: 78             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156457065-156458145Adipose_Nuclei
SE_00337chr1:156458785-156462158Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156456670-156457855Adrenal_Gland
SE_00902chr1:156457886-156465033Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156458406-156465126Aorta
SE_02937chr1:156459147-156460802Bladder
SE_03183chr1:156456043-156465384Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156457206-156457660Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156457996-156458566Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156458577-156459023Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156459107-156459811Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156456452-156464992CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156456935-156461868CD3
SE_13485chr1:156456265-156458192CD34_Primary_RO01536
SE_13485chr1:156458238-156464737CD34_Primary_RO01536
SE_15064chr1:156456690-156463250CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156457379-156459814CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156457977-156460457CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156457236-156458338CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156458341-156459309CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17138chr1:156459405-156460421CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156455796-156465002CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156455595-156466497CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156456364-156463048CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156455831-156464221CD56
SE_21124chr1:156457099-156461742CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156458726-156460216CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156457256-156460201CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156458712-156461319Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156457788-156458281Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156458815-156460139Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156458742-156460751Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156458944-156461980Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156457546-156463758Esophagus
SE_28187chr1:156458987-156460424Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156458941-156460473Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156457385-156464605Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156457284-156462277Gastric
SE_32703chr1:156456813-156464850GM12878
SE_33523chr1:156455889-156465173H2171
SE_37054chr1:156457835-156464275HSMMtube
SE_38176chr1:156459372-156461851HUVEC
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156458508-156459348LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156459756-156461387NHLF
SE_45962chr1:156459159-156461844Osteoblasts
SE_46671chr1:156458747-156461587Ovary
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_49466chr1:156457509-156462281Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156459182-156460267Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156456590-156465184Small_Intestine
SE_53429chr1:156457271-156464857Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156458029-156461282Thymus
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156459121-156461353HSMM
SE_65297chr1:156456555-156461791Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1156459000156459400
chr1156458442156458923
Enhancer Sequence
CCAGAGGAGG AGATGCCCCT GTCTTAGGCA GTCCTTCCTC CCATCTAACC ACAAACCCCT 60
CTACAAAGCA GATGCAGTCT ATACTGACCT TTTTTCCTTC TGCTATCCAT TCCACATTGC 120
TGCAGGGTCT TTGAAAGCCC TGAGGCAAGA ACATGAACTC AACCCTGATT TTGGAAGAAG 180
GGGTAGCTGG GGCCTAGGCA GGCACAAAAT ACCCTAACCT GACCCTATCC AAGGTTTGGA 240
GGCCTATCCT AGCTAAACTT CCCTCCTACC CAATTAGGGA GGTTTTAATG AACACCTGGA 300
CCTCCTTAAT TAGCCCTCTG CCTAATTACC TAACCAACTG GCAGGAGCCA GAGGCCTGGG 360
CATCTGTTCT CCAGATGTGA GTCTCTCCTC TCCAGCCTCA CCTGGCCCCA TTCTTCTCCT 420
GTCTGGTCTA CTCCTCCTCT AGGAAGCCCT CGCAGATGAT CCGGCCCTTG GCTGCTTCTC 480
TTCTAACCAT CTCTCCTTCA CCCTGCCTAG TATCTGGAGC CCAGGGCTTG GGAGGACTTG 540
GGCTACCAAA GAGACAGGGG GTTGGCCAGG ATGGCCTTCC TGTTCTGATG GCCCCAGGGC 600
CTGCCCAATC CTGACCTCAG GCCACAACTA TGACTCCTCG GGCTGACAGT ATCTATGTCA 660
CCAAAAGTTC CCCTTCAAAG GCTCTCAAGG CTCTGGCTGA TTGACTCTGA TTCACCTGAC 720
TCCGTGGACA GGACAAGGGT GGGGCGGAGT GAACCTTGTG GGTGGCAGGG GGTTGGGACA 780
GGCAGAGGCA GGGCCTTCCT GGTGGACATG GGAGAAGCAA AGATGGGCAG GACATTTGGC 840
AATGCCCACC CATATCTGTT CCCATCCTAG TGGTCCCAAG GCTCAAAGAA ACTACAGGGC 900
ATCTGCTTTC AAAGCTCCCA TACCAGCACA GGTCAAAAGG GAGCAGATGC CCAGAGAGGG 960
AAACAGGCAC AAACTCACCA ACTGTGGAGA AGGGTGGCTG AGGAGAAGCC TTCACAAATG 1020
GACAGCAGGG AGGATGCAGG GCAGGAGGCC CCTCTGACAA CACCCTTGAC AAAGAGAGCT 1080
GAGGGGACCA GGGGGAATCA AGAAGGACCC CACTGATAGC CATTTTTCCA ATCCCAGGTA 1140
CCGACCCAAT TAGAACTTGT GGGTTGTGTT TACATGCAAA TGAGCTACAC ATGATGTGCA 1200
AAATGTACCG TAAAGGAGGA CTGGTTTGGA GGGGGCATGG GAGAAGAAAC AGGTCCCTGC 1260
CTCCCCCAAT GCAACACCTC TGGGTACCTG AGCAATATTC AAACCATTCT CGGGTTTCAG 1320
AATGATGCTA TCTCAGTTCC TGTGTGAAGG TGGCCTGGGG CCAGTGGGGA GAGCGGTGAA 1380
GGGGAGAGGT CAGGGTAGCC TCCTTGCAGC TGCAGCAGGG CTGAGCAGGG CTGTCCTTCC 1440
CATGGAGCTG CAGGGGAATT CCTTTCCGAT AGCCAGCCTC TATCCTCTCT TTCTTGCTCT 1500
TGGCAGGGGA GTACCTACCT GTCCTTCTCC CCTACACCCT TCCACCCATA TCTGTTCCCA 1560
TCCTAGTGGT CCCAAGGCTC AAAGAAACTA CAGGGCATCT GCTTCCAGAG CTCCCATACC 1620
AGCACAGGTC AAAAGGGAGC AGATGCCCAG AGAAGCTGAG TGAGCAGCCT CGCATCACAG 1680
AGCAGTGGGC CTCAACCTGC TCTTCCTCAT GGTGAGAAAG GGAGCTCTCA TTAGGCAGGC 1740
CCTTCATCTC TTCCTCCCAG GCTGCTCCGG GCTGCAGGCT GAGGACTGGA GGGGAAGGCA 1800
GGAGGCGCTG GAGACAGCTG TCATCCCTCC TCCCGCCCCT TCCCTGTGGC TGGGCTGCAG 1860
GGCATGAAAT AAGCAGCAGG CGCTGGGGGA GGGGGTGACA ATCCAATCCA CCTGTCACCC 1920
CCACAGTCAG GCAGCCTCAA GCAGCCTGCT CACTAACGAG GGAGGAGGCG TGGGTGAGGC 1980
AGACACAGAA GAGGGTGGCA GAGGGGGGAC AGACACACAG ACACAGGAAA GATGACAGAG 2040
AAAAAGAGGC AGCGAGGCCA GAAGGCATTA TGGGGCAGAG GCAGAGACAG ATAAGGAGAG 2100
GGCTAGAGGA GAGGGAGAGG CAGGAGACCA CAGAGACAAA GATTCAGAGA GAAGCAGGTA 2160
GAGAACAAGA GACAGGTTCA ACAACGGCTT CCAGGACTGA CTCCTGGCCC AGCGCTGGGG 2220
GAATAACTCA ACAGGACACC ATCCCTGCCC TCTGAGAACT TGCAGTGCAG CCAAGAGACA 2280
GACAAGGGAG GGGCAGGTCC CACCCAGGGC AAGGGCAGGG AGAGGCAAGG GGGCCCTTGG 2340
GGGCCTGGAC TGGACCCAGA CACAGCCCCA GAAGGAGCAT CCCAGAGCAG GCAGGCCGGC 2400
CCTGAGAGGC AGCAGAGGTG AGGACCGAGG ACCAAGGACG ACAGCTGCCC AGCTGAATCC 2460
CCAGGCCCTG CCTTATTACC CAGTCTACCC TCAGGTTCAC AACCTTCCTA GTCATTCTCT 2520
CTTCCAACTT CAGCCCTGGG ACCTCCTCCC TAGTACAGAG ACACAGGCTA AGGAGCTCTG 2580
GGAGACAGGG CAGGAAGGTG AAGCCGGTGA TGCCCCCAAA CACCCAGGCA AGATGGTCCA 2640
GGATCATTCT GTGGTTCACA CAGTGAGCTC TTCCTTCACA AAAGAAGTGG GGGGCATTAC 2700
CCCTCCGAAG TCTGAGCCAA GGCAGGAGCC TCACATTGTC CCTCTCCCCA TCCCACACAC 2760
AGCCCAATTC TCACAACCCC TCCTGCGAGG CCTGCTCCCC ACGCCCCTAC TCCTGGGCCC 2820
CTCTCGGGTC TCCTTCTCAT GCTCCGTTCC CTCTGCCCCC TCTCTGTCCC CGCCCCCTCC 2880
CACAGCAGCC TCTTTTCTTC ACCCCAGAAG TGCTTCTAGG GTCTGATCTC AAAGGCAGAG 2940
ACCCAGCCCC AACCCTTCAA AGTTCTGTCT GGCAGGCTCA CTACCCAAAT CCCTGGTTCC 3000
CACCGTCTTT CCCTCCCTCG GGGACTCCCC TCCCCCAGTC CAGCAGCCTC AGGGCTGGGC 3060
AGGGGCTATT TTTAGCCTGG GCACTGAGCT AATTTTAACT 3100