EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS044-09838 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_kidney 
Coordinate
chr4:87934870-87937470 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE40MA0464.2chr4:87935871-87935881ATCACGTGAC+6.02
Lhx3MA0135.1chr4:87936011-87936024AAATTAATTAGTT+6.29
TFEBMA0692.1chr4:87935871-87935881ATCACGTGAC+6.02
ZNF263MA0528.1chr4:87936389-87936410TCCCTCTCCCCTCCAGCCTCC-6.24
mix-aMA0621.1chr4:87936012-87936023AATTAATTAGT+6.62
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00044chr4:87925917-87937753Adipose_Nuclei
SE_04495chr4:87934936-87936066Brain_Anterior_Caudate
SE_09301chr4:87934672-87937396CD14
SE_13996chr4:87926459-87937391CD34_Primary_RO01536
SE_25464chr4:87934337-87936990DND41
SE_25899chr4:87932204-87937369Duodenum_Smooth_Muscle
SE_28182chr4:87931936-87937655Fetal_Intestine
SE_29054chr4:87925927-87937753Fetal_Intestine_Large
SE_40923chr4:87934617-87935863Left_Ventricle
SE_42369chr4:87934617-87935834Lung
SE_42369chr4:87936913-87937386Lung
SE_48291chr4:87934624-87935658Psoas_Muscle
SE_48291chr4:87936975-87938104Psoas_Muscle
SE_48846chr4:87935132-87935698Right_Atrium
SE_50046chr4:87934397-87937133RPMI-8402
SE_50812chr4:87934367-87935781Sigmoid_Colon
SE_51125chr4:87934467-87937513Skeletal_Muscle
SE_53707chr4:87934702-87935718Spleen
SE_61878chr4:87918796-87966556Toledo
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr48793544387935912
chr48793637787936444
chr48793675687936864
Enhancer Sequence
AATAAAAAGT AAAAGGCTAT TTTAGGGGCA ATATGGTCAT ATGAGGTTCA GGGTTCTCAA 60
ACTTGATTAG ACACAAAAAT CACCGTGGGT GCTTGTTAGT ATGCAGATTC TGCTCCCCCT 120
CCCCCAGAGA TTCTGAATGG ACAGGTTCTG GGTGGAGCTC TGCTGTCTGT AAGGCCAGGG 180
GCGCAGGTAC CATGCTTTGT GAGATGGTGC ATGTGTGAGT GAGAGAGATC ATATAAACCA 240
TGTTGTATGA TGCTATTAAA TTTTGATATC ATATATGCTT ATAAATACAC ATTTTTCCCC 300
TCCTATTGAA ACAGACTGGA GGTTGGTAGA GAAGGTGGAT ATCTACGTCC ATAAAATTTA 360
TCCTTATATT ACAAACTGTT GGTTGAAATA TCCAAATGCG TCTGTGTTAA AAAAAAAATT 420
AAAAGATACC AAGAAGCAAT TCCCAGTGTT TGATCATACA GCACCTTCCC AAGAATTGTT 480
TCTTCTCAAG GAGCAGGGTA TTTAATTTAC TTTTTTCCAT GCGTTGTGGG CTCCCTCCCC 540
AGTTAGAGTT AACTGCTAAG TATCTCTCTC TCTACCACAC ACAGCCCAGT TTACCAGGTG 600
GCAGTTGTTT TTGTTCCCAG GGAAAAGTTA AAATGGTGTG AATTGGTCAG TTTTGTCCAA 660
ACTTTGTGAA ACCGAAATGA AAGTTTTGTT TTTTAAGAAA AGCTTTGCCT AGGGGTACTG 720
CTGAACAAAT AATGTTCAAC AAGACATTTT AAATGGAACT CCTACTGGGA AGTAAATGTT 780
AAAATTATAG CAGATGTCAC TTCCTGTAAC AAAATTCAGG AAACAGTCTT TGGTATGTGG 840
GTGTTGTAAC TTTTCAATTT TTGGAACTTT CCTTCAGGAA ACTGTCCTGT CAGAAGCAAA 900
GCAGTCAATA AAATATGAAG CACAACTTAA ACTATGTTAT ACAGTGTAAT TAAATTTTGA 960
TTTGGTGCAT ATGTTTTTGT GGTCAAGACA GACCCAAGAT TATCACGTGA CTTTCATCCT 1020
GGATAATGTA AGTCTGGATA ACTTGTTAAA TTGCTTCTCC CCCACTTCTC CCATTCTGGT 1080
TACTTTAAAA ATACAGGTGT ATCTGATTTA CTCTGGACTT GAATTTATGG AAAGTGGTAT 1140
AAAATTAATT AGTTCTCATT GTTTTGTACA AAACTATGAA ACCTGTTTCC TCCCTAGCTT 1200
TGCAGAAATT TTGTCTCAAT TGACAAACTG TCTACCTTAG ACATTTCTAA GATGGCCTAT 1260
TTAGTAAGTT GGTAGCTTTG AGCTTTGATA AAAGTTTGAG TCCATGATAT TATGGTTTAA 1320
GAAAATTTTT CCTTAAAGGA AAACAGAACG TGTTATTGAG TTAATATTGC TGGGTTTTAG 1380
TTGTTGTTTA TTTGCTGAAA GGATAGTCAT TGGTATAAAG TAAGCTAAAG CTCTGTCCTT 1440
TTATATTTTT TCAGGTAATT TTGACCTAGC AATTACAGCT ATAGGAATGT TTTCCTGTTA 1500
CTCATTTACA GTCTGTGTCT CCCTCTCCCC TCCAGCCTCC TTTTAGAGTT AAGACGGTGC 1560
TAACTCTCCA TTTAAAAAAG TGTGTAAAAA ATAAACTTTG TACCACAGGG GAAAAATTAG 1620
GCAGTAACAT TTACTGGCAT TAGAATAGCA AAAGGATAAA ATGAAACCTA GTGTATTACC 1680
TTAATACATA ATTGAGGTTT TGCAACCTAA AAATATTGGA AAGAATTATT AATGTTGTTC 1740
AGATTGTCTG CTTATCTTGT GACTTGGTTT TAGTAAAATT CAAAGTGCCA CTGGAACTTA 1800
GTTTTTGTTT TTAAATGGGA ACTATGCCCA GAAGATGAAA AGTCCTAGGT TGGCAGTTAG 1860
ATTGAATTTG ATAATTCTGT CACTGCTGAT GGTGTGAGTT TTTTATTTGT TCTTACCCTT 1920
AGGGCAGGGA GGGGCCTCCT CTTAAAAACA CCTTCATTTC TTTCTTATTT TAGCAGTCAT 1980
GTTTCTTTAA GGGTAAAGTA AAAATCATTA GGTTTACTTA ATTCTGAGTT TAAATTTGTA 2040
GGCTTTATAA AAATTCTTGA CAGTTTATGA TAAGCCTAGC ATAAAACTTC GTTTTCTCTC 2100
TGAGGTCACT CGTATTCTGT GTTGACATCC TTAAAGTATT GGTATTATCC ATGATCTTAG 2160
AGTGTTTTAA AGAATGAAGA AGTCGGGCGT GGTCGCTCAT GCCTGTAATC CCAGCACTCT 2220
GGGAGGCCCA GGCAGGCGGA TCACCTGAGG TCAGGAGTTT GAGAGCAGCC TGGTCAACAT 2280
GGTGAAACCT CGTCTCTACT AAAAATACAA ACATTAGCTG GGCGTAGTGG CAGGTGCCTG 2340
TAATCCCAGC TACTCGGGAG GCTGAGGCAG GAGAATTGCT TGAACTCGGG AGGTGGAGGT 2400
TGCAGTTAGC CAAGATCATG CCGTTGCACT CCAGCCTGGG CGATCTTTTG GTAGCTTGGT 2460
GTAAATGACC TTTTGTGGGG AAAGAGGGAA GAGGGGAATA GTTAAATTGA ATCGAGGTAC 2520
GTTCCTTGTC ACCCAGATCT TTTATATCTT TTGTTATATC TCATTTTATG GGTATTTCTT 2580
CCCAGCCCAA GTTTTTGTAA 2600