EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS044-08182 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Fetal_kidney 
Coordinate
chr20:52237860-52241140 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr20:52238760-52238772AAATGTTTGTTT+6.27
GATA2MA0036.3chr20:52240272-52240283TTCTTATCTCT+6.32
Gata1MA0035.3chr20:52240272-52240283TTCTTATCTCT+6.32
Gata4MA0482.1chr20:52240273-52240284TCTTATCTCTT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 67             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00202chr20:52237156-52241471Adipose_Nuclei
SE_01520chr20:52238267-52238857Adrenal_Gland
SE_01520chr20:52238925-52239488Adrenal_Gland
SE_01520chr20:52239856-52240832Adrenal_Gland
SE_09307chr20:52237363-52241404CD14
SE_10450chr20:52237455-52240853CD19_Primary
SE_11048chr20:52237331-52241305CD20
SE_12021chr20:52237840-52241019CD3
SE_12932chr20:52237750-52238967CD34_Primary_RO01480
SE_12932chr20:52239664-52241147CD34_Primary_RO01480
SE_13374chr20:52237409-52241390CD34_Primary_RO01536
SE_14131chr20:52237663-52241007CD34_Primary_RO01549
SE_14425chr20:52237382-52241210CD4_Memory_Primary_7pool
SE_15956chr20:52239385-52240739CD4_Naive_Primary_7pool
SE_17516chr20:52237410-52241228CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_17991chr20:52237602-52241215CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18376chr20:52237342-52241357CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19367chr20:52237855-52240963CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20514chr20:52237768-52239682CD56
SE_20514chr20:52239693-52240942CD56
SE_20778chr20:52237388-52241244CD8_Memory_7pool
SE_21595chr20:52237812-52241086CD8_Naive_7pool
SE_22055chr20:52237595-52241150CD8_Naive_8pool
SE_22608chr20:52237749-52241006CD8_primiary
SE_23631chr20:52237850-52239604Colon_Crypt_1
SE_23631chr20:52239767-52240926Colon_Crypt_1
SE_25474chr20:52237191-52241350DND41
SE_25863chr20:52237336-52241223Duodenum_Smooth_Muscle
SE_27064chr20:52237821-52239682Esophagus
SE_27064chr20:52239713-52240873Esophagus
SE_29954chr20:52237594-52241160Fetal_Muscle
SE_31207chr20:52237595-52241203Fetal_Thymus
SE_31876chr20:52237314-52239695Gastric
SE_31876chr20:52239698-52240860Gastric
SE_32501chr20:52237391-52241368GM12878
SE_32761chr20:52238509-52241054H1
SE_33810chr20:52237233-52241121HCC1954
SE_34736chr20:52236978-52241296HeLa
SE_37291chr20:52237667-52241245HSMMtube
SE_38829chr20:52237315-52241210HUVEC
SE_39111chr20:52237629-52241045IMR90
SE_39554chr20:52237812-52241034Jurkat
SE_40005chr20:52237605-52241107K562
SE_43170chr20:52237991-52239568Lung
SE_43170chr20:52239672-52240870Lung
SE_43417chr20:52237820-52241285MCF-7
SE_43529chr20:52237407-52241209MM1S
SE_44298chr20:52237683-52241068NHDF-Ad
SE_45084chr20:52237345-52241027NHLF
SE_45865chr20:52237537-52241347Osteoblasts
SE_47117chr20:52235754-52241766Panc1
SE_49906chr20:52237830-52241183RPMI-8402
SE_50336chr20:52237567-52239590Sigmoid_Colon
SE_50336chr20:52239762-52241000Sigmoid_Colon
SE_52644chr20:52237369-52240934Small_Intestine
SE_53525chr20:52237239-52239656Spleen
SE_53525chr20:52239734-52240980Spleen
SE_55284chr20:52237847-52239493Thymus
SE_55284chr20:52239819-52240764Thymus
SE_55973chr20:52237803-52241183u87
SE_58388chr20:52194578-52305868Ly1
SE_60096chr20:52194891-52241355Ly4
SE_61672chr20:52194577-52244989Toledo
SE_62467chr20:52194714-52241390Tonsil
SE_64787chr20:52237763-52241096NHEK
SE_66461chr20:52237812-52241034Jurkat
SE_68377chr20:52196064-52241229TC32
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH20I053620chr205223694152242320
Enhancer Sequence
ACTTCAAGTG ATCTGCCTGC CTCAGCCTCT CAAAGTGCTG GGATTATAGG CATGAGCCGC 60
TGTGCCTGGC TGAATATTTT TACATAGGAA AACAAAAGAG AGAGAAAAAG AAAGACAATC 120
TCAATGCTTT TCTCAGAAAG AACAGGAAGC CTCAAGGAGG AAGTAGGTGA CAGTTTATTT 180
TTCAACAAGC ACACGTTATC AAGTGAATGA AATTCCTCTG GAAGCTATAA AATTGAAGAT 240
TGGAGGATGG CAGTGTTCAG ATAGCATGAA AGGTTGCTCA CTATTTAGGA ATTTTTTTCA 300
AAGCTAAGTT ATTAATGAAA GCCAATTATT TGCACTTTTC CAGAAGGAAA CACTGAGTCA 360
TTCATGAAAT GATCTAAGAT TTTGAAACTT GCTTACACCA TTTTTTTCCC CTCCTCCTTT 420
CTTACCTGTG CCAAAAACAG AAAAGCCAAC TACTCACTGG GGCCTAAATC CAGGGAGCCT 480
GCACCAAATT AGCTCAAGAC TGGAGTAATT TAACAGACTC GTGATGCCCC GAAGGCTTAG 540
GTCCTACCAG GATGGTAAAC TCTGAAGTGC CTCCATTGCC CCCGCAGGGT GCAGAGCACA 600
GGGGCCTGGT CCCCACCTCT GGAGGGCCTG TGATTAACTG GTTCTGGCTC AGTAATTATT 660
TAGCCATATC CCTGGACTGC CTCCAAGTTT CAAGTCGAAC AGCAAAAGGG CGTGGGCCCG 720
CAGATAGGCA GAACCGTGCT CCTAGGAGGC ATTACTTATT TACAGCCAGA TCCCTACGGA 780
ATTTGGCCAG AGATGGGATA CAGATGAGAA TGTGTTTGGC TAGGAAATAC TGACTTCTTG 840
ATGCATTTAT GGAAAGTTTG TGAGCTTAGG CCAGTAAACC ATGTCAAAAA CACAGTCAAC 900
AAATGTTTGT TTCAGGAATA AACTGTGAGT GAGGTGGTTT TAACCTAGGG ACAGCTTCAT 960
TCTGTTTCTT TCCTGGTGAG ACTATTTCTA GGTACTTTTT AAAAAACGTA CGTTGAGGCA 1020
AATTCACTAA GAGTCAAACC ACTGAAGTTT CTGGTTAGGC CATCAGTGGA AGCTGCTTAT 1080
TTCATCTTCA CAAACAACTG TAAGTCCATG TAGATAAATA ATGTAGACAA GGAAACAATG 1140
TTTTGATCCA AACAATACAG AAAAGCTTGG AATTGTGCCT CCTTAACGTA ACACCTTATG 1200
TTTGCATTGT TCTGTTAAAA GGATTTTACA GATACATTAT CTTAAAATGA CACTGCAAGG 1260
TACAGAGGGG AAGTTGAATG TCCCATTTCA CAGATTAGAC AACGGTGGCT CAGAGAGACC 1320
ATGACCTTCC GAAGGTCACA AAATTAGTAC ATTGCAAAGT CCATGCTTAA ATCCAGGGCC 1380
CCTGGCAAGA GTGCTGAGCT TGCCCCTTAC AAACCGGATC TGAATGTTCC CTTCTGTATA 1440
CCAGGACTCT GTGAGCTTAT GTCCTTTGGT TTTGCATTAA ACCTGAGCTT TTAGCTCCTA 1500
GAATTCACAA GGAATATTCA AGTCTATTTC CACTCCCTAC CTTGAAGCTC CTGGTCTGTT 1560
TTCACAACAG GGGATGTGCC TGTTTGAGAA GGAAGTGGTC TAGAGTCTGG TATTAGTGTA 1620
AAATGGCTTC CTCTTTTTCT CCTTGAATTT ATTCTGGTAG TATTTTATCC CAATACTCCT 1680
CCCCCGCAGC AAAAAAATCC CAAATTCTGC AACACAATTG AGGAACTTAA AAAAAAAAGA 1740
AAAGAAAAAC CTTTCTCATC CACTAAGATG TTACTAATGA TCACCAGTGA TTTTTAATTC 1800
CCTTTGTATA TGTGTGTATT TTTCAGCTTT TTTTTTAAAC AATGATATAG GGTGGGGTTT 1860
TCTAACATTT AGGGAAAAAA TTATTTTTAA AAAATCTCAT TATTTTTGTG TAATTCACAT 1920
GGTGTAATTC ACACAATGGG TGGTTATTAC TAACACCAGT AGGAAAAAAT ATCACAGGAG 1980
CTTCATGACA AATCCTTAGG CAGGGTTTAG GTCTCACTAA TTTAGAATAT GCCTGGTAAG 2040
CACTGGTTAA AAATTGATGA TCCCGGGAAG TCTTTCTCAA ACGATTTTTG TAAAATACCT 2100
AGGAGACCTT GAACTGTCTG TTACGGAGGT TTCCAATCCT GAGGAGAAGG ACGGAGGGTG 2160
GCGTTCACGA GGGATACTGC CTATTACTCA GCTTAAAGTC CCCTTGGCTC TGCCCTCCTC 2220
CTCCTCCTCG TGCTGCGAGC TGGGAGGAGT CAGCGTTTTC TCTCCCTAAC TGGCATTTTC 2280
ACTAGGCAGA ATACTTGTCT TTTGTGAACG TTTTCATTTT CAAGACATAT AAAAGAAAAC 2340
TTTGTTCTTT AGTAAGTGAT TTTCTCCCCC GACAGGGAGA GGGTTACAAA TCCCTCCCTC 2400
TCCAGCGGAG TTTTCTTATC TCTTATTTAC AGAGCAGTAG CCATTTTGGG GAGGGGGAAA 2460
AGTTGTCAGC AACTCACGTC CTAATAATGG CAGATATTTT TCTTAAGCCC TCACCATGTC 2520
CCAAGCACTC TCCCAAGAGT TTTACATGTA TTAACTCAGT TAATCCTTCC TAGAGCCTTA 2580
TGGTATACGT GCTATTAGGA TCCCGATTTT ACAGAGGAAG AGACTGAGGA ACAGAAATGT 2640
AAACTAACCT GCCAAGATCA CACAGAGGCT GGGATTAGCT CTCTGACCTC TGTCCCAGAG 2700
GCAGAATTTT TTTCTAATCT CACGAGTATA GGTGAAAGTC AGAGTCTCAT TACAGATTGA 2760
GACTGAACAG AAAGTTGGAA TCCATTGAAA AAGAGGTGTG TGACATTGAT CAAGGCCAGC 2820
ACTTTTATTT TTGCCCATTT ATACTTCCTT AAAAATCTAT GAGCCAACTC TGTTGTTACA 2880
ACACAAACAT GCAGTGGTTC CCTAGCCAGG TCAGGTCAGC TAGAAAATAC AACATACGCT 2940
CTTGAACAAC TAGATTTATT TCAACCCAAT TTTCAATGTT TATATAATTC AATTGTAAAA 3000
TGTTAAAACT TGGAGGATTT TATTCACCAG CTGAAGGACT CATAGTTACT ATCTTTAAAA 3060
ACAGCAGTGA ATAAGCAAAC TATAAACTAA CAAAAAAACC AAGCACAACA AAACAAACAG 3120
CAAATTAGGT TTAATCATAA TGCTTGGGAG AATATGTATT TGGCTTAATT ATATTTTCTT 3180
CTTTTTTTTT TTTTTTTTGA GATGGAGTTT CGCTCTTGTT GCCCAGGCTG GAGTGCAATG 3240
GCACGATCTC AGCTCACTGC AATCTCCGCC TCCTGGATTC 3280