EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS040-18452 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Esophagus 
Coordinate
chr19:39185140-39187650 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39187120-39187138GAGAGGAAGGATGGAAGC+6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39186290-39186308CTTTACTCCCTTCCTTCT-6.07
EWSR1-FLI1MA0149.1chr19:39187124-39187142GGAAGGATGGAAGCAGAG+6.35
ZNF263MA0528.1chr19:39186013-39186034CTTTTTGCCTTTCCCTCCTCC-6.12
ZfxMA0146.2chr19:39185143-39185157CCCGCCTCGGCCTC+6.01
ZfxMA0146.2chr19:39185758-39185772CCCGCCTCGGCCTC+6.01
Number of super-enhancer constituents: 56             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00117chr19:39182049-39186979Adipose_Nuclei
SE_00865chr19:39185510-39187918Adrenal_Gland
SE_01543chr19:39181993-39190228Aorta
SE_02408chr19:39181342-39185560Astrocytes
SE_03166chr19:39185728-39189384Brain_Angular_Gyrus
SE_03903chr19:39185394-39193508Brain_Anterior_Caudate
SE_04868chr19:39185423-39189876Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05805chr19:39182078-39206004Brain_Hippocampus_Middle
SE_06803chr19:39186740-39189302Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07777chr19:39185584-39193917Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_09404chr19:39182333-39191485CD14
SE_20249chr19:39181278-39188425CD56
SE_22709chr19:39182642-39186831CD8_primiary
SE_23062chr19:39185118-39185515Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39185726-39186655Colon_Crypt_1
SE_23062chr19:39186752-39190129Colon_Crypt_1
SE_23732chr19:39185140-39185416Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39185750-39186483Colon_Crypt_2
SE_23732chr19:39187149-39187658Colon_Crypt_2
SE_24739chr19:39185106-39185492Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39185730-39186728Colon_Crypt_3
SE_24739chr19:39187116-39190124Colon_Crypt_3
SE_25779chr19:39180965-39189795Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26525chr19:39180697-39193852Esophagus
SE_27614chr19:39180632-39201469Fetal_Intestine
SE_28533chr19:39164445-39201888Fetal_Intestine_Large
SE_29583chr19:39185825-39186549Fetal_Muscle
SE_31384chr19:39185422-39186593Gastric
SE_31384chr19:39186799-39187735Gastric
SE_34299chr19:39180509-39186508HCT-116
SE_35812chr19:39168616-39191950HMEC
SE_36926chr19:39172838-39186932HSMMtube
SE_38012chr19:39181151-39186650HUVEC
SE_40594chr19:39180727-39193965Left_Ventricle
SE_42097chr19:39180674-39193834Lung
SE_44161chr19:39181143-39185634NHDF-Ad
SE_44161chr19:39186536-39189303NHDF-Ad
SE_45660chr19:39180876-39186673Osteoblasts
SE_47114chr19:39164477-39226374Panc1
SE_47461chr19:39185655-39186661Pancreas
SE_47461chr19:39186840-39187168Pancreas
SE_48075chr19:39180646-39186770Psoas_Muscle
SE_48555chr19:39185073-39190229Right_Atrium
SE_50056chr19:39182445-39193963Sigmoid_Colon
SE_51136chr19:39181521-39186773Skeletal_Muscle
SE_51705chr19:39182066-39185548Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52339chr19:39180899-39193971Small_Intestine
SE_53291chr19:39181227-39190272Spleen
SE_54534chr19:39180651-39189737Stomach_Smooth_Muscle
SE_56725chr19:39185122-39189741VACO_400
SE_62811chr19:39125155-39186863Tonsil
SE_63494chr19:39182024-39185548HSMM
SE_64225chr19:39185744-39186682NHEK
SE_64225chr19:39186925-39190261NHEK
SE_65266chr19:39181937-39187543Pancreatic_islets
SE_68725chr19:39186614-39190205H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 5             
ChromosomeStartEnd
chr193918733839187648
chr193918644739186795
chr193918563039186442
chr193918682939186989
chr193918557039186200
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH19I038673chr193916453639206516
Enhancer Sequence
CCGCCCGCCT CGGCCTCCCA AAGTGCTGGG ATTACAGGTG CGAGCCACTG CGCCCGGCCC 60
TGGCTGGGGG CTTCTTGACC TGACTCTGCT GTCTCTCCCT CACTGGCCAG CACCTCCCAT 120
TCTACTCAGA CATCGTGGAA TGAATGCCCA CCCCGTGTTT GTATGTATCA TCTGTGTCTG 180
TGTGACATTA AGCAAGTCAC TGAACCTCTC CCTGCCTCAG TTTCCTCATC AAATGGAGAT 240
ATATCGCATG TGATCATGGG GTTGGAGGTT TTAAAGAGTT GCTAATGTGT AAATAGTAAG 300
AACTAGCAAT TAGCCGTTAT AGCATAATTA CCTTTAATAT GTCATGCCCC CCGCACCCCC 360
GTGCTGAATG TAATTTTGCG GGGGGGCGGG TTGAGACAGG GTCTGGCTCT GTCACCGAGG 420
CTGGAGTGCA CTAACACAAT CTCAGCTTAC TGCAACCTCT GCCTCTCAGG CACAAGCTGT 480
CTTCCCACCT CAGCCTCTCG AGTAGCTGGG ACTACAGGCG CTCAGTACCA CGCCTGGCTA 540
ATTTTTGTAG TTTTTGTAGA GATGGGGTTT TGCCATGTTG CCTAGGCTGA TCTCAAACTC 600
CTGTGCTAAA GCAATCCTCC CGCCTCGGCC TCCTAAAGTG CTGGGATTAC ATGGTGTGTG 660
CCACCATGCC TGGCTGGCCA GAATGTAAAT GATAACTGTT TTGCTTCCTC CTGTGTCCAG 720
TACATAATAG GGCTCCAAGT CAGTATTTGT GAGGCAGGTG CATGCCTCTT AGTTGCGGTC 780
CTGAGGGCAT GGCCACTGCC ACGTTCTGGA CAGTCAGAGT CGCTGCTGCC CCTGGAAGAT 840
GACCGCGATC ATGAAGCCCA GGAGAGCTCG ATGCTTTTTG CCTTTCCCTC CTCCCACAGA 900
GGGCTGGCAG CTCTGGTTCC TCCCAAATGA AATAGAAACC TTGAGTTTGC ATTTCTTCTT 960
TGGCGTGCCG GCAGGGCACC TCTGCCTTCC TCTTCCTGCC AGGGGGAGGA AGTTTCTCTC 1020
AGGGGCTCTT CACCCTGCTT TATTCCTGGC CATCACACAT TGACCCTTGT CCCCTTCGGC 1080
TCTTTCCCTG CATGGCAGGG ACAGCATGAC CGTTTAATGG CTTTGTGAGG CCAGCATGCC 1140
AGCCTCACTT CTTTACTCCC TTCCTTCTCG GAGTGGGCTC TGTCCCTTCT GCAGGAGGGC 1200
TTTGGCACAT GCTCTTCCCA GTATCTGGAA GGTCTCCCTC ATTTTTATCT TATTAACTCC 1260
TCATCCTTCA GCTCAGAGTT TGAGAATGAC TTCTTCAAGG ACACCTTTCT GTGTCTGCCT 1320
CACCAGTCGC TTGGTGCCCC CCCACCCCGC CACCATGCTG ACCGCACTCT TCAGCTCCCA 1380
TCCCAGGGGA GGTGACACAA ACTCGGCCCC AGGAGCCCAG CACCTGGCTT TAAACCCAGC 1440
TCTGTAACTT TCTAGGTGTG TGACTGATGG GAGCAAGCCA CTTCACCTCT CAGGCCCTCC 1500
GTTTCCTCAT CTGCAAAATG GAGGCAGTAC TAGCACCTCC CTCCAGAGAT GATTACGAGG 1560
GTGACAGAAT TAGTAAGTGA CCAAGTGCCT CGAGCAGTGC CCGCCCCTAG TAGACTCTAT 1620
GGAAGTGTCT GCTGCAGTTA TTGCTGTTAT TATTACCACT TTTCCTAAGG GCGTTATTTC 1680
TGGAGTGGAC TGATCGCTTG ATTAATGAGA TCAGACCTGG AGCCTCATGA GAGTGTCTGC 1740
TTTTGCTCAC TGTTATGGAT TCAGCACAGG GCCTGGCCCT CTGCTGACCC CCAGCATATG 1800
CTTGTCCAGA GAATGAATAT GTACGGACCC ATGGTGGCCT GGGGCATCAT GAGGTCGGCT 1860
GCCCACATTC TGAGAATTTT GCATGGTGGA GGGCGGCGTG GTGGGCGCAT AGGGCCCCCA 1920
TCTATAGAAA CCACCTCTCC ACACCATCCA CCCCACGCAG CGTAGTCTAA ACCGGGTAGG 1980
GAGAGGAAGG ATGGAAGCAG AGTGTTATTT TTGTAACCAA GTAGAAGAAG CGATGAATTT 2040
TTAATGTCCC ATTCGAACTC CAGCTCCTAC TCACCAGTCT CTCCGCATGG AGAAGTGGCC 2100
GTCATGGTCG ACCTGTTCCC AAGGGTGGCC TTGTGAGTGC AGGCTCTCCT CACCAGAGCT 2160
GAGGGCTTTG TGAACCTCTG ATGTCAATAG ATGCCCCTCA TCTTCCAGGA GGACAAAACA 2220
GGGCAAAGCA AGACATGGGG TGAGAACAGG AGTGCATCAG TGGGGTTCCC CAAGCCTGTG 2280
TCAGGTCCGG ATCTGGGTGG GAGTTCCCTT CTGCGTCATC CAGGCCAGGC GAGTGGGCAT 2340
CCTCCCTGAG CACCTGTGCT TGGGGCTTTG CCTGTGTCAG TCAGGAAGAC AGAGTACACG 2400
GAAGAGTTAC CATTGCTTTC AGAGCAAACC TTCCTTTGAC ATGCATTTAA CACAGCACGG 2460
AGTGATTGAC ATGTGTCCTT GTGTTTAATC CCTATCTTAA CCTCTCGGTT 2510