EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS040-12485 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Esophagus 
Coordinate
chr15:93344580-93345980 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr15:93345056-93345067CCACACCCTGC+6.62
Klf1MA0493.1chr15:93345054-93345065GGCCACACCCT+6.32
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr15:93345581-93345596TGAACTCTTGAGCTC-6.19
Number of super-enhancer constituents: 45             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00699chr15:93344490-93346258Adipose_Nuclei
SE_02552chr15:93344356-93346022Astrocytes
SE_04213chr15:93344683-93345364Brain_Anterior_Caudate
SE_09652chr15:93344405-93349641CD14
SE_13564chr15:93344856-93345607CD34_Primary_RO01536
SE_14477chr15:93344287-93346258CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20859chr15:93344392-93345551CD8_Memory_7pool
SE_23716chr15:93344676-93345274Colon_Crypt_1
SE_24264chr15:93344677-93345190Colon_Crypt_2
SE_26010chr15:93344365-93346231Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26840chr15:93344537-93345993Esophagus
SE_31921chr15:93344607-93345323Gastric
SE_31921chr15:93345424-93345935Gastric
SE_33848chr15:93344601-93346032HCC1954
SE_34564chr15:93343115-93346256HCT-116
SE_34679chr15:93343662-93356193HeLa
SE_36003chr15:93344258-93346223HMEC
SE_37354chr15:93343418-93348955HSMMtube
SE_39112chr15:93344631-93346007IMR90
SE_39970chr15:93344334-93346003K562
SE_41310chr15:93344648-93345967Left_Ventricle
SE_42600chr15:93344591-93346094Lung
SE_44673chr15:93344367-93346219NHDF-Ad
SE_45291chr15:93344417-93346229NHLF
SE_47211chr15:93343882-93346232Panc1
SE_48549chr15:93344612-93345404Psoas_Muscle
SE_49286chr15:93344682-93345409Right_Atrium
SE_49286chr15:93345529-93345957Right_Atrium
SE_50492chr15:93344610-93346025Sigmoid_Colon
SE_51268chr15:93344312-93346130Skeletal_Muscle
SE_52184chr15:93344640-93346256Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52822chr15:93344621-93345349Small_Intestine
SE_52822chr15:93345427-93346060Small_Intestine
SE_53626chr15:93344673-93345362Spleen
SE_53626chr15:93345397-93345907Spleen
SE_56153chr15:93344552-93346055u87
SE_57089chr15:93344656-93345260VACO_400
SE_57089chr15:93345539-93345975VACO_400
SE_58215chr15:93344670-93345184VACO_9m
SE_60705chr15:93340495-93393151DHL6
SE_61142chr15:93340330-93400291HBL1
SE_62387chr15:93344538-93393491Tonsil
SE_63974chr15:93344626-93346244HSMM
SE_64371chr15:93344611-93345614NHEK
SE_65898chr15:93344422-93345397Pancreatic_islets
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr159334499393345488
Enhancer Sequence
ATGCGCCGCC ACGCCCAGCT AATTGTTGTA TTTTTAGTAG AGACAGGGTT TCACCATGTT 60
GGCCAGAATG GTCTTGATCT CCTGACCTCA TGATCCACTC ACCTCAGCCT CCCAAAATGC 120
TGTGATTACA GGCGCGAACC ACCACGCCCA GCCAATTCCT TGGATTTAAG AGCCGACAGC 180
TGCGAGAACT TCCCTTCTGG CAGGCAAACC AACTCCAAGG CATGAAAGCC ACAGGAATGC 240
TGGGGAGATA AATGCAGGAA GACACAGGTC CTACTCAATG GCACCATCAC CCTGCACTGC 300
TGTGGCCAGG CCTCCAAGGT TCCCTGGCTC CTTCTTCCAG GCTGCTGAAG GGGACCCTGG 360
AGCACCTTGG TTGAGAGGAG TCCCTGCCCC AGCTTTCGGG GCACAGGCCC CTACTGTCCT 420
TTTCTGCCTT GTCTCTGGCC CTTCTCCCCT ATCTTCCAGC CACACCAAAC AACAGGCCAC 480
ACCCTGCTGC ACTCAGCTTT CTCCCACAGA CGTGTTTTTG CCGTTTCTCA TGCAGTAGCT 540
CACTGCCTGG AATGGGCTTC CCAGCATTTC CCCTAGAAAT TCCATTTGCT CTTCTGAATG 600
CCTTATAAGG ATCTCTTCTC CAGAAAATGT CCTTACTAAT CCTATCAGTT GGGGTTACCT 660
AGTCATCTCT CTACTTAGTG ATCAGTGTTC AAATCCTGCT TCTCTATACC AGCTCTGTGA 720
GGTTGAATGA GCTATTCCAT CTTTTCTGTC TAGGTTTTCT CATTTCCTTT TTTGTTCTTT 780
TTTTTTTTTT TTTTTTTTGA GACAGGGTCT GGCTTTGTCA CCCAGGCTAG AGTGCAGTTG 840
CGCAATCTCG GCTCACTGGA ACCTCCTCCT CCCAGGCTCA AGCAATTCTC CCACCTCAGC 900
CTCCAGAATA GCTGGGACCA CAGGCATGTG CCACCAAGCC CAACTAATCT TTTTGTATTT 960
TTAGTAGAGA TGTAGTTTTG CTATGTTGCC CATGCTGATC TTGAACTCTT GAGCTCAAAA 1020
TTATCCACCC ACCTTGGCCT CCCAGAGTGC TGGGATTACA GGCATGTGCC AACATGCCCG 1080
GCTGGGGCCA TGCTCTTTCT GAAGCCTCCA GAGGAGACCC TCTGTTCCAT GGCTTTTTCT 1140
TCTGGTGTTG GTGGCAGTCC TTGGAGTTCC TTGCTTCATG GATGATACTT CACTCCAGTC 1200
TCTGTGGCAG AAATTCTCTG GTGTGTGTAG ACAAGCCTTC CTCTGCCTCC CTCTTAGGAA 1260
GATACATGTG ATAACACTTA AGGCCCACCC TGATCATCCA AAATCATCTC CCCATCTCAA 1320
GATATTTTTT TTTTTTTGAG ATGGAGTCTC GCTCTGTTTC CCAGGCTGGA GTGCAGTGGC 1380
GCAGTCTTGG CTCACTGCAT 1400