EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS040-09043 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Esophagus 
Coordinate
chr12:123371380-123374700 
Number of super-enhancer constituents: 48             
IDCoordinateTissue/cell
SE_03969chr12:123372158-123374142Brain_Anterior_Caudate
SE_04866chr12:123372627-123374025Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05835chr12:123372506-123374335Brain_Hippocampus_Middle
SE_06752chr12:123372427-123374364Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07820chr12:123371511-123373975Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_11355chr12:123370263-123387549CD20
SE_12882chr12:123371153-123375031CD34_Primary_RO01480
SE_13364chr12:123370352-123377384CD34_Primary_RO01536
SE_14078chr12:123370527-123374122CD34_Primary_RO01549
SE_14078chr12:123374135-123377388CD34_Primary_RO01549
SE_15159chr12:123371489-123374216CD4_Memory_Primary_7pool
SE_20678chr12:123371452-123375661CD56
SE_23035chr12:123371451-123374116CD8_primiary
SE_23035chr12:123374193-123375063CD8_primiary
SE_23125chr12:123371398-123374057Colon_Crypt_1
SE_23125chr12:123374210-123374794Colon_Crypt_1
SE_23796chr12:123371617-123374038Colon_Crypt_2
SE_23796chr12:123374267-123374702Colon_Crypt_2
SE_25026chr12:123371394-123374077Colon_Crypt_3
SE_26757chr12:123370440-123374088Esophagus
SE_26757chr12:123374175-123382269Esophagus
SE_28186chr12:123370530-123374306Fetal_Intestine
SE_29262chr12:123370485-123374291Fetal_Intestine_Large
SE_30119chr12:123371598-123374763Fetal_Muscle
SE_31427chr12:123371483-123374784Gastric
SE_35883chr12:123370374-123381488HMEC
SE_37349chr12:123370777-123381030HSMMtube
SE_40937chr12:123371444-123374123Left_Ventricle
SE_40937chr12:123374195-123374891Left_Ventricle
SE_42306chr12:123371472-123374890Lung
SE_43888chr12:123371004-123381065MM1S
SE_47190chr12:123370007-123381847Panc1
SE_47585chr12:123371515-123372768Pancreas
SE_47585chr12:123372855-123374043Pancreas
SE_47585chr12:123374271-123374686Pancreas
SE_49030chr12:123371530-123372578Right_Atrium
SE_49030chr12:123372717-123374100Right_Atrium
SE_50159chr12:123371388-123374104Sigmoid_Colon
SE_50159chr12:123374182-123374874Sigmoid_Colon
SE_52477chr12:123370694-123374096Small_Intestine
SE_52477chr12:123374179-123374760Small_Intestine
SE_53586chr12:123371348-123374988Spleen
SE_61538chr12:123340041-123395084Toledo
SE_62830chr12:123354785-123387061Tonsil
SE_64309chr12:123370452-123374999NHEK
SE_65302chr12:123370430-123374818Pancreatic_islets
SE_66800chr12:123370544-123374097Jurkat
SE_66800chr12:123374223-123374829Jurkat
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr12123374277123374697
chr12123373600123374131
chr12123374260123374548
Enhancer Sequence
GGTATTACTA ACTCCCATTT TAAAGAGGAG GAAACTGACA CTTAGGAAGG TTAAATACTT 60
GCCCCAAAGT TTCCTAGCAA CCCAAATCCT GTCTTAACCA CGATGCTTCA ACAGTCAACT 120
TTCCAATTTT TGTACGGCTT TTATGACTTT TGCCTCCTAT CACTTATTTC TTGATGATGT 180
TATTGGTTCT TCTAGTTTTT CCCCACAGTC TTAACATTTG CCACTGGCAG ATAAACCACA 240
TGACTAAGTG ATTATTTGAA CTGTGTGCAA AAGCAAGACT CAACAGGCTC TGCTATAAGT 300
CCAGTATATG TCCTTGAAGT CAGTTATCTC GGCTGCCCAA CGATCATTTT TATCAACCAT 360
CTTTCAGCCT CCTAACTCAT ATCCCAGCTT TCTAATCTCA TCCCCCTCAA ATCCATCCTT 420
CCCCTGGCTG CCAAAACGAT CTACATAAAT GGCGAGTGTG ACCAACCGCA GCACTCCCTG 480
GCTTAAATCC TCCAACGGCT CCCTGCCTAG AGGATCAAGC CCAAGCTCCT TAACAGGGCA 540
TATGAGGCCA TCTGGTCCCT GACTGCCTTT TGGGCCTCAG CCCCCACTAC ACCCTGCCCT 600
GGTCCCTCCA GCAATACTTA TAATATTCCT GTATGCACAC ACACTCTGTC CCGGCTTCTT 660
CCCTAAGTGC CTTTGTTCCT CCCATATGCC TGGGAGCCCT TCTCCCTCAT TACCTGGCTA 720
ACTCTTAACT CATTCTCTGA ATCATAACTT ATGAGTCATT CATCTTCTCC AGGAAACACT 780
CCCTGCTGAC CCCCCACCTT CCAAAGGCTT ACTGGATCTC CCCCCACCAG TGTGTGGGCC 840
TCACTACTGT TTCACATGTA CCCTGTACAC CTGCATGATC CTAAATGATG AAAACTATGT 900
GGTTTACTGG TTTCACATCC CCCAAGTGGC ACACCACAGA TGCTCCGCAA AGGCTGGGTA 960
CATGAATAAA CTTCTTGACC TCAGTCATGT TCACATTAAT GAAAACTACT GTCTGATGGC 1020
AAACATGTTA GACCACTTTT GTTTTTTTTC TTTTAGACAG GGTCTCACTA TGTCGCCCAG 1080
GCTGGTCTCA AACTCATGGG GCTCAAGAGA TCCTCCCACC TCAGCCTTCG GAGTAGCTGG 1140
ATTTACAGGT GTCAGCCACC ACACCCAGCT CTGATGACAA ACATGAATTT GCACTATGTT 1200
CCTCTACTAT CCTAGACACT GGGCTGCAGA TGTAACCTCG AGGTGCCATT AGTTAACCTT 1260
GGAGATAAAA GGTTTGATTT AAAAGAAACA TTAGCTGTAA CGCTGCTTGA AATATAAGAA 1320
ATTATTCAAA TATCTACTTT TCACATAAAC TCTTTGACAA AGTAATGGAC TACGTTCCTC 1380
ACAATCCCTT GACAAATACT TTGAAAAGCC TTCCCTTGAC ACACTGTAAC GTATTCTAGA 1440
GACAACAAAG CTAAGCTAAG TCACCTCTCT ACTTTCATTC TTCCCTTGGA AGAAATTCTA 1500
CAAAGGCATT TCCTCTGCTT TTGTATCATT GGGTAAGACA TCATTTCCAA TGATGAAATC 1560
TGAAAACTCA CACAGCTGGG GAAGGAAATA AACCAACGAG AACTCTTGTC TCAGCATGTT 1620
CTGAGCGCCA GTGATTACCT ACGAGTGGCT GGCACACGGT CTTCTAGATC ACCTCCCACT 1680
GCGTACCTGG CATGAATCTC CATAGCAACA TTCTGCTACA AATACTGTAA TCAAAGCCAA 1740
ACAGGCAACA AGGCCGGCAT TCCTCAGCTC AAGAACACAA CCACTCTGCA TACGACCGAC 1800
CGGTGAGGGT CAAACAGTGC AGTCTACTTC TGGGTTCCTC TTCCAGCCAG TCTCTAACAG 1860
GATGTTAGGT CATCCAACTT GTTTCTCTCG TTTCTCCCCT CCCTTCGATG GCAGCTCTTT 1920
CCTTCTCCCA ACCCACTAAT AGCTCCTAGT GGCCTTTCAA ACTTTTATAT TCTCCTTGAT 1980
TTCCACAAGC ACTTGGAGGA GAGTGGCTTG AATTTCTGTC TCCAAGCAGA GCATTCACCC 2040
TGAGCTCCAG AACCACACTC CAACTGCCTG CGGGACAAAG CCCTGCCCAT CCCTCATGCT 2100
CTGCCTAATC CGGCCTCAAT GACTCCCTCC CTCCTGCACC CCCACTGCCC CTCCCCTCCC 2160
CGCTCACCAG AGCCCTGTCT CCTACTCACT TCCACTTGAA GCCCGGTTAT CACCACTCAC 2220
TCAGCAGCAC TACCCAGGCA CATCCTGGGT GCCAGGCACT GTGCTGGGTG CCAAGGACAA 2280
AAAGACAAAC ATGACAAAAT GCAGCCCCCA AGCCAGTGGG GGACACAGGG AAGTGACTTA 2340
CAAAATGTGT GTCAAGTGCC ACAGGAGAGG TATACAAAGA AGCTAAGAGA CCACGTGCCT 2400
GTGACAGAGG TGGGGAAAGC ACTTCAGGTC AGCAGGAGAG GGGAAGTGAG AAAGGGAGTC 2460
GGGCCAGCTG GTCCGAATAC CTCTCCCAGA GCCCTAGCTC AAATCCTAAT TTCTTCCTAA 2520
CCTCCACTTC CGCCGCCAAC CTGGTCCTGC CACGCCAAGC CAGCCCACGC TTTGCTGACA 2580
GATTAACCTC CCTAAAGAGC AGTTTCAGGC CGGGCGCGGT GGCTCACGCC TGTAATCCCA 2640
GCACTTTGGG AGGCCGAGGC GGACGGATCA CCTGAGGTCA GGAGTTCTAG ACCAGCCCGA 2700
CCAACATGGA GAAACCCCAT CTCTACTAAA AATACAAAAT TAGCCGAGCA TGGTGGCGCG 2760
TGCCTGTAAT CCCAGCTACT TGGGAGGCTG AGGCAGGAGA ATCGCTTGAA TCCGGGAGGC 2820
AGAGGTTGCG GTGAGCCGAG ATTGTGCCAT TGCACTCCAG CCTGGGAGAC AAGAGCAAAA 2880
CTCGGTCTCA AAAAAAAAAA AAAAAAAGAG CAGTTTCATC CGACTGCTTC TCTGCTCCAA 2940
AATCATCACG AAGCTCCTTG TTTCCTCCTA AATTAACCAC CATGGGGCGC ACACCCTGGC 3000
ACTCCCCCTC ACCAGCCCTA TTTCTTGTCA TTTCTCTACA CACAAGTACA TGCCATCTGG 3060
CCAAAGTAGA CGAGAACTCG CTCGTCGGAC AACCCATCCC TGCTTTCCTG CCTCTGTGCC 3120
TGTGTCACTT CCTCCTGAGC CCCCATTTTT GTCCATCAAA AGCCTACTTA GAGAAATAAA 3180
TAATTCACAA CAGTGGACAT GGGGAAGAGC ACACTGAGGG CAGAGCACAA GGCGGGGGGT 3240
TCCGCCGGTT GGCAGTGTTT ACTTCCTCGG CTGGGTAGCA GGTAGACAAA GTTCCTTATT 3300
CTCTGTGCCC TCTGGTAGAT 3320