EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS040-00316 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
Esophagus 
Coordinate
chr1:9300790-9304980 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs556189727chr19303926hg19
rs139855605chr19304979hg19
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr1:9301255-9301268TAATTAATTAACA+6.12
Lhx3MA0135.1chr1:9301251-9301264TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr1:9301252-9301265AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr1:9301248-9301261ATTTAATTAATTA-6
POU6F1MA0628.1chr1:9301253-9301263ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:9301253-9301263ATTAATTAAT-6.02
ZEB1MA0103.3chr1:9302733-9302744CCCACCTGCCC+6.14
ZNF263MA0528.1chr1:9303583-9303604TTCCCCCTCACTTCCTTCTTC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:9303234-9303255AGATGAGGAAGAGGCAGAGGG+6.13
Number of super-enhancer constituents: 22             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00971chr1:9299188-9301445Adrenal_Gland
SE_00971chr1:9301454-9306003Adrenal_Gland
SE_04741chr1:9299086-9301460Brain_Anterior_Caudate
SE_04741chr1:9301732-9305744Brain_Anterior_Caudate
SE_25729chr1:9294018-9308743DND41
SE_27139chr1:9299280-9305763Esophagus
SE_32037chr1:9300788-9306127Gastric
SE_41114chr1:9296304-9301508Left_Ventricle
SE_41114chr1:9301637-9305676Left_Ventricle
SE_42618chr1:9297636-9301518Lung
SE_42618chr1:9301536-9306196Lung
SE_47002chr1:9300746-9301254Ovary
SE_47002chr1:9302434-9303421Ovary
SE_47002chr1:9303445-9303973Ovary
SE_47002chr1:9304297-9305097Ovary
SE_48140chr1:9291388-9312295Psoas_Muscle
SE_49071chr1:9299226-9301460Right_Atrium
SE_49071chr1:9301662-9306104Right_Atrium
SE_51432chr1:9291490-9301462Skeletal_Muscle
SE_51432chr1:9301520-9306157Skeletal_Muscle
SE_53841chr1:9297927-9301475Spleen
SE_53841chr1:9301948-9305548Spleen
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr193032009303348
Enhancer Sequence
ATGCTCTTTG GCTAACTTCA AGTATGTAAT TTCGGAAGGT TTATTTCACA GCCCATTCCT 60
CTCAGAGCAG GCAAGGAGGC AGAGGGGAGA AGTGCTTCAG AAGAAAACCT TCTGAAGCAG 120
AGCCGTGCAG CATGAGGAGG AGGCTTGGAG CCCAGGAGAT GTGTTGGAGC CGTGGGTGCC 180
TCTGCTCCAG AGGCTGGGGT CCCCCTGTCC CTGACTTTGA CTTAACTGGG CTTCTCTGGG 240
CCTGCTTCTT TCCCTGTCAG GGCAGCAGGG AGGATGACCA AGCCAGCCTT CCTCCTGCTG 300
CTTCCAGACT AGTCGGGAGT GTTGAGTTAG GAACCAGGGT TGGTTCTCCA GTGCTGTCTG 360
CAGGGCCTGG CTCTGTAGCC CCAGGAGAGG AGGGAGGTTC ACAATGTTTT TCCTGAGAGC 420
AATGGTATAC TACCCTTGGG GGCCAGGAGG AACTTTGCAT TTAATTAATT AATTAACATT 480
TGTATAGCAT TTTTGTCAAA TGTATCATCT CAGTCTTCAC TGCCCCTCCC CCCACCCCCA 540
CCTTGGGTTG ATGGTATTTG CCCTGTTTTG TAGATGAAGA AATGTGGATG CTAAGGCTCT 600
AATCACCTAC CCACCCTTAT GGAAAGGTGG AGGGCATCTC CCTGATTTAA TTAGCTGATT 660
TATTTATTTA TTTTATTTAT TTACTTTTTT TGAGACAGGA TCTTGCTCTG TCACCAGGCT 720
GGAGTGCAGT GGTGCGATCA TGGCTCACTG CAGCCTGGAC CTCTCGGGCT CAAGCAGTCC 780
TCAGCCTCCT GAGTAGCTGA GACTACAGAC ATGTGCCACC ACGCCCAGCT AGTTTTTAAA 840
TATTTTTTGT AGAGATGGGG GTCTCGCTGT GTTGCCCAGG CTGGTCTGGA AGTCCTGGGC 900
TCAAGTGATC CTCCTGCCTT GGCCTCCCAG AGTGCCGGGA TTATAGGCAT GAGCCACTGT 960
GCCTGGCCTA ATTAGCTGAC TTAATTAGAT CACGAAGTTA GGCAGTGGTC TTGAGCCCAG 1020
GTCCTTGGAC CCCAATGCTT CCTTCTTCTG CTTGACAAAG GAAGCTGTTT AGCATCGTGA 1080
CTGAGGGTCC AGGCTTTGTG GCTTGACAGT TTCCTTCACC TCCCAGTTTC CTCGTCTGTA 1140
GAATGAGACT CCTCACAGAA CCTCCTCCAC AAGACTGTTG TGAGGAATGA TTGGAAAGGT 1200
GCGTTTAAGT CATCTGGCAC ACGCCGACTA CTTGGTTAAC ATAGGTATTA TTATTGGATT 1260
CAGGAACAAC CAGTTTTTAC AAGGGGATGG GCGCATGAAA CCATTTGAGA CTGTTTCGAA 1320
ACACCTGTGT TAGGACCCAC CCTACACCTA CTGGATCAGA ATGTCTCTGT CTTGAGAAAG 1380
GGAGCAGGAG GCGAGGACCG CGTGTTTGTT CTGATGCCCT CCTTTGATGA GAACTGCTGC 1440
TCTGGTGCTC GCTGCTCAGT ATTCCGGAGT CTCACTACTC AAAGTGTGCT CTTGGACCAG 1500
CTGTCAGCAC TTCAGGTCCT CTTCCTTCTG CATCAGAATG TCCTTTTAAA AAGATCCCCA 1560
GGAAATTCAA ATGCTCATTA AAGTTTGAGA AACACTGTAA AGGTTAAAAA AACATAAAAA 1620
AAAAAATACC CACACATACT ACCCCCACCC ATTTAGGAAA GAGTTGTTTT TTAGTTGTTT 1680
TGCAACCACA GAGTAAGCAA TCATGTTGTA ATACCCAATA TCTTGGATTT GTTTAAAGGA 1740
GTGCTGGCAA CATAACAGAT AAGGGAGGCC AACCTCAGAA CCGGGGACCC ACAACAGGAC 1800
TGGTCAGGGA GGACTGTGGC AAACCTCAGA GTCAGAACAG GATTAAAGAG AGGGCCAGGA 1860
GTCAGTTCAG GCCAGGTGGC CATCCGTCAC AGCTGTCTGC AGTCTTCTGG GGTGGGGGCA 1920
GAGGTGCTGG CCCTTGGGGC TCCCCCACCT GCCCATGCCA GGACTCTGGA GGCTTAGCTC 1980
CTCCCTTTGT ACCAGGCACG TCCAGAGCCC TGGCTACCAG GATCCGATCA GCAGCTCTGA 2040
AGCGCAGCCT GCCAGCTGGC GGCTCCTCCT TCTCCAGGCT GTTCTCTGGG CTTCAGATTT 2100
CTTGCTGCCT CTCTCCTGCA CTGACCTTGC AGCTTCTCCT TCTCTCCAGA CGAGCGATTG 2160
CCGGTTGAGG AAAAAACGCT TGAAGGGCCA AGGACAGGGA CTGGAAAGCA GGAGGAAAAA 2220
GCAGAATGGT CCTGTGGTCC GTGTGTGTAT TTAGGGGTGA GGGCAGATAC AGGGAGAGTG 2280
GGAGAGGAAG GCTGGGGAGC CACCCGTGTG GCCCTGATCC TCTAGTTAAA GCTCCAGTGA 2340
TGGACGCGTC GTGTGTCCTG TAGACACTGG CTCAGACACT GTGGTTGGGT CCTCACCTTG 2400
GGTTGGTCCC TCACTAGGAC CCTCTTGGAG ATGGATCTTG AGAGAGATGA GGAAGAGGCA 2460
GAGGGGGTGG TGGGAGGAGG GGGTCTGACG TCAGGGTCAA GAGGCAGATT GGTGCCCTCT 2520
GTATAGGGAT GGTGGAGAGG TCATTGGGCT GGTTCTGTGG GGACTTTTGT AAGTTATCTC 2580
TTTAAACCTC AACTTCTCCA TTTGTATTAC CAGATTATGG CTTCCTAAAG TTGTTAAAGA 2640
TTTTGTTAAT CCTTTACCTG GTAAATGCCT GACATATAAT AGGCGCTAAA TCAGCCATTC 2700
AGTTCCTTCG TCACTGCTCC CACCTGCAGG CTGAGCCCCA TTTCCACCGT GGATTTCTGA 2760
CTAGTTCCCA TGGGCATGCC GGCCGTGATG ACTTTCCCCC TCACTTCCTT CTTCCTTTCC 2820
CTCCAACACT GGCCTTGGTT GGAAGCTAGA GAGCCAGAGA GCTGTGGAGG AAGAATTCAG 2880
TGCAGGAAGC CCTACAACCT TGGTTAGAAC AGAAGGGCAG AACAAACAAA TACTTGGTGT 2940
GTTTGTGACC CACCTTAGGC CTCTACTTCT CATGCATGTG AGTGCCTCAG TTTAGGCTGA 3000
ACACTAGCCC AGGTGGTTTG CTTACCTGGG AGAGGTTGTA GCCACTGGCC CAGACACTGT 3060
TGTTGGTCCT CACCTTGGGT TGGTCACTCA CTAGGACCCT CTTGGACATG AATTTTGAGA 3120
GAGATGAGGA AGAGGCGGGG GCGGTGGGAG GGGGGGTCTG ACGTCAGGGT CAAGAGGCAG 3180
ATTTGGTCCC CTCTATAGCG GTGCTGGAGA GGTCATTGGG CATGTCATGC AGTGGCTGCA 3240
CAGTCAGTCC CAGCTCCCCT GCTTTCTTAC CCTGGGACCT TCATTGACCT GAGCCTCAGC 3300
TTTTCCATTT GCAGAATGGG AGGACTGTCA CAGAACCCCA TGTGGTTCTT TCAGGATTCT 3360
TGTCTGGATT CATTGAGCTC TAATACACAT AAGTACTTAG TGCCAGCACT AATCATTTGC 3420
TGGTATCACT CTTCCAGGAT GACACCTACC ACTCGGTGCT TAATAGGTGA TAGGTACAGG 3480
CCTCAGCTCA TTATAAGCAT GAACTCCTTT TATCCTTATA ACAACTCTGT GCTGTAGGTA 3540
CCGCTATTAC CCCCATTTCA GGTGAGAAAA CTGAGGTACA GCCAGGTTAA ATAATTGTGC 3600
ACTTACTAAG GGGTTGAGCT GGGATTCAAA CTCAGGCAGT TAGTCTGGAG TCCATGTTTT 3660
CTGTCACTAT GCTGTAGCAG TTATTAGTCA TCACTTGGTA GTTGGAGCCC AGTGGACATG 3720
GAGAAGAGGC AAGTGAGAGG AGGTGGTCCT GCCCTCTCAC TGTTCCAACT GTCGCCTGAG 3780
GACCTGCCAC TATACCTAGG CTGGGGCTGC CCTGCTTGTC CGGGTGACCT GTGCTCCTAG 3840
AAGAGACTGG CCTTGGTCAT AAAATGGACA GCTCCACTCC CAGGCCTGCG GCCCTCCCTG 3900
GTGGCCTTTG CCGCTTTCCT ATGCTCCTGG CAGCAAAGTG GTTCATCTCT AGCAAGTGGT 3960
CTCTAACTTT CCCAGGCAGA GTCCCTGTCT ACAGGGCAGG CTCCCTACCC ACTGACTTCC 4020
TGGAACAGAA GCCAAGCTGT CAGGAGGGAG GGACAAGCTG TGGGCTTATA ACATTTTCTT 4080
AAGAAACACG TGGTGGTTTC TTGCCAGGCA GGAAGTGTTT GTTTCCACAT CGTAGCCACC 4140
TGAACCATGT CTGATCCTTC CTTGTTCCTC GTCTGTCTCT CTTTGCACCC 4190