EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS039-06071 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_NPC 
Coordinate
chr4:80201780-80204410 
SNPs
Number: 2             
IDChromosomePositionGenome Version
rs6848123chr480203425hg19
rs28454198chr480204001hg19
TF binding sites/motifs
Number: 7             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr4:80201913-80201924TTAATTAATAT-6.62
Foxd3MA0041.1chr4:80202434-80202446AAAAAAACATTC-6.52
IRF1MA0050.2chr4:80202937-80202958TCTTAGTTTCTGTTTCTGATT+6.55
KLF4MA0039.3chr4:80202103-80202114GCAGGGTGTGG-6.62
LMX1BMA0703.2chr4:80201910-80201921ATTTTAATTAA+6.62
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:80203870-80203885AATGTCAAGAGGTCA+6.84
RARAMA0729.1chr4:80203870-80203888AATGTCAAGAGGTCAATT+6.57
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr48020284480203025
Enhancer Sequence
TTTCTGTTTC TTGTGCCTGG AGAATCCTGA CTGATATAGG GGCTTCAGGA AACTCTGTGG 60
AGTTTGAGGA CAAAGGCGGT ATCTTTCATT TTTGTGTATA TCCAGCAACA ATGCCTGGCT 120
CTAACACATG ATTTTAATTA ATATTAACAG AAATAAAATG TGTGTGCATG AACTGGACTG 180
AGTGGAAGTG TTCATATGAT GGAATGAAGA AAAGTAATAT AAAGAAAGTT ATAGGGACTA 240
CATTGAGGAA AGCCTTGAAA GACAGATTGA AGCCTCAATT TTGGGGGCAT TGGGAAGTCT 300
TGGAAGTTTC TGCACACAAG GTTGCAGGGT GTGGTGAGTG AGGGAGTGAT ATAAGAATAG 360
TGTTTCAGGA AGGTTAACTG AACAGGCAAA GAAACAACTA ACACTTATCA ATGCTTTCCA 420
GGCTCCAGTG CAAATGTTTC CTAGCAATTA ACTCACCAAT TCCTCACAGC TGTCTACAGC 480
TGGGTACCAT CATTATCCTA TCCCCAGTTT ACAGATGAGG AAGCAGAGGC ACAGACTTGC 540
CAAACAATTT ACCAGTCAAA CAGCAAATGG CAAACATGGG CAGTCTGAAA AGCATTTAAC 600
TATTACATTC TACTGCCTCC CTCTATAGTA TGGCTATGCA GATGGAGGAA AAAAAAAAAA 660
ACATTCTCAA GGAGACAGTA AAGAATCCAA CTGTAGAAAT GATGTGGCAT AGATAATAAA 720
TACATATCAT AAAGTAAGAG TTGTCAGGAC TTGGCATCAC TAGATGTGGG CTGATATTGG 780
ATAAAATCAA GGCCCATTAA TTACTTAGCT AGTAATTTAT CCATTAATTT TATCAACATT 840
TATTGAGTAC CCACCAAATA TCATGCACTG TTATATCTAC TAGTGATACC ACAGTGCACA 900
AAGCAGACAA GTTCTTTGTT GTCGAGTCCA TATTCTACTA CAAGATAAGT GATTAATAAA 960
TAAAAAATAT CAGGTAACAA TAAGTGCTAT GATGAAAATA AAAGAAGGCA ATAGAGACTG 1020
ATTAGGATCT GATTACATAG ACAGTACTCA AGGAAGGCCT CTCTAAGGAA TTAGCATGTA 1080
CACAATGACA AATTACATCC CTATTATCTG CCACAGAGCC TATCAGGCTG TCCAAGGGAG 1140
AGAATACAGT CATGGGTTCT TAGTTTCTGT TTCTGATTAA GCCAGTAAAG CTCCTTCCTC 1200
AGAGAGACAG AAACTAAACA CCATGGCTGC AGGCTTCTAA AAGCCTAAAA CAAAACAAAA 1260
TAGAACAACA ACAACAAAAT AAGGCAGGTT GGACAAGCTC TAGACCCTTT AAAAAATATT 1320
TGCTGAATGA GTGAATGAAG TGATTTGAGG AACTTGAAAA GCAAGAAATT ACATTTTTCC 1380
AGGATGGGTG GGACTGTCAT GAAAGAAACA AAACTTCTTT CAATGACCTG AATGATGGGA 1440
ATTAACCAAC CTTCTAAAGA TCTAGGGACA AAGTGTCCTG GCAGGGGGAC CAGCAAACAC 1500
AAAGCCCCAA GAAAAGAACG AATGGCATGC TTGGCATGCT TGAAGAACAC AAGTAAGGCA 1560
AATGTGTCTG GGATGTAGTG GGAAAAGAGT ATAAAGAGGT GAAGGCAGAG AAGTAAACAC 1620
AGCCCACATT ATACAAGGTG CTGGATGACA GGCTTAGGGG TTTTAATTTG GAAGGTTTAA 1680
ATAGAACAGT TACATAATAT AAATTCTGTT TTTTAAAAAA GTCACTCTGG CCAACCTGTG 1740
AAAAAGGAAT TATAGCATGA TAGGAGTAGA AGCCAAGCAC TATATTAGGA GACAATAGAA 1800
GAAGTCCAGT TTGTAGCTAT TGAGATGGAG TTCATGGAAA TATTTCAGAG GTGGAATTGA 1860
CAAGAATGGC TGATGGGTTA GACAGCAAAG AGAGGGAAGG AAAGGTTTTC TAAATGTTTC 1920
CTAGATCAAC TAGATAGATT GTGATATATT GAAAAATTTC CTAGAGCAAA CAGATAGATT 1980
GTGGTGTATT GATGATTGTT TAAAAAAACA AGGAGGAAGA TAAGTTTTGC AAATCTCAGA 2040
AGTTTTGTTT GAGGCATGTT AATGAGTTGC ATATTAGAAA TTCCAGTGGA AATGTCAAGA 2100
GGTCAATTGG ATCTAAAAGC CTATTTCAGG TGAGGTTCAA GGCTAGAGAA AGAAATTTCA 2160
GATCACTGGA AATACGGAAT TATTTAACTC CATGGAACTG GATGAAATTG CCTAGTAAGA 2220
GAGTGTAGAC TAAAGAAGAA AAAGATCCCC AGCTACAAAC TCTGAGGCTT TCCGGTATTT 2280
CAAATGTAGC AGAGAATAAG GAACCAGCAG AGGAATGGCC AGTAAGGATG GAGGAAGTAG 2340
AGTGAAGTAT CTGAGAGCCA AACTCAGAGA GGCTTTTGAG GACAGAAGGG TTCACCATGG 2400
CCAACGCTGC TGAGAAGTCT CTAAATATAA GAGCAAAAGT GTTACTGTTG GATGTGGAAA 2460
CATGCAAATC ATTGGTGATC TCAATGTGCA ATCTCAGTGG AAGGTGAGGC AGAAAGCCTA 2520
CAGGAATTAG TTGAGGAGAA AATAGAAGGT AATGCAATAG AGAAGAGACT ATAGACAACC 2580
TTGTCAAGAA TGTTCACTGT GAAGGGTGTA GTATAAAGGG ATAGTAGTGA 2630