EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-17245 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr5:87955210-87960260 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs1422192chr587959023hg19
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr5:87955927-87955938CTAATCCTCTC-6.02
IRF1MA0050.2chr5:87955455-87955476AAAGTGGAATTGAAAGTAAAC-6.27
Six3MA0631.1chr5:87957895-87957912GAAAGGGTATCAATTTT+7.22
Number of super-enhancer constituents: 18             
IDCoordinateTissue/cell
SE_02696chr5:87955130-87958057Astrocytes
SE_02696chr5:87959257-87960137Astrocytes
SE_03210chr5:87955005-87956778Brain_Angular_Gyrus
SE_03210chr5:87956977-87957900Brain_Angular_Gyrus
SE_03976chr5:87954778-87958132Brain_Anterior_Caudate
SE_03976chr5:87958293-87982935Brain_Anterior_Caudate
SE_04950chr5:87951288-87958099Brain_Cingulate_Gyrus
SE_04950chr5:87958444-87989956Brain_Cingulate_Gyrus
SE_06110chr5:87954635-87958040Brain_Hippocampus_Middle
SE_06732chr5:87951076-87958169Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_06732chr5:87958173-87991815Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07796chr5:87951112-87958205Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_07796chr5:87958266-87992522Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_44047chr5:87954387-87958258MM1S
SE_56053chr5:87954692-87966511u87
SE_60284chr5:87954647-87973608Ly4
SE_61643chr5:87954482-87973550Toledo
SE_63353chr5:87950865-87989017NCI-H69
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 1             
ChromosomeStartEnd
chr58795663287957169
Number: 1             
IDChromosomeStartEnd
GH05I088659chr58795508787964962
Enhancer Sequence
GAAATCTGTC AGACAGCTAC TTAGTGACAG AATTAAATGA ATATTGTTAG GTAAGTGTTT 60
TAATAACGCA GCATTTTCGA AGCATTTTCT GAAGATTATT TCTCATTGGC CCTGTCATAA 120
AGTGGTAGCA AACTGCTTTA AAACAGTAAT CAGACCGAAA GTAGTTGAGG AAGCCTATGA 180
CAGGAAGTTG TTAATAATAT CCTTCGAAAT TTACCTGTGA AATACAGAGC TTGACTACTT 240
TTGTAAAAGT GGAATTGAAA GTAAACGGCC TCTGTAATGC AAATCGACCA GCAGCAAGAA 300
AGCCACTACC TTTGGAGTCC CACGACTTCA CCTGAGCTTG CAATAGACCT TGTGCGCCCT 360
TTGGTTCATG GAATCAAAAC TGTTTTGACA TGTTGGCCAG TGCCCTTCGG TGTCACTGAA 420
GCTCAGCCCG CGGACGGCGG TGTGTCAGTG TGCACCGGGA GGCCTGGGCC TCAGTCCCTG 480
GGCTCGTGCC TACGCAACAG CAGGACCGCC CGCGGCCTCC CAGGACCAGT GACCGTCACC 540
CGCAGTAAGG ATCGGGGCGG CTCCGCCAGT TTCGGCCCTC TTTCCAAGAC CTCTTTCCAA 600
GGCGCTCTTT CCTAGCCTCA CCCGAGGGCC GCAGAGCCGG ACCTGTGCCG GGCGAGTTGG 660
ATTTAGCCCA GTTAGAGTTA AGATGGTATC ATTAGCTGCG CACAGCGTGA CTTCCCGCTA 720
ATCCTCTCTG CAACTTACAA CAAGTTTAAA TGTCCATGCA TGATGTTATT AACTGGCTTT 780
AGTAAGTGCT TAAGACCCAG ATCTCTTTTT AAAGTAATCT CTGAACAAGT TCTACTGTAT 840
CCACCCAACA AGGAGATTAA TATTTCCAGC AAATCTGATG ATGGGGTAAG ATGTGCCCTG 900
AGCTCCTATG GGCAATGGGG GTAGAAGTGG GAGTTGCCCC AGGGAAGGGC CCAGAGTGGC 960
AAGCGCTCAC CAACGCCGGC CACCGAGCAA AACTTCCCCG CCCCCGCCCC CCACCCAGCT 1020
TCCCCGCAGG GAGACCCTTT CCGTTAGCAG CTTTTCACTA AGTTAATAAC GGTGTGTGTG 1080
TGGTGGTGGC GGGGAGGGGG GATTTGGGGG TTACACAATA TCTATATCAA TGATATTGAT 1140
CACGTCCAGG GAAGAAGCCT GGGCAAAACT AGAGACACCG AGTGTCAGCA AAAGAAAGCT 1200
TCTTAACCAC AAGTTGCGTG CCGCCTGAGG AAGGTGCCCT GTGGCAGGGG GTGGCCGCTG 1260
GGAGATGCCT GCCTCTAACC GACGTCCAGG CGTGACTAAA CCTCGACGCC ACCCCCATTC 1320
ACAAGCTCAA CTCAGGGATT CCCAAGCAAC CGCAGACCGG AGGTGGCGCA GAGGCAGTGA 1380
CCGAGGTCGC TGATTAGGGG CCGAGAGGCT GGCAAATAAT AATTTTAAAA AAAAAAAAAA 1440
CCGGAATAGC CTTCGCGGAC GCAGCTCAGC GTGCCAGGCA AAGGACAGTC TGACGACCCG 1500
CCCCTGCCGA GCCCCGCAGC GCGGCGCCGG TGTCCAGCAG CCTCCAAGGC GCCGAGCGCG 1560
GGCACGGGAA CTTGAGCTAG CGCAAACTTG GGCGGCCTCC CAGCCTGCTA CCCGGGCCGC 1620
AGCGCGCCCC CGGCCTCCCA GTCGCGCGCC AACCCGGGAG CGCGCGCGCC GGCGCACCAG 1680
CTCCATCAGC TAGAGGAGCC CGTCTCCCGG GAAACACCAA TCAGACGCCC GCTTTCAGGC 1740
GAGGGCCGCG AGCCGCAGCA GCTGCAGGAG GACTCGGGCA GTTGGCGGTC ACCGGGAGGC 1800
GTCGTCCTGC CCCGCGGCGG GCCAGCCGCC TTCGCTGCTG CCACTGCCTA GCCTAACCGC 1860
ATCTGCAGCC AGTCACAGAG TCGGCTGTCT CCTCTTTGCA CCGCCCACGC CAAGTACCTT 1920
GCAAGGCGGC TGCTAAGCCT GGCTAATTTT AGATCTCCAG AATGCGCTAT GCCCGCGCTC 1980
AACTAAAACC AAGTCAAACC ATCAAGCACA GTGATGTGCT GCTTTTTGAA CAAATATGGC 2040
TCAAAACTCC GTATTTCCCT GAATAAAGTC GATTATCTGC ACTTTTTAAA AGCCCTACCC 2100
CCTGTGGTCT GGCAGTTGGC TGAAAAGCGG AAAGCCACAC GCTCCCACCT CAAACATGGT 2160
CATCACCTTT CTAAGGAAGT GCACTAACTC TCGCAGCCCT GATTGAGGGC AGATAAATAT 2220
TCCTTAATAT CAATCACAAC TATATACTTT CCATTTCCAT TCACCATCTT AGAATTAATT 2280
CCACAAATAA GTCGAACAGT TCCCAGAAGG GGTGAAATGG GTTCTCTGAG CAAACAGGAA 2340
TAGAGGGTTC TGCTGATTTC TGTACTAGGT TGTTTAAGTT GTGTTAAGAA CCGATGAGCA 2400
AAGAAACAGG GTTAACAAAG CCATCCATTA AAATCCAGAG ACACTGAAGA ACTGCCTTAC 2460
ATGTCCCAAT TGCTGTAGGA CCTGTTTAAC TATCTCGAAG TAGTCATGTT AAAACAATCG 2520
ACCCAGCATT ATAGATATCT TTTTTACTCA ATAACTGATT CTAATTAGTT CTTAGTCTTA 2580
AAGAACACCT TGTCCTGTGT TGCCCATCTC ACCACTGCCA CCCCCAGTTC CCACTAAATG 2640
CAACATATTA TGGTGTGTTT TACTTAACTG TAGCACATTA GGGAGGAAAG GGTATCAATT 2700
TTCTGAAACC ACAGTGACAT TTCCAGATGT ATAGATTCAT AGGAAAAAAA TAGATACATA 2760
GACAGTTACA TACTGTCATT CATTTTCTAG CCACATTGGA AAATAAAGCC TTTGGTTTCA 2820
TCTCTCCATT TTTGAAAAGT CAAAATTCCT AAAATGCTAA AATATCTTAA AATATTTATA 2880
TGTATCCATC TATATGGCTT CCTTATAATT TAAATGGTTT CTTAATTTTC ATCAGGCTAC 2940
ACAAAAATCA AATTAGAATT TTATATTTTT CCAAATAAGA AAATTATTTT AATTTTAAAA 3000
ATAAACACAA AGAACTCTTG TGGTGGAAAA TTTACTGTTC AAGGTGACCT AAAGAACAGT 3060
CACTTTGGAA AATATTCCAT TTTGAATGTA AATAATGCAT GTCTCATTAT TATGCATAAT 3120
AGCAACTTCA TTAAGGGATT GATACTAGTG AAAATACCCA TTCACATTCA GCAAGGACAC 3180
TGAAGAAGTC TTCCTGAATC TTTTTTTTAA CCTTTATCCA ATTTTCATTT TTGTTGTTGT 3240
TTTGTATTTT TTGTATGACT ATGTTTATCC TATATCCTTT ATTATTTGAT TAGTGAGTGA 3300
CTTTTCAATG TTAATTTTCT GGTATAACAA AGTAGGGTAA AGAAAATAAA TGGGTTCTAT 3360
CTTTATATTT ACTTTTACAG GTATCATTTT ATCACCCTAT TTCTAAGTAT TTCATGAAAA 3420
GATTCTAGAT GTCAAAACCT GCAGTTAACG TTCCTGTTTA GAAATACGCA AAATAATACC 3480
TTTGACGTTG GCAACTCAGA TGTATTATTC AGCAAAACAG CAATTACTCA TTGTTTTGCA 3540
CTTACATGTT AAGAACTATG AGACACTTGG TGACACAATA ACAAAATTGC AAAGTCAATT 3600
ACATTTAAAA TAGACATCCT AGTAAAACAT ACACAACCAA CTCCATTTAC TTTTTTTGAA 3660
CTGTTTTGTT TCCTTTTTCT GACTGTTTAC AGTCAAATAG ATTTCGTGAA TGTTAAACCG 3720
AAGGATAACT GATTTACACA CATCATGAGG GGGAAAAAGT TAGAAAGTAG GGGGAGGGGC 3780
ATAACATAAA AAGGAAGTGT ATTCCTGGGC ACGCCAGAAT CCGCCTAGGG AGGTGCCAGA 3840
ATATTCTTAA ATATTTTGGG AAATGATGTT CTTTTGCAAT GTCAATCACA GTGGCAAACT 3900
TTGAAAGAGC AGTGTGCCAT AATTTAAAGC AAAATTTAAG CTAGATTCAC ACTAACAATT 3960
CTATGCAGGA CTAAAGTAGT AAAACCCACA TAGAGTCCAT TTATATTTAA GAATAGAGAA 4020
CTTCAGGTGG GGCTAGGTGT TTGTTTTATG GTATTTTAAT TGCAGAAGCA GAATTTTTGT 4080
AATTTGAACT CGCCAGTACT GAATTCCACC TCTCATCCCA GCCTGAAGCC TGAATTGAAG 4140
TTCCCATCAG AAAATTAAAA TGTTTGTCTG GATAAAATAA CTTCTAAATG AACTATTTCT 4200
TTTCGTTTCT TTTTGTATTT TCTGCAATGT AGCCCCTCGC AATGATATTA GTTCTAGTGT 4260
GGGAAAATAT TATAATTGAG ATTTGGTAAG TTATTTGCAG ACTTTTCTTT ACAGTTTTTC 4320
TTTACACTGT GCTGACATTT AGTACAGCCC TGGTGAGGAA AACAATACTA CCATTCATAG 4380
CTCTAGACGT AGATTTCAAT CGACTTAAGC GGGCACAATG AAACTTGGTC ATTCACTGGT 4440
TACCCATATT GTGTTCTCAA ATTTTCTCTC AGCAAAAGTA TAATGACTCA GTATTGTATG 4500
GTTGCATAGA CAAGGGCTCG GAACAAGAGA CACTAGTTTT GTCTGACGGT GTGAGAAAGT 4560
CGTGAAGGGA TCTTTTCTTC CAGATGGTGT TAAATTCAGC TGCCTTTTTA ACATTGGCCT 4620
TGCACAGCAA TCTGCTGCTC CCCTTTCACA AAGACTGCAC TTGGTTCCCA CTAGTTAACA 4680
TGCATACTCA CGCAACCTGC AACTTCACTC CAACTGTTTT ACAATGCAGT GGTATGCTAA 4740
ATAAACTTGA TCCGGTTTCT GCCAATGTTA AAACTAGGTT TCAAAGAACT ACTTAACTGA 4800
TATTTACACT TCTTTTGACT TAAATGTACA TGCCTTTGGA ATATTACGGG TTTCAAAGAA 4860
ATATCACCTT ATTATAAGGT CAATGTACAG ATTATTTCCA ACACCCTTCA AACCTATGCT 4920
CAGATACAGT ACCTCTCTTC AACACACACA AATAAAACAA AATGTCAGAA GTTTGATGTG 4980
TAATAGAAAA AAGAAAAATT GGGACATGTT GCACCAAGGG CAGTGGAACA GCAAAAAATA 5040
AAATGAAAAT 5050