EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-03666 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr11:65251980-65255230 
Target genes
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs587080chr1165253800hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr11:65255002-65255020GGAGGTCAGGAAGGAAAG+6.13
IRF1MA0050.2chr11:65252868-65252889AAAAAAAAAGAGAAAGTTTAT-6.38
RARAMA0729.1chr11:65252268-65252286GCTCGAACTTCTGACCTC-6.44
RFX1MA0509.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA+6.78
RFX1MA0509.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA-6.78
RFX2MA0600.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA-7.13
RFX2MA0600.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA+7.15
RFX5MA0510.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA+7.38
RFX5MA0510.2chr11:65255021-65255037AGTTGCTATGGCAACA-7.42
ZNF263MA0528.1chr11:65255097-65255118GAGGGATGGGGGAGAAAGGGA+6.06
Number of super-enhancer constituents: 76             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00028chr11:65250988-65277615Adipose_Nuclei
SE_00879chr11:65253195-65254978Adrenal_Gland
SE_01577chr11:65252760-65253733Aorta
SE_01577chr11:65253818-65262467Aorta
SE_02242chr11:65253964-65262748Astrocytes
SE_02898chr11:65254006-65255064Bladder
SE_03165chr11:65252854-65253723Brain_Angular_Gyrus
SE_03165chr11:65253779-65258378Brain_Angular_Gyrus
SE_03882chr11:65252507-65262880Brain_Anterior_Caudate
SE_04846chr11:65252181-65262791Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05895chr11:65250838-65275661Brain_Hippocampus_Middle
SE_06693chr11:65252147-65276599Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07762chr11:65250696-65262852Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08788chr11:65253928-65255129Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09268chr11:65254148-65256277CD14
SE_13317chr11:65254385-65255165CD34_Primary_RO01536
SE_14049chr11:65254463-65256148CD34_Primary_RO01549
SE_25770chr11:65252372-65276621Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26547chr11:65252543-65262946Esophagus
SE_27634chr11:65253802-65258438Fetal_Intestine
SE_28555chr11:65252858-65262651Fetal_Intestine_Large
SE_29556chr11:65252771-65276612Fetal_Muscle
SE_30929chr11:65254039-65256553Fetal_Thymus
SE_31424chr11:65252932-65262941Gastric
SE_33163chr11:65253828-65255072H1
SE_33445chr11:65252127-65258476H2171
SE_34266chr11:65252073-65262837HCT-116
SE_34617chr11:65237426-65277580HeLa
SE_35831chr11:65252552-65262853HMEC
SE_36925chr11:65252260-65275698HSMMtube
SE_37995chr11:65253943-65262751HUVEC
SE_38870chr11:65253832-65255145IMR90
SE_40612chr11:65252729-65253785Left_Ventricle
SE_40612chr11:65253804-65266678Left_Ventricle
SE_41603chr11:65253853-65254890LNCaP
SE_42107chr11:65253153-65253776Lung
SE_42107chr11:65253824-65266681Lung
SE_43442chr11:65253831-65255109MCF-7
SE_44137chr11:65252735-65262954NHDF-Ad
SE_44750chr11:65252712-65253727NHLF
SE_44750chr11:65253791-65275500NHLF
SE_45562chr11:65252799-65275714Osteoblasts
SE_46695chr11:65253925-65255034Ovary
SE_47127chr11:65243490-65277571Panc1
SE_48070chr11:65253942-65269802Psoas_Muscle
SE_48581chr11:65253787-65258461Right_Atrium
SE_49457chr11:65254304-65254937Right_Ventricle
SE_50062chr11:65253835-65262568Sigmoid_Colon
SE_51077chr11:65252635-65277472Skeletal_Muscle
SE_51697chr11:65254242-65262983Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52357chr11:65252816-65253709Small_Intestine
SE_52357chr11:65253845-65262584Small_Intestine
SE_54029chr11:65253993-65262983Spleen
SE_54503chr11:65243495-65276614Stomach_Smooth_Muscle
SE_55162chr11:65254434-65254894Thymus
SE_55732chr11:65252807-65255220u87
SE_56764chr11:65253901-65254808VACO_400
SE_57928chr11:65254229-65254855VACO_9m
SE_58932chr11:65238587-65276390Ly3
SE_59720chr11:65237780-65272476Ly4
SE_60674chr11:65238641-65271340DHL6
SE_61239chr11:65237836-65278618HBL1
SE_62240chr11:65238321-65275907Tonsil
SE_63249chr11:65244238-65267283GLC16
SE_63391chr11:65243820-65268347NCI-H69
SE_63485chr11:65254228-65262853HSMM
SE_64233chr11:65252819-65253822NHEK
SE_64233chr11:65253928-65256664NHEK
SE_65450chr11:65253579-65270152Pancreatic_islets
SE_66874chr11:65252127-65258476H2171
SE_67468chr11:65252807-65255220u87
SE_68042chr11:65238458-65277023TC32
SE_68043chr11:65238458-65277023TC32
SE_68495chr11:65243635-65267694TC71
SE_68496chr11:65243635-65267694TC71
SE_68897chr11:65253783-65258392H9
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 3             
ChromosomeStartEnd
chr116525320065253546
chr116525283165253647
chr116525223965252500
Enhancer Sequence
TCCCAAAGTT CTGGGATTAC AGGCGTGAGC CACCGCGCCT GGCCCTAAAC TATTCTTTTT 60
ACTTTTTATT TTATTTTTTG AGAATTTTTT TGAGACGGAA TCTTGCTCTG TCACCCAGGC 120
TGGAGTGCAG TGGCGTGATC TTGGCTCACT GCAAACTCCG ACTCCTGGGT TCAAGTGAGT 180
CTCCTGCCTC AGCCTCCCAA GTAGCTGGGA TTACAGGCAT GCACCACTAG GCCTGGCTGA 240
TTTTTGCATT TTTAGTAGAG ATGGGGTTTC ACCATGTTGA CCAGGTTAGC TCGAACTTCT 300
GACCTCGTGA TTCGACTGCC TCATCCTCCC AAAGTGCTGG GATTACAGAT GTGAGCCACC 360
ACGCCTGGCC TTTACTTTTT TATGTTTGAA ATTTTCCATA ACAAAACATC TTTAAGTATT 420
GGAAATACTG ACAAACGGTG AGCCAACTTT TCCCAAATAC AAAATTATAA CAAAATTACC 480
CTGCACTGTC ACCACCGTTT CATAAGAAAA AAGTCTTTAT AACATCAAAG ATACAAGAAG 540
GGCTTGTGAA CCCAAAATAT CTGAGACAGG TCTCAACCAA TTTAGAAGGT TTATTTTGCC 600
AGCCGGGCAC GGTGGCTAAC ACCTGTAATC CCAGCACTTT GAGAGGCTGA GGAGGGTGGA 660
TCTTGAGGTC AGGAGTTTGA GACCAGCCTG CCCAACATAG TGAAACCCTG TCTCTACTAA 720
AAATACAAAA AATTAGCTGG GCATGATGGC GGGCGCCTGT AATCCCAGCT ACTTGGGAGA 780
CTGAGGCAGG AGAATTGCTT GAACCTGTGA GGTGGAGGTT GCAGTGAGGC GGGATCGTGC 840
CACTGCACTC TAGCCCGGGC GACAGTGCAA GACTCCGTCT CAAAAAACAA AAAAAAAGAG 900
AAAGTTTATT TTGCCAAGGT TAAGGACACA CCCATGACAC AGCCTCGGGA GGTAGATAAG 960
AGACAAAGAG TTGCACTCTT TTCTTTTGAG TTTCTGATTA GCCTTTCACC TAATACGCAA 1020
TTTACATTTG AGAGGAGGGC AGAGGAGTAG TCACTTTTGC TTTAGTCTGG TTTAGTGAAA 1080
TCAGAGGTCA GGGGAAGCAA TCCGATATGC ATTAGTCTCA CGTGAGCCTC GGAGGGATGA 1140
TTTTGAGTTC TGTCTGTCCT TTGTCCACAA GGAATTTCCT TGTGGGCAAA TTGTGAGGGA 1200
GGCATGTAGC TTTTTTTTTA ATAAATCTTT GTAGCTATCT TATTTAGGGA TAAAATTGGA 1260
AGCAGGTTTG CCTGACATAG TTCCCAGCTT GACTTTTCCC TTGGCTTAGT GATTTTGGGA 1320
TTCCAAGATT TATTTTCCTT TCACAGGCTT AATCTCTGAA TAAAGGACCC TCTTAAAATG 1380
GGATGTAGTT AGTTTTCTGG AAAAGTCACA GCCGACGCTC CCAGGGACTG TTTCTGGTTC 1440
ACGGGCCCTA GGTTCAAACA ACCCTTCCCA AACCTTGTTT GTTTCAAAGG TTGAGATCAA 1500
AGCTAGTGGG TAGCCAGTGA GGCTGTGCTT GTTCACTCTG TGACTCGGAC AAGCTGGCAC 1560
CTGTCTTCTC TGGGCTGCTT TCTCTCAAAG ACTAAGAGTG TTTAGTGCAG AAAGGCCCTC 1620
AGAGATCTGG GTTAACCTCT TATTTATTTA TTTTTATTTT TTGTTTTGTT TTGTTGTTTT 1680
TGAGATGGAG TCTCACTCTG TCGCCCAGGC TGGAGTGCAA TGGCACGATC TTGGCTCACT 1740
GCAACCTCTG CCTCCCGGGT TCAAGCGATT CTCCTGCCTC AGCCTCCCAA GTAGCTGGGA 1800
TTACAGGCGT ATGTCACCAA ACCCAGCTAA TTTTTGTGTT TTGAGTAGAG ACAGGGTTTC 1860
GCCATGTTGG CCAGGCTGGT CTCGAACTCC TGACCTCAGA TGATCTGCCC ACCTCGGCCT 1920
CCCAAAGTGT TGGGATTACA GGCGTGAGCT ACCATGCCCA GCCGGTTAAC TTCTTATTTT 1980
TACAGATGAG AGAACTGAGA CAAAGAGAGG AAGAGTGACT TGCTGGAGGT AACAGGGTGC 2040
CACTTAAATG GCACAGCCTA GGGTAGAACC CAGGGCTGCT GGTGCCTCGT CCAGGGTTTG 2100
CTCCACTCAA CGTTTTACCT GCTATGAACT GACCCATGTT GTTTTCGTCA TTCTAGTCAG 2160
TACCTAGAAA GACAGCTGTG TGGACTAGCT GCTGGACCAC CAGGCTTTAA GTCTTGACAT 2220
TGCTATTTAC TGGCTGTGCA ACCTTGAGCA AGTTTACTTA ACTTCTCTGG GCCTCCATTT 2280
CCTCATCTGT AAAATGGGTA GGTGCTGTAA TCATGACAGT TATCTTCCGT GAAAATTCAG 2340
TGAATGCATG TGCCGCAGTG CCTGCCATGT AGAAAGGACT CAGTGCAGCA TAGCTGCATT 2400
TTCACCTCCT ATATGGATGG TAAGTTCCAC AGATTTATTA CGGAAAGCAG GCTGGCCTTT 2460
AACTTAGGGT CATGGAATGT CAGAGCTGGA AGGGGCCTCT TGAGTTAACT AGAGAGGCGT 2520
CCTTTTACAG GAGAAAATGA GTCCCTGGGG GCCTGCGTGA CCTGCTGAAG GTCCCAGGGG 2580
CTTTTGGTGA CAGAACAGGA ATCAAACTCC AAAGGGGTCC TCTGTCCTGG GGCTCTGGGC 2640
TTGTTGAACA AGTCAGCTGC CCCATCCTCC AATTTATAGA GCCATTAGCC CAAGGGAGTG 2700
TCAGTGTTGG TCAAGTAAAG ACACGTGGAA GTGCACGGAG CTCTACAGTT TACTAACAGC 2760
ATTTGCAAAG TTGGAGCCTT ACTCCAGCCT AGAAGGTGGT GAGTGCTGGA ATGAATATTC 2820
CATTTCACAG AAAGAAACCA AGGCCCCCAG GGATGAGTTG GTAACCAAAG CCATGGGTAG 2880
AGGCACAGAA ATTCCTTGAC TACTCTGGAA AATGAGGGAG TTCACCTTCA AGAGAAGAAA 2940
GTTAGGTCAG TATAAAATGG CTGACAGCCT CTTCTGCCTT CAGAAAAGTA CTTCAACTGC 3000
AAAGTCAACT ACTAACTTCC AAGGAGGTCA GGAAGGAAAG CAGTTGCTAT GGCAACATCT 3060
TTGGCAGCTA TTTTCATCCT TCTCTGGTTC AGAACAGCTT CCAGCAGGTT CCTGTGGGAG 3120
GGATGGGGGA GAAAGGGAAA GGCTAGCTCC AGCCCAGCAA CTGTCCTCAG CCAATCTCCC 3180
ACCAGATTTC GGTGGCAAGA GGAAGGTGGC AGCCAATGAA GAGGCTCGGA GCTTGCATCA 3240
TCCTCCTGAC 3250