EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
HS038-01249 
Organism
Homo sapiens 
Tissue/cell
ESC_neuron 
Coordinate
chr1:156467350-156470270 
SNPs
Number: 1             
IDChromosomePositionGenome Version
rs10908505chr1156468243hg19
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468381-156468399CCTCCCTTCCCCCCTCCC-6.04
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468377-156468395CCTTCCTCCCTTCCCCCC-7.1
EWSR1-FLI1MA0149.1chr1:156468373-156468391CCTCCCTTCCTCCCTTCC-8.06
ZNF263MA0528.1chr1:156468377-156468398CCTTCCTCCCTTCCCCCCTCC-6.09
ZNF263MA0528.1chr1:156468373-156468394CCTCCCTTCCTCCCTTCCCCC-6.65
ZNF263MA0528.1chr1:156468372-156468393TCCTCCCTTCCTCCCTTCCCC-6.67
ZNF263MA0528.1chr1:156468388-156468409TCCCCCCTCCCCCCCTTCCCC-7.07
ZNF263MA0528.1chr1:156469853-156469874AGAGGAGGGAGAGGGAGGGAG+7.53
ZNF263MA0528.1chr1:156468389-156468410CCCCCCTCCCCCCCTTCCCCC-8.08
ZNF263MA0528.1chr1:156468380-156468401TCCTCCCTTCCCCCCTCCCCC-8.36
Number of super-enhancer constituents: 102             
IDCoordinateTissue/cell
SE_00337chr1:156465189-156476309Adipose_Nuclei
SE_00902chr1:156465123-156476044Adrenal_Gland
SE_01624chr1:156465207-156468384Aorta
SE_01624chr1:156468387-156476109Aorta
SE_02565chr1:156469795-156476049Astrocytes
SE_02937chr1:156468807-156469775Bladder
SE_02937chr1:156469801-156475479Bladder
SE_03183chr1:156465551-156470721Brain_Angular_Gyrus
SE_04141chr1:156455754-156476291Brain_Anterior_Caudate
SE_04925chr1:156442957-156476137Brain_Cingulate_Gyrus
SE_05851chr1:156442823-156476598Brain_Hippocampus_Middle
SE_06826chr1:156455584-156476327Brain_Hippocampus_Middle_150
SE_07824chr1:156444206-156476920Brain_Inferior_Temporal_Lobe
SE_08791chr1:156467954-156468407Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156468701-156469223Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156469253-156469634Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_08791chr1:156469940-156470645Brain_Mid_Frontal_Lobe
SE_09328chr1:156455579-156476984CD14
SE_10496chr1:156468612-156471986CD19_Primary
SE_11165chr1:156449814-156479014CD20
SE_12168chr1:156468582-156469168CD3
SE_12168chr1:156469839-156476292CD3
SE_13036chr1:156468049-156468754CD34_Primary_RO01480
SE_13036chr1:156468793-156472076CD34_Primary_RO01480
SE_13485chr1:156465196-156476191CD34_Primary_RO01536
SE_14170chr1:156467146-156468304CD34_Primary_RO01549
SE_14170chr1:156468402-156476146CD34_Primary_RO01549
SE_15064chr1:156468335-156476467CD4_Memory_Primary_7pool
SE_16164chr1:156468699-156473244CD4_Naive_Primary_7pool
SE_16728chr1:156468726-156472622CD4_Naive_Primary_8pool
SE_17138chr1:156468445-156472542CD4p_CD225int_CD127p_Tmem
SE_17525chr1:156455508-156476948CD4p_CD25-_CD45RAp_Naive
SE_18052chr1:156466294-156476695CD4p_CD25-_CD45ROp_Memory
SE_18886chr1:156466624-156476417CD4p_CD25-_Il17-_PMAstim_Th
SE_19364chr1:156467906-156476154CD4p_CD25-_Il17p_PMAstim_Th17
SE_20186chr1:156466814-156476634CD56
SE_21124chr1:156468394-156476159CD8_Memory_7pool
SE_21730chr1:156468468-156476440CD8_Naive_7pool
SE_22205chr1:156468381-156476957CD8_Naive_8pool
SE_22473chr1:156455624-156476936CD8_primiary
SE_23670chr1:156465636-156467896Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156467923-156468409Colon_Crypt_1
SE_23670chr1:156468420-156470673Colon_Crypt_1
SE_24009chr1:156467544-156467865Colon_Crypt_2
SE_24009chr1:156468521-156470659Colon_Crypt_2
SE_25163chr1:156468482-156469101Colon_Crypt_3
SE_25163chr1:156469338-156475883Colon_Crypt_3
SE_25856chr1:156465342-156477016Duodenum_Smooth_Muscle
SE_26648chr1:156465154-156476164Esophagus
SE_28187chr1:156466638-156468184Fetal_Intestine
SE_28187chr1:156468391-156476221Fetal_Intestine
SE_29274chr1:156466454-156468169Fetal_Intestine_Large
SE_29274chr1:156468218-156476064Fetal_Intestine_Large
SE_29623chr1:156457659-156476054Fetal_Muscle
SE_31030chr1:156468651-156480271Fetal_Thymus
SE_31445chr1:156465385-156476063Gastric
SE_32703chr1:156465262-156472841GM12878
SE_33523chr1:156465372-156473390H2171
SE_34669chr1:156467034-156476478HeLa
SE_37054chr1:156464710-156476367HSMMtube
SE_38176chr1:156467537-156476177HUVEC
SE_39310chr1:156468423-156470654IMR90
SE_40614chr1:156456530-156477045Left_Ventricle
SE_41764chr1:156467948-156468364LNCaP
SE_41764chr1:156468497-156471403LNCaP
SE_42136chr1:156456472-156476277Lung
SE_44813chr1:156468511-156476032NHLF
SE_45962chr1:156465453-156476220Osteoblasts
SE_46671chr1:156466803-156467897Ovary
SE_46671chr1:156468431-156470688Ovary
SE_47855chr1:156467369-156467777Pancreas
SE_47855chr1:156468651-156470639Pancreas
SE_48054chr1:156442802-156481304Psoas_Muscle
SE_48580chr1:156457242-156467895Right_Atrium
SE_48580chr1:156467911-156476055Right_Atrium
SE_49466chr1:156465535-156467898Right_Ventricle
SE_49466chr1:156468478-156470678Right_Ventricle
SE_50090chr1:156456568-156476106Sigmoid_Colon
SE_51078chr1:156456787-156481370Skeletal_Muscle
SE_51995chr1:156465545-156467660Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51995chr1:156468480-156469739Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_51995chr1:156469832-156470695Skeletal_Muscle_Myoblast
SE_52473chr1:156465351-156469748Small_Intestine
SE_52473chr1:156469779-156476230Small_Intestine
SE_53429chr1:156465373-156476196Spleen
SE_54540chr1:156458123-156476924Stomach_Smooth_Muscle
SE_55197chr1:156468465-156468974Thymus
SE_55197chr1:156469022-156469677Thymus
SE_55197chr1:156469792-156476120Thymus
SE_57194chr1:156468590-156471295VACO_400
SE_58979chr1:156449810-156478804Ly3
SE_59740chr1:156457157-156478970Ly4
SE_60601chr1:156449917-156475935DHL6
SE_61299chr1:156450124-156478621HBL1
SE_61431chr1:156449469-156496609Toledo
SE_62421chr1:156450235-156479388Tonsil
SE_63341chr1:156457704-156475426NCI-H82
SE_63769chr1:156465531-156467660HSMM
SE_63769chr1:156468416-156469749HSMM
SE_63769chr1:156469818-156476118HSMM
SE_65297chr1:156461973-156472274Pancreatic_islets
SE_68350chr1:156458923-156476306TC32
Diseases: AD,Huntington,Obesity,Parkinson,Prostate cancer,Schizophrenia and Sleep disorder
Number of disease enhancers: 2             
ChromosomeStartEnd
chr1156468556156468776
chr1156468000156468081
Enhancer Sequence
CAAGGCCTGT ATTAAGTCAA GGCCCTCAAC TCCTCTTTTC CAGTAAGGCC ACCACTCTCT 60
CGACTAGAGG GGCAAAGAAG CAGGGGGCCT GACTCAAATA GAACTAGGGA AATGTTGGGC 120
CCACCCACTT GCTCCTGGAC TTCCCTTGTC CCCATAAAGG TACTCAGGTG TGTGGCAAAG 180
TGTCCAACCA AGGGCCCACA CCAGGCCAGC GTAAGTCCTG AGATTCTGGA TCCAGTGCCA 240
ACCAGGGAGA GCAGGGGGCC CAGCTGGTCA GGAAGAGAAA GTTGACAAAA TGGGGAGAGG 300
TCCAGGCCTC TCTGGGGGTA TAAGAGCCAG GGACGACCAC AGCAGAGGGA CCCTCTGAGG 360
GCACGGTAGA GGAGAAGGGT CTGAGGGGCT GGGCCATAAT CAATGAGGGC CTATCCCCAA 420
GGCCTCCTCG GGGGCCAAGG CACCTCCCAC TCCAAGCTTC CTTACTACTG CTCCTTTAGC 480
TCCCCCCAAC CTGAAGAGTC TCCCTCTGGC TTCTCTTCCC TATCACATCT CCCAGGAAAG 540
ATTAAAAAAA AAAAAAAAAA AAAAAAAAAC CCTGCTACAG AGAGATTATA TAACAGCAGC 600
CAGAAAGACT ATCATATCTC CCAGCCTATG AGAAGAACCA GGAGCCAAGG GGGCAGAGCC 660
AGGATGCCCA GGCCCTCCAG CCCAGGGGCA CCAAGCACAG AGTGGGGTGG ACACGGACAG 720
CACCTGCCAC CCCTCCAAGT CCTCCACCAA TCTTTCAGGC ATTGAGTACA GCAGACAGAA 780
GCTCTAGCCA ATTCCCCATG CCCATCCCCC AACACAAGGA TCATGAGGCT CTCTGGGTCC 840
TGCTTCTTCC CTTGGACTGG GGCTTCCATG AACACGGACT GTATGTCTCC CTTCCCAGAA 900
TCCCTCCCTA CTATGAAGTT GTGCCTAAAA GAGTGGAAAG ACGAAAGCTC TGACACAGAT 960
TTGCTGTGTG ATCTCAGGTA AAAAACTCAA CCTTTTGGGT CCCTACAGGG GTGAGTAAAA 1020
GCTCCTCCCT TCCTCCCTTC CCCCCTCCCC CCCTTCCCCC CAGAGAGACC AGAGACCTCT 1080
CCCTTTACAA ATGTACATGC ACACACATAC ATATACACAC ATATGCAAAC ATACAGGGTG 1140
TGTTGGCGGG GGCAGGGGAG TTACAACAAA GAGAATATAA TCACTGAGAC CCAAAGGTCC 1200
AAATGCCTAT GCTGGGGCAA GTGGGGAAGG AGCTCCATAT AAGCTCCAGT GTCCCCCAAT 1260
CACCCCGTAT AAAGAGGTCC TCAGCCACTC CCACAATAGT CCTACCCCAC CCCCATCTCC 1320
TGCCCAACAC ACTGGGAAAC CACAGGAAGG AAATTCATTC CCAGGCAGGG CCGTGGGAGC 1380
TGGGACAGCC AGACTAAGTC CTGGGGCGGG TGTGACCCCG TGGCCACAAG CGGGTGGACA 1440
TCTGTGAACA CTGACATGTG CCTTTTCAAT GCTCTCCTCA GCTACTGAGA CCTTCCTGTT 1500
GGGGTTGGGA GAGGAGTGGG AGGTGGACAG CTCCCAAACG CCAAAACACC CAATCTCAGG 1560
CTGACCTGCG CTCCCCTCCT ATCTCCAGGC CAGAGCAGCC CAAGGTCACC GCCCCAGACG 1620
GCAAACTTCC CATAGTCTAG GCTGGACCCT GAATTGCTGC GGAGACCCAC TGAAGGGATA 1680
GGAGGAGGAG TGGATAAGGG CCACCTCCAC CCCAAAGCAA AGAAACCAGG ACTCTGAGGA 1740
AAACTCAAAT GGGGGTTGGG CACAGCAAAG AGGGACACAG GATCCCCCCC AACCCGCTAT 1800
ACCCTCCCCC AACCCATCAA CAATGCACCA AGCAATGGGA GGCAGAGGGA GGCTCCCATT 1860
CAGAAGGGCA AACCTGGGAT AACCCGGTCG GTGGCTTCTA GAGTGCCTTC CTTTCAGGAG 1920
GAGTCCTCGG AAGGCTGCTG AGAGGACAGC GTGATTCACT AGGGGGAGGG GGCCCCTTTC 1980
CCCATCCCCC TAAGACCCGA ACCTGGTAGG AGAGAAGCTG GCATTGGAGT GGGGGACTAA 2040
AAGCATTTTG GTCTCCTTGG CCCATCCTCC CAAAAGCCCC CCCAAACTCC CTAAACCCCC 2100
GCTCGCAGCC CAGCTCCGCC TGCCATAGGT GGAAAGGACT AGAGAACTCT TGCCCAGATG 2160
TTGAACAGCT GCAAACTTCT GGCCAGGGAG TTCTCCAGTT GGGGTTACTG ACAAACCACA 2220
TCAGGGGTCT CGGAAGCGGG GCTAGGAGGT CTCAAGGAAG GGTCCTGCGT GCCCACCTCG 2280
TGGCGACTCC GCGTCCCAAC TCCACAGGCA CCCGGCAAAC ACGGGCCCCG GAGACACACA 2340
CACTCACACA CCCCAACCCA CTACCCCGGT GTCATCTGAA CAACATCCCC CCTCCCTCCC 2400
CCGCTTCCCA AACAGCTGCG GCTCCCCCCG CCTCCACCCT CCCGCCGCCC TCCCAGGCCC 2460
CCTTCTGCAC CATTTCGGGC CAAGGAGGAG GGAACAGGCG GCGAGAGGAG GGAGAGGGAG 2520
GGAGGGCCGG CTGTTAAAAT GTCAGTCGCT CCCGACTGTC ACCGGAGACC CCCTCGGAGG 2580
ATGGCGCCCC GTCCCAGACC GCTCGGAGGC CGTCGTAAAC CCCCTACACG AACAGGCGGG 2640
CGCGCCCCCA ATCCGCCCGT CCCCACCCCG TACTCCCAAC ACCCAAGGGA ATTGCAGCCC 2700
ACTCCACTTG TCCCCCACGA CAGACTCCCT GACACAAACA GTCCCCTAGG TAATCCCCGC 2760
CAACGCCACA CGAAAACACG GCCCGCTTCG CGAGTTCCTC CCGGCCCGGG GGCTGCCCCA 2820
TCCCACCCCT CAGGGGGACG GTCTAGACCA CCCTCCACCC CAACCCCTGG ACCGGGTGGG 2880
GGAGGGGGCC TCTTAAAGTG GCAGGCGCAT TATTTTTCTC 2920